PATJ (англ. PATJ, crumbs cell polarity complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 801 амінокислот, а молекулярна маса — 196 368.
PATJ | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PATJ, Cipp, InaD-like, hINADL, INADL, crumbs cell polarity complex component, PATJ crumbs cell polarity complex component | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 603199 MGI: 1277960 HomoloGene: 72199 GeneCards: PATJ | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
ожиріння | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 61.74 – 62.18 Mb | Хр. 4: 98.28 – 98.61 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MPENPATDKL | QVLQVLDRLK | MKLQEKGDTS | QNEKLSMFYE | TLKSPLFNQI | ||||
LTLQQSIKQL | KGQLNHIPSD | CSANFDFSRK | GLLVFTDGSI | TNGNVHRPSN | ||||
NSTVSGLFPW | TPKLGNEDFN | SVIQQMAQGR | QIEYIDIERP | STGGLGFSVV | ||||
ALRSQNLGKV | DIFVKDVQPG | SVADRDQRLK | ENDQILAINH | TPLDQNISHQ | ||||
QAIALLQQTT | GSLRLIVARE | PVHTKSSTSS | SLNDTTLPET | VCWGHVEEVE | ||||
LINDGSGLGF | GIVGGKTSGV | VVRTIVPGGL | ADRDGRLQTG | DHILKIGGTN | ||||
VQGMTSEQVA | QVLRNCGNSV | RMLVARDPAG | DISVTPPAPA | ALPVALPTVA | ||||
SKGPGSDSSL | FETYNVELVR | KDGQSLGIRI | VGYVGTSHTG | EASGIYVKSI | ||||
IPGSAAYHNG | HIQVNDKIVA | VDGVNIQGFA | NHDVVEVLRN | AGQVVHLTLV | ||||
RRKTSSSTSP | LEPPSDRGTV | VEPLKPPALF | LTGAVETETN | VDGEDEEIKE | ||||
RIDTLKNDNI | QALEKLEKVP | DSPENELKSR | WENLLGPDYE | VMVATLDTQI | ||||
ADDAELQKYS | KLLPIHTLRL | GVEVDSFDGH | HYISSIVSGG | PVDTLGLLQP | ||||
EDELLEVNGM | QLYGKSRREA | VSFLKEVPPP | FTLVCCRRLF | DDEASVDEPR | ||||
RTETSLPETE | VDHNMDVNTE | EDDDGELALW | SPEVKIVELV | KDCKGLGFSI | ||||
LDYQDPLDPT | RSVIVIRSLV | ADGVAERSGG | LLPGDRLVSV | NEYCLDNTSL | ||||
AEAVEILKAV | PPGLVHLGIC | KPLVEDNEEE | SCYILHSSSN | EDKTEFSGTI | ||||
HDINSSLILE | APKGFRDEPY | FKEELVDEPF | LDLGKSFHSQ | QKEIEQSKEA | ||||
WEMHEFLTPR | LQEMDEEREI | LVDEEYELYQ | DPSPSMELYP | LSHIQEATPV | ||||
PSVNELHFGT | QWLHDNEPSE | SQEARTGRTV | YSQEAQPYGY | CPENVMKENF | ||||
VMESLPSVPS | TEGNSQQGRF | DDLENLNSLA | KTSLDLGMIP | NDVQGPSLLI | ||||
DLPVVAQRRE | QEDLPLYQHQ | ATRVISKASA | YTGMLSSRYA | TDTCELPERE | ||||
EGEGEETPNF | SHWGPPRIVE | IFREPNVSLG | ISIVGGQTVI | KRLKNGEELK | ||||
GIFIKQVLED | SPAGKTNALK | TGDKILEVSG | VDLQNASHSE | AVEAIKNAGN | ||||
PVVFIVQSLS | STPRVIPNVH | NKANKITGNQ | NQDTQEKKEK | RQGTAPPPMK | ||||
LPPPYKALTD | DSDENEEEDA | FTDQKIRQRY | ADLPGELHII | ELEKDKNGLG | ||||
LSLAGNKDRS | RMSIFVVGIN | PEGPAAADGR | MRIGDELLEI | NNQILYGRSH | ||||
QNASAIIKTA | PSKVKLVFIR | NEDAVNQMAV | TPFPVPSSSP | SSIEDQSGTE | ||||
PISSEEDGSV | EVGIKQLPES | ESFKLAVSQM | KQQKYPTKVS | FSSQEIPLAP | ||||
ASSYHSTDAD | FTGYGGFQAP | LSVDPATCPI | VPGQEMIIEI | SKGRSGLGLS | ||||
IVGGKDTPLN | AIVIHEVYEE | GAAARDGRLW | AGDQILEVNG | VDLRNSSHEE | ||||
AITALRQTPQ | KVRLVVYRDE | AHYRDEENLE | IFPVDLQKKA | GRGLGLSIVG | ||||
KRNGSGVFIS | DIVKGGAADL | DGRLIQGDQI | LSVNGEDMRN | ASQETVATIL | ||||
KCAQGLVQLE | IGRLRAGSWT | SARTTSQNSQ | GSQQSAHSSC | HPSFAPVITG | ||||
LQNLVGTKRV | SDPSQKNSGT | DMEPRTVEIN | RELSDALGIS | IAGGRGSPLG | ||||
DIPVFIAMIQ | ASGVAARTQK | LKVGDRIVSI | NGQPLDGLSH | ADVVNLLKNA | ||||
YGRIILQVVA | DTNISAIAAQ | LENMSTGYHL | GSPTAEHHPE | DTEEQLQMTA | ||||
D |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.
Література
- Philipp S., Flockerzi V. (1997). Molecular characterization of a novel PDZ domain protein with homology to INAD from Drosophila melanogaster. FEBS Lett. 413: 243—248. PMID 9280290 DOI:10.1016/S0014-5793(97)00877-6
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Roh M.H., Liu C.-J., Laurinec S., Margolis B. (2002). The carboxyl terminus of zona occludens-3 binds and recruits a mammalian homologue of discs lost to tight junctions. J. Biol. Chem. 277: 27501—27509. PMID 12021270 DOI:10.1074/jbc.M201177200
- Nakajima H., Tanoue T. (2011). Lulu2 regulates the circumferential actomyosin tensile system in epithelial cells through p114RhoGEF. J. Cell Biol. 195: 245—261. PMID 22006950 DOI:10.1083/jcb.201104118
- Li Y., Karnak D., Demeler B., Margolis B., Lavie A. (2004). Structural basis for L27 domain-mediated assembly of signaling and cell polarity complexes. EMBO J. 23: 2723—2733. PMID 15241471 DOI:10.1038/sj.emboj.7600294
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з PATJ переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 21 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
PATJ angl PATJ crumbs cell polarity complex component bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 801 aminokislot a molekulyarna masa 196 368 PATJNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1VF6 2D92 2DAZ 2DB5 2DLU 2DM8 2DMZ 2EHR 4Q2NIdentifikatoriSimvoliPATJ Cipp InaD like hINADL INADL crumbs cell polarity complex component PATJ crumbs cell polarity complex componentZovnishni ID OMIM 603199 MGI 1277960 HomoloGene 72199 GeneCards PATJPov yazani genetichni zahvoryuvannyaozhirinnya Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein bindingKlitinna komponenta citoplazma perinuclear region of cytoplasm klitinna membrana apical part of cell ekzosoma apical plasma membrane membrana bicellular tight junction centrosoma centr organizaciyi mikrotrubochok gialoplazma mizhklitinni kontakti GO 0009327 protein containing complexBiologichnij proces GO 0007243 intracellular signal transduction bicellular tight junction assemblyDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez10207 12695Ensembl ENSG00000132849 ENSMUSG00000061859UniProt Q8NI35 Q63ZW7RefSeq mRNK NM 005799 NM 176877 NM 176878 NM 001350145NM 001005784 NM 001005787 NM 007704 NM 172696 NM 001355177RefSeq bilok NP 795352 NP 001337074NP 001005784 NP 001005787 NP 031730 NP 766284 NP 001342106Lokus UCSC Hr 1 61 74 62 18 MbHr 4 98 28 98 61 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MPENPATDKLQVLQVLDRLKMKLQEKGDTSQNEKLSMFYETLKSPLFNQI LTLQQSIKQLKGQLNHIPSDCSANFDFSRKGLLVFTDGSITNGNVHRPSN NSTVSGLFPWTPKLGNEDFNSVIQQMAQGRQIEYIDIERPSTGGLGFSVV ALRSQNLGKVDIFVKDVQPGSVADRDQRLKENDQILAINHTPLDQNISHQ QAIALLQQTTGSLRLIVAREPVHTKSSTSSSLNDTTLPETVCWGHVEEVE LINDGSGLGFGIVGGKTSGVVVRTIVPGGLADRDGRLQTGDHILKIGGTN VQGMTSEQVAQVLRNCGNSVRMLVARDPAGDISVTPPAPAALPVALPTVA