CRY1 (англ. Cryptochrome circadian clock 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 586 амінокислот, а молекулярна маса — 66 395.
CRY1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | CRY1, cryptochrome circadian clock 1, PHLL1, DSPD, cryptochrome circadian regulator 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601933 MGI: 1270841 HomoloGene: 7042 GeneCards: CRY1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
безсоння | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 12: 106.99 – 107.09 Mb | Хр. 10: 84.97 – 85.02 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGVNAVHWFR | KGLRLHDNPA | LKECIQGADT | IRCVYILDPW | FAGSSNVGIN | ||||
RWRFLLQCLE | DLDANLRKLN | SRLFVIRGQP | ADVFPRLFKE | WNITKLSIEY | ||||
DSEPFGKERD | AAIKKLATEA | GVEVIVRISH | TLYDLDKIIE | LNGGQPPLTY | ||||
KRFQTLISKM | EPLEIPVETI | TSEVIEKCTT | PLSDDHDEKY | GVPSLEELGF | ||||
DTDGLSSAVW | PGGETEALTR | LERHLERKAW | VANFERPRMN | ANSLLASPTG | ||||
LSPYLRFGCL | SCRLFYFKLT | DLYKKVKKNS | SPPLSLYGQL | LWREFFYTAA | ||||
TNNPRFDKME | GNPICVQIPW | DKNPEALAKW | AEGRTGFPWI | DAIMTQLRQE | ||||
GWIHHLARHA | VACFLTRGDL | WISWEEGMKV | FEELLLDADW | SINAGSWMWL | ||||
SCSSFFQQFF | HCYCPVGFGR | RTDPNGDYIR | RYLPVLRGFP | AKYIYDPWNA | ||||
PEGIQKVAKC | LIGVNYPKPM | VNHAEASRLN | IERMKQIYQQ | LSRYRGLGLL | ||||
ASVPSNPNGN | GGFMGYSAEN | IPGCSSSGSC | SQGSGILHYA | HGDSQQTHLL | ||||
KQGRSSMGTG | LSGGKRPSQE | EDTQSIGPKV | QRQSTN |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, хромофором, ФАД, флавопротеїном. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Griffin E.A. Jr., Staknis D., Weitz C.J. (1999). Light-independent role of CRY1 and CRY2 in the mammalian circadian clock. Science. 286: 768—771. PMID 10531061 DOI:10.1126/science.286.5440.768
- Partch C.L., Shields K.F., Thompson C.L., Selby C.P., Sancar A. (2006). Posttranslational regulation of the mammalian circadian clock by cryptochrome and protein phosphatase 5. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 10467—10472. PMID 16790549 DOI:10.1073/pnas.0604138103
- Ye R., Selby C.P., Ozturk N., Annayev Y., Sancar A. (2011). Biochemical analysis of the canonical model for the mammalian circadian clock. J. Biol. Chem. 286: 25891—25902. PMID 21613214 DOI:10.1074/jbc.M111.254680
- Eckel-Mahan K., Sassone-Corsi P. (2013). Metabolism and the circadian clock converge. Physiol. Rev. 93: 107—135. PMID 23303907 DOI:10.1152/physrev.00016.2012
- Partch C.L., Green C.B., Takahashi J.S. (2014). Molecular architecture of the mammalian circadian clock. Trends Cell Biol. 24: 90—99. PMID 23916625 DOI:10.1016/j.tcb.2013.07.002
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з CRY1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 14 травня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
CRY1 angl Cryptochrome circadian clock 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 12 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 586 aminokislot a molekulyarna masa 66 395 CRY1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB4CT0 4K0RIdentifikatoriSimvoliCRY1 cryptochrome circadian clock 1 PHLL1 DSPD cryptochrome circadian regulator 1Zovnishni ID OMIM 601933 MGI 1270841 HomoloGene 7042 GeneCards CRY1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyabezsonnyaOntologiya genaMolekulyarna funkciya deoxyribodipyrimidine photo lyase activity DNA binding nucleotide binding phosphatase binding blue light photoreceptor activity transcription factor binding histone deacetylase binding DNA 6 4 photolyase activity core promoter sequence specific DNA binding kinase binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding photoreceptor activity double stranded DNA binding protein kinase binding E box binding lyase activityKlitinna komponenta citoplazma mitohondriya klitinne yadroBiologichnij proces glyukoneogenez negative regulation of glucocorticoid receptor signaling pathway response to glucagon GO 0009373 regulation of transcription DNA templated glucose homeostasis vidpovid na stimul ritmichnij proces negative regulation of circadian rhythm lipid storage GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II circadian regulation of gene expression transcription DNA templated response to insulin negative regulation of protein ubiquitination regulation of circadian rhythm regulation of DNA damage checkpoint DNA damage induced protein phosphorylation negative regulation of G protein coupled receptor signaling pathway GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated negative regulation of glucocorticoid secretion entrainment of circadian clock by photoperiod blue light signaling pathway cirkadnij ritm negative regulation of gluconeogenesis positive regulation of protein ubiquitination response to light stimulus response to activityDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1407 12952Ensembl ENSG00000008405 ENSMUSG00000020038UniProt Q16526 P97784RefSeq mRNK NM 004075NM 007771RefSeq bilok NP 004066 NP 004066 1NP 031797Lokus UCSC Hr 12 106 99 107 09 MbHr 10 84 97 85 02 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MGVNAVHWFRKGLRLHDNPALKECIQGADTIRCVYILDPWFAGSSNVGINRWRFLLQCLEDLDANLRKLNSRLFVIRGQPADVFPRLFKEWNITKLSIEYDSEPFGKERDAAIKKLATEAGVEVIVRISHTLYDLDKIIELNGGQPPLTYKRFQTLISKMEPLEIPVETITSEVIEKCTTPLSDDHDEKYGVPSLEELGFDTDGLSSAVWPGGETEALTRLERHLERKAWVANFERPRMNANSLLASPTGLSPYLRFGCLSCRLFYFKLTDLYKKVKKNSSPPLSLYGQLLWREFFYTAATNNPRFDKMEGNPICVQIPWDKNPEALAKWAEGRTGFPWIDAIMTQLRQEGWIHHLARHAVACFLTRGDLWISWEEGMKVFEELLLDADWSINAGSWMWLSCSSFFQQFFHCYCPVGFGRRTDPNGDYIRRYLPVLRGFPAKYIYDPWNAPEGIQKVAKCLIGVNYPKPMVNHAEASRLNIERMKQIYQQLSRYRGLGLLASVPSNPNGNGGFMGYSAENIPGCSSSGSCSQGSGILHYAHGDSQQTHLLKQGRSSMGTGLSGGKRPSQEEDTQSIGPKVQRQSTNA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do represoriv receptoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi biologichni ritmi Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z nukleotidami hromoforom FAD flavoproteyinom Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Griffin E A Jr Staknis D Weitz C J 1999 Light independent role of CRY1 and CRY2 in the mammalian circadian clock Science 286 768 771 PMID 10531061 DOI 10 1126 science 286 5440 768 Partch C L Shields K F Thompson C L Selby C P Sancar A 2006 Posttranslational regulation of the mammalian circadian clock by cryptochrome and protein phosphatase 5 Proc Natl Acad Sci U S A 103 10467 10472 PMID 16790549 DOI 10 1073 pnas 0604138103 Ye R Selby C P Ozturk N Annayev Y Sancar A 2011 Biochemical analysis of the canonical model for the mammalian circadian clock J Biol Chem 286 25891 25902 PMID 21613214 DOI 10 1074 jbc M111 254680 Eckel Mahan K Sassone Corsi P 2013 Metabolism and the circadian clock converge Physiol Rev 93 107 135 PMID 23303907 DOI 10 1152 physrev 00016 2012 Partch C L Green C B Takahashi J S 2014 Molecular architecture of the mammalian circadian clock Trends Cell Biol 24 90 99 PMID 23916625 DOI 10 1016 j tcb 2013 07 002PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z CRY1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 14 travnya 2016 Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 19 veresnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 12Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi