DEFB1

DEFB1 (англ. Defensin beta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 68 амінокислот, а молекулярна маса — 7 420.

DEFB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1E4S, 1IJU, 1IJV, 1KJ5, 2NLB, 2NLC, 2NLD, 2NLE, 2NLF, 2NLG, 2NLH, 2NLP, 2NLQ, 2NLS, 2PLZ
Ідентифікатори
Символи	DEFB1, BD1, DEFB-1, DEFB101, HBD1, defensin beta 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602056 MGI: 1096878 HomoloGene: 88476 GeneCards: DEFB1
Онтологія гена Молекулярна функція • CCR6 chemokine receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • Golgi lumen • extracellular region • екзосома • sperm midpiece • міжклітинний простір • extrinsic component of membrane • microvesicle • мембрана Біологічний процес • хемотаксис • G protein-coupled receptor signaling pathway • defense response • innate immune response in mucosa • acute inflammatory response • response to bacterium • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • response to testosterone • positive regulation of flagellated sperm motility involved in capacitation • defense response to bacterium • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source • cAMP-mediated signaling • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • antimicrobial humoral response • вроджений імунітет • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1672	13214
Ensembl	ENSG00000164825 ENSG00000284881	ENSMUSG00000044748
UniProt	P60022	P56386
RefSeq (мРНК)	NM_005218	NM_007843
RefSeq (білок)	NP_005209	NP_031869
Локус (UCSC)	Хр. 8: 6.87 – 6.88 Mb	Хр. 8: 22.27 – 22.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRTSYLLLFT		LCLLLSEMAS		GGNFLTGLGH		RSDHYNCVSS		GGQCLYSACP
IFTKIQGTCY		RGKAKCCK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, . Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Liu L., Zhao C., Heng H.H.Q., Ganz T. (1997). The human beta-defensin-1 and alpha-defensins are encoded by adjacent genes: two peptide families with differing disulfide topology share a common ancestry. Genomics. 43: 316—320. PMID 9268634 DOI:10.1006/geno.1997.4801
• McCray P.B. Jr., Bentley L. (1997). Human airway epithelia express a beta-defensin. Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 16: 343—349. PMID 9070620 DOI:10.1165/ajrcmb.16.3.9070620
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bensch K.W., Raida M., Maegert H.-J., Schulz-Knappe P., Forssmann W.-G. (1995). hBD-1: a novel beta-defensin from human plasma. FEBS Lett. 368: 331—335. PMID 7628632 DOI:10.1016/0014-5793(95)00687-5
• Kluever E., Schulz A., Forssmann W.-G., Adermann K. (2002). Chemical synthesis of beta-defensins and LEAP-1/hepcidin. J. Pept. Res. 59: 241—248. PMID 12010514 DOI:10.1034/j.1399-3011.2002.00980.x
• Hoover D.M., Chertov O., Lubkowski J. (2001). The structure of human beta-defensin-1: new insights into structural properties of beta-defensins. J. Biol. Chem. 276: 39021—39026. PMID 11486002 DOI:10.1074/jbc.M103830200

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2766 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-02 у Wayback Machine.]
4. UniProt, P60022 (англ.) . Архів оригіналу за 31 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 8