RORC (англ. RAR related orphan receptor C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 518 амінокислот, а молекулярна маса — 58 195.
RORC | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | RORC, NR1F3, RORG, RZR-GAMMA, RZRG, TOR, RAR-related orphan receptor gamma, IMD42, RAR related orphan receptor C | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 602943 MGI: 104856 HomoloGene: 21051 GeneCards: RORC | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
запальні захворювання кишківника | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 151.81 – 151.83 Mb | Хр. 3: 94.28 – 94.31 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDRAPQRQHR | ASRELLAAKK | THTSQIEVIP | CKICGDKSSG | IHYGVITCEG | ||||
CKGFFRRSQR | CNAAYSCTRQ | QNCPIDRTSR | NRCQHCRLQK | CLALGMSRDA | ||||
VKFGRMSKKQ | RDSLHAEVQK | QLQQRQQQQQ | EPVVKTPPAG | AQGADTLTYT | ||||
LGLPDGQLPL | GSSPDLPEAS | ACPPGLLKAS | GSGPSYSNNL | AKAGLNGASC | ||||
HLEYSPERGK | AEGRESFYST | GSQLTPDRCG | LRFEEHRHPG | LGELGQGPDS | ||||
YGSPSFRSTP | EAPYASLTEI | EHLVQSVCKS | YRETCQLRLE | DLLRQRSNIF | ||||
SREEVTGYQR | KSMWEMWERC | AHHLTEAIQY | VVEFAKRLSG | FMELCQNDQI | ||||
VLLKAGAMEV | VLVRMCRAYN | ADNRTVFFEG | KYGGMELFRA | LGCSELISSI | ||||
FDFSHSLSAL | HFSEDEIALY | TALVLINAHR | PGLQEKRKVE | QLQYNLELAF | ||||
HHHLCKTHRQ | SILAKLPPKG | KLRSLCSQHV | ERLQIFQHLH | PIVVQAAFPP | ||||
LYKELFSTET | ESPVGLSK |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів, . Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Hirose T., Smith R.J., Jetten A.M. (1994). ROR gamma: the third member of ROR/RZR orphan receptor subfamily that is highly expressed in skeletal muscle. Biochem. Biophys. Res. Commun. 205: 1976—1983. PMID 7811290 DOI:10.1006/bbrc.1994.2902
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Jetten A.M. (2009). Retinoid-related orphan receptors (RORs): critical roles in development, immunity, circadian rhythm, and cellular metabolism. Nucl. Recept. Signal. 7: 3—35. PMID 19381306 DOI:10.1621/nrs.07003
- Wang Y., Kumar N., Crumbley C., Griffin P.R., Burris T.P. (2010). A second class of nuclear receptors for oxysterols: Regulation of RORalpha and RORgamma activity by 24S-hydroxycholesterol (cerebrosterol). Biochim. Biophys. Acta. 1801: 917—923. PMID 20211758 DOI:10.1016/j.bbalip.2010.02.012
- Solt L.A., Burris T.P. (2012). Action of RORs and their ligands in (patho)physiology. Trends Endocrinol. Metab. 23: 619—627. PMID 22789990 DOI:10.1016/j.tem.2012.05.012
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з RORC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
RORC angl RAR related orphan receptor C bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 518 aminokislot a molekulyarna masa 58 195 RORCNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3B0W 3KYT 3L0J 3L0L 4NB6 4NIE 4QM0 4S14 4WLB 4WPF 4WQP 4XT9 4YMQ 4ZJR 4ZJW 4ZOM 5C4O 5APK 5APJ 5APH 5C4U 5C4S 5C4T 4YPQ 5AYG 5IXK 5IZ0 5EJV 5ETHIdentifikatoriSimvoliRORC NR1F3 RORG RZR GAMMA RZRG TOR RAR related orphan receptor gamma IMD42 RAR related orphan receptor CZovnishni ID OMIM 602943 MGI 104856 HomoloGene 21051 GeneCards RORCPov yazani genetichni zahvoryuvannyazapalni zahvoryuvannya kishkivnika Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding sequence specific DNA binding ligand activated transcription factor activity GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity zinc ion binding zv yazuvannya z ionom metalu steroid hormone receptor activity GO 0038050 GO 0004886 GO 0038051 nuclear receptor activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding oxysterol binding GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding GO 0001078 GO 0001214 GO 0001206 DNA binding transcription repressor activity RNA polymerase II specific GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specific transcription coactivator bindingKlitinna komponenta nukleoplazma klitinne yadro yaderni tilcyaBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated ritmichnij proces cellular response to sterol negative regulation of thymocyte apoptotic process circadian regulation of gene expression regulation of fat cell differentiation transcription DNA templated regulation of steroid metabolic process GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated multicellular organism development regulation of glucose metabolic process cirkadnij ritm xenobiotic metabolic process positive regulation of circadian rhythm adipose tissue development T helper 17 cell differentiation Peyer s patch development transcription initiation from RNA polymerase II promoter T helper cell differentiation lymph node development steroid hormone mediated signaling pathway intracellular receptor signaling pathway GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II cytokine mediated signaling pathwayDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6097 19885Ensembl ENSG00000143365 ENSMUSG00000028150UniProt P51449 P51450RefSeq mRNK NM 001001523 NM 005060NM 001293734 NM 011281RefSeq bilok NP 001001523 NP 005051NP 001280663 NP 035411Lokus UCSC Hr 1 151 81 151 83 MbHr 3 94 28 94 31 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MDRAPQRQHRASRELLAAKKTHTSQIEVIPCKICGDKSSGIHYGVITCEG CKGFFRRSQRCNAAYSCTRQQNCPIDRTSRNRCQHCRLQKCLALGMSRDA VKFGRMSKKQRDSLHAEVQKQLQQRQQQQQEPVVKTPPAGAQGADTLTYT LGLPDGQLPLGSSPDLPEASACPPGLLKASGSGPSYSNNLAKAGLNGASC HLEYSPERGKAEGRESFYSTGSQLTPDRCGLRFEEHRHPGLGELGQGPDS YGSPSFRSTPEAPYASLTEIEHLVQSVCKSYRETCQLRLEDLLRQRSNIF SREEVTGYQRKSMWEMWERCAHHLTEAIQYVVEFAKRLSGFMELCQNDQI VLLKAGAMEVVLVRMCRAYNADNRTVFFEGKYGGMELFRALGCSELISSI FDFSHSLSALHFSEDEIALYTALVLINAHRPGLQEKRKVEQLQYNLELAF HHHLCKTHRQSILAKLPPKGKLRSLCSQHVERLQIFQHLHPIVVQAAFPP LYKELFSTETESPVGLSK A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do receptoriv aktivatoriv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi biologichni ritmi Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaHirose T Smith R J Jetten A M 1994 ROR gamma the third member of ROR RZR orphan receptor subfamily that is highly expressed in skeletal muscle Biochem Biophys Res Commun 205 1976 1983 PMID 7811290 DOI 10 1006 bbrc 1994 2902 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Jetten A M 2009 Retinoid related orphan receptors RORs critical roles in development immunity circadian rhythm and cellular metabolism Nucl Recept Signal 7 3 35 PMID 19381306 DOI 10 1621 nrs 07003 Wang Y Kumar N Crumbley C Griffin P R Burris T P 2010 A second class of nuclear receptors for oxysterols Regulation of RORalpha and RORgamma activity by 24S hydroxycholesterol cerebrosterol Biochim Biophys Acta 1801 917 923 PMID 20211758 DOI 10 1016 j bbalip 2010 02 012 Solt L A Burris T P 2012 Action of RORs and their ligands in patho physiology Trends Endocrinol Metab 23 619 627 PMID 22789990 DOI 10 1016 j tem 2012 05 012PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z RORC pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 24 serpnya 2017 Procitovano 25 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 24 serpnya 2017 Procitovano 25 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 1 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi