GGPS1 (англ. Geranylgeranyl diphosphate synthase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 300 амінокислот, а молекулярна маса — 34 871.
GGPS1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | GGPS1, GGPPS, GGPPS1, geranylgeranyl diphosphate synthase 1, MDHLO, MUDHLOV | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606982 MGI: 1341724 HomoloGene: 31267 GeneCards: GGPS1 | ||||||||||||||||
2.5.1.1 | |||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
Геранілгеранілпірофосфат, minodronic acid | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 235.33 – 235.34 Mb | Хр. 13: 14.23 – 14.24 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEKTQETVQR | ILLEPYKYLL | QLPGKQVRTK | LSQAFNHWLK | VPEDKLQIII | ||||
EVTEMLHNAS | LLIDDIEDNS | KLRRGFPVAH | SIYGIPSVIN | SANYVYFLGL | ||||
EKVLTLDHPD | AVKLFTRQLL | ELHQGQGLDI | YWRDNYTCPT | EEEYKAMVLQ | ||||
KTGGLFGLAV | GLMQLFSDYK | EDLKPLLNTL | GLFFQIRDDY | ANLHSKEYSE | ||||
NKSFCEDLTE | GKFSFPTIHA | IWSRPESTQV | QNILRQRTEN | IDIKKYCVHY | ||||
LEDVGSFEYT | RNTLKELEAK | AYKQIDARGG | NPELVALVKH | LSKMFKEENE | ||||
Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі як ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Kuzuguchi T., Morita Y., Sagami I., Sagami H., Ogura K. (1999). Human geranylgeranyl diphosphate synthase. cDNA cloning and expression. J. Biol. Chem. 274: 5888—5894. PMID 10026212 DOI:10.1074/jbc.274.9.5888
- Kainou T., Kawamura K., Tanaka K., Matsuda H., Kawamukai M. (1999). Identification of the GGPS1 genes encoding geranylgeranyl diphosphate synthases from mouse and human. Biochim. Biophys. Acta. 1437: 333—340. PMID 10101267 DOI:10.1016/S1388-1981(99)00028-1
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kavanagh K.L., Dunford J.E., Bunkoczi G., Russell R.G., Oppermann U. (2006). The crystal structure of human geranylgeranyl pyrophosphate synthase reveals a novel hexameric arrangement and inhibitory product binding. J. Biol. Chem. 281: 22004—22012. PMID 16698791 DOI:10.1074/jbc.M602603200
Примітки
- Сполуки, які фізично взаємодіють з GGPS1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 19 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до . |
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
GGPS1 angl Geranylgeranyl diphosphate synthase 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 300 aminokislot a molekulyarna masa 34 871 GGPS1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2Q80IdentifikatoriSimvoliGGPS1 GGPPS GGPPS1 geranylgeranyl diphosphate synthase 1 MDHLO MUDHLOVZovnishni ID OMIM 606982 MGI 1341724 HomoloGene 31267 GeneCards GGPS12 5 1 1Reaguye na spolukuGeranilgeranilpirofosfat minodronic acid Ontologiya genaMolekulyarna funkciya transferase activity farnesyltranstransferase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding zv yazuvannya z ionom metalu dimethylallyltranstransferase activity geranyltranstransferase activity identical protein bindingKlitinna komponenta citoplazma gialoplazmaBiologichnij proces cholesterol biosynthetic process farnesyl diphosphate biosynthetic process geranyl diphosphate biosynthetic process geranylgeranyl diphosphate biosynthetic process isoprenoid biosynthetic process isoprenoid metabolic process regulation of cholesterol biosynthetic processDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez9453 14593Ensembl ENSG00000152904 ENSMUSG00000021302UniProt O95749 Q9WTN0RefSeq mRNK NM 001037277 NM 001037278 NM 004837 NM 001371477 NM 001371478NM 010282 NM 001331119 NM 001331176 NM 001331177 NM 001331178NM 001331180RefSeq bilok NP 001032354 NP 001032355 NP 001358406 NP 001358407 NP 004828NP 001032354 1NP 001318048 NP 001318105 NP 001318106 NP 001318107 NP 001318109NP 034412Lokus UCSC Hr 1 235 33 235 34 MbHr 13 14 23 14 24 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MEKTQETVQRILLEPYKYLLQLPGKQVRTKLSQAFNHWLKVPEDKLQIII EVTEMLHNASLLIDDIEDNSKLRRGFPVAHSIYGIPSVINSANYVYFLGL EKVLTLDHPDAVKLFTRQLLELHQGQGLDIYWRDNYTCPTEEEYKAMVLQ KTGGLFGLAVGLMQLFSDYKEDLKPLLNTLGLFFQIRDDYANLHSKEYSE NKSFCEDLTEGKFSFPTIHAIWSRPESTQVQNILRQRTENIDIKKYCVHY LEDVGSFEYTRNTLKELEAKAYKQIDARGGNPELVALVKHLSKMFKEENE A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do transferaz Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak acetilyaciya Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom magniyu Lokalizovanij u citoplazmi LiteraturaKuzuguchi T Morita Y Sagami I Sagami H Ogura K 1999 Human geranylgeranyl diphosphate synthase cDNA cloning and expression J Biol Chem 274 5888 5894 PMID 10026212 DOI 10 1074 jbc 274 9 5888 Kainou T Kawamura K Tanaka K Matsuda H Kawamukai M 1999 Identification of the GGPS1 genes encoding geranylgeranyl diphosphate synthases from mouse and human Biochim Biophys Acta 1437 333 340 PMID 10101267 DOI 10 1016 S1388 1981 99 00028 1 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Kavanagh K L Dunford J E Bunkoczi G Russell R G Oppermann U 2006 The crystal structure of human geranylgeranyl pyrophosphate synthase reveals a novel hexameric arrangement and inhibitory product binding J Biol Chem 281 22004 22012 PMID 16698791 DOI 10 1074 jbc M602603200PrimitkiSpoluki yaki fizichno vzayemodiyut z GGPS1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 19 lipnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 17 serpnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 1 Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi