Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

CX3CL1 англ C X3 C motif chemokine ligand 1 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому пле

CX3CL1

CX3CL1

CX3CL1 (англ. C-X3-C motif chemokine ligand 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 397 амінокислот, а молекулярна маса — 42 203.

CX3CL1
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи CX3CL1, ABCD-3, C3Xkine, CXC3, CXC3C, NTN, NTT, SCYD1, fractalkine, neurotactin, C-X3-C motif chemokine ligand 1
Зовнішні ІД OMIM: 601880 MGI: 1097153 HomoloGene: 2251 GeneCards: CX3CL1
Шаблон експресії
image

image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6376
20312
Ensembl
ENSG00000006210
ENSMUSG00000031778
UniProt
P78423
O35188
RefSeq (мРНК)
NM_002996
NM_001304392
NM_009142
RefSeq (білок)
NP_001291321
NP_002987
NP_033168
Локус (UCSC) Хр. 16: 57.37 – 57.39 Mb Хр. 8: 95.5 – 95.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MAPISLSWLLRLATFCHLTVLLAGQHHGVTKCNITCSKMTSKIPVALLIH
YQQNQASCGKRAIILETRQHRLFCADPKEQWVKDAMQHLDRQAAALTRNG
GTFEKQIGEVKPRTTPAAGGMDESVVLEPEATGESSSLEPTPSSQEAQRA
LGTSPELPTGVTGSSGTRLPPTPKAQDGGPVGTELFRVPPVSTAATWQSS
APHQPGPSLWAEAKTSEAPSTQDPSTQASTASSPAPEENAPSEGQRVWGQ
GQSPRPENSLEREEMGPVPAHTDAFQDWGPGSMAHVSVVPVSSEGTPSRE
PVASGSWTPKAEEPIHATMDPQRLGVLITPVPDAQAATRRQAVGLLAFLG
LLFCLGVAMFTYQSLQGCPRKMAGEMAEGLRYIPRSCGSNSYVLVPV

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, хемотаксис. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649
  • Fujita M., Takada Y.K., Takada Y. (2012). Integrins alphavbeta3 and alpha4beta1 act as coreceptors for fractalkine, and the integrin-binding defective mutant of fractalkine is an antagonist of CX3CR1. J. Immunol. 189: 5809—5819. PMID 23125415 DOI:10.4049/jimmunol.1200889
  • Fujita M., Takada Y.K., Takada Y. (2014). The chemokine fractalkine can activate integrins without CX3CR1 through direct binding to a ligand-binding site distinct from the classical RGD-binding site. PLoS ONE. 9: E96372—E96372. PMID 24789099 DOI:10.1371/journal.pone.0096372
  • Mizoue L.S., Bazan J.F., Johnson E.C., Handel T.M. (1999). Solution structure and dynamics of the CX3C chemokine domain of fractalkine and its interaction with an N-terminal fragment of CX3CR1. Biochemistry. 38: 1402—1414. PMID 9931005 DOI:10.1021/bi9820614
  • Hoover D.M., Mizoue L.S., Handel T.M., Lubkowski J. (2000). The crystal structure of the chemokine domain of fractalkine shows a novel quaternary arrangement. J. Biol. Chem. 275: 23187—23193. PMID 10770945 DOI:10.1074/jbc.M002584200

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

CX3CL1 angl C X3 C motif chemokine ligand 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 16 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 397 aminokislot a molekulyarna masa 42 203 CX3CL1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1B2T 1F2L 3ONA 4XT1 4XT3IdentifikatoriSimvoliCX3CL1 ABCD 3 C3Xkine CXC3 CXC3C NTN NTT SCYD1 fractalkine neurotactin C X3 C motif chemokine ligand 1Zovnishni ID OMIM 601880 MGI 1097153 HomoloGene 2251 GeneCards CX3CL1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya cytokine activity chemokine activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding CCR chemokine receptor binding signaling receptor binding integrin binding CX3C chemokine receptor bindingKlitinna komponenta integral component of membrane membrana klitinna membrana extracellular region cell surface mizhklitinnij prostirBiologichnij proces G protein coupled receptor signaling pathway defense response positive regulation of inflammatory response monocyte chemotaxis cytokine mediated signaling pathway chemokine mediated signaling pathway angiogenesis involved in wound healing cellular response to tumor necrosis factor Zagoyennya ran leukocyte chemotaxis neutrophil chemotaxis positive regulation of angiogenesis positive regulation of transforming growth factor beta1 production GO 0032320 GO 0032321 GO 0032855 GO 0043089 GO 0032854 positive regulation of GTPase activity adgeziya klitin GO 0046730 GO 0046737 GO 0046738 GO 0046736 imunna vidpovid cellular response to interleukin 1 leukocyte adhesive activation positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade cellular response to interferon gamma cell chemotaxis lymphocyte chemotaxis negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand positive regulation of calcium independent cell cell adhesion hemotaksis integrin activation negative regulation of cell migration leukocyte migration involved in inflammatory response macrophage chemotaxis regulation of signaling receptor activityDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6376 20312Ensembl ENSG00000006210 ENSMUSG00000031778UniProt P78423 O35188RefSeq mRNK NM 002996 NM 001304392NM 009142RefSeq bilok NP 001291321 NP 002987NP 033168Lokus UCSC Hr 16 57 37 57 39 MbHr 8 95 5 95 51 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAPISLSWLLRLATFCHLTVLLAGQHHGVTKCNITCSKMTSKIPVALLIH YQQNQASCGKRAIILETRQHRLFCADPKEQWVKDAMQHLDRQAAALTRNG GTFEKQIGEVKPRTTPAAGGMDESVVLEPEATGESSSLEPTPSSQEAQRA LGTSPELPTGVTGSSGTRLPPTPKAQDGGPVGTELFRVPPVSTAATWQSS APHQPGPSLWAEAKTSEAPSTQDPSTQASTASSPAPEENAPSEGQRVWGQ GQSPRPENSLEREEMGPVPAHTDAFQDWGPGSMAHVSVVPVSSEGTPSRE PVASGSWTPKAEEPIHATMDPQRLGVLITPVPDAQAATRRQAVGLLAFLG LLFCLGVAMFTYQSLQGCPRKMAGEMAEGLRYIPRSCGSNSYVLVPV A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do citokiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinna adgeziya hemotaksis Lokalizovanij u klitinnij membrani membrani Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Halim A Nilsson J Ruetschi U Hesse C Larson G 2011 Human urinary glycoproteomics attachment site specific analysis of N and O linked glycosylations by CID and ECD Mol Cell Proteomics PMID 22171320 DOI 10 1074 mcp M111 013649 Fujita M Takada Y K Takada Y 2012 Integrins alphavbeta3 and alpha4beta1 act as coreceptors for fractalkine and the integrin binding defective mutant of fractalkine is an antagonist of CX3CR1 J Immunol 189 5809 5819 PMID 23125415 DOI 10 4049 jimmunol 1200889 Fujita M Takada Y K Takada Y 2014 The chemokine fractalkine can activate integrins without CX3CR1 through direct binding to a ligand binding site distinct from the classical RGD binding site PLoS ONE 9 E96372 E96372 PMID 24789099 DOI 10 1371 journal pone 0096372 Mizoue L S Bazan J F Johnson E C Handel T M 1999 Solution structure and dynamics of the CX3C chemokine domain of fractalkine and its interaction with an N terminal fragment of CX3CR1 Biochemistry 38 1402 1414 PMID 9931005 DOI 10 1021 bi9820614 Hoover D M Mizoue L S Handel T M Lubkowski J 2000 The crystal structure of the chemokine domain of fractalkine shows a novel quaternary arrangement J Biol Chem 275 23187 23193 PMID 10770945 DOI 10 1074 jbc M002584200PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 24 bereznya 2016 Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 serpnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 16 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