SKGPGSDSSLFETYNVELVRKDGQSLGIRIVGYVGTSHTGEASGIYVKSI IPGSAAYHNGHIQVNDKIVAVDGVNIQGFANHDVVEVLRNAGQVVHLTLV RRKTSSSTSPLEPPSDRGTVVEPLKPPALFLTGAVETETNVDGEDEEIKE RIDTLKNDNIQALEKLEKVPDSPENELKSRWENLLGPDYEVMVATLDTQI ADDAELQKYSKLLPIHTLRLGVEVDSFDGHHYISSIVSGGPVDTLGLLQP EDELLEVNGMQLYGKSRREAVSFLKEVPPPFTLVCCRRLFDDEASVDEPR RTETSLPETEVDHNMDVNTEEDDDGELALWSPEVKIVELVKDCKGLGFSI LDYQDPLDPTRSVIVIRSLVADGVAERSGGLLPGDRLVSVNEYCLDNTSL AEAVEILKAVPPGLVHLGICKPLVEDNEEESCYILHSSSNEDKTEFSGTI HDINSSLILEAPKGFRDEPYFKEELVDEPFLDLGKSFHSQQKEIEQSKEA WEMHEFLTPRLQEMDEEREILVDEEYELYQDPSPSMELYPLSHIQEATPV PSVNELHFGTQWLHDNEPSESQEARTGRTVYSQEAQPYGYCPENVMKENF VMESLPSVPSTEGNSQQGRFDDLENLNSLAKTSLDLGMIPNDVQGPSLLI DLPVVAQRREQEDLPLYQHQATRVISKASAYTGMLSSRYATDTCELPERE EGEGEETPNFSHWGPPRIVEIFREPNVSLGISIVGGQTVIKRLKNGEELK GIFIKQVLEDSPAGKTNALKTGDKILEVSGVDLQNASHSEAVEAIKNAGN PVVFIVQSLSSTPRVIPNVHNKANKITGNQNQDTQEKKEKRQGTAPPPMK LPPPYKALTDDSDENEEEDAFTDQKIRQRYADLPGELHIIELEKDKNGLG LSLAGNKDRSRMSIFVVGINPEGPAAADGRMRIGDELLEINNQILYGRSH QNASAIIKTAPSKVKLVFIRNEDAVNQMAVTPFPVPSSSPSSIEDQSGTE PISSEEDGSVEVGIKQLPESESFKLAVSQMKQQKYPTKVSFSSQEIPLAP ASSYHSTDADFTGYGGFQAPLSVDPATCPIVPGQEMIIEISKGRSGLGLS IVGGKDTPLNAIVIHEVYEEGAAARDGRLWAGDQILEVNGVDLRNSSHEE AITALRQTPQKVRLVVYRDEAHYRDEENLEIFPVDLQKKAGRGLGLSIVG KRNGSGVFISDIVKGGAADLDGRLIQGDQILSVNGEDMRNASQETVATIL KCAQGLVQLEIGRLRAGSWTSARTTSQNSQGSQQSAHSSCHPSFAPVITG LQNLVGTKRVSDPSQKNSGTDMEPRTVEINRELSDALGISIAGGRGSPLG DIPVFIAMIQASGVAARTQKLKVGDRIVSINGQPLDGLSHADVVNLLKNA YGRIILQVVADTNISAIAAQLENMSTGYHLGSPTAEHHPEDTEEQLQMTA D A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak polimorfizm Lokalizovanij u klitinnij membrani citoplazmi membrani klitinnih kontaktah shilnih kontaktah LiteraturaPhilipp S Flockerzi V 1997 Molecular characterization of a novel PDZ domain protein with homology to INAD from Drosophila melanogaster FEBS Lett 413 243 248 PMID 9280290 DOI 10 1016 S0014 5793 97 00877 6 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Roh M H Liu C J Laurinec S Margolis B 2002 The carboxyl terminus of zona occludens 3 binds and recruits a mammalian homologue of discs lost to tight junctions J Biol Chem 277 27501 27509 PMID 12021270 DOI 10 1074 jbc M201177200 Nakajima H Tanoue T 2011 Lulu2 regulates the circumferential actomyosin tensile system in epithelial cells through p114RhoGEF J Cell Biol 195 245 261 PMID 22006950 DOI 10 1083 jcb 201104118 Li Y Karnak D Demeler B Margolis B Lavie A 2004 Structural basis for L27 domain mediated assembly of signaling and cell polarity complexes EMBO J 23 2723 2733 PMID 15241471 DOI 10 1038 sj emboj 7600294PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z PATJ pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 6 kvitnya 2016 Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 21 serpnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 1 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi