Антисенс РНК (асРНК, антизмістовна РНК, asRNA, англ. antisense RNA) – це широкий клас РНК, що транскрибуються з протилежного, комплементарного ланцюга ДНК від того, з якого синтезуються РНК, що кодують гени (змістовні або сенс РНК). Оскільки гени можуть кодувати послідовність мРНК, що буде потім використана для синтезу білка (трансляції) але існують і такі гени, що кодують нкРНК, нуклеотидна послідовність яких не буде безпосередньо переведена у амінокислотну послідовність білку, то обидва – сенсовий і антисенсовий – транскрипти, що синтезуються з одного локусу, можуть бути некодуючими РНК. В такому випадку нкРНК, що була вперше описана і функції якої були встановлені, називається сенсовою, а комплементарна їй – асРНК (найвідоміший приклад – (Xist) та (Tsix): довгі нкРНК, що виконують специфічні функції при інактивації X-хромосоми).
Частина асРНК синтезуються з того самого локусу, що і сенсові РНК, частково або повністю перекриваючи ділянки ДНК в яких вони закодовані – це так звані цис-транскрипти і вони повністю комплементарні зі сенсовими РНК в тій ділянці, де є перекривання. Є ще транс-закодовані РНК – вони формуються з іншого локусу і можуть бути лише частково комплементарними сенсовим РНК.
Історія відкриття
Антисенсові транскрипти були знайдені у прокаріотів більше ніж 40 років тому. Вперше синтез сенсової та антисенсової РНК були показані для гену cro вірусу бактеріофага лямбда (фаг λ) на початку 70х років 20 сторіччя. Автори зробили припущення що такий дво-направлений синтез РНК може грати регуляторні ролі у вірусі фага λ і можливо комплементарне з'єднання РНК буде зменшувати рівень мРНК гену cro, що й призводить до лізогенії в період інфекції. І лише через 10 років, на початку 80х, було показано що у бактерії Escherichia coli асРНК контролює дозрівання праймеру плазміди ColE1 для реплікації ДНК. Пізніше асРНК були відкриті для багатьох прокаріотів, для яких антисенсові РНК виконують широкий набір функцій: транспозиції (переміщення частин ДНК, транспозонів), реплікація плазмід, кон'югація, експресія генів бактерій, часовий контроль розвитку бактеріофагів.
Пізніше асРНК були знайдені і у еукаріотів. У 1981 році вперше була представлена транскрипція з двох ланцюгів ДНК людської та мишиної мітохондріальної ДНК. Мітохондріальна ДНК дуже "економна" – ділянки між сусідніми генами мають невелику кількість некодуючих нуклеотидів і наявні транскрипти, що синтезуються в сенсовому і антисенсовому напрямках. У 1986 році було показано асРНК для ядерної ДНК у плодової мухи Drosophila.
Примітки
- Vicent Pelechano & Lars M. Steinmetz (December 2013). Gene regulation by antisense transcription. Nature reviews. Genetics. 14 (12): 880—893. doi:10.1038/nrg3594. PMID 24217315.
- W. G. Spiegelman, L. F. Reichardt, M. Yaniv, S. F. Heinemann, A. D. Kaiser & H. Eisen (November 1972). Bidirectional transcription and the regulation of Phage lambda repressor synthesis. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 69 (11): 3156—3160. PMID 4508309.
- E. G. Wagner & R. W. Simons (1994). Antisense RNA control in bacteria, phages, and plasmids. Annual review of microbiology. 48: 713—742. doi:10.1146/annurev.mi.48.100194.003433. PMID 7826024.
- C. Vanhee-Brossollet & C. Vaquero (April 1998). Do natural antisense transcripts make sense in eukaryotes?. [en]. 211 (1): 1—9. PMID 9573333.
- S. Anderson, A. T. Bankier, B. G. Barrell, M. H. de Bruijn, A. R. Coulson, J. Drouin, I. C. Eperon, D. P. Nierlich, B. A. Roe, F. Sanger, P. H. Schreier, A. J. Smith, R. Staden & I. G. Young (April 1981). Sequence and organization of the human mitochondrial genome. Nature. 290 (5806): 457—465. PMID 7219534.
- M. J. Bibb, R. A. Van Etten, C. T. Wright, M. W. Walberg & D. A. Clayton (October 1981). Sequence and gene organization of mouse mitochondrial DNA. Cell. 26 (2 Pt 2): 167—180. PMID 7332926.
- S. Henikoff, M. A. Keene, K. Fechtel & J. W. Fristrom (January 1986). Gene within a gene: nested Drosophila genes encode unrelated proteins on opposite DNA strands. Cell. 44 (1): 33—42. PMID 3079672.
- C. A. Spencer, R. D. Gietz & R. B. Hodgetts (July 1986). Overlapping transcription units in the dopa decarboxylase region of Drosophila. Nature. 322 (6076): 279—281. doi:10.1038/322279a0. PMID 2874495.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Antisens RNK asRNK antizmistovna RNK asRNA angl antisense RNA ce shirokij klas RNK sho transkribuyutsya z protilezhnogo komplementarnogo lancyuga DNK vid togo z yakogo sintezuyutsya RNK sho koduyut geni zmistovni abo sens RNK Oskilki geni mozhut koduvati poslidovnist mRNK sho bude potim vikoristana dlya sintezu bilka translyaciyi ale isnuyut i taki geni sho koduyut nkRNK nukleotidna poslidovnist yakih ne bude bezposeredno perevedena u aminokislotnu poslidovnist bilku to obidva sensovij i antisensovij transkripti sho sintezuyutsya z odnogo lokusu mozhut buti nekoduyuchimi RNK V takomu vipadku nkRNK sho bula vpershe opisana i funkciyi yakoyi buli vstanovleni nazivayetsya sensovoyu a komplementarna yij asRNK najvidomishij priklad Xist ta Tsix dovgi nkRNK sho vikonuyut specifichni funkciyi pri inaktivaciyi X hromosomi Shematichne zobrazhennya centru inaktivaciyi X hromosomi u mishej v mezhah yakogo zakodovani geni nkRNK Xist ta antisensovij jomu Tsix Chastina asRNK sintezuyutsya z togo samogo lokusu sho i sensovi RNK chastkovo abo povnistyu perekrivayuchi dilyanki DNK v yakih voni zakodovani ce tak zvani cis transkripti i voni povnistyu komplementarni zi sensovimi RNK v tij dilyanci de ye perekrivannya Ye she trans zakodovani RNK voni formuyutsya z inshogo lokusu i mozhut buti lishe chastkovo komplementarnimi sensovim RNK Istoriya vidkrittyaAntisensovi transkripti buli znajdeni u prokariotiv bilshe nizh 40 rokiv tomu Vpershe sintez sensovoyi ta antisensovoyi RNK buli pokazani dlya genu cro virusu bakteriofaga lyambda fag l na pochatku 70h rokiv 20 storichchya Avtori zrobili pripushennya sho takij dvo napravlenij sintez RNK mozhe grati regulyatorni roli u virusi faga l i mozhlivo komplementarne z yednannya RNK bude zmenshuvati riven mRNK genu cro sho j prizvodit do lizogeniyi v period infekciyi I lishe cherez 10 rokiv na pochatku 80h bulo pokazano sho u bakteriyi Escherichia coli asRNK kontrolyuye dozrivannya prajmeru plazmidi ColE1 dlya replikaciyi DNK Piznishe asRNK buli vidkriti dlya bagatoh prokariotiv dlya yakih antisensovi RNK vikonuyut shirokij nabir funkcij transpoziciyi peremishennya chastin DNK transpozoniv replikaciya plazmid kon yugaciya ekspresiya geniv bakterij chasovij kontrol rozvitku bakteriofagiv Piznishe asRNK buli znajdeni i u eukariotiv U 1981 roci vpershe bula predstavlena transkripciya z dvoh lancyugiv DNK lyudskoyi ta mishinoyi mitohondrialnoyi DNK Mitohondrialna DNK duzhe ekonomna dilyanki mizh susidnimi genami mayut neveliku kilkist nekoduyuchih nukleotidiv i nayavni transkripti sho sintezuyutsya v sensovomu i antisensovomu napryamkah U 1986 roci bulo pokazano asRNK dlya yadernoyi DNK u plodovoyi muhi Drosophila PrimitkiVicent Pelechano amp Lars M Steinmetz December 2013 Gene regulation by antisense transcription Nature reviews Genetics 14 12 880 893 doi 10 1038 nrg3594 PMID 24217315 W G Spiegelman L F Reichardt M Yaniv S F Heinemann A D Kaiser amp H Eisen November 1972 Bidirectional transcription and the regulation of Phage lambda repressor synthesis Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 69 11 3156 3160 PMID 4508309 E G Wagner amp R W Simons 1994 Antisense RNA control in bacteria phages and plasmids Annual review of microbiology 48 713 742 doi 10 1146 annurev mi 48 100194 003433 PMID 7826024 C Vanhee Brossollet amp C Vaquero April 1998 Do natural antisense transcripts make sense in eukaryotes en 211 1 1 9 PMID 9573333 S Anderson A T Bankier B G Barrell M H de Bruijn A R Coulson J Drouin I C Eperon D P Nierlich B A Roe F Sanger P H Schreier A J Smith R Staden amp I G Young April 1981 Sequence and organization of the human mitochondrial genome Nature 290 5806 457 465 PMID 7219534 M J Bibb R A Van Etten C T Wright M W Walberg amp D A Clayton October 1981 Sequence and gene organization of mouse mitochondrial DNA Cell 26 2 Pt 2 167 180 PMID 7332926 S Henikoff M A Keene K Fechtel amp J W Fristrom January 1986 Gene within a gene nested Drosophila genes encode unrelated proteins on opposite DNA strands Cell 44 1 33 42 PMID 3079672 C A Spencer R D Gietz amp R B Hodgetts July 1986 Overlapping transcription units in the dopa decarboxylase region of Drosophila Nature 322 6076 279 281 doi 10 1038 322279a0 PMID 2874495