LBP англ Lipopolysaccharide binding protein білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому пле

LBP (англ. Lipopolysaccharide binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 481 амінокислот, а молекулярна маса — 53 384.

LBP

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4M4D

Ідентифікатори

Символи

LBP, BPIFD2, lipopolysaccharide binding protein

Зовнішні ІД

OMIM: 151990 MGI: 1098776 HomoloGene: 3055 GeneCards: LBP

Пов'язані генетичні захворювання

періодонтит

Онтологія гена
Молекулярна функція	• lipoteichoic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipid binding • signaling receptor binding • lipopolysaccharide binding • ліпопептидний зв'язок
Клітинна компонента	• мембрана • екзосома • extracellular region • cell surface • міжклітинний простір
Біологічний процес	• detection of molecule of bacterial origin • lipid transport • toll-like receptor 4 signaling pathway • процес імунної системи • leukocyte chemotaxis involved in inflammatory response • cellular defense response • cellular response to lipoteichoic acid • defense response to bacterium • GO:0015921 lipopolysaccharide transport • positive regulation of interleukin-8 production • positive regulation of interleukin-6 production • positive regulation of neutrophil chemotaxis • positive regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway • positive regulation of chemokine production • negative regulation of tumor necrosis factor production • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • Опсонізація • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • positive regulation of tumor necrosis factor production • response to lipopolysaccharide • macrophage activation involved in immune response • positive regulation of respiratory burst involved in inflammatory response • acute-phase response • вроджений імунітет • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • cellular response to lipopolysaccharide • positive regulation of macrophage activation • toll-like receptor signaling pathway • macromolecule localization • positive regulation of cytolysis • GO:0015915 транспорт • cytokine-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3929


16803

Ensembl


ENSG00000129988


ENSMUSG00000016024

UniProt


P18428


Q61805

RefSeq (мРНК)


NM_004139


NM_008489

RefSeq (білок)


NP_004130


NP_032515

Локус (UCSC)

Хр. 20: 38.35 – 38.38 Mb

Хр. 2: 158.15 – 158.17 Mb

PubMed search

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGALARALPS	ILLALLLTST	PEALGANPGL	VARITDKGLQ	YAAQEGLLAL
QSELLRITLP	DFTGDLRIPH	VGRGRYEFHS	LNIHSCELLH	SALRPVPGQG
LSLSISDSSI	RVQGRWKVRK	SFFKLQGSFD	VSVKGISISV	NLLLGSESSG
RPTVTASSCS	SDIADVEVDM	SGDLGWLLNL	FHNQIESKFQ	KVLESRICEM
IQKSVSSDLQ	PYLQTLPVTT	EIDSFADIDY	SLVEAPRATA	QMLEVMFKGE
IFHRNHRSPV	TLLAAVMSLP	EEHNKMVYFA	ISDYVFNTAS	LVYHEEGYLN
FSITDDMIPP	DSNIRLTTKS	FRPFVPRLAR	LYPNMNLELQ	GSVPSAPLLN
FSPGNLSVDP	YMEIDAFVLL	PSSSKEPVFR	LSVATNVSAT	LTFNTSKITG
FLKPGKVKVE	LKESKVGLFN	AELLEALLNY	YILNTFYPKF	NDKLAEGFPL
PLLKRVQLYD	LGLQIHKDFL	FLGANVQYMR	V

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, . Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транспорт, транспорт ліпідів. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

Hubacek J.A., Buchler C., Aslanidis C., Schmitz G. (1997). The genomic organization of the genes for human lipopolysaccharide binding protein (LBP) and bactericidal permeability increasing protein (BPI) is highly conserved. Biochem. Biophys. Res. Commun. 236: 427—430. PMID 9240454 DOI:10.1006/bbrc.1997.6970
Wright S.D., Ramos R.A., Tobias P.S., Ulevitch R.J., Mathison J.C. (1990). CD14, a receptor for complexes of lipopolysaccharide (LPS) and LPS binding protein. Science. 249: 1431—1433. PMID 1698311 DOI:10.1126/science.1698311
Jerala R. (2007). Structural biology of the LPS recognition. Int. J. Med. Microbiol. 297: 353—363. PMID 17481951 DOI:10.1016/j.ijmm.2007.04.001
Tsukamoto H., Fukudome K., Takao S., Tsuneyoshi N., Kimoto M. (2010). Lipopolysaccharide-binding protein-mediated Toll-like receptor 4 dimerization enables rapid signal transduction against lipopolysaccharide stimulation on membrane-associated CD14-expressing cells. Int. Immunol. 22: 271—280. PMID 20133493 DOI:10.1093/intimm/dxq005
Long J.Y., Liu J.Q., Xue Y.N., Wang H.X. (1998). Cloning and sequencing of human lipopolysaccharide-binding protein gene. Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Jin Zhan. 25: 469—471.

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з LBP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6517 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url ()
UniProt, P18428 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з LBP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6517 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url ()

[UniProt-5] UniProt, P18428 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.