LRRC8D

LRRC8D (англ. Leucine rich repeat containing 8 family member D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 858 амінокислот, а молекулярна маса — 98 201.

LRRC8D
Ідентифікатори
Символи	LRRC8D, LRRC5, leucine-rich repeat containing 8 family member D, leucine rich repeat containing 8 family member D, leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D, HsLRRC8D
Зовнішні ІД	OMIM: 612890 MGI: 1922368 HomoloGene: 10004 GeneCards: LRRC8D
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • volume-sensitive anion channel activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • іонні канали • клітинна мембрана Біологічний процес • anion transmembrane transport • ion transport • regulation of anion transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • трансмембранний транспорт • GO:0015915 транспорт • cell volume homeostasis • inorganic anion transport • taurine transport • aspartate transmembrane transport • cellular response to osmotic stress Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55144	231549
Ensembl	ENSG00000171492	ENSMUSG00000046079
UniProt	Q7L1W4	Q8BGR2
RefSeq (мРНК)	NM_001134479 NM_018103	NM_001122768 NM_178701
RefSeq (білок)	NP_001127951 NP_060573	NP_001116240 NP_848816
Локус (UCSC)	Хр. 1: 89.82 – 89.94 Mb	Хр. 5: 105.85 – 105.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFTLAEVASL		NDIQPTYRIL		KPWWDVFMDY		LAVVMLMVAI		FAGTMQLTKD
QVVCLPVLPS		PVNSKAHTPP		GNAEVTTNIP		KMEAATNQDQ		DGRTTNDISF
GTSAVTPDIP		LRATYPRTDF		ALPNQEAKKE		KKDPTGRKTN		LDFQQYVFIN
QMCYHLALPW		YSKYFPYLAL		IHTIILMVSS		NFWFKYPKTC		SKVEHFVSIL
GKCFESPWTT		KALSETACED		SEENKQRITG		AQTLPKHVST		SSDEGSPSAS
TPMINKTGFK		FSAEKPVIEV		PSMTILDKKD		GEQAKALFEK		VRKFRAHVED
SDLIYKLYVV		QTVIKTAKFI		FILCYTANFV		NAISFEHVCK		PKVEHLIGYE
VFECTHNMAY		MLKKLLISYI		SIICVYGFIC		LYTLFWLFRI		PLKEYSFEKV
REESSFSDIP		DVKNDFAFLL		HMVDQYDQLY		SKRFGVFLSE		VSENKLREIS
LNHEWTFEKL		RQHISRNAQD		KQELHLFMLS		GVPDAVFDLT		DLDVLKLELI
PEAKIPAKIS		QMTNLQELHL		CHCPAKVEQT		AFSFLRDHLR		CLHVKFTDVA
EIPAWVYLLK		NLRELYLIGN		LNSENNKMIG		LESLRELRHL		KILHVKSNLT
KVPSNITDVA		PHLTKLVIHN		DGTKLLVLNS		LKKMMNVAEL		ELQNCELERI
PHAIFSLSNL		QELDLKSNNI		RTIEEIISFQ		HLKRLTCLKL		WHNKIVTIPP
SITHVKNLES		LYFSNNKLES		LPVAVFSLQK		LRCLDVSYNN		ISMIPIEIGL
LQNLQHLHIT		GNKVDILPKQ		LFKCIKLRTL		NLGQNCITSL		PEKVGQLSQL
TQLELKGNCL		DRLPAQLGQC		RMLKKSGLVV		EDHLFDTLPL		EVKEALNQDI
NIPFANGI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Abascal F., Zardoya R. (2012). LRRC8 proteins share a common ancestor with pannexins, and may form hexameric channels involved in cell-cell communication. Bioessays. 34: 551—560. PMID 22532330 DOI:10.1002/bies.201100173
• Lee C.C., Freinkman E., Sabatini D.M., Ploegh H.L. (2014). The protein synthesis inhibitor blasticidin S enters mammalian cells via leucine-rich repeat-containing protein 8D. J. Biol. Chem. 289: 17124—17131. PMID 24782309 DOI:10.1074/jbc.M114.571257

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
4. (англ.) . Архів оригіналу за 8 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1