HLA-A

HLA-A (англ. HLA class I histocompatibility antigen, A-3 alpha chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 365 амінокислот, а молекулярна маса — 40 841.

HLA-A
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2XPG, 3RL1, 3RL2,%%s2BCK, 3I6L, 3NFN, 3QZW, 3VXM, 3VXN, 3VXO, 3VXP, 3VXR, 3VXS, 3VXU, 3W0W, 3WL9, 3WLB, 4F7M, 4F7P, 4F7T, 4WU5, 4WU7, 5HGA, 5HGD, 5HGB, 5HGH,%%s1Q94, 1QVO, 1X7Q, 2HN7, 4MJ5, 4MJ6, 4N8V, 4UQ2,%%s1W72, 3BO8, 4NQV, 4NQX, 5BRZ, 5BS0,%%s1AKJ, 1AO7, 1AQD, 1B0G, 1B0R, 1BD2, 1DUY, 1DUZ, 1EEY, 1EEZ, 1HHG, 1HHH, 1HHI, 1HHJ, 1HHK, 1HLA, 1I1F, 1I1Y, 1I4F, 1I7R, 1I7T, 1I7U, 1IM3, 1JF1, 1JHT, 1LP9, 1OGA, 1P7Q, 1QEW, 1QR1, 1QRN, 1QSE, 1QSF, 1S8D, 1S9W, 1S9X, 1S9Y, 1T1W, 1T1X, 1T1Y, 1T1Z, 1T20, 1T21, 1T22, 1TVB, 1TVH, 2AV1, 2AV7, 2BNQ, 2BNR, 2C7U, 2CLR, 2F53, 2F54, 2GIT, 2GJ6, 2GT9, 2GTW, 2GTZ, 2GUO, 2J8U, 2JCC, 2P5E, 2P5W, 2PYE, 2UWE, 2V2W, 2V2X, 2VLJ, 2VLK, 2VLL, 2VLR, 2X4N, 2X4O, 2X4P, 2X4Q, 2X4R, 2X4S, 2X4T, 2X4U, 2X70, 3BGM, 3BH8, 3BH9, 3BHB, 3D25, 3D39, 3D3V, 3FQN, 3FQR, 3FQT, 3FQU, 3FQW, 3FQX, 3FT2, 3FT3, 3FT4, 3GIV, 3GJF, 3GSN, 3GSO, 3GSQ, 3GSR, 3GSU, 3GSV, 3GSW, 3GSX, 3H7B, 3H9H, 3H9S, 3HAE, 3HLA, 3HPJ, 3I6G, 3I6K, 3IXA, 3KLA, 3MGO, 3MGT, 3MR9, 3MRB, 3MRC, 3MRD, 3MRF, 3MRG, 3MRH, 3MRI, 3MRJ, 3MRK, 3MRL, 3MRM, 3MRN, 3MRO, 3MRP, 3MRQ, 3MRR, 3MYJ, 3O3A, 3O3B, 3O3D, 3O3E, 3PWJ, 3PWL, 3PWN, 3PWP, 3QDG, 3QDJ, 3QDM, 3QEQ, 3QFD, 3QFJ, 3REW, 3TO2, 3UTQ, 3UTS, 3UTT, 3V5D, 3V5H, 3V5K, 4E5X, 4EMZ, 4EN2, 4EUP, 4FTV, 4GKN, 4GKS, 4I4W, 4JFD, 4JFE, 4JFF, 4JFO, 4JFP, 4JFQ, 4K7F, 4L29, 4L3C, 4L3E, 4MNQ, 4NNX, 4NNY, 4NO0, 4NO2, 4NO3, 4NO5, 4OV5, 4QOK, 4U6X, 4U6Y, 4UQ3, 4WJ5, 4WUU, 5EU3, 5EU5, 5EU4, 5D2L, 5D2N, 5EU6, 5HHQ, 5HHO, 5HHM, 5C09, 5C0F, 5E9D, 5C0G, 5C0A, 4ZEZ, 5C0I, 5D9S, 5HYJ, 5C0H, 5C0J, 5C0E, 5C0C, 5C0B, 5C07, 5C0D, 5C08, 5HHN,%%s1HSB, 1TMC, 2HLA, 4HWZ, 4HX1, 4I48
Ідентифікатори
Символи	HLA-A, Aw-33, Aw-74, major histocompatibility complex, class I, A, HLA-A11, HLA-A33, HLA-DQB1, HLA-DRB1
Зовнішні ІД	OMIM: 142800 MGI: 95931 HomoloGene: 128352 GeneCards: HLA-A
Онтологія гена Молекулярна функція • beta-2-microglobulin binding • TAP binding • peptide antigen binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • phagocytic vesicle membrane • комплекс Ґольджі • early endosome membrane • Golgi membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • cell surface • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • MHC class I protein complex • мембрана • recycling endosome membrane • endoplasmic reticulum membrane • екзосома Біологічний процес • antigen processing and presentation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent • type I interferon signaling pathway • regulation of immune response • GO:0022415 viral process • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • Убіквітин-залежний протеоліз • T cell mediated cytotoxicity • CD8-positive, alpha-beta T cell activation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I • positive regulation of T cell mediated cytotoxicity • T cell mediated cytotoxicity directed against tumor cell target • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I • адаптивна імунна відповідь Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3105	15013
Ensembl	ENSG00000206505 ENSG00000224320 ENSG00000206503 ENSG00000223980 ENSG00000229215 ENSG00000227715 ENSG00000235657 ENSG00000231834	ENSMUSG00000091705
UniProt	P04439 Q5SUL5	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001242758 NM_002116	NM_010392 NM_001368740
RefSeq (білок)	NP_001229687 NP_002107 NP_001229687.1	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 29.94 – 29.95 Mb	Хр. 17: 35.56 – 35.57 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVMAPRTLL		LLLSGALALT		QTWAGSHSMR		YFFTSVSRPG		RGEPRFIAVG
YVDDTQFVRF		DSDAASQRME		PRAPWIEQEG		PEYWDQETRN		VKAQSQTDRV
DLGTLRGYYN		QSEAGSHTIQ		IMYGCDVGSD		GRFLRGYRQD		AYDGKDYIAL
NEDLRSWTAA		DMAAQITKRK		WEAAHEAEQL		RAYLDGTCVE		WLRRYLENGK
ETLQRTDPPK		THMTHHPISD		HEATLRCWAL		GFYPAEITLT		WQRDGEDQTQ
DTELVETRPA		GDGTFQKWAA		VVVPSGEEQR		YTCHVQHEGL		PKPLTLRWEL
SSQPTIPIVG		IIAGLVLLGA		VITGAVVAAV		MWRRKSSDRK		GGSYTQAASS
DSAQGSDVSL		TACKV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у мембрані.

Література

• Strachan T., Sodoyer R., Damotte M., Jordan B.R. (1984). Complete nucleotide sequence of a functional class I HLA gene, HLA-A3: implications for the evolution of HLA genes. EMBO J. 3: 887—894. PMID 6609814
• Cowan E.P., Jordan B.E., Coligan J.E. (1985). Molecular cloning and DNA sequence analysis of genes encoding cytotoxic T lymphocyte-defined HLA-A3 subtypes: the E1 subtype. J. Immunol. 135: 2835—2841. PMID 2993417

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
4. (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 6