Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

TATA бокс бокс Гольдштейна Гоґнесса послідовність промоторної ділянки більшості але не всіх генів еукароіот та архебакте

ТАТА-бокс

ТАТА-бокс

TATA-бокс (бокс Гольдштейна-Гоґнесса) — послідовність промоторної ділянки більшості (але не всіх) генів еукароіот та архебактерій. Зазвичай розташована у позиції −25 відносно точки початку транскрпипції. До TATA-боксу приєднуються загальні фактори транскрпиції, таким чином він бере участь у визначенні місця та частково напрямку транскрипції. Аналогічна за функціями ділянка у бактерій називається .

Історія дослідження

TATA-бокс був відкритий року Гоґнессом при порівнянні 5'-фланукючих послідовностей білок-кодуючих генів дрозофіли, ссавців та вірусів еукаріот. Майже у всіх генів, що транскрибуються РНК-полімеразою II, була виявлена послідовність TATAAA у положенні 25—30 нуклеотидів до точки початку транскрипції. TATA-бокс також був виявлений у Saccharomyces cerevisiae, проте у положенні −40 — −120.

Із розвитком методів трансфекції та in vitro транскрипції вдалось встановити, що мутації в цій послідовності зазвичай призводять до зменшення або повного зникнення активності промотора. У тих випадках коли активність залишалась, зазвичай спостерігалось зміщення точки початку транскрипції.

Поширення

Перші уявлення про те, що TATA-бокс може бути строго консервативною послідовністю, необхідною для ініціації транскрипції у всіх еукаріот, не знайшли підтвердження, оскільки було виявлено багато генів позбавлених його. Різні аналізи геному дрозофіли показали, що консенсусну послідовність TATAAA або послідовність із зміною одного нуклеотиду містять від 33 % до 43 % промоторів. В людини 32 % із 1031 потенційного промотора містили TATA-бокс.

Принаймні у деяких генах ТАТА-бокс був виявлений у всіх досліджених тварин, рослин та грибів, а також багатьох архей. Позбавлені такої послідовності деякі древні паразитичні найпростіші.

Функціонування

Консенсус послідовність TATA-боксу: 5'-ТАТА(А/T)А(А/T)-3'. Він розпізнається білком TBP (англ. TATA-binding protein), який входить до складу загального фактора транскрипції (транскрипційний фактор D для РНК-полімерази II). Крім TBP TFIID містить також близько TBP-асоційованих факторів (англ. TBP-associated factors, TAFs).

TBP — один із найдревніших і найважливіших транскприпційних факторів, він дуже мало змінився впродовж еволюції. ДНК-зв'язуюча ділянка цього білка має форму сідла, кожна половина представлена 5-ланцюговою антипаралельною β-структурою. Вісім із десяти β-ланцюгів завдяки гідрофобним взаємодіям зв'язуються із малим жолобком подвійної спіралі ДНК. Приєднання TBP до ДНК викликає її деформацію і згинання, що сприяє розходженню двох її ланцюгів. Розходження також полегшується тим, що TATA-бокс майже завжди складається тільки із пар нуклеотдиів А-Т, між якими утворюється тільки два водневі зв'язки, на противагу Г-Ц парам, азотисті основи в яких сполучені трьома зв'язками. Деформація ДНК і розходження її ланцюгів слугує «позначкою» активного промотора і сприяє приєднанню інших факторів транскрипції.

Джерела

  • Alberts B, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P (2007). (вид. 5th). Garland Science. ISBN . Архів оригіналу за 22 липня 2011. Процитовано 9 квітня 2012.
  • Tamarin RH (2001). Principles of Genetics (вид. 7th). Mcgraw-Hill. ISBN .
  • Robinson R., et al. Encyclopedia of Genetics. — Macmillan, 2003. — Т. 4. — С. 112. — .
  • Smale ST, Kadonaga JT (2003). The RNA polymerase II core promoter. Annu Rev Biochem. 72: 449—79. doi:10.1146/annurev.biochem.72.121801.161520. PMID 12651739.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

TATA boks boks Goldshtejna Gognessa poslidovnist promotornoyi dilyanki bilshosti ale ne vsih geniv eukaroiot ta arhebakterij Zazvichaj roztashovana u poziciyi 25 vidnosno tochki pochatku transkrpipciyi Do TATA boksu priyednuyutsya zagalni faktori transkrpiciyi takim chinom vin bere uchast u viznachenni miscya ta chastkovo napryamku transkripciyi Analogichna za funkciyami dilyanka u bakterij nazivayetsya Istoriya doslidzhennyaTATA boks buv vidkritij roku Gognessom pri porivnyanni 5 flanukyuchih poslidovnostej bilok koduyuchih geniv drozofili ssavciv ta virusiv eukariot Majzhe u vsih geniv sho transkribuyutsya RNK polimerazoyu II bula viyavlena poslidovnist TATAAA u polozhenni 25 30 nukleotidiv do tochki pochatku transkripciyi TATA boks takozh buv viyavlenij u Saccharomyces cerevisiae prote u polozhenni 40 120 Iz rozvitkom metodiv transfekciyi ta in vitro transkripciyi vdalos vstanoviti sho mutaciyi v cij poslidovnosti zazvichaj prizvodyat do zmenshennya abo povnogo zniknennya aktivnosti promotora U tih vipadkah koli aktivnist zalishalas zazvichaj sposterigalos zmishennya tochki pochatku transkripciyi PoshirennyaPershi uyavlennya pro te sho TATA boks mozhe buti strogo konservativnoyu poslidovnistyu neobhidnoyu dlya iniciaciyi transkripciyi u vsih eukariot ne znajshli pidtverdzhennya oskilki bulo viyavleno bagato geniv pozbavlenih jogo Rizni analizi genomu drozofili pokazali sho konsensusnu poslidovnist TATAAA abo poslidovnist iz zminoyu odnogo nukleotidu mistyat vid 33 do 43 promotoriv V lyudini 32 iz 1031 potencijnogo promotora mistili TATA boks Prinajmni u deyakih genah TATA boks buv viyavlenij u vsih doslidzhenih tvarin roslin ta gribiv a takozh bagatoh arhej Pozbavleni takoyi poslidovnosti deyaki drevni parazitichni najprostishi FunkcionuvannyaKonsensus poslidovnist TATA boksu 5 TATA A T A A T 3 Vin rozpiznayetsya bilkom TBP angl TATA binding protein yakij vhodit do skladu zagalnogo faktora transkripciyi transkripcijnij faktor D dlya RNK polimerazi II Krim TBP TFIID mistit takozh blizko TBP asocijovanih faktoriv angl TBP associated factors TAFs TBP odin iz najdrevnishih i najvazhlivishih transkpripcijnih faktoriv vin duzhe malo zminivsya vprodovzh evolyuciyi DNK zv yazuyucha dilyanka cogo bilka maye formu sidla kozhna polovina predstavlena 5 lancyugovoyu antiparalelnoyu b strukturoyu Visim iz desyati b lancyugiv zavdyaki gidrofobnim vzayemodiyam zv yazuyutsya iz malim zholobkom podvijnoyi spirali DNK Priyednannya TBP do DNK viklikaye yiyi deformaciyu i zginannya sho spriyaye rozhodzhennyu dvoh yiyi lancyugiv Rozhodzhennya takozh polegshuyetsya tim sho TATA boks majzhe zavzhdi skladayetsya tilki iz par nukleotdiiv A T mizh yakimi utvoryuyetsya tilki dva vodnevi zv yazki na protivagu G C param azotisti osnovi v yakih spolucheni troma zv yazkami Deformaciya DNK i rozhodzhennya yiyi lancyugiv sluguye poznachkoyu aktivnogo promotora i spriyaye priyednannyu inshih faktoriv transkripciyi DzherelaAlberts B Johnson A Lewis J Raff M Roberts K Walter P 2007 vid 5th Garland Science ISBN 978 0 8153 4105 5 Arhiv originalu za 22 lipnya 2011 Procitovano 9 kvitnya 2012 Tamarin RH 2001 Principles of Genetics vid 7th Mcgraw Hill ISBN 0072334193 Robinson R et al Encyclopedia of Genetics Macmillan 2003 T 4 S 112 ISBN 0 02 865610 5 Smale ST Kadonaga JT 2003 The RNA polymerase II core promoter Annu Rev Biochem 72 449 79 doi 10 1146 annurev biochem 72 121801 161520 PMID 12651739

Дата публікації:
Топ