NCAN (англ. Neurocan) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 321 амінокислот, а молекулярна маса — 143 093.
NCAN | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | NCAN, CSPG3, neurocan | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600826 MGI: 104694 HomoloGene: 3229 GeneCards: NCAN | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
біполярний афективний розлад | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 19: 19.21 – 19.25 Mb | Хр. 8: 70.55 – 70.57 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGAPFVWALG | LLMLQMLLFV | AGEQGTQDIT | DASERGLHMQ | KLGSGSVQAA | ||||
LAELVALPCL | FTLQPRPSAA | RDAPRIKWTK | VRTASGQRQD | LPILVAKDNV | ||||
VRVAKSWQGR | VSLPSYPRRR | ANATLLLGPL | RASDSGLYRC | QVVRGIEDEQ | ||||
DLVPLEVTGV | VFHYRSARDR | YALTFAEAQE | ACRLSSAIIA | APRHLQAAFE | ||||
DGFDNCDAGW | LSDRTVRYPI | TQSRPGCYGD | RSSLPGVRSY | GRRNPQELYD | ||||
VYCFARELGG | EVFYVGPARR | LTLAGARAQC | RRQGAALASV | GQLHLAWHEG | ||||
LDQCDPGWLA | DGSVRYPIQT | PRRRCGGPAP | GVRTVYRFAN | RTGFPSPAER | ||||
FDAYCFRAHH | PTSQHGDLET | PSSGDEGEIL | SAEGPPVREL | EPTLEEEEVV | ||||
TPDFQEPLVS | SGEEETLILE | EKQESQQTLS | PTPGDPMLAS | WPTGEVWLST | ||||
VAPSPSDMGA | GTAASSHTEV | APTDPMPRRR | GRFKGLNGRY | FQQQEPEPGL | ||||
QGGMEASAQP | PTSEAAVNQM | EPPLAMAVTE | MLGSGQSRSP | WADLTNEVDM | ||||
PGAGSAGGKS | SPEPWLWPPT | MVPPSISGHS | RAPVLELEKA | EGPSARPATP | ||||
DLFWSPLEAT | VSAPSPAPWE | AFPVATSPDL | PMMAMLRGPK | EWMLPHPTPI | ||||
STEANRVEAH | GEATATAPPS | PAAETKVYSL | PLSLTPTGQG | GEAMPTTPES | ||||
PRADFRETGE | TSPAQVNKAE | HSSSSPWPSV | NRNVAVGFVP | TETATEPTGL | ||||
RGIPGSESGV | FDTAESPTSG | LQATVDEVQD | PWPSVYSKGL | DASSPSAPLG | ||||
SPGVFLVPKV | TPNLEPWVAT | DEGPTVNPMD | STVTPAPSDA | SGIWEPGSQV | ||||
FEEAESTTLS | PQVALDTSIV | TPLTTLEQGD | KVGVPAMSTL | GSSSSQPHPE | ||||
PEDQVETQGT | SGASVPPHQS | SPLGKPAVPP | GTPTAASVGE | SASVSSGEPT | ||||
VPWDPSSTLL | PVTLGIEDFE | LEVLAGSPGV | ESFWEEVASG | EEPALPGTPM | ||||
NAGAEEVHSD | PCENNPCLHG | GTCNANGTMY | GCSCDQGFAG | ENCEIDIDDC | ||||
LCSPCENGGT | CIDEVNGFVC | LCLPSYGGSF | CEKDTEGCDR | GWHKFQGHCY | ||||
RYFAHRRAWE | DAEKDCRRRS | GHLTSVHSPE | EHSFINSFGH | ENTWIGLNDR | ||||
IVERDFQWTD | NTGLQFENWR | ENQPDNFFAG | GEDCVVMVAH | ESGRWNDVPC | ||||
NYNLPYVCKK | GTVLCGPPPA | VENASLIGAR | KAKYNVHATV | RYQCNEGFAQ | ||||
HHVATIRCRS | NGKWDRPQIV | CTKPRRSHRM | RRHHHHHQHH | HQHHHHKSRK | ||||
ERRKHKKHPT | EDWEKDEGNF | C |
Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, лектинами. Секретований назовні.
Література
- Prange C.K., Pennacchio L.A., Lieuallen K., Fan W., Lennon G.G. (1998). Characterization of the human neurocan gene, CSPG3. Gene. 221: 199—205. PMID 9795216 DOI:10.1016/S0378-1119(98)00455-7
- Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з NCAN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2465 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 23 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
NCAN angl Neurocan bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 19 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 321 aminokislot a molekulyarna masa 143 093 NCANIdentifikatoriSimvoliNCAN CSPG3 neurocanZovnishni ID OMIM 600826 MGI 104694 HomoloGene 3229 GeneCards NCANPov yazani genetichni zahvoryuvannyabipolyarnij afektivnij rozlad Ontologiya genaMolekulyarna funkciya calcium ion binding hyaluronic acid binding carbohydrate binding extracellular matrix structural constituentKlitinna komponenta Golgi lumen extracellular region lysosomal lumen GO 0005578 Pozaklitinna matricyaBiologichnij proces chondroitin sulfate catabolic process skeletal system development central nervous system development chondroitin sulfate biosynthetic process extracellular matrix organization dermatan sulfate biosynthetic process adgeziya klitinDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1463 13004Ensembl ENSG00000130287 ENSMUSG00000002341UniProt O14594 P55066RefSeq mRNK NM 004386NM 007789RefSeq bilok NP 004377NP 031815Lokus UCSC Hr 19 19 21 19 25 MbHr 8 70 55 70 57 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MGAPFVWALGLLMLQMLLFVAGEQGTQDITDASERGLHMQKLGSGSVQAA LAELVALPCLFTLQPRPSAARDAPRIKWTKVRTASGQRQDLPILVAKDNV VRVAKSWQGRVSLPSYPRRRANATLLLGPLRASDSGLYRCQVVRGIEDEQ DLVPLEVTGVVFHYRSARDRYALTFAEAQEACRLSSAIIAAPRHLQAAFE DGFDNCDAGWLSDRTVRYPITQSRPGCYGDRSSLPGVRSYGRRNPQELYD VYCFARELGGEVFYVGPARRLTLAGARAQCRRQGAALASVGQLHLAWHEG LDQCDPGWLADGSVRYPIQTPRRRCGGPAPGVRTVYRFANRTGFPSPAER FDAYCFRAHHPTSQHGDLETPSSGDEGEILSAEGPPVRELEPTLEEEEVV TPDFQEPLVSSGEEETLILEEKQESQQTLSPTPGDPMLASWPTGEVWLST VAPSPSDMGAGTAASSHTEVAPTDPMPRRRGRFKGLNGRYFQQQEPEPGL QGGMEASAQPPTSEAAVNQMEPPLAMAVTEMLGSGQSRSPWADLTNEVDM PGAGSAGGKSSPEPWLWPPTMVPPSISGHSRAPVLELEKAEGPSARPATP DLFWSPLEATVSAPSPAPWEAFPVATSPDLPMMAMLRGPKEWMLPHPTPI STEANRVEAHGEATATAPPSPAAETKVYSLPLSLTPTGQGGEAMPTTPES PRADFRETGETSPAQVNKAEHSSSSPWPSVNRNVAVGFVPTETATEPTGL RGIPGSESGVFDTAESPTSGLQATVDEVQDPWPSVYSKGLDASSPSAPLG SPGVFLVPKVTPNLEPWVATDEGPTVNPMDSTVTPAPSDASGIWEPGSQV FEEAESTTLSPQVALDTSIVTPLTTLEQGDKVGVPAMSTLGSSSSQPHPE PEDQVETQGTSGASVPPHQSSPLGKPAVPPGTPTAASVGESASVSSGEPT VPWDPSSTLLPVTLGIEDFELEVLAGSPGVESFWEEVASGEEPALPGTPM NAGAEEVHSDPCENNPCLHGGTCNANGTMYGCSCDQGFAGENCEIDIDDC LCSPCENGGTCIDEVNGFVCLCLPSYGGSFCEKDTEGCDRGWHKFQGHCY RYFAHRRAWEDAEKDCRRRSGHLTSVHSPEEHSFINSFGHENTWIGLNDR IVERDFQWTDNTGLQFENWRENQPDNFFAGGEDCVVMVAHESGRWNDVPC NYNLPYVCKKGTVLCGPPPAVENASLIGARKAKYNVHATVRYQCNEGFAQ HHVATIRCRSNGKWDRPQIVCTKPRRSHRMRRHHHHHQHHHQHHHHKSRK ERRKHKKHPTEDWEKDEGNFC A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak klitinna adgeziya Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionom kalciyu lektinami Sekretovanij nazovni LiteraturaPrange C K Pennacchio L A Lieuallen K Fan W Lennon G G 1998 Characterization of the human neurocan gene CSPG3 Gene 221 199 205 PMID 9795216 DOI 10 1016 S0378 1119 98 00455 7 Halim A Ruetschi U Larson G Nilsson J 2013 LC MS MS characterization of O glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins J Proteome Res 12 573 584 PMID 23234360 DOI 10 1021 pr300963hPrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z NCAN pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 2465 angl Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 23 zhovtnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 19 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi