COL11A1 (англ. Collagen type XI alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 806 амінокислот, а молекулярна маса — 181 065.
COL11A1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | COL11A1, collagen, type XI, alpha 1, CO11A1, COLL6, STL2, collagen type XI alpha 1, collagen type XI alpha 1 chain, DFNA37 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 120280 MGI: 88446 HomoloGene: 56389 GeneCards: COL11A1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
primary open angle glaucoma, Marshall syndrome, fibrochondrogenesis, Stickler syndrome type 2 | |||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
ocriplasmin | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 102.88 – 103.11 Mb | Хр. 3: 113.82 – 114.01 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEPWSSRWKT | KRWLWDFTVT | TLALTFLFQA | REVRGAAPVD | VLKALDFHNS | ||||
PEGISKTTGF | CTNRKNSKGS | DTAYRVSKQA | QLSAPTKQLF | PGGTFPEDFS | ||||
ILFTVKPKKG | IQSFLLSIYN | EHGIQQIGVE | VGRSPVFLFE | DHTGKPAPED | ||||
YPLFRTVNIA | DGKWHRVAIS | VEKKTVTMIV | DCKKKTTKPL | DRSERAIVDT | ||||
NGITVFGTRI | LDEEVFEGDI | QQFLITGDPK | AAYDYCEHYS | PDCDSSAPKA | ||||
AQAQEPQIDE | YAPEDIIEYD | YEYGEAEYKE | AESVTEGPTV | TEETIAQTEA | ||||
NIVDDFQEYN | YGTMESYQTE | APRHVSGTNE | PNPVEEIFTE | EYLTGEDYDS | ||||
QRKNSEDTLY | ENKEIDGRDS | DLLVDGDLGE | YDFYEYKEYE | DKPTSPPNEE | ||||
FGPGVPAETD | ITETSINGHG | AYGEKGQKGE | PAVVEPGMLV | EGPPGPAGPA | ||||
GIMGPPGLQG | PTGPPGDPGD | RGPPGRPGLP | GADGLPGPPG | TMLMLPFRYG | ||||
GDGSKGPTIS | AQEAQAQAIL | QQARIALRGP | PGPMGLTGRP | GPVGGPGSSG | ||||
AKGESGDPGP | QGPRGVQGPP | GPTGKPGKRG | RPGADGGRGM | PGEPGAKGDR | ||||
GFDGLPGLPG | DKGHRGERGP | QGPPGPPGDD | GMRGEDGEIG | PRGLPGEAGP | ||||
RGLLGPRGTP | GAPGQPGMAG | VDGPPGPKGN | MGPQGEPGPP | GQQGNPGPQG | ||||
LPGPQGPIGP | PGEKGPQGKP | GLAGLPGADG | PPGHPGKEGQ | SGEKGALGPP | ||||
GPQGPIGYPG | PRGVKGADGV | RGLKGSKGEK | GEDGFPGFKG | DMGLKGDRGE | ||||
VGQIGPRGED | GPEGPKGRAG | PTGDPGPSGQ | AGEKGKLGVP | GLPGYPGRQG | ||||
PKGSTGFPGF | PGANGEKGAR | GVAGKPGPRG | QRGPTGPRGS | RGARGPTGKP | ||||
GPKGTSGGDG | PPGPPGERGP | QGPQGPVGFP | GPKGPPGPPG | KDGLPGHPGQ | ||||
RGETGFQGKT | GPPGPGGVVG | PQGPTGETGP | IGERGHPGPP | GPPGEQGLPG | ||||
AAGKEGAKGD | PGPQGISGKD | GPAGLRGFPG | ERGLPGAQGA | PGLKGGEGPQ | ||||
GPPGPVGSPG | ERGSAGTAGP | IGLPGRPGPQ | GPPGPAGEKG | APGEKGPQGP | ||||
AGRDGVQGPV | GLPGPAGPAG | SPGEDGDKGE | IGEPGQKGSK | GDKGENGPPG | ||||
PPGLQGPVGA | PGIAGGDGEP | GPRGQQGMFG | QKGDEGARGF | PGPPGPIGLQ | ||||
GLPGPPGEKG | ENGDVGPMGP | PGPPGPRGPQ | GPNGADGPQG | PPGSVGSVGG | ||||
VGEKGEPGEA | GNPGPPGEAG | VGGPKGERGE | KGEAGPPGAA | GPPGAKGPPG | ||||
DDGPKGNPGP | VGFPGDPGPP | GEPGPAGQDG | VGGDKGEDGD | PGQPGPPGPS | ||||
GEAGPPGPPG | KRGPPGAAGA | EGRQGEKGAK | GEAGAEGPPG | KTGPVGPQGP | ||||
AGKPGPEGLR | GIPGPVGEQG | LPGAAGQDGP | PGPMGPPGLP | GLKGDPGSKG | ||||
EKGHPGLIGL | IGPPGEQGEK | GDRGLPGTQG | SPGAKGDGGI | PGPAGPLGPP | ||||
GPPGLPGPQG | PKGNKGSTGP | AGQKGDSGLP | GPPGSPGPPG | EVIQPLPILS | ||||
SKKTRRHTEG | MQADADDNIL | DYSDGMEEIF | GSLNSLKQDI | EHMKFPMGTQ | ||||
TNPARTCKDL | QLSHPDFPDG | EYWIDPNQGC | SGDSFKVYCN | FTSGGETCIY | ||||
PDKKSEGVRI | SSWPKEKPGS | WFSEFKRGKL | LSYLDVEGNS | INMVQMTFLK | ||||
LLTASARQNF | TYHCHQSAAW | YDVSSGSYDK | ALRFLGSNDE | EMSYDNNPFI | ||||
KTLYDGCASR | KGYEKTVIEI | NTPKIDQVPI | VDVMINDFGD | QNQKFGFEVG | ||||
PVCFLG |
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhidkova N.I., Justice S.K., Mayne R. (1995). Alternative mRNA processing occurs in the variable region of the pro-alpha 1(XI) and pro-alpha 2(XI) collagen chains. J. Biol. Chem. 270: 9486—9493. PMID 7721876 DOI:10.1074/jbc.270.16.9486
- Yoshioka H., Ramirez F. (1990). Pro-alpha 1(XI) collagen. Structure of the amino-terminal propeptide and expression of the gene in tumor cell lines. J. Biol. Chem. 265: 6423—6426. PMID 1690726
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з COL11A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Сполуки, які фізично взаємодіють з COL11A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 25 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
COL11A1 angl Collagen type XI alpha 1 chain bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 806 aminokislot a molekulyarna masa 181 065 COL11A1IdentifikatoriSimvoliCOL11A1 collagen type XI alpha 1 CO11A1 COLL6 STL2 collagen type XI alpha 1 collagen type XI alpha 1 chain DFNA37Zovnishni ID OMIM 120280 MGI 88446 HomoloGene 56389 GeneCards COL11A1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaprimary open angle glaucoma Marshall syndrome fibrochondrogenesis Stickler syndrome type 2 Reaguye na spolukuocriplasmin Ontologiya genaMolekulyarna funkciya protein macromolecule adaptor activity zv yazuvannya z ionom metalu extracellular matrix binding extracellular matrix structural constituent heparin binding heparan sulfate binding extracellular matrix structural constituent conferring tensile strengthKlitinna komponenta kolagen endoplasmic reticulum lumen collagen type XI trimer GO 0005578 Pozaklitinna matricya extracellular region collagen containing extracellular matrix mizhklitinnij prostirBiologichnij proces embryonic skeletal system morphogenesis endodermal cell differentiation osifikaciya tendon development skeletal system morphogenesis chondrocyte development heart morphogenesis sluh detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of sound ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis cartilage development proteoglycan metabolic process inner ear morphogenesis cartilage condensation zir extracellular matrix organization collagen fibril organizationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1301 12814Ensembl ENSG00000060718 ENSMUSG00000027966UniProt P12107 Q61245RefSeq mRNK NM 001190709 NM 001854 NM 080629 NM 080630NM 007729RefSeq bilok NP 001177638 NP 001845 NP 542196 NP 542197NP 031755Lokus UCSC Hr 1 102 88 103 11 MbHr 3 113 82 114 01 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MEPWSSRWKTKRWLWDFTVTTLALTFLFQAREVRGAAPVDVLKALDFHNS PEGISKTTGFCTNRKNSKGSDTAYRVSKQAQLSAPTKQLFPGGTFPEDFS ILFTVKPKKGIQSFLLSIYNEHGIQQIGVEVGRSPVFLFEDHTGKPAPED YPLFRTVNIADGKWHRVAISVEKKTVTMIVDCKKKTTKPLDRSERAIVDT NGITVFGTRILDEEVFEGDIQQFLITGDPKAAYDYCEHYSPDCDSSAPKA AQAQEPQIDEYAPEDIIEYDYEYGEAEYKEAESVTEGPTVTEETIAQTEA NIVDDFQEYNYGTMESYQTEAPRHVSGTNEPNPVEEIFTEEYLTGEDYDS QRKNSEDTLYENKEIDGRDSDLLVDGDLGEYDFYEYKEYEDKPTSPPNEE FGPGVPAETDITETSINGHGAYGEKGQKGEPAVVEPGMLVEGPPGPAGPA GIMGPPGLQGPTGPPGDPGDRGPPGRPGLPGADGLPGPPGTMLMLPFRYG GDGSKGPTISAQEAQAQAILQQARIALRGPPGPMGLTGRPGPVGGPGSSG AKGESGDPGPQGPRGVQGPPGPTGKPGKRGRPGADGGRGMPGEPGAKGDR GFDGLPGLPGDKGHRGERGPQGPPGPPGDDGMRGEDGEIGPRGLPGEAGP RGLLGPRGTPGAPGQPGMAGVDGPPGPKGNMGPQGEPGPPGQQGNPGPQG LPGPQGPIGPPGEKGPQGKPGLAGLPGADGPPGHPGKEGQSGEKGALGPP GPQGPIGYPGPRGVKGADGVRGLKGSKGEKGEDGFPGFKGDMGLKGDRGE VGQIGPRGEDGPEGPKGRAGPTGDPGPSGQAGEKGKLGVPGLPGYPGRQG PKGSTGFPGFPGANGEKGARGVAGKPGPRGQRGPTGPRGSRGARGPTGKP GPKGTSGGDGPPGPPGERGPQGPQGPVGFPGPKGPPGPPGKDGLPGHPGQ RGETGFQGKTGPPGPGGVVGPQGPTGETGPIGERGHPGPPGPPGEQGLPG AAGKEGAKGDPGPQGISGKDGPAGLRGFPGERGLPGAQGAPGLKGGEGPQ GPPGPVGSPGERGSAGTAGPIGLPGRPGPQGPPGPAGEKGAPGEKGPQGP AGRDGVQGPVGLPGPAGPAGSPGEDGDKGEIGEPGQKGSKGDKGENGPPG PPGLQGPVGAPGIAGGDGEPGPRGQQGMFGQKGDEGARGFPGPPGPIGLQ GLPGPPGEKGENGDVGPMGPPGPPGPRGPQGPNGADGPQGPPGSVGSVGG VGEKGEPGEAGNPGPPGEAGVGGPKGERGEKGEAGPPGAAGPPGAKGPPG DDGPKGNPGPVGFPGDPGPPGEPGPAGQDGVGGDKGEDGDPGQPGPPGPS GEAGPPGPPGKRGPPGAAGAEGRQGEKGAKGEAGAEGPPGKTGPVGPQGP AGKPGPEGLRGIPGPVGEQGLPGAAGQDGPPGPMGPPGLPGLKGDPGSKG EKGHPGLIGLIGPPGEQGEKGDRGLPGTQGSPGAKGDGGIPGPAGPLGPP GPPGLPGPQGPKGNKGSTGPAGQKGDSGLPGPPGSPGPPGEVIQPLPILS SKKTRRHTEGMQADADDNILDYSDGMEEIFGSLNSLKQDIEHMKFPMGTQ TNPARTCKDLQLSHPDFPDGEYWIDPNQGCSGDSFKVYCNFTSGGETCIY PDKKSEGVRISSWPKEKPGSWFSEFKRGKLLSYLDVEGNSINMVQMTFLK LLTASARQNFTYHCHQSAAWYDVSSGSYDKALRFLGSNDEEMSYDNNPFI KTLYDGCASRKGYEKTVIEINTPKIDQVPIVDVMINDFGDQNQKFGFEVG PVCFLG A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom kalciyu Lokalizovanij u pozaklitinnomu matriksi Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Zhidkova N I Justice S K Mayne R 1995 Alternative mRNA processing occurs in the variable region of the pro alpha 1 XI and pro alpha 2 XI collagen chains J Biol Chem 270 9486 9493 PMID 7721876 DOI 10 1074 jbc 270 16 9486 Yoshioka H Ramirez F 1990 Pro alpha 1 XI collagen Structure of the amino terminal propeptide and expression of the gene in tumor cell lines J Biol Chem 265 6423 6426 PMID 1690726PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z COL11A1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z COL11A1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 10 veresnya 2015 Procitovano 25 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 25 veresnya 2017 Procitovano 25 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 1 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi