Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

COL3A1 англ Collagen type III alpha 1 chain білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому пле

COL3A1

COL3A1

COL3A1 (англ. Collagen type III alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 466 амінокислот, а молекулярна маса — 138 564.

COL3A1
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи COL3A1, EDS4A, collagen type III alpha 1, collagen type III alpha 1 chain, EDSVASC, PMGEDSV
Зовнішні ІД OMIM: 120180 MGI: 88453 HomoloGene: 55433 GeneCards: COL3A1
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant type IV Ehlers-Danlos syndrome, Ehlers-Danlos syndrome, vascular-like type, Bilateral frontoparietal polymicrogyria, хвороба Пейроні
Реагує на сполуку
ocriplasmin
Шаблон експресії
image

image

image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1281
12825
Ensembl
ENSG00000168542
ENSMUSG00000026043
UniProt
P02461
P08121
RefSeq (мРНК)
NM_000090
NM_001376916
NM_009930
RefSeq (білок)
NP_000081
NP_034060
Локус (UCSC) Хр. 2: 188.97 – 189.01 Mb Хр. 1: 45.35 – 45.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MMSFVQKGSWLLLALLHPTIILAQQEAVEGGCSHLGQSYADRDVWKPEPC
QICVCDSGSVLCDDIICDDQELDCPNPEIPFGECCAVCPQPPTAPTRPPN
GQGPQGPKGDPGPPGIPGRNGDPGIPGQPGSPGSPGPPGICESCPTGPQN
YSPQYDSYDVKSGVAVGGLAGYPGPAGPPGPPGPPGTSGHPGSPGSPGYQ
GPPGEPGQAGPSGPPGPPGAIGPSGPAGKDGESGRPGRPGERGLPGPPGI
KGPAGIPGFPGMKGHRGFDGRNGEKGETGAPGLKGENGLPGENGAPGPMG
PRGAPGERGRPGLPGAAGARGNDGARGSDGQPGPPGPPGTAGFPGSPGAK
GEVGPAGSPGSNGAPGQRGEPGPQGHAGAQGPPGPPGINGSPGGKGEMGP
AGIPGAPGLMGARGPPGPAGANGAPGLRGGAGEPGKNGAKGEPGPRGERG
EAGIPGVPGAKGEDGKDGSPGEPGANGLPGAAGERGAPGFRGPAGPNGIP
GEKGPAGERGAPGPAGPRGAAGEPGRDGVPGGPGMRGMPGSPGGPGSDGK
PGPPGSQGESGRPGPPGPSGPRGQPGVMGFPGPKGNDGAPGKNGERGGPG
GPGPQGPPGKNGETGPQGPPGPTGPGGDKGDTGPPGPQGLQGLPGTGGPP
GENGKPGEPGPKGDAGAPGAPGGKGDAGAPGERGPPGLAGAPGLRGGAGP
PGPEGGKGAAGPPGPPGAAGTPGLQGMPGERGGLGSPGPKGDKGEPGGPG
ADGVPGKDGPRGPTGPIGPPGPAGQPGDKGEGGAPGLPGIAGPRGSPGER
GETGPPGPAGFPGAPGQNGEPGGKGERGAPGEKGEGGPPGVAGPPGGSGP
AGPPGPQGVKGERGSPGGPGAAGFPGARGLPGPPGSNGNPGPPGPSGSPG
KDGPPGPAGNTGAPGSPGVSGPKGDAGQPGEKGSPGAQGPPGAPGPLGIA
GITGARGLAGPPGMPGPRGSPGPQGVKGESGKPGANGLSGERGPPGPQGL
PGLAGTAGEPGRDGNPGSDGLPGRDGSPGGKGDRGENGSPGAPGAPGHPG
PPGPVGPAGKSGDRGESGPAGPAGAPGPAGSRGAPGPQGPRGDKGETGER
GAAGIKGHRGFPGNPGAPGSPGPAGQQGAIGSPGPAGPRGPVGPSGPPGK
DGTSGHPGPIGPPGPRGNRGERGSEGSPGHPGQPGPPGPPGAPGPCCGGV
GAAAIAGIGGEKAGGFAPYYGDEPMDFKINTDEIMTSLKSVNGQIESLIS
PDGSRKNPARNCRDLKFCHPELKSGEYWVDPNQGCKLDAIKVFCNMETGE
TCISANPLNVPRKHWWTDSSAEKKHVWFGESMDGGFQFSYGNPELPEDVL
DVHLAFLRLLSSRASQNITYHCKNSIAYMDQASGNVKKALKLMGSNEGEF
KAEGNSKFTYTVLEDGCTKHTGEWSKTVFEYRTRKAVRLPIVDIAPYDIG
GPDQEFGVDVGPVCFL

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • Ala-Kokko L., Kontusaari S., Baldwin C.T., Kuivaniemi H., Prockop D.J. (1989). Structure of cDNA clones coding for the entire prepro alpha 1 (III) chain of human type III procollagen. Differences in protein structure from type I procollagen and conservation of codon preferences. Biochem. J. 260: 509—516. PMID 2764886 DOI:10.1042/bj2600509
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Benson-Chanda V., Su M.W., Weil D., Chu M.-L., Ramirez F. (1989). Cloning and analysis of the 5' portion of the human type-III procollagen gene (COL3A1). Gene. 78: 255—265. PMID 2777083 DOI:10.1016/0378-1119(89)90228-X
  • Toman D., Ricca G., de Crombrugghe B. (1988). Nucleotide sequence of a cDNA coding for the amino-terminal region of human prepro alpha 1(III) collagen. Nucleic Acids Res. 16: 7201—7201. PMID 3405773 DOI:10.1093/nar/16.14.7201
  • Janeczko R.A., Ramirez F. (1989). Nucleotide and amino acid sequences of the entire human alpha 1 (III) collagen. Nucleic Acids Res. 17: 6742—6742. PMID 2780304 DOI:10.1093/nar/17.16.6742
  • Seyer J.M., Kang A.H. (1977). Covalent structure of collagen: amino acid sequence of cyanogen bromide peptides from the amino-terminal segment of type III collagen of human liver. Biochemistry. 16: 1158—1164. PMID 557335 DOI:10.1021/bi00625a020

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з COL3A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з COL3A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. (англ.) . Архів оригіналу за 23 червня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
  6. (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

COL3A1 angl Collagen type III alpha 1 chain bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 466 aminokislot a molekulyarna masa 138 564 COL3A1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB2V53 3DMW 4AE2 4AEJ 4AK3 4GYXIdentifikatoriSimvoliCOL3A1 EDS4A collagen type III alpha 1 collagen type III alpha 1 chain EDSVASC PMGEDSVZovnishni ID OMIM 120180 MGI 88453 HomoloGene 55433 GeneCards COL3A1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaautosomal dominant type IV Ehlers Danlos syndrome Ehlers Danlos syndrome vascular like type Bilateral frontoparietal polymicrogyria hvoroba PejroniReaguye na spolukuocriplasminOntologiya genaMolekulyarna funkciya zv yazuvannya z ionom metalu integrin binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding platelet derived growth factor binding SMAD binding extracellular matrix structural constituent protease binding extracellular matrix structural constituent conferring tensile strengthKlitinna komponenta kolagen endoplasmic reticulum lumen mizhklitinnij prostir collagen type III trimer GO 0005578 Pozaklitinna matricya extracellular region collagen containing extracellular matrixBiologichnij proces positive regulation of Rho protein signal transduction skeletal system development negative regulation of neuron migration response to cytokine response to mechanical stimulus GO 0010260 starinnya lyudini extracellular matrix organization platelet activation heart development GO 0051357 GO 0051358 GO 0051359 peptide cross linking negative regulation of immune response blood vessel development regulation of immune response cerebral cortex development collagen catabolic process cellular response to amino acid stimulus integrin mediated signaling pathway response to radiation cell matrix adhesion digestive tract development transforming growth factor beta receptor signaling pathway aorta smooth muscle tissue morphogenesis skin development collagen fibril organization Zagoyennya ran supramolecular fiber organizationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1281 12825Ensembl ENSG00000168542 ENSMUSG00000026043UniProt P02461 P08121RefSeq mRNK NM 000090 NM 001376916NM 009930RefSeq bilok NP 000081NP 034060Lokus UCSC Hr 2 188 97 189 01 MbHr 1 45 35 45 39 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MMSFVQKGSWLLLALLHPTIILAQQEAVEGGCSHLGQSYADRDVWKPEPCQICVCDSGSVLCDDIICDDQELDCPNPEIPFGECCAVCPQPPTAPTRPPNGQGPQGPKGDPGPPGIPGRNGDPGIPGQPGSPGSPGPPGICESCPTGPQNYSPQYDSYDVKSGVAVGGLAGYPGPAGPPGPPGPPGTSGHPGSPGSPGYQGPPGEPGQAGPSGPPGPPGAIGPSGPAGKDGESGRPGRPGERGLPGPPGIKGPAGIPGFPGMKGHRGFDGRNGEKGETGAPGLKGENGLPGENGAPGPMGPRGAPGERGRPGLPGAAGARGNDGARGSDGQPGPPGPPGTAGFPGSPGAKGEVGPAGSPGSNGAPGQRGEPGPQGHAGAQGPPGPPGINGSPGGKGEMGPAGIPGAPGLMGARGPPGPAGANGAPGLRGGAGEPGKNGAKGEPGPRGERGEAGIPGVPGAKGEDGKDGSPGEPGANGLPGAAGERGAPGFRGPAGPNGIPGEKGPAGERGAPGPAGPRGAAGEPGRDGVPGGPGMRGMPGSPGGPGSDGKPGPPGSQGESGRPGPPGPSGPRGQPGVMGFPGPKGNDGAPGKNGERGGPGGPGPQGPPGKNGETGPQGPPGPTGPGGDKGDTGPPGPQGLQGLPGTGGPPGENGKPGEPGPKGDAGAPGAPGGKGDAGAPGERGPPGLAGAPGLRGGAGPPGPEGGKGAAGPPGPPGAAGTPGLQGMPGERGGLGSPGPKGDKGEPGGPGADGVPGKDGPRGPTGPIGPPGPAGQPGDKGEGGAPGLPGIAGPRGSPGERGETGPPGPAGFPGAPGQNGEPGGKGERGAPGEKGEGGPPGVAGPPGGSGPAGPPGPQGVKGERGSPGGPGAAGFPGARGLPGPPGSNGNPGPPGPSGSPGKDGPPGPAGNTGAPGSPGVSGPKGDAGQPGEKGSPGAQGPPGAPGPLGIAGITGARGLAGPPGMPGPRGSPGPQGVKGESGKPGANGLSGERGPPGPQGLPGLAGTAGEPGRDGNPGSDGLPGRDGSPGGKGDRGENGSPGAPGAPGHPGPPGPVGPAGKSGDRGESGPAGPAGAPGPAGSRGAPGPQGPRGDKGETGERGAAGIKGHRGFPGNPGAPGSPGPAGQQGAIGSPGPAGPRGPVGPSGPPGKDGTSGHPGPIGPPGPRGNRGERGSEGSPGHPGQPGPPGPPGAPGPCCGGVGAAAIAGIGGEKAGGFAPYYGDEPMDFKINTDEIMTSLKSVNGQIESLISPDGSRKNPARNCRDLKFCHPELKSGEYWVDPNQGCKLDAIKVFCNMETGETCISANPLNVPRKHWWTDSSAEKKHVWFGESMDGGFQFSYGNPELPEDVLDVHLAFLRLLSSRASQNITYHCKNSIAYMDQASGNVKKALKLMGSNEGEFKAEGNSKFTYTVLEDGCTKHTGEWSKTVFEYRTRKAVRLPIVDIAPYDIGGPDQEFGVDVGPVCFLA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom kalciyu Lokalizovanij u pozaklitinnomu matriksi Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaAla Kokko L Kontusaari S Baldwin C T Kuivaniemi H Prockop D J 1989 Structure of cDNA clones coding for the entire prepro alpha 1 III chain of human type III procollagen Differences in protein structure from type I procollagen and conservation of codon preferences Biochem J 260 509 516 PMID 2764886 DOI 10 1042 bj2600509 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Benson Chanda V Su M W Weil D Chu M L Ramirez F 1989 Cloning and analysis of the 5 portion of the human type III procollagen gene COL3A1 Gene 78 255 265 PMID 2777083 DOI 10 1016 0378 1119 89 90228 X Toman D Ricca G de Crombrugghe B 1988 Nucleotide sequence of a cDNA coding for the amino terminal region of human prepro alpha 1 III collagen Nucleic Acids Res 16 7201 7201 PMID 3405773 DOI 10 1093 nar 16 14 7201 Janeczko R A Ramirez F 1989 Nucleotide and amino acid sequences of the entire human alpha 1 III collagen Nucleic Acids Res 17 6742 6742 PMID 2780304 DOI 10 1093 nar 17 16 6742 Seyer J M Kang A H 1977 Covalent structure of collagen amino acid sequence of cyanogen bromide peptides from the amino terminal segment of type III collagen of human liver Biochemistry 16 1158 1164 PMID 557335 DOI 10 1021 bi00625a020PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z COL3A1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z COL3A1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 23 chervnya 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 1 veresnya 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 2Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