AGRN (англ. Agrin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 067 амінокислот, а молекулярна маса — 217 232.
AGRN | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | AGRN, CMS8, CMSPPD, agrin | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 103320 MGI: 87961 HomoloGene: 27907 GeneCards: AGRN | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
congenital myasthenic syndrome 8 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 1.02 – 1.06 Mb | Хр. 4: 156.25 – 156.28 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAGRSHPGPL | RPLLPLLVVA | ACVLPGAGGT | CPERALERRE | EEANVVLTGT | ||||
VEEILNVDPV | QHTYSCKVRV | WRYLKGKDLV | ARESLLDGGN | KVVISGFGDP | ||||
LICDNQVSTG | DTRIFFVNPA | PPYLWPAHKN | ELMLNSSLMR | ITLRNLEEVE | ||||
FCVEDKPGTH | FTPVPPTPPD | ACRGMLCGFG | AVCEPNAEGP | GRASCVCKKS | ||||
PCPSVVAPVC | GSDASTYSNE | CELQRAQCSQ | QRRIRLLSRG | PCGSRDPCSN | ||||
VTCSFGSTCA | RSADGLTASC | LCPATCRGAP | EGTVCGSDGA | DYPGECQLLR | ||||
RACARQENVF | KKFDGPCDPC | QGALPDPSRS | CRVNPRTRRP | EMLLRPESCP | ||||
ARQAPVCGDD | GVTYENDCVM | GRSGAARGLL | LQKVRSGQCQ | GRDQCPEPCR | ||||
FNAVCLSRRG | RPRCSCDRVT | CDGAYRPVCA | QDGRTYDSDC | WRQQAECRQQ | ||||
RAIPSKHQGP | CDQAPSPCLG | VQCAFGATCA | VKNGQAACEC | LQACSSLYDP | ||||
VCGSDGVTYG | SACELEATAC | TLGREIQVAR | KGPCDRCGQC | RFGALCEAET | ||||
GRCVCPSECV | ALAQPVCGSD | GHTYPSECML | HVHACTHQIS | LHVASAGPCE | ||||
TCGDAVCAFG | AVCSAGQCVC | PRCEHPPPGP | VCGSDGVTYG | SACELREAAC | ||||
LQQTQIEEAR | AGPCEQAECG | SGGSGSGEDG | DCEQELCRQR | GGIWDEDSED | ||||
GPCVCDFSCQ | SVPGSPVCGS | DGVTYSTECE | LKKARCESQR | GLYVAAQGAC | ||||
RGPTFAPLPP | VAPLHCAQTP | YGCCQDNITA | ARGVGLAGCP | SACQCNPHGS | ||||
YGGTCDPATG | QCSCRPGVGG | LRCDRCEPGF | WNFRGIVTDG | RSGCTPCSCD | ||||
PQGAVRDDCE | QMTGLCSCKP | GVAGPKCGQC | PDGRALGPAG | CEADASAPAT | ||||
CAEMRCEFGA | RCVEESGSAH | CVCPMLTCPE | ANATKVCGSD | GVTYGNECQL | ||||
KTIACRQGLQ | ISIQSLGPCQ | EAVAPSTHPT | SASVTVTTPG | LLLSQALPAP | ||||
PGALPLAPSS | TAHSQTTPPP | SSRPRTTASV | PRTTVWPVLT | VPPTAPSPAP | ||||
SLVASAFGES | GSTDGSSDEE | LSGDQEASGG | GSGGLEPLEG | SSVATPGPPV | ||||
ERASCYNSAL | GCCSDGKTPS | LDAEGSNCPA | TKVFQGVLEL | EGVEGQELFY | ||||
TPEMADPKSE | LFGETARSIE | STLDDLFRNS | DVKKDFRSVR | LRDLGPGKSV | ||||
RAIVDVHFDP | TTAFRAPDVA | RALLRQIQVS | RRRSLGVRRP | LQEHVRFMDF | ||||
