POLB (англ. DNA polymerase beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 335 амінокислот, а молекулярна маса — 38 178.
POLB | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | POLB, DNA polymerase beta | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 174760 MGI: 97740 HomoloGene: 2013 GeneCards: POLB | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | н/д | Хр. 8: 23.12 – 23.14 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSKRKAPQET | LNGGITDMLT | ELANFEKNVS | QAIHKYNAYR | KAASVIAKYP | ||||
HKIKSGAEAK | KLPGVGTKIA | EKIDEFLATG | KLRKLEKIRQ | DDTSSSINFL | ||||
TRVSGIGPSA | ARKFVDEGIK | TLEDLRKNED | KLNHHQRIGL | KYFGDFEKRI | ||||
PREEMLQMQD | IVLNEVKKVD | SEYIATVCGS | FRRGAESSGD | MDVLLTHPSF | ||||
TSESTKQPKL | LHQVVEQLQK | VHFITDTLSK | GETKFMGVCQ | LPSKNDEKEY | ||||
PHRRIDIRLI | PKDQYYCGVL | YFTGSDIFNK | NMRAHALEKG | FTINEYTIRP | ||||
LGVTGVAGEP | LPVDSEKDIF | DYIQWKYREP | KDRSE |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ліаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, синтез ДНК, реплікація ДНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію, іоном натрію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bennett R.A., Wilson D.M. III, Wong D., Demple B. (1997). Interaction of human apurinic endonuclease and DNA polymerase beta in the base excision repair pathway. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 7166—7169. PMID 9207062 DOI:10.1073/pnas.94.14.7166
- Matsumoto Y., Kim K., Katz D.S., Feng J.-A. (1998). Catalytic center of DNA polymerase beta for excision of deoxyribose phosphate groups. Biochemistry. 37: 6456—6464. PMID 9572863 DOI:10.1021/bi9727545
- Pelletier H., Sawaya M.R., Wolfle W., Wilson S.H., Kraut J. (1996). A structural basis for metal ion mutagenicity and nucleotide selectivity in human DNA polymerase beta. Biochemistry. 35: 12762—12777. PMID 8841119 DOI:10.1021/bi9529566
- Pelletier H., Sawaya M.R. (1996). Characterization of the metal ion binding helix-hairpin-helix motifs in human DNA polymerase beta by X-ray structural analysis. Biochemistry. 35: 12778—12787. PMID 8841120 DOI:10.1021/bi960790i
- Sawaya M.R., Prasad R., Wilson S.H., Kraut J., Pelletier H. (1997). Crystal structures of human DNA polymerase beta complexed with gapped and nicked DNA: evidence for an induced fit mechanism. Biochemistry. 36: 11205—11215. PMID 9287163 DOI:10.1021/bi9703812
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9174 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
POLB angl DNA polymerase beta bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 8 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 335 aminokislot a molekulyarna masa 38 178 POLBNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1BPX 1BPY 1BPZ 1MQ2 1MQ3 1TV9 1TVA 1ZJM 1ZJN 1ZQA 1ZQB 1ZQC 1ZQD 1ZQE 1ZQF 1ZQG 1ZQH 1ZQI 1ZQJ 1ZQK 1ZQL 1ZQM 1ZQN 1ZQO 1ZQP 1ZQQ 1ZQR 1ZQS 1ZQT 2FMP 2FMQ 2FMS 2I9G 2ISO 2ISP 2P66 2PXI 3C2K 3C2L 3C2M 3GDX 3ISB 3ISC 3ISD 3JPN 3JPO 3JPP 3JPQ 3JPR 3JPS 3JPT 3LK9 3MBY 3OGU 3RH4 3RH5 3RH6 3RJE 3RJF 3RJG 3RJH 3RJI 3RJJ 3RJK 3TFR 3TFS 4DO9 4DOA 4DOB 4DOC 4F5N 4F5O 4F5P 4F5Q 4F5R 4GXI 4GXJ 4GXK 4JWM 4JWN 4KLD 4KLE 4KLF 4KLG 4KLH 4KLI 4KLJ 4KLL 4KLM 4KLO 4KLQ 4KLS 4KLT 4KLU 4LVS 4M2Y 4M47 4M9G 4M9H 4M9J 4M9L 4M9N 4MF2 4MF8 4MFA 4MFC 4MFF 4NLK 4NLN 4NLZ 4NM1 4NM2 4NXZ 4NY8 4O5C 4O5E 4O5K 4O9M 4P2H 4PGQ 4PGX 4PGY 4PH5 4PHA 4PHD 4PHE 4PHP 4PPX 4R63 4R64 4R65 4R66 4RPX 4RPY 4RPZ 4RQ0 4RQ1 4RQ2 4RQ3 4RQ4 4RQ5 4RQ6 4RQ7 4RQ8 4RT2 4RT3 4TUP 4TUQ 4TUR 4TUS 4UAW 4UAY 4UAZ 4UB1 4UB2 4UB3 4UB4 4UB5 4UBB 4UBC 7ICE 7ICF 7ICG 7ICH 7ICI 7ICJ 7ICK 7ICL 7ICM 7ICN 7ICO 7ICP 7ICQ 7ICR 7ICS 7ICT 7ICU 7ICV 8ICA 8ICB 8ICC 8ICE 8ICF 8ICG 8ICH 8ICI 8ICJ 8ICK 8ICL 8ICM 8ICN 8ICO 8ICP 8ICQ 8ICR 8ICS 8ICT 8ICU 8ICV 8ICW 8ICX 8ICY 8ICZ 9ICA 9ICB 9ICC 9ICE 9ICF 9ICG 9ICH 9ICI 9ICJ 9ICK 9ICL 9ICM 9ICN 9ICO 9ICP 9ICQ 9ICR 9ICS 9ICT 9ICU 9ICV 9ICW 9ICX 9ICY 5BOL 5BOM 5BPC 5DB8 5DBB 5DBA 5DB7 5DBC 5DB9 5DB6 4YMN 4YN4 4YMO 4YMM 4Z6C 4Z6F 4Z6D 4Z6EIdentifikatoriSimvoliPOLB DNA polymerase betaZovnishni ID OMIM 174760 MGI 97740 HomoloGene 2013 GeneCards POLBOntologiya genaMolekulyarna funkciya transferase activity DNA binding nucleotidyltransferase activity microtubule binding zv yazuvannya z ionom metalu damaged DNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding lyase activity enzyme binding DNA directed DNA polymerase activity DNA apurinic or apyrimidinic site endonuclease activity DNK polimeraza DNA polymerase activityKlitinna komponenta citoplazma nukleoplazma spindle microtubule mikrotrubochka klitinne yadro GO 0009327 protein containing complexBiologichnij proces neuron apoptotic process somatic hypermutation of immunoglobulin genes pyrimidine dimer repair nucleotide excision repair DNA gap filling DNA dependent DNA replication DNA biosynthetic process homeostasis of number of cells response to hyperoxia GO 0010260 starinnya lyudini spleen development salivary gland morphogenesis cellular response to DNA damage stimulus immunoglobulin heavy chain V D J recombination replikaciya DNK somatic diversification of immunoglobulins base excision repair gap filling intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage response to ethanol inflammatory response lymph node development response to gamma radiation GO 0100026 Reparaciya DNK GO 0097285 apoptoz base excision repair base excision repair DNA ligation protein deubiquitination double strand break repair via nonhomologous end joiningDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez5423 18970Ensembl ENSG00000070501 ENSMUSG00000031536UniProt P06746 Q8K409RefSeq mRNK NM 002690NM 011130RefSeq bilok NP 002681NP 035260Lokus UCSC n dHr 8 23 12 23 14 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSKRKAPQETLNGGITDMLTELANFEKNVSQAIHKYNAYRKAASVIAKYP HKIKSGAEAKKLPGVGTKIAEKIDEFLATGKLRKLEKIRQDDTSSSINFL TRVSGIGPSAARKFVDEGIKTLEDLRKNEDKLNHHQRIGLKYFGDFEKRI PREEMLQMQDIVLNEVKKVDSEYIATVCGSFRRGAESSGDMDVLLTHPSF TSESTKQPKLLHQVVEQLQKVHFITDTLSKGETKFMGVCQLPSKNDEKEY PHRRIDIRLIPKDQYYCGVLYFTGSDIFNKNMRAHALEKGFTINEYTIRP LGVTGVAGEPLPVDSEKDIFDYIQWKYREPKDRSE A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz liaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak poshkodzhennya DNK reparaciya DNK sintez DNK replikaciya DNK acetilyuvannya Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv DNK ionom magniyu ionom natriyu Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Bennett R A Wilson D M III Wong D Demple B 1997 Interaction of human apurinic endonuclease and DNA polymerase beta in the base excision repair pathway Proc Natl Acad Sci U S A 94 7166 7169 PMID 9207062 DOI 10 1073 pnas 94 14 7166 Matsumoto Y Kim K Katz D S Feng J A 1998 Catalytic center of DNA polymerase beta for excision of deoxyribose phosphate groups Biochemistry 37 6456 6464 PMID 9572863 DOI 10 1021 bi9727545 Pelletier H Sawaya M R Wolfle W Wilson S H Kraut J 1996 A structural basis for metal ion mutagenicity and nucleotide selectivity in human DNA polymerase beta Biochemistry 35 12762 12777 PMID 8841119 DOI 10 1021 bi9529566 Pelletier H Sawaya M R 1996 Characterization of the metal ion binding helix hairpin helix motifs in human DNA polymerase beta by X ray structural analysis Biochemistry 35 12778 12787 PMID 8841120 DOI 10 1021 bi960790i Sawaya M R Prasad R Wilson S H Kraut J Pelletier H 1997 Crystal structures of human DNA polymerase beta complexed with gapped and nicked DNA evidence for an induced fit mechanism Biochemistry 36 11205 11215 PMID 9287163 DOI 10 1021 bi9703812PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 9174 angl Procitovano 7 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 24 serpnya 2017 Procitovano 7 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 8 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi