Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

Цю статтю треба вікіфікувати для відповідності стандартам якості Вікіпедії Будь ласка допоможіть додаванням доречних вну

Обчислювальна геноміка

Обчислювальна геноміка
Цю статтю треба для відповідності Вікіпедії. Будь ласка, допоможіть додаванням доречних внутрішніх посилань або . (жовтень 2017)

Обчислювальна геноміка використовує обчислювальний аналіз, щоб розшифрувати послідовності генома і пов'язані з ними дані, включаючи послідовності ДНК і РНК. Також обчислювальна геноміка може бути визначена як розділ біоінформатики, але з тією відмінністю, що увага приділяється аналізу повних геномів (а не окремих генів), щоб зрозуміти принципи того, як різна ДНК управляє організмом на молекулярному рівні.

Історія

Обчислювальна геноміка почала свій розвиток одночасно з біоінформатикою. У 1960-х роках Маргарет Дейгофф і інші в Національному Біомедичному Дослідницькому фонді створили бази різних послідовностей білків для еволюційного дослідження. У їх дослідженні будувалося філогенетичне дерево, яке визначило зміни, потрібні для того щоб певний білок еволюціонував в інший білок. Це привело до створення матриці замін, яка оцінює імовірність зв'язку одного білка з іншим.

Починаючи з 1980-х років, стали з'являтися бази даних з геномними послідовностями, але при цьому виникли нові проблеми при пошуку і порівнянні даних про окремі гени. На відміну від алгоритмів пошуку текстів, які використовуються на вебсайтах, при пошуку генетичної схожості необхідно виявляти послідовності, які не обов'язково ідентичні, але і просто схожі. Це привело до появи , який є алгоритмом динамічного програмування для того, щоб порівняти набори послідовностей амінокислот один з одним при використанні матриць замін, отриманих у більш ранньому дослідженні М. Дейхофф. Пізніше з'явився алгоритм , який дозволяє здійснювати швидкий і оптимізований пошук у базах цих послідовностей генів. BLAST і його модифікації — одні з найширше використовуваних алгоритмів для цієї мети.

Поява фрази «обчислювальна геноміка» збігається з появою повних анотованих геномів у другій половині 1990-х років. Перша щорічна конференції з питань обчислювальної геноміки була організована ученими з Інституту геномних досліджень (TIGR) в 1998, забезпечуючи форум для цієї спеціальності і ефективно відрізняючи цю галузь науки від загальніших областей геноміки або обчислювальній біології. Уперше в науковій літературі цей термін, згідно MEDLINE, був використаний одним роком раніше (у журналі Nucleic Acids Research).

Див. також

Примітки

  1. Koonin EV (2001) Computational Genomics, National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, NIH (PubMed ID: 11267880)
  2. . Архів оригіналу за 22 березня 2018. Процитовано 7 жовтня 2017.
  3. David Mount (2000), Bioinformatics, Sequence and Genome Analysis, pp. 2-3, Cold Spring Harbor Laboratory Press,
  4. T.A. Brown(1999), Genomes, John Wiley & Sons,
  5. [backPid]=67&cHash=fd69079f5e [[https://web.archive.org/web/20170107160058/http://www.jcvi.org/cms/press/press-releases/full-text/archive/2004//article/computational-genomics-conference-to-attract-leading-scientists/?tx_ttnews Архівовано 7 січня 2017 у Wayback Machine.] The 7th Annual Conference on Computational Genomics (2004)]
  6. The 9th Annual Conference on Computational Genomics (2006) [ 2007-02-12 у Wayback Machine.]
  7. A. Wagner(1997), A computational genomics approach to the identification of gene networks, Nucleic Acids Res., Sep 15;25 (18): 3594-604, ISSN 0305-1048
В іншому мовному розділі є повніша стаття Computational genomics(англ.). Ви можете допомогти, розширивши поточну статтю за допомогою з англійської.
  • Дивитись автоперекладену версію статті з мови «англійська».
  • Перекладач повинен розуміти, що відповідальність за кінцевий вміст статті у Вікіпедії несе саме автор редагувань. Онлайн-переклад надається лише як корисний інструмент перегляду вмісту зрозумілою мовою. Не використовуйте невичитаний і невідкоригований машинний переклад у статтях української Вікіпедії!
  • Машинний переклад Google є корисною відправною точкою для перекладу, але перекладачам необхідно виправляти помилки та підтверджувати точність перекладу, а не просто скопіювати машинний переклад до української Вікіпедії.
  • Не перекладайте текст, який видається недостовірним або неякісним. Якщо можливо, перевірте текст за посиланнями, поданими в іншомовній статті.
  • Докладні рекомендації: див. .

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

Cyu stattyu treba vikifikuvati dlya vidpovidnosti standartam yakosti Vikipediyi Bud laska dopomozhit dodavannyam dorechnih vnutrishnih posilan abo vdoskonalennyam rozmitki statti zhovten 2017 Obchislyuvalna genomika vikoristovuye obchislyuvalnij analiz shob rozshifruvati poslidovnosti genoma i pov yazani z nimi dani vklyuchayuchi poslidovnosti DNK i RNK Takozh obchislyuvalna genomika mozhe buti viznachena yak rozdil bioinformatiki ale z tiyeyu vidminnistyu sho uvaga pridilyayetsya analizu povnih genomiv a ne okremih geniv shob zrozumiti principi togo yak rizna DNK upravlyaye organizmom na molekulyarnomu rivni IstoriyaObchislyuvalna genomika pochala svij rozvitok odnochasno z bioinformatikoyu U 1960 h rokah Margaret Dejgoff i inshi v Nacionalnomu Biomedichnomu Doslidnickomu fondi stvorili bazi riznih poslidovnostej bilkiv dlya evolyucijnogo doslidzhennya U yih doslidzhenni buduvalosya filogenetichne derevo yake viznachilo zmini potribni dlya togo shob pevnij bilok evolyucionuvav v inshij bilok Ce privelo do stvorennya matrici zamin yaka ocinyuye imovirnist zv yazku odnogo bilka z inshim Pochinayuchi z 1980 h rokiv stali z yavlyatisya bazi danih z genomnimi poslidovnostyami ale pri comu vinikli novi problemi pri poshuku i porivnyanni danih pro okremi geni Na vidminu vid algoritmiv poshuku tekstiv yaki vikoristovuyutsya na vebsajtah pri poshuku genetichnoyi shozhosti neobhidno viyavlyati poslidovnosti yaki ne obov yazkovo identichni ale i prosto shozhi Ce privelo do poyavi yakij ye algoritmom dinamichnogo programuvannya dlya togo shob porivnyati nabori poslidovnostej aminokislot odin z odnim pri vikoristanni matric zamin otrimanih u bilsh rannomu doslidzhenni M Dejhoff Piznishe z yavivsya algoritm yakij dozvolyaye zdijsnyuvati shvidkij i optimizovanij poshuk u bazah cih poslidovnostej geniv BLAST i jogo modifikaciyi odni z najshirshe vikoristovuvanih algoritmiv dlya ciyeyi meti Poyava frazi obchislyuvalna genomika zbigayetsya z poyavoyu povnih anotovanih genomiv u drugij polovini 1990 h rokiv Persha shorichna konferenciyi z pitan obchislyuvalnoyi genomiki bula organizovana uchenimi z Institutu genomnih doslidzhen TIGR v 1998 zabezpechuyuchi forum dlya ciyeyi specialnosti i efektivno vidriznyayuchi cyu galuz nauki vid zagalnishih oblastej genomiki abo obchislyuvalnij biologiyi Upershe v naukovij literaturi cej termin zgidno MEDLINE buv vikoristanij odnim rokom ranishe u zhurnali Nucleic Acids Research Div takozhObchislyuvalna biologiya Teoretichna informatika Strukturna genomikaPrimitkiKoonin EV 2001 Computational Genomics National Center for Biotechnology Information National Library of Medicine NIH PubMed ID 11267880 Arhiv originalu za 22 bereznya 2018 Procitovano 7 zhovtnya 2017 David Mount 2000 Bioinformatics Sequence and Genome Analysis pp 2 3 Cold Spring Harbor Laboratory Press ISBN 0 87969 597 8 T A Brown 1999 Genomes John Wiley amp Sons ISBN 0 471 31618 0 backPid 67 amp cHash fd69079f5e https web archive org web 20170107160058 http www jcvi org cms press press releases full text archive 2004 article computational genomics conference to attract leading scientists tx ttnews Arhivovano7 sichnya 2017 u Wayback Machine The 7th Annual Conference on Computational Genomics 2004 The 9th Annual Conference on Computational Genomics 2006 2007 02 12 u Wayback Machine A Wagner 1997 A computational genomics approach to the identification of gene networks Nucleic Acids Res Sep 15 25 18 3594 604 ISSN 0305 1048 V inshomu movnomu rozdili ye povnisha stattya Computational genomics angl Vi mozhete dopomogti rozshirivshi potochnu stattyu za dopomogoyu perekladu z anglijskoyi Divitis avtoperekladenu versiyu statti z movi anglijska Perekladach povinen rozumiti sho vidpovidalnist za kincevij vmist statti u Vikipediyi nese same avtor redaguvan Onlajn pereklad nadayetsya lishe yak korisnij instrument pereglyadu vmistu zrozumiloyu movoyu Ne vikoristovujte nevichitanij i nevidkorigovanij mashinnij pereklad u stattyah ukrayinskoyi Vikipediyi Mashinnij pereklad Google ye korisnoyu vidpravnoyu tochkoyu dlya perekladu ale perekladacham neobhidno vipravlyati pomilki ta pidtverdzhuvati tochnist perekladu a ne prosto skopiyuvati mashinnij pereklad do ukrayinskoyi Vikipediyi Ne perekladajte tekst yakij vidayetsya nedostovirnim abo neyakisnim Yaksho mozhlivo perevirte tekst za posilannyami podanimi v inshomovnij statti Dokladni rekomendaciyi div Vikipediya Pereklad

Дата публікації:
Топ