S100A7

S100A7 (англ. S100 calcium binding protein A7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 101 амінокислот, а молекулярна маса — 11 471.

S100A7
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1PSR, 2PSR, 2WND, 2WOR, 2WOS, 3PSR, 4AQJ
Ідентифікатори
Символи	S100A7, PSOR1, S100A7c, S100 calcium binding protein A7
Зовнішні ІД	OMIM: 600353 HomoloGene: 48150 GeneCards: S100A7
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RAGE receptor binding • transition metal ion binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • focal adhesion • extracellular region • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • azurophil granule lumen • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • GO:0001315 response to reactive oxygen species • positive regulation of monocyte chemotaxis • keratinocyte differentiation • positive regulation of granulocyte chemotaxis • sequestering of metal ion • response to lipopolysaccharide • positive regulation of T cell chemotaxis • Ангіогенез • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • epidermis development • вроджений імунітет • antimicrobial humoral response • neutrophil degranulation • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6278	н/д
Ensembl	ENSG00000143556	н/д
UniProt	P31151	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_002963	н/д
RefSeq (білок)	NP_002954	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 1: 153.46 – 153.46 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSNTQAERSI		IGMIDMFHKY		TRRDDKIEKP		SLLTMMKENF		PNFLSACDKK
GTNYLADVFE		KKDKNEDKKI		DFSEFLSLLG		DIATDYHKQS		HGAAPCSGGS
Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kulski J.K., Lim C.P., Dunn D.S., Bellgard M. (2003). Genomic and phylogenetic analysis of the S100A7 (psoriasin) gene duplications within the region of the S100 gene cluster on human chromosome 1q21. J. Mol. Evol. 56: 397—406. PMID 12664160 DOI:10.1007/s00239-002-2410-5
• Brodersen D.E., Nyborg J., Kjeldgaard M. (1999). Zinc-binding site of an S100 protein revealed. Two crystal structures of Ca2+-bound human psoriasin (S100A7) in the Zn2+-loaded and Zn2+-free states. Biochemistry. 38: 1695—1704. PMID 10026247 DOI:10.1021/bi982483d

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10497 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 25 серпня 2017. [Архівовано 2017-10-14 у Wayback Machine.]
3. UniProt, P31151 (англ.) . Архів оригіналу за 1 жовтня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1