DWFPAFITGA | TSGAIAAGAT | ARATTASRLP | SSAVTPRAPH | PSHTSQPVAK | ||||
TTAAPTTRRP | PTTAPSRVPG | RRPPAPQQPP | KPCDSQPCFH | GGTCQDWALG | ||||
GGFTCSCPAG | RGGAVCEKVL | GAPVPAFEGR | SFLAFPTLRA | YHTLRLALEF | ||||
RALEPQGLLL | YNGNARGKDF | LALALLDGRV | QLRFDTGSGP | AVLTSAVPVE | ||||
PGQWHRLELS | RHWRRGTLSV | DGETPVLGES | PSGTDGLNLD | TDLFVGGVPE | ||||
DQAAVALERT | FVGAGLRGCI | RLLDVNNQRL | ELGIGPGAAT | RGSGVGECGD | ||||
HPCLPNPCHG | GAPCQNLEAG | RFHCQCPPGR | VGPTCADEKS | PCQPNPCHGA | ||||
APCRVLPEGG | AQCECPLGRE | GTFCQTASGQ | DGSGPFLADF | NGFSHLELRG | ||||
LHTFARDLGE | KMALEVVFLA | RGPSGLLLYN | GQKTDGKGDF | VSLALRDRRL | ||||
EFRYDLGKGA | AVIRSREPVT | LGAWTRVSLE | RNGRKGALRV | GDGPRVLGES | ||||
PKSRKVPHTV | LNLKEPLYVG | GAPDFSKLAR | AAAVSSGFDG | AIQLVSLGGR | ||||
QLLTPEHVLR | QVDVTSFAGH | PCTRASGHPC | LNGASCVPRE | AAYVCLCPGG | ||||
FSGPHCEKGL | VEKSAGDVDT | LAFDGRTFVE | YLNAVTESEL | ANEIPVPETL | ||||
DSGALHEKAL | QSNHFELSLR | TEATQGLVLW | SGKATERADY | VALAIVDGHL | ||||
QLSYNLGSQP | VVLRSTVPVN | TNRWLRVVAH | REQREGSLQV | GNEAPVTGSS | ||||
PLGATQLDTD | GALWLGGLPE | LPVGPALPKA | YGTGFVGCLR | DVVVGRHPLH | ||||
LLEDAVTKPE | LRPCPTP |
Кодований геном білок за функцією належить до . Задіяний у такому біологічному процесі як диференціація. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, позаклітинному матриксі, синапсах. Також секретований назовні.
Література
- Denzer A.J., Brandenberger R., Gesemann M., Chiquet M., Ruegg M.A. (1997). Agrin binds to the nerve-muscle basal lamina via laminin. J. Cell Biol. 137: 671—683. PMID 9151673 DOI:10.1083/jcb.137.3.671
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kumar P., Ferns M.J., Meizel S. (2006). Identification of agrinSN isoform and muscle-specific receptor tyrosine kinase (MuSK) in sperm. Biochem. Biophys. Res. Commun. 342: 522—528. PMID 16487930 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.01.161
- Zhang W., Coldefy A.S., Hubbard S.R., Burden S.J. (2011). Agrin binds to the N-terminal region of Lrp4 protein and stimulates association between Lrp4 and the first immunoglobulin-like domain in muscle-specific kinase (MuSK). J. Biol. Chem. 286: 40624—40630. PMID 21969364 DOI:10.1074/jbc.M111.279307
- Kumar P., Ferns M.J., Meizel S. (2006). Biochem. Biophys. Res. Commun. 344: 453—453.
{{}}
: Пропущений або порожній|title=
()
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з AGRN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:329 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
AGRN angl Agrin bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 2 067 aminokislot a molekulyarna masa 217 232 AGRNIdentifikatoriSimvoliAGRN CMS8 CMSPPD agrinZovnishni ID OMIM 103320 MGI 87961 HomoloGene 27907 GeneCards AGRNPov yazani genetichni zahvoryuvannyacongenital myasthenic syndrome 8 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya dystroglycan binding structural constituent of cytoskeleton GO 0001948 GO 0016582 protein binding heparan sulfate proteoglycan binding chondroitin sulfate binding laminin binding sialic acid binding calcium ion binding extracellular matrix structural constituentKlitinna komponenta integral component of membrane membrana GO 0005578 Pozaklitinna matricya klitinna membrana sinaps extracellular region mizhklitinni kontakti lysosomal lumen Golgi lumen ekzosoma gialoplazma bazalna membrana collagen containing extracellular matrixBiologichnij proces G protein coupled acetylcholine receptor signaling pathway glycosaminoglycan metabolic process clustering of voltage gated sodium channels diferenciaciya klitin positive regulation of synaptic assembly at neuromuscular junction synapse organization extracellular matrix organization receptor clustering retinoid metabolic process multicellular organism development GO 0032320 GO 0032321 GO 0032855 GO 0043089 GO 0032854 positive regulation of GTPase activity glycosaminoglycan catabolic process glycosaminoglycan biosynthetic process positive regulation of filopodium assembly GO 0072468 signalna transdukciya GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II cytoskeleton organization regulation of synaptic assembly at neuromuscular junction axon guidance neuromuscular junction development animal organ morphogenesis gistogenezDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez375790 11603Ensembl ENSG00000188157 ENSMUSG00000041936UniProt O00468 A2ASQ1RefSeq mRNK NM 001305275 NM 198576 NM 001364727NM 021604 NM 001369026 NM 001369027RefSeq bilok NP 001292204 NP 940978 NP 001351656NP 067617 NP 001355955 NP 001355956Lokus UCSC Hr 1 1 02 1 06 MbHr 4 156 25 156 28 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAGRSHPGPLRPLLPLLVVAACVLPGAGGTCPERALERREEEANVVLTGT VEEILNVDPVQHTYSCKVRVWRYLKGKDLVARESLLDGGNKVVISGFGDP LICDNQVSTGDTRIFFVNPAPPYLWPAHKNELMLNSSLMRITLRNLEEVE FCVEDKPGTHFTPVPPTPPDACRGMLCGFGAVCEPNAEGPGRASCVCKKS PCPSVVAPVCGSDASTYSNECELQRAQCSQQRRIRLLSRGPCGSRDPCSN VTCSFGSTCARSADGLTASCLCPATCRGAPEGTVCGSDGADYPGECQLLR RACARQENVFKKFDGPCDPCQGALPDPSRSCRVNPRTRRPEMLLRPESCP ARQAPVCGDDGVTYENDCVMGRSGAARGLLLQKVRSGQCQGRDQCPEPCR FNAVCLSRRGRPRCSCDRVTCDGAYRPVCAQDGRTYDSDCWRQQAECRQQ RAIPSKHQGPCDQAPSPCLGVQCAFGATCAVKNGQAACECLQACSSLYDP VCGSDGVTYGSACELEATACTLGREIQVARKGPCDRCGQCRFGALCEAET GRCVCPSECVALAQPVCGSDGHTYPSECMLHVHACTHQISLHVASAGPCE TCGDAVCAFGAVCSAGQCVCPRCEHPPPGPVCGSDGVTYGSACELREAAC LQQTQIEEARAGPCEQAECGSGGSGSGEDGDCEQELCRQRGGIWDEDSED GPCVCDFSCQSVPGSPVCGSDGVTYSTECELKKARCESQRGLYVAAQGAC RGPTFAPLPPVAPLHCAQTPYGCCQDNITAARGVGLAGCPSACQCNPHGS YGGTCDPATGQCSCRPGVGGLRCDRCEPGFWNFRGIVTDGRSGCTPCSCD PQGAVRDDCEQMTGLCSCKPGVAGPKCGQCPDGRALGPAGCEADASAPAT CAEMRCEFGARCVEESGSAHCVCPMLTCPEANATKVCGSDGVTYGNECQL KTIACRQGLQISIQSLGPCQEAVAPSTHPTSASVTVTTPGLLLSQALPAP PGALPLAPSSTAHSQTTPPPSSRPRTTASVPRTTVWPVLTVPPTAPSPAP SLVASAFGESGSTDGSSDEELSGDQEASGGGSGGLEPLEGSSVATPGPPV ERASCYNSALGCCSDGKTPSLDAEGSNCPATKVFQGVLELEGVEGQELFY TPEMADPKSELFGETARSIESTLDDLFRNSDVKKDFRSVRLRDLGPGKSV RAIVDVHFDPTTAFRAPDVARALLRQIQVSRRRSLGVRRPLQEHVRFMDF DWFPAFITGATSGAIAAGATARATTASRLPSSAVTPRAPHPSHTSQPVAK TTAAPTTRRPPTTAPSRVPGRRPPAPQQPPKPCDSQPCFHGGTCQDWALG GGFTCSCPAGRGGAVCEKVLGAPVPAFEGRSFLAFPTLRAYHTLRLALEF RALEPQGLLLYNGNARGKDFLALALLDGRVQLRFDTGSGPAVLTSAVPVE PGQWHRLELSRHWRRGTLSVDGETPVLGESPSGTDGLNLDTDLFVGGVPE DQAAVALERTFVGAGLRGCIRLLDVNNQRLELGIGPGAATRGSGVGECGD HPCLPNPCHGGAPCQNLEAGRFHCQCPPGRVGPTCADEKSPCQPNPCHGA APCRVLPEGGAQCECPLGREGTFCQTASGQDGSGPFLADFNGFSHLELRG LHTFARDLGEKMALEVVFLARGPSGLLLYNGQKTDGKGDFVSLALRDRRL EFRYDLGKGAAVIRSREPVTLGAWTRVSLERNGRKGALRVGDGPRVLGES PKSRKVPHTVLNLKEPLYVGGAPDFSKLARAAAVSSGFDGAIQLVSLGGR QLLTPEHVLRQVDVTSFAGHPCTRASGHPCLNGASCVPREAAYVCLCPGG FSGPHCEKGLVEKSAGDVDTLAFDGRTFVEYLNAVTESELANEIPVPETL DSGALHEKALQSNHFELSLRTEATQGLVLWSGKATERADYVALAIVDGHL QLSYNLGSQPVVLRSTVPVNTNRWLRVVAHREQREGSLQVGNEAPVTGSS PLGATQLDTDGALWLGGLPELPVGPALPKAYGTGFVGCLRDVVVGRHPLH LLEDAVTKPELRPCPTP A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak diferenciaciya Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionom kalciyu Lokalizovanij u klitinnij membrani membrani klitinnih kontaktah pozaklitinnomu matriksi sinapsah Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaDenzer A J Brandenberger R Gesemann M Chiquet M Ruegg M A 1997 Agrin binds to the nerve muscle basal lamina via laminin J Cell Biol 137 671 683 PMID 9151673 DOI 10 1083 jcb 137 3 671 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Kumar P Ferns M J Meizel S 2006 Identification of agrinSN isoform and muscle specific receptor tyrosine kinase MuSK in sperm Biochem Biophys Res Commun 342 522 528 PMID 16487930 DOI 10 1016 j bbrc 2006 01 161 Zhang W Coldefy A S Hubbard S R Burden S J 2011 Agrin binds to the N terminal region of Lrp4 protein and stimulates association between Lrp4 and the first immunoglobulin like domain in muscle specific kinase MuSK J Biol Chem 286 40624 40630 PMID 21969364 DOI 10 1074 jbc M111 279307 Kumar P Ferns M J Meizel S 2006 Biochem Biophys Res Commun 344 453 453 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Propushenij abo porozhnij title dovidka PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z AGRN pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 329 angl Procitovano 25 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 serpnya 2017 Procitovano 25 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 1 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi