Окремі положення цієї статті сумнівні. (березень 2023) |
Ця стаття про неакадемічні дослідження та концепції. (березень 2023) |
Ця стаття містить , що можуть не відповідати вимогам Вікіпедії до . (березень 2023) |
Генетична генеалогія — набір генетичних методів, що використовуються для досліджень з генеалогії. Зазвичай генетична генеалогія використовує спільно з традиційними генеалогічними методами дослідження. Успіх традиційних методів цілком залежить від збереження і існування документів (наприклад, переписних книг, літописів і т. д.). Кожна людина несе в собі свого роду «біологічний документ», який не може бути загублений, — це ДНК людини. Методи генетичної генеалогії дозволяють зокрема дістати доступ до тієї частини ДНК, яка передається незмінною від батька до сина по прямій чоловічій лінії, — Y-хромосомі.
ДНК-тест Y-хромосоми дозволяє, наприклад, двом чоловікам визначити чи розділяють вони загального предка по чоловічій лінії чи ні. ДНК-тест — не просто допомога в генеалогічних дослідженнях, це сучасний інструмент, який генеалоги можуть використовувати для того, щоб встановити або спростувати споріднені зв'язки між декількома людьми.
Генеалогія в біології — сукупність відомостей про батьків і віддаленіших предків конкретної особини чи групи особин рослин або тварин. Знаючи біологічні й продуктивні якості предків, а також родичів по так званій бічній лінії, можна правильніше підібрати пари для схрещування з метою одержання організмів з бажаними властивостями.
STR-профайлінг
В цьому тесті використовуються спеціальні ДНК-маркери, нуклеотидна послідовність у яких повторюється безліч разів, — (англ. Short Tandem Repeats, STR). Ці повтори можна знайти і проаналізувати за допомогою таких методів як ПЛР або секвенування ДНК. Прикладом STR може бути така послідовність ДНК так:
…CTGT TCTA TCTA TCTA TCTA TCTA TCTA TCTA TCTA TCTA TCTGCC…
Можна відмітити, що TCTA повторюється 9 разів, а оскільки цей STR-маркер називається DYS391 (DNA Y-chromosome Segment № 391) робиться запис: DYS391 = 9.
У цьому маркері число повторень може бути між 7 і 14. Y-хромосома унікальна в цьому відношенні, тому що не піддається кросинговеру з кожним новим поколінням. В результаті злиття яйцеклітини і сперматозоїда, дитина отримує гени, які будуть сумішшю генів батька і матері. Але Y-хромосома передається тільки від батька, таким чином число повторів в маркерах сина буде тим же самим, що і у його батька. Діаграма нижче показує шлях Y-хромосоми, яка подорожує вниз по всіх чоловічих лініях, таким чином генетичні кузени також розділять ту ж саму Y-хромосому.
Іноді число повторів збільшується або зменшується, зазвичай в одній з ліній. Таким чином, батько може мати DYS391 = 9, а його син DYS391 = 10. Це є прикладом мутації і трапляється, коли ДНК копіюється трохи неправильно. Варто відзначити, що це природне явище. Ці мутації дуже важливі, тому що учені знають частоту їх виникнення, і таким чином можна вирахувати приблизний час, коли жив найближчий спільний предок (MRCA).
Інтерпретація результатів
Після перевірки і об'єднання результатів декілька STR з одного геному визначається , який може бути представлений у вигляді послідовності числа кожного маркера. Тест з 21 маркера може бути схожий на дану таблицю:
STR Маркери Y-ДНК | ||||||||||||
19 | 385a | 385b | 388 | 389i | 389ii | 390 | 391 | 392 | 393 | 425 | 426 | |
Your Haplotype | 14 | 12 | 17 | 12 | 13 | 29 | 24 | 11 | 13 | 13 | 12 | 10 |
Маркери STR записані в заголовку, а сам гаплотип в елементах таблиці. Так, наприклад, для DYS19 написано 14 повторів. Гаплотип може дати інформацію про те, звідки походить ваша Y-хромосома, тобто прослідкувати шлях предків даної людини протягом 100 тисяч років. Наприклад, Атлантичний Модальний Гаплотип (AMH) визначений тільки шістьма маркерами, і це найзагальніший гаплотип у Західній Європі.
19 | 388 | 390 | 391 | 392 | 393 |
14 | 12 | 24 | 11 | 13 | 13 |
У базі даних YHRD [ 26 лютого 2010 у Wayback Machine.] кожен може порівняти його гаплотип з іншими занесеними в неї зразками. Ця база даних містить велику кількість євразійських зразків, а зараз містить ще і зразки американців і жителів східної Азії, а також ескімосів. База даних YHDR використовує до одинадцяти маркерів. Окрім цього, — корисний інструмент дослідника і дозволяє додати результати своїх тестів Y-хромосоми в базу даних.
Цікавий проект — база даних гаплотипів і генеалогічних даних — . Після заповнення в критеріях пошуку гаплотипу, програма видасть в результатах найближчі за збігами гаплотипи з прізвищами людей і покаже генеалогічне дерево, де буде вказаний передбачуваний загальний предок і всі інші зразки, з якими збіглися результати маркерів. У цій базі даних зареєстровано більше 50000 гаплотипів.
Тестування Y-хромосоми найцікавіше, якщо порівнювати результати двох і більше чоловік спільно з результатами традиційних генеалогічних пошуків. Нижче описаний гіпотетичний випадок, де три генетичні кузени з одним прізвищем пройшли тест. У якийсь момент у минулому цієї сім'ї відбулася єдина мутація в Y-хромосомі. Ця мутація залишила слід в ДНК всіх чоловіків цієї сім'ї. При порівнянні їх гаплотіпов спостерігається наступне:
Y-ДНК STR-маркери | ||||||||||||
19 | 385a | 385b | 388 | 389i | 389ii | 390 | 391 | 392 | 393 | 425 | 426 | |
Кузен 1 | 14 | 12 | 17 | 12 | 13 | 29 | 24 | 11 | 13 | 13 | 12 | 10 |
Кузен 2 | 14 | 12 | 17 | 12 | 13 | 29 | 24 | 11 | 13 | 13 | 12 | 10 |
Кузен 3 | 14 | 12 | 17 | 12 | 13 | 29 | 24 | 11 | 14 | 13 | 12 | 10 |
У цій таблиці більшість чисел збігаються, за винятком маркера поміченого сірим кольором. У учасника № 3 показана мутація в DYS392. Учасники № 1 і № 2, цифри яких повністю збігаються, дуже близькі родичі. Учасник № 3 теж є їх родичем, але більш далеким.
Використання результатів
Генетична генеалогія допомагає підтвердити результати традиційних архівних досліджень, показуючи що дві або більше людини з тим же прізвищем пов'язані спорідненістю, тобто мають загального предка. Оцінка часу життя їх гіпотетичного Спільного Предка зводиться до математики і статистики. Дослідження показують, що мутація в будь-якому маркері — окремий випадок, і відбувається приблизно кожні 500 поколінь (тобто раз в 10000 років). Якщо є точний збіг в 21 маркері, то середній час, що пройшов з тих пір, коли жив найближчий спільний предок (MRCA), тільки 8,3 поколінь. Якщо є хоч би одна єдина розбіжність (мутація), тоді час збільшується до 20,5 поколінь. Також генеалогічний тест допоможе встановити етнічне походження, походження предків, зрозуміти, кров яких етнічних народів тече у венах.
Скільки мутацій (невідповідностей) повинні бути присутніми в результатах тестів двох людей, щоб можна було виключити їх належність до одного клану? Велика кількість мутацій говорить про віддаленішу спорідненість або її відсутність. У випадку з 21 маркером 2 мутації між гаплотипами — це прикордонний результат, а 3 мутації зазвичай виключають взагалі достатньо близьку спорідненість між цими людьми (в межах тисячоліть).
Див. також
Примітки
- . 23 грудня 2018. Архів оригіналу за 23 січня 2019. Процитовано 22 січня 2019.
Посилання
- Тест ДНК [ 9 грудня 2018 у Wayback Machine.] для генеалогічних цілей: який вибрати? (рос.)
Це незавершена стаття з генетики. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Okremi polozhennya ciyeyi statti sumnivni Bud laska oznajomtesya z vidpovidnim ta za mozhlivosti vipravte nedoliki berezen 2023 Cya stattya pro neakademichni doslidzhennya ta koncepciyi Bud laska oznajomtesya z vidpovidnim i vidredagujte yiyi tak abi ce bulo chitko vidno yak z yiyi pershih rechen tak i z nastupnogo tekstu berezen 2023 Cya stattya mistit posilannya na dzherela sho mozhut ne vidpovidati vimogam Vikipediyi do avtoritetnih dzherel Bud laska perevirte chi vidpovidayut vkazanim kriteriyam dzherela vikoristani v cij statti berezen 2023 U Vikipediyi ye statti pro inshi znachennya cogo termina Genealogiya znachennya Genetichna genealogiya nabir genetichnih metodiv sho vikoristovuyutsya dlya doslidzhen z genealogiyi Zazvichaj genetichna genealogiya vikoristovuye spilno z tradicijnimi genealogichnimi metodami doslidzhennya Uspih tradicijnih metodiv cilkom zalezhit vid zberezhennya i isnuvannya dokumentiv napriklad perepisnih knig litopisiv i t d Kozhna lyudina nese v sobi svogo rodu biologichnij dokument yakij ne mozhe buti zagublenij ce DNK lyudini Metodi genetichnoyi genealogiyi dozvolyayut zokrema distati dostup do tiyeyi chastini DNK yaka peredayetsya nezminnoyu vid batka do sina po pryamij cholovichij liniyi Y hromosomi DNK test Y hromosomi dozvolyaye napriklad dvom cholovikam viznachiti chi rozdilyayut voni zagalnogo predka po cholovichij liniyi chi ni DNK test ne prosto dopomoga v genealogichnih doslidzhennyah ce suchasnij instrument yakij genealogi mozhut vikoristovuvati dlya togo shob vstanoviti abo sprostuvati sporidneni zv yazki mizh dekilkoma lyudmi Genealogiya v biologiyi sukupnist vidomostej pro batkiv i viddalenishih predkiv konkretnoyi osobini chi grupi osobin roslin abo tvarin Znayuchi biologichni j produktivni yakosti predkiv a takozh rodichiv po tak zvanij bichnij liniyi mozhna pravilnishe pidibrati pari dlya shreshuvannya z metoyu oderzhannya organizmiv z bazhanimi vlastivostyami STR profajlingV comu testi vikoristovuyutsya specialni DNK markeri nukleotidna poslidovnist u yakih povtoryuyetsya bezlich raziv angl Short Tandem Repeats STR Ci povtori mozhna znajti i proanalizuvati za dopomogoyu takih metodiv yak PLR abo sekvenuvannya DNK Prikladom STR mozhe buti taka poslidovnist DNK tak CTGT TCTA TCTA TCTA TCTA TCTA TCTA TCTA TCTA TCTA TCTGCC Mozhna vidmititi sho TCTA povtoryuyetsya 9 raziv a oskilki cej STR marker nazivayetsya DYS391 DNA Y chromosome Segment 391 robitsya zapis DYS391 9 U comu markeri chislo povtoren mozhe buti mizh 7 i 14 Y hromosoma unikalna v comu vidnoshenni tomu sho ne piddayetsya krosingoveru z kozhnim novim pokolinnyam V rezultati zlittya yajceklitini i spermatozoyida ditina otrimuye geni yaki budut sumishshyu geniv batka i materi Ale Y hromosoma peredayetsya tilki vid batka takim chinom chislo povtoriv v markerah sina bude tim zhe samim sho i u jogo batka Diagrama nizhche pokazuye shlyah Y hromosomi yaka podorozhuye vniz po vsih cholovichih liniyah takim chinom genetichni kuzeni takozh rozdilyat tu zh samu Y hromosomu Inodi chislo povtoriv zbilshuyetsya abo zmenshuyetsya zazvichaj v odnij z linij Takim chinom batko mozhe mati DYS391 9 a jogo sin DYS391 10 Ce ye prikladom mutaciyi i traplyayetsya koli DNK kopiyuyetsya trohi nepravilno Varto vidznachiti sho ce prirodne yavishe Ci mutaciyi duzhe vazhlivi tomu sho ucheni znayut chastotu yih viniknennya i takim chinom mozhna virahuvati pribliznij chas koli zhiv najblizhchij spilnij predok MRCA Interpretaciya rezultativPislya perevirki i ob yednannya rezultativ dekilka STR z odnogo genomu viznachayetsya yakij mozhe buti predstavlenij u viglyadi poslidovnosti chisla kozhnogo markera Test z 21 markera mozhe buti shozhij na danu tablicyu STR Markeri Y DNK 19385a385b388389i389ii 390391392393425426 Your Haplotype1412171213 292411131312 10 Markeri STR zapisani v zagolovku a sam gaplotip v elementah tablici Tak napriklad dlya DYS19 napisano 14 povtoriv Gaplotip mozhe dati informaciyu pro te zvidki pohodit vasha Y hromosoma tobto proslidkuvati shlyah predkiv danoyi lyudini protyagom 100 tisyach rokiv Napriklad Atlantichnij Modalnij Gaplotip AMH viznachenij tilki shistma markerami i ce najzagalnishij gaplotip u Zahidnij Yevropi 19388390391392393 141224111313 U bazi danih YHRD 26 lyutogo 2010 u Wayback Machine kozhen mozhe porivnyati jogo gaplotip z inshimi zanesenimi v neyi zrazkami Cya baza danih mistit veliku kilkist yevrazijskih zrazkiv a zaraz mistit she i zrazki amerikanciv i zhiteliv shidnoyi Aziyi a takozh eskimosiv Baza danih YHDR vikoristovuye do odinadcyati markeriv Okrim cogo korisnij instrument doslidnika i dozvolyaye dodati rezultati svoyih testiv Y hromosomi v bazu danih Cikavij proekt baza danih gaplotipiv i genealogichnih danih Pislya zapovnennya v kriteriyah poshuku gaplotipu programa vidast v rezultatah najblizhchi za zbigami gaplotipi z prizvishami lyudej i pokazhe genealogichne derevo de bude vkazanij peredbachuvanij zagalnij predok i vsi inshi zrazki z yakimi zbiglisya rezultati markeriv U cij bazi danih zareyestrovano bilshe 50000 gaplotipiv Testuvannya Y hromosomi najcikavishe yaksho porivnyuvati rezultati dvoh i bilshe cholovik spilno z rezultatami tradicijnih genealogichnih poshukiv Nizhche opisanij gipotetichnij vipadok de tri genetichni kuzeni z odnim prizvishem projshli test U yakijs moment u minulomu ciyeyi sim yi vidbulasya yedina mutaciya v Y hromosomi Cya mutaciya zalishila slid v DNK vsih cholovikiv ciyeyi sim yi Pri porivnyanni yih gaplotipov sposterigayetsya nastupne Y DNK STR markeri 19385a385b388389i389ii390391392393425426 Kuzen 1141217121329241113131210 Kuzen 2141217121329241113131210 Kuzen 3141217121329241114131210 U cij tablici bilshist chisel zbigayutsya za vinyatkom markera pomichenogo sirim kolorom U uchasnika 3 pokazana mutaciya v DYS392 Uchasniki 1 i 2 cifri yakih povnistyu zbigayutsya duzhe blizki rodichi Uchasnik 3 tezh ye yih rodichem ale bilsh dalekim Vikoristannya rezultativGenetichna genealogiya dopomagaye pidtverditi rezultati tradicijnih arhivnih doslidzhen pokazuyuchi sho dvi abo bilshe lyudini z tim zhe prizvishem pov yazani sporidnenistyu tobto mayut zagalnogo predka Ocinka chasu zhittya yih gipotetichnogo Spilnogo Predka zvoditsya do matematiki i statistiki Doslidzhennya pokazuyut sho mutaciya v bud yakomu markeri okremij vipadok i vidbuvayetsya priblizno kozhni 500 pokolin tobto raz v 10000 rokiv Yaksho ye tochnij zbig v 21 markeri to serednij chas sho projshov z tih pir koli zhiv najblizhchij spilnij predok MRCA tilki 8 3 pokolin Yaksho ye hoch bi odna yedina rozbizhnist mutaciya todi chas zbilshuyetsya do 20 5 pokolin Takozh genealogichnij test dopomozhe vstanoviti etnichne pohodzhennya pohodzhennya predkiv zrozumiti krov yakih etnichnih narodiv teche u venah Skilki mutacij nevidpovidnostej povinni buti prisutnimi v rezultatah testiv dvoh lyudej shob mozhna bulo viklyuchiti yih nalezhnist do odnogo klanu Velika kilkist mutacij govorit pro viddalenishu sporidnenist abo yiyi vidsutnist U vipadku z 21 markerom 2 mutaciyi mizh gaplotipami ce prikordonnij rezultat a 3 mutaciyi zazvichaj viklyuchayut vzagali dostatno blizku sporidnenist mizh cimi lyudmi v mezhah tisyacholit Div takozhGaplogrupa Y hromosomaPrimitki 23 grudnya 2018 Arhiv originalu za 23 sichnya 2019 Procitovano 22 sichnya 2019 PosilannyaTest DNK 9 grudnya 2018 u Wayback Machine dlya genealogichnih cilej yakij vibrati ros Ce nezavershena stattya z genetiki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi