CXCL12 або SDF-1(англ. C-X-C motif chemokine ligand 12) – білок, який кодується геном CXCL12, розташованим у людей на довгому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 93 амінокислот, а молекулярна маса — 10 666. Хемокін підродини CXC, взаємодіє з рецепторами CXCR4 і CXCR7 та відіграє важливу роль в ембріональному розвитку і гематопоезі. CXCL12 виступає не тільки як хемоатрактант: у деяких випадках він може стимулювати проліферацію клітин і сприяти їх виживанню.
CXCL12 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | CXCL12, IRH, PBSF, SCYB12, SDF1, TLSF, TPAR1, C-X-C motif chemokine ligand 12 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600835 MGI: 103556 HomoloGene: 128606 GeneCards: CXCL12 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 10: 44.37 – 44.39 Mb | Хр. 6: 117.15 – 117.16 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MNAKVVVVLV | LVLTALCLSD | GKPVSLSYRC | PCRFFESHVA | RANVKHLKIL | ||||
NTPNCALQIV | ARLKNNNRQV | CIDPKLKWIQ | EYLEKALNKR | FKM |
Функції
CXCL12 виконує безліч функцій як в дорослому організмі, так і в ході ембріонального розвитку. У першу чергу, CXCL12 є хемоаттрактантом для клітин, які мають його рецептори на мембрані, наприклад для B-лімфоцитів і гемопоетичних стовбурових клітин. Клітини строми кісткового мозку синтезують CXCL12, який забезпечує локалізацію гемопоетичних клітин-попередників у їх і не дає їм завчасно покинути кістковий мозок. В ембріональному розвитку CXCL12 керує міграцією різних типів клітин і відіграє важливу роль у формуванні органів.
CXCL12 виступає як фактор росту для B-клітин і стимулює їх проліферацію. Крім того, CXCL12 може захищати злоякісні В-клітини від апоптозу при .
Див. також
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 13 лютого 2018. Процитовано 12 лютого 2018.
- (англ.) . Архів оригіналу за 13 лютого 2018. Процитовано 12 лютого 2018.
- Rankin S. M. Chemokines and adult bone marrow stem cells // Immunol Lett. — 2012. — Т. 145, вип. 1—2. — С. 47—54. — DOI:10.1016/j.imlet.2012.04.009. — PMID 22698183.
- Yu L., Cecil J., Peng S. B., Schrementi J., Kovacevic S., Paul D., Su E. W., Wang J. Identification and expression of novel isoforms of human stromal cell-derived factor 1 // Gene. — 2006. — Т. 7, вип. 374. — С. 174—179. — PMID 16626895.
- Lewellis S. W., Knaut H. Attractive guidance: how the chemokine SDF1/CXCL12 guides different cells to different locations // Semin Cell Dev Biol. — 2012. — Т. 23, вип. 3. — С. 333—340. — DOI:10.1016/j.semcdb.2012.03.009. — PMID 22414535.
- Burger J. A., Tsukada N., Burger M., Zvaifler N. J., Dell'Aquila M., Kipps T. J. Blood-derived nurse-like cells protect chronic lymphocytic leukemia B cells from spontaneous apoptosis through stromal cell-derived factor-1 // Blood. — 2000. — Т. 96, вип. 8. — С. 2655—2663. — PMID 11023495.[недоступне посилання з листопадаа 2019]
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Veldkamp C.T., Peterson F.C., Pelzek A.J., Volkman B.F. (2005). The monomer-dimer equilibrium of stromal cell-derived factor-1 (CXCL 12) is altered by pH, phosphate, sulfate, and heparin. Protein Sci. 14: 1071—1081. PMID 15741341 DOI:10.1110/ps.041219505
- Veldkamp C.T., Seibert C., Peterson F.C., Sakmar T.P., Volkman B.F. (2006). Recognition of a CXCR4 sulfotyrosine by the chemokine stromal cell-derived factor-1alpha (SDF-1alpha/CXCL12). J. Mol. Biol. 359: 1400—1409. PMID 16725153 DOI:10.1016/j.jmb.2006.04.052
- Gozansky E.K., Louis J.M., Caffrey M., Clore G.M. (2005). Mapping the binding of the N-terminal extracellular tail of the CXCR4 receptor to stromal cell-derived factor-1alpha. J. Mol. Biol. 345: 651—658. PMID 15588815 DOI:10.1016/j.jmb.2004.11.003
- Murphy J.W., Yuan H., Kong Y., Xiong Y., Lolis E.J. (2010). Heterologous quaternary structure of CXCL12 and its relationship to the CC chemokine family. Proteins. 78: 1331—1337. PMID 20077567 DOI:10.1002/prot.22666
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до . |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
CXCL12 abo SDF 1 angl C X C motif chemokine ligand 12 bilok yakij koduyetsya genom CXCL12 roztashovanim u lyudej na dovgomu plechi 10 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 93 aminokislot a molekulyarna masa 10 666 Hemokin pidrodini CXC vzayemodiye z receptorami CXCR4 i CXCR7 ta vidigraye vazhlivu rol v embrionalnomu rozvitku i gematopoezi CXCL12 vistupaye ne tilki yak hemoatraktant u deyakih vipadkah vin mozhe stimulyuvati proliferaciyu klitin i spriyati yih vizhivannyu CXCL12Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1A15 1QG7 1SDF 1VMC 2J7Z 2K01 2K03 2K04 2K05 2KEC 2KED 2KEE 2KOL 2NWG 2SDF 3GV3 3HP3 4LMQ 4UAI 2N55IdentifikatoriSimvoliCXCL12 IRH PBSF SCYB12 SDF1 TLSF TPAR1 C X C motif chemokine ligand 12Zovnishni ID OMIM 600835 MGI 103556 HomoloGene 128606 GeneCards CXCL12Ontologiya genaMolekulyarna funkciya chemokine receptor binding cytokine activity chemokine activity CXCR chemokine receptor binding chemoattractant activity growth factor activity signaling receptor binding integrin binding GO 0001948 GO 0016582 protein bindingKlitinna komponenta klitinna membrana extracellular region ekzosoma external side of plasma membrane mizhklitinnij prostir citoplazma klitinne yadro collagen containing extracellular matrixBiologichnij proces negative regulation of leukocyte tethering or rolling G protein coupled receptor signaling pathway regulation of calcium ion transport response to hypoxia positive regulation of endothelial cell proliferation positive regulation of cell migration chemokine mediated signaling pathway adult locomotory behavior response to mechanical stimulus response to peptide hormone positive regulation of monocyte chemotaxis cellular calcium ion homeostasis response to virus neuron migration response to heat negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage positive regulation of axon extension involved in axon guidance krovoobig telencephalon cell migration hemotaksis regulation of actin polymerization or depolymerization positive regulation of calcium ion import brain development adgeziya klitin positive regulation of dopamine secretion animal organ regeneration positive regulation of neuron differentiation GO 0046730 GO 0046737 GO 0046738 GO 0046736 imunna vidpovid positive regulation of cell population proliferation cell chemotaxis negative regulation of leukocyte apoptotic process response to radiation positive regulation of T cell migration positive regulation of cell adhesion GO 0072468 signalna transdukciya positive chemotaxis induction of positive chemotaxis defense response response to ultrasound antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide T cell chemotaxis detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain regulation of signaling receptor activity axon guidance GO 0022415 viral process integrin activation chemokine C X C motif ligand 12 signaling pathway cellular response to chemokine negative regulation of dendritic cell apoptotic processDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6387 20315Ensembl ENSG00000107562 ENSMUSG00000061353UniProt P48061 P40224RefSeq mRNK NM 199168 NM 000609 NM 001033886 NM 001178134 NM 001277990NM 001012477 NM 013655 NM 021704RefSeq bilok NP 000600 NP 001029058 NP 001171605 NP 001264919 NP 954637NP 001012495 NP 038683 NP 068350Lokus UCSC Hr 10 44 37 44 39 MbHr 6 117 15 117 16 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MNAKVVVVLVLVLTALCLSDGKPVSLSYRCPCRFFESHVARANVKHLKIL NTPNCALQIVARLKNNNRQVCIDPKLKWIQEYLEKALNKRFKM A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y TirozinFunkciyiCXCL12 vikonuye bezlich funkcij yak v doroslomu organizmi tak i v hodi embrionalnogo rozvitku U pershu chergu CXCL12 ye hemoattraktantom dlya klitin yaki mayut jogo receptori na membrani napriklad dlya B limfocitiv i gemopoetichnih stovburovih klitin Klitini stromi kistkovogo mozku sintezuyut CXCL12 yakij zabezpechuye lokalizaciyu gemopoetichnih klitin poperednikiv u yih i ne daye yim zavchasno pokinuti kistkovij mozok V embrionalnomu rozvitku CXCL12 keruye migraciyeyu riznih tipiv klitin i vidigraye vazhlivu rol u formuvanni organiv CXCL12 vistupaye yak faktor rostu dlya B klitin i stimulyuye yih proliferaciyu Krim togo CXCL12 mozhe zahishati zloyakisni V klitini vid apoptozu pri Div takozhHromosoma 10PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 13 lyutogo 2018 Procitovano 12 lyutogo 2018 angl Arhiv originalu za 13 lyutogo 2018 Procitovano 12 lyutogo 2018 Rankin S M Chemokines and adult bone marrow stem cells Immunol Lett 2012 T 145 vip 1 2 S 47 54 DOI 10 1016 j imlet 2012 04 009 PMID 22698183 Yu L Cecil J Peng S B Schrementi J Kovacevic S Paul D Su E W Wang J Identification and expression of novel isoforms of human stromal cell derived factor 1 Gene 2006 T 7 vip 374 S 174 179 PMID 16626895 Lewellis S W Knaut H Attractive guidance how the chemokine SDF1 CXCL12 guides different cells to different locations Semin Cell Dev Biol 2012 T 23 vip 3 S 333 340 DOI 10 1016 j semcdb 2012 03 009 PMID 22414535 Burger J A Tsukada N Burger M Zvaifler N J Dell Aquila M Kipps T J Blood derived nurse like cells protect chronic lymphocytic leukemia B cells from spontaneous apoptosis through stromal cell derived factor 1 Blood 2000 T 96 vip 8 S 2655 2663 PMID 11023495 nedostupne posilannya z listopadaa 2019 LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Veldkamp C T Peterson F C Pelzek A J Volkman B F 2005 The monomer dimer equilibrium of stromal cell derived factor 1 CXCL 12 is altered by pH phosphate sulfate and heparin Protein Sci 14 1071 1081 PMID 15741341 DOI 10 1110 ps 041219505 Veldkamp C T Seibert C Peterson F C Sakmar T P Volkman B F 2006 Recognition of a CXCR4 sulfotyrosine by the chemokine stromal cell derived factor 1alpha SDF 1alpha CXCL12 J Mol Biol 359 1400 1409 PMID 16725153 DOI 10 1016 j jmb 2006 04 052 Gozansky E K Louis J M Caffrey M Clore G M 2005 Mapping the binding of the N terminal extracellular tail of the CXCR4 receptor to stromal cell derived factor 1alpha J Mol Biol 345 651 658 PMID 15588815 DOI 10 1016 j jmb 2004 11 003 Murphy J W Yuan H Kong Y Xiong Y Lolis E J 2010 Heterologous quaternary structure of CXCL12 and its relationship to the CC chemokine family Proteins 78 1331 1337 PMID 20077567 DOI 10 1002 prot 22666 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij