POLR2B (англ. RNA polymerase II subunit B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 174 амінокислот, а молекулярна маса — 133 897.
POLR2B | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | POLR2B, POL2RB, RPB2, hRPB140, hsRPB2, polymerase (RNA) II subunit B, RNA polymerase II subunit B | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 180661 MGI: 2388280 HomoloGene: 722 GeneCards: POLR2B | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 4: 56.98 – 57.03 Mb | Хр. 5: 77.46 – 77.5 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MYDADEDMQY | DEDDDEITPD | LWQEACWIVI | SSYFDEKGLV | RQQLDSFDEF | ||||
IQMSVQRIVE | DAPPIDLQAE | AQHASGEVEE | PPRYLLKFEQ | IYLSKPTHWE | ||||
RDGAPSPMMP | NEARLRNLTY | SAPLYVDITK | TVIKEGEEQL | QTQHQKTFIG | ||||
KIPIMLRSTY | CLLNGLTDRD | LCELNECPLD | PGGYFIINGS | EKVLIAQEKM | ||||
ATNTVYVFAK | KDSKYAYTGE | CRSCLENSSR | PTSTIWVSML | ARGGQGAKKS | ||||
AIGQRIVATL | PYIKQEVPII | IVFRALGFVS | DRDILEHIIY | DFEDPEMMEM | ||||
VKPSLDEAFV | IQEQNVALNF | IGSRGAKPGV | TKEKRIKYAK | EVLQKEMLPH | ||||
VGVSDFCETK | KAYFLGYMVH | RLLLAALGRR | ELDDRDHYGN | KRLDLAGPLL | ||||
AFLFRGMFKN | LLKEVRIYAQ | KFIDRGKDFN | LELAIKTRII | SDGLKYSLAT | ||||
GNWGDQKKAH | QARAGVSQVL | NRLTFASTLS | HLRRLNSPIG | RDGKLAKPRQ | ||||
LHNTLWGMVC | PAETPEGHAV | GLVKNLALMA | YISVGSQPSP | ILEFLEEWSM | ||||
ENLEEISPAA | IADATKIFVN | GCWVGIHKDP | EQLMNTLRKL | RRQMDIIVSE | ||||
VSMIRDIRER | EIRIYTDAGR | ICRPLLIVEK | QKLLLKKRHI | DQLKEREYNN | ||||
YSWQDLVASG | VVEYIDTLEE | ETVMLAMTPD | DLQEKEVAYC | STYTHCEIHP | ||||
SMILGVCASI | IPFPDHNQSP | RNTYQSAMGK | QAMGVYITNF | HVRMDTLAHV | ||||
LYYPQKPLVT | TRSMEYLRFR | ELPAGINSIV | AIASYTGYNQ | EDSVIMNRSA | ||||
VDRGFFRSVF | YRSYKEQESK | KGFDQEEVFE | KPTRETCQGM | RHAIYDKLDD | ||||
DGLIAPGVRV | SGDDVIIGKT | VTLPENEDEL | ESTNRRYTKR | DCSTFLRTSE | ||||
TGIVDQVMVT | LNQEGYKFCK | IRVRSVRIPQ | IGDKFASRHG | QKGTCGIQYR | ||||
QEDMPFTCEG | ITPDIIINPH | AIPSRMTIGH | LIECLQGKVS | ANKGEIGDAT | ||||
PFNDAVNVQK | ISNLLSDYGY | HLRGNEVLYN | GFTGRKITSQ | IFIGPTYYQR | ||||
LKHMVDDKIH | SRARGPIQIL | NRQPMEGRSR | DGGLRFGEME | RDCQIAHGAA | ||||
QFLRERLFEA | SDPYQVHVCN | LCGIMAIANT | RTHTYECRGC | RNKTQISLVR | ||||
MPYACKLLFQ | ELMSMSIAPR | MMSV |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як транскрипція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном магнію. Локалізований у ядрі.
Література
- Acker J., Wintzerith M., Vigneron M., Kedinger C. (1992). Primary structure of the second largest subunit of human RNA polymerase II (or B). J. Mol. Biol. 226: 1295—1299. PMID 1518060 DOI:10.1016/0022-2836(92)91071-V
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 34444—34453. PMID 9852112 DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
- Lee J.H., Skalnik D.G. (2008). Wdr82 is a C-terminal domain-binding protein that recruits the Setd1A Histone H3-Lys4 methyltransferase complex to transcription start sites of transcribed human genes. Mol. Cell. Biol. 28: 609—618. PMID 17998332 DOI:10.1128/MCB.01356-07
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
POLR2B angl RNA polymerase II subunit B bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 4 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 174 aminokislot a molekulyarna masa 133 897 POLR2BNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB5IY9 5IYA 5IYC 5IYB 5IY7 5IY8 5IYD 5IY6IdentifikatoriSimvoliPOLR2B POL2RB RPB2 hRPB140 hsRPB2 polymerase RNA II subunit B RNA polymerase II subunit BZovnishni ID OMIM 180661 MGI 2388280 HomoloGene 722 GeneCards POLR2BOntologiya genaMolekulyarna funkciya transferase activity DNA binding nucleotidyltransferase activity ribonucleoside binding RNA polymerase II activity chromatin binding zv yazuvannya z ionom metalu DNA directed 5 3 RNA polymerase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding RNA bindingKlitinna komponenta membrana RNK polimeraza II klitinne yadro nukleoplazmaBiologichnij proces mRNA splicing via spliceosome somatic stem cell population maintenance transcription elongation from RNA polymerase II promoter 7 methylguanosine mRNA capping transcription by RNA polymerase II positive regulation of viral transcription transcription coupled nucleotide excision repair transcription initiation from RNA polymerase II promoter snRNA transcription by RNA polymerase II fibroblast growth factor receptor signaling pathway transcription DNA templated RNA metabolic process GO 1905616 regulation of gene silencing by miRNADzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez5431 231329Ensembl ENSG00000047315 ENSMUSG00000029250UniProt P30876 Q8CFI7RefSeq mRNK NM 001303269 NM 000938 NM 001303268NM 153798RefSeq bilok NP 000929 NP 001290197 NP 001290198NP 722493Lokus UCSC Hr 4 56 98 57 03 MbHr 5 77 46 77 5 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MYDADEDMQYDEDDDEITPDLWQEACWIVISSYFDEKGLVRQQLDSFDEF IQMSVQRIVEDAPPIDLQAEAQHASGEVEEPPRYLLKFEQIYLSKPTHWE RDGAPSPMMPNEARLRNLTYSAPLYVDITKTVIKEGEEQLQTQHQKTFIG KIPIMLRSTYCLLNGLTDRDLCELNECPLDPGGYFIINGSEKVLIAQEKM ATNTVYVFAKKDSKYAYTGECRSCLENSSRPTSTIWVSMLARGGQGAKKS AIGQRIVATLPYIKQEVPIIIVFRALGFVSDRDILEHIIYDFEDPEMMEM VKPSLDEAFVIQEQNVALNFIGSRGAKPGVTKEKRIKYAKEVLQKEMLPH VGVSDFCETKKAYFLGYMVHRLLLAALGRRELDDRDHYGNKRLDLAGPLL AFLFRGMFKNLLKEVRIYAQKFIDRGKDFNLELAIKTRIISDGLKYSLAT GNWGDQKKAHQARAGVSQVLNRLTFASTLSHLRRLNSPIGRDGKLAKPRQ LHNTLWGMVCPAETPEGHAVGLVKNLALMAYISVGSQPSPILEFLEEWSM ENLEEISPAAIADATKIFVNGCWVGIHKDPEQLMNTLRKLRRQMDIIVSE VSMIRDIREREIRIYTDAGRICRPLLIVEKQKLLLKKRHIDQLKEREYNN YSWQDLVASGVVEYIDTLEEETVMLAMTPDDLQEKEVAYCSTYTHCEIHP SMILGVCASIIPFPDHNQSPRNTYQSAMGKQAMGVYITNFHVRMDTLAHV LYYPQKPLVTTRSMEYLRFRELPAGINSIVAIASYTGYNQEDSVIMNRSA VDRGFFRSVFYRSYKEQESKKGFDQEEVFEKPTRETCQGMRHAIYDKLDD DGLIAPGVRVSGDDVIIGKTVTLPENEDELESTNRRYTKRDCSTFLRTSE TGIVDQVMVTLNQEGYKFCKIRVRSVRIPQIGDKFASRHGQKGTCGIQYR QEDMPFTCEGITPDIIINPHAIPSRMTIGHLIECLQGKVSANKGEIGDAT PFNDAVNVQKISNLLSDYGYHLRGNEVLYNGFTGRKITSQIFIGPTYYQR LKHMVDDKIHSRARGPIQILNRQPMEGRSRDGGLRFGEMERDCQIAHGAA QFLRERLFEASDPYQVHVCNLCGIMAIANTRTHTYECRGCRNKTQISLVR MPYACKLLFQELMSMSIAPRMMSV A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak transkripciya Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku ionom magniyu Lokalizovanij u yadri LiteraturaAcker J Wintzerith M Vigneron M Kedinger C 1992 Primary structure of the second largest subunit of human RNA polymerase II or B J Mol Biol 226 1295 1299 PMID 1518060 DOI 10 1016 0022 2836 92 91071 V The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Kershnar E Wu S Y Chiang C M 1998 Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope tagged subunits of the multiprotein complexes J Biol Chem 273 34444 34453 PMID 9852112 DOI 10 1074 jbc 273 51 34444 Lee J H Skalnik D G 2008 Wdr82 is a C terminal domain binding protein that recruits the Setd1A Histone H3 Lys4 methyltransferase complex to transcription start sites of transcribed human genes Mol Cell Biol 28 609 618 PMID 17998332 DOI 10 1128 MCB 01356 07PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 7 chervnya 2017 Procitovano 30 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 20 serpnya 2017 Procitovano 30 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 4 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi