Метилобактерія | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Біологічна класифікація | ||||||||||||
| ||||||||||||
Methylobacterium organophilum | ||||||||||||
Species | ||||||||||||
Див. текст. | ||||||||||||
Посилання | ||||||||||||
|
Метилобактерія (лат. Methylobacterium) — рід порядку .
Метилобактерія виявляється в її нормальних оселищах, тобто в ґрунті та воді, а також як забруднювач в наборах реагентів для екстрагування ДНК, що може призвести до її помилкової появи в або метагеномних наборах даних. У березні 2021 року, новий вид, умовно названий Methylobacterium ajmalii, асоційований з трьома новими штамами, позначеними як IF7SW-B2T, IIF1SW-B5 та IIF4SW-B5, як повідомляється, був вперше виявлений на Міжнародній космічній станції.
Короткий опис
Грам-негативні паличкоподібні бактерії, 0,8—1,2 × 1,0—8,0 мкм, здебільшого плеоморфні, можуть галузитися, що особливо характерно для старих клітин. На агаризованих мінеральних середовищах з метанолом більшість видів утворює рожеві колонії (через синтез каротиноїдного пігменту), крім одного незабарвленого виду (М. nodulans). Рухливі завдяки єдиному полярному, приполярному або латеральному джгутику. Суворі аероби, кисень слугує термінальним акцептором електронів. Каталазо-, уреазо- і оксидазопозитивні. Деякі штами здатні до . Мезофіли, . Ростових факторів не потребують, проте пантотенат кальцію може здійснювати стимулювальний вплив. Факультативні метилотрофи, ростуть на формальдегіді (в мікромолярних концентраціях), та метанолі, деякі штами ростуть на метильованих амінах і галометанах. Асимілюють С1-сполуки через сериновий цикл (іцл(ізоцитратліазний)--варіант). Домінувальна жирна кислота — C18:1. Широко розповсюджені в природі. Вміст Г+Ц в ДНК 68,0-72,4 мол.%. Серед представників роду широко поширені симбіонти рослин. Представники роду Methylobacterium є перспективними об'єктами для біотехнології (виробництво білка, ектоіну, полі-β-гідроксибутирату, фітогормонів, і т. д.)
Природна генетична трансформація
Природна генетична трансформація в бактерій — це процес, що охоплює перенесення ДНК з однієї клітини в іншу через проміжне середовище та інтеграцію донорської послідовності в геном реципієнта гомологічною рекомбінацією. Клітини є здатними зазнавати генетичної трансформації ставати компетентними для поглинання ДНК ближче до кінця фази експоненціального росту.
Види
Типовий вид — Patt et al. 1976.
Вид Jourand et al. 2004 здатний утворювати бульбочки в симбіозі з африканською рослиною роду .
Рід Methylobacterium містить наступні види:
- Gallego et al. 2006
- Weon et al. 2008
- Bijlani et al. 2021
- Gallego et al. 2005
- Kato et al. 2008
- Tani and Sahin 2013
- Hoppe et al. 2012
- Wellner et al. 2012
- Jia et al. 2020
- Park et al. 2018
- Lee et al. 2013
- Kim et al. 2020
- Lee and Jeon 2018
- Green et al. 1988
- Schauer and Kutschera 2011
- Tani et al. 2012
- Idris et al. 2012
- Madhaiyan et al. 2012
- Kato et al. 2008
- Tani and Sahin 2013
- Gallego et al. 2005
- Chaudhry et al. 2016
- Weon et al. 2008
- Gallego et al. 2005
- Aslam et al. 2007
- Kato et al. 2008
- Knief et al. 2012
- Schauer et al. 2011
- (Austin and Goodfellow 1979) Green and Bousfield 1983
- Jourand et al. 2004
- Feng et al. 2020
- Patt et al. 1976 (Approved Lists 1980)
- Madhaiyan et al. 2007
- Chen et al. 2019
- Tani et al. 2012
- Kato et al. 2008
- Madhaiyan et al. 2009
- Madhaiyan and Poonguzhali 2014
- Jiang et al. 2020
- Kang et al. 2007
- Madhaiyan and Poonguzhali 2014
- corrig. (Ito and Iizuka 1971) Green and Bousfield 1983
- Ten et al. 2020
- Cao et al. 2013
- Pascual et al. 2021
- Kato et al. 2008
- Veyisoglu et al. 2013
- Kim et al. 2019
- Kim et al. 2020
- Wellner et al. 2013
- Wellner et al. 2013
- Gallego et al. 2005
Посилання
- Parte, A.C. . LPSN. Архів оригіналу за 5 червня 2021. Процитовано 5 червня 2021.
- Garrity, George M.; Brenner, Don J.; Krieg, Noel R.; Staley, James T. (eds.) (2005). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Volume Two: The Proteobacteria, Part C: The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria. New York, New York: Springer. .
- Salter, S; Cox, M; Turek, E; Calus, S; Cookson, W; Moffatt, M; Turner, P; Parkhill, J; Loman, N; Walker, A (2014). Reagent contamination can critically impact sequence-based microbiome analyses. BMC Biology. 12 (1). doi:10.1186/s12915-014-0087-z.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом () - Bowler, Jacinta (16 березня 2021). . ScienceAlert. Архів оригіналу за 16 березня 2021. Процитовано 16 березня 2021.
- Rogers, Adam (5 квітня 2021). . Wired. Архів оригіналу за 24 травня 2021. Процитовано 5 червня 2021.
One species, found on a HEPA filter in the station’s life-support system, was a garden-variety (literally!) Methylobacterium rhodesianum. But three samples—from a surface near the materials research rack, a wall near the “cupola” of windows, and the astronauts' dining table—were something new.
- O'Connor M, Wopat A, Hanson RS (1977). Genetic transformation in Methylobacterium organophilum. J. Gen. Microbiol. 98 (1): 265—72. doi:10.1099/00221287-98-1-265. PMID 401866.
- Euzéby JP, Parte AC. . List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Архів оригіналу за 22 травня 2021. Процитовано 22 травня 2021.
- Bijlani S, Singh NK, Eedara VVR, Podile AR, Mason CE, Wang CCC, Venkateswaran K. (2021). Methylobacterium ajmalii sp. nov., Isolated From the International Space Station. Front Microbiol. 12: 639396. doi:10.3389/fmicb.2021.639396.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом ()
Джерела
- Троценко Ю. А., Доронина Н. В., Торгонская М. Л. Аэробные метилобактерии. — Пущино: ОНТИ ПНЦ РАН, 2010. — 325 с.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Metilobakteriya Biologichna klasifikaciya Domen Bakteriyi Bacteria Tip Proteobakteriyi Proteobacteria Klas Alfa proteobakteriyi a Proteobacteria Ryad Rodina Rid Methylobacterium Patt et al 1976 Approved Lists 1980 Tipovij vid Methylobacterium organophilum Species Div tekst Posilannya EOL 98147 ITIS 957576 NCBI 407 Metilobakteriya lat Methylobacterium rid poryadku Metilobakteriya viyavlyayetsya v yiyi normalnih oselishah tobto v grunti ta vodi a takozh yak zabrudnyuvach v naborah reagentiv dlya ekstraguvannya DNK sho mozhe prizvesti do yiyi pomilkovoyi poyavi v abo metagenomnih naborah danih U berezni 2021 roku novij vid umovno nazvanij Methylobacterium ajmalii asocijovanij z troma novimi shtamami poznachenimi yak IF7SW B2T IIF1SW B5 ta IIF4SW B5 yak povidomlyayetsya buv vpershe viyavlenij na Mizhnarodnij kosmichnij stanciyi Korotkij opisGram negativni palichkopodibni bakteriyi 0 8 1 2 1 0 8 0 mkm zdebilshogo pleomorfni mozhut galuzitisya sho osoblivo harakterno dlya starih klitin Na agarizovanih mineralnih seredovishah z metanolom bilshist vidiv utvoryuye rozhevi koloniyi cherez sintez karotinoyidnogo pigmentu krim odnogo nezabarvlenogo vidu M nodulans Ruhlivi zavdyaki yedinomu polyarnomu pripolyarnomu abo lateralnomu dzhgutiku Suvori aerobi kisen sluguye terminalnim akceptorom elektroniv Katalazo ureazo i oksidazopozitivni Deyaki shtami zdatni do Mezofili Rostovih faktoriv ne potrebuyut prote pantotenat kalciyu mozhe zdijsnyuvati stimulyuvalnij vpliv Fakultativni metilotrofi rostut na formaldegidi v mikromolyarnih koncentraciyah ta metanoli deyaki shtami rostut na metilovanih aminah i galometanah Asimilyuyut S1 spoluki cherez serinovij cikl icl izocitratliaznij variant Dominuvalna zhirna kislota C18 1 Shiroko rozpovsyudzheni v prirodi Vmist G C v DNK 68 0 72 4 mol Sered predstavnikiv rodu shiroko poshireni simbionti roslin Predstavniki rodu Methylobacterium ye perspektivnimi ob yektami dlya biotehnologiyi virobnictvo bilka ektoinu poli b gidroksibutiratu fitogormoniv i t d Prirodna genetichna transformaciyaPrirodna genetichna transformaciya v bakterij ce proces sho ohoplyuye perenesennya DNK z odniyeyi klitini v inshu cherez promizhne seredovishe ta integraciyu donorskoyi poslidovnosti v genom recipiyenta gomologichnoyu rekombinaciyeyu Klitini ye zdatnimi zaznavati genetichnoyi transformaciyi stavati kompetentnimi dlya poglinannya DNK blizhche do kincya fazi eksponencialnogo rostu VidiTipovij vid Patt et al 1976 Vid Jourand et al 2004 zdatnij utvoryuvati bulbochki v simbiozi z afrikanskoyu roslinoyu rodu Rid Methylobacterium mistit nastupni vidi Gallego et al 2006 Weon et al 2008 Bijlani et al 2021 Gallego et al 2005 Kato et al 2008 Tani and Sahin 2013 Hoppe et al 2012 Wellner et al 2012 Jia et al 2020 Park et al 2018 Lee et al 2013 Kim et al 2020 Lee and Jeon 2018 Green et al 1988 Schauer and Kutschera 2011 Tani et al 2012 Idris et al 2012 Madhaiyan et al 2012 Kato et al 2008 Tani and Sahin 2013 Gallego et al 2005 Chaudhry et al 2016 Weon et al 2008 Gallego et al 2005 Aslam et al 2007 Kato et al 2008 Knief et al 2012 Schauer et al 2011 Austin and Goodfellow 1979 Green and Bousfield 1983 Jourand et al 2004 Feng et al 2020 Patt et al 1976 Approved Lists 1980 Madhaiyan et al 2007 Chen et al 2019 Tani et al 2012 Kato et al 2008 Madhaiyan et al 2009 Madhaiyan and Poonguzhali 2014 Jiang et al 2020 Kang et al 2007 Madhaiyan and Poonguzhali 2014 corrig Ito and Iizuka 1971 Green and Bousfield 1983 Ten et al 2020 Cao et al 2013 Pascual et al 2021 Kato et al 2008 Veyisoglu et al 2013 Kim et al 2019 Kim et al 2020 Wellner et al 2013 Wellner et al 2013 Gallego et al 2005PosilannyaParte A C LPSN Arhiv originalu za 5 chervnya 2021 Procitovano 5 chervnya 2021 Garrity George M Brenner Don J Krieg Noel R Staley James T eds 2005 Bergey s Manual of Systematic Bacteriology Volume Two The Proteobacteria Part C The Alpha Beta Delta and Epsilonproteobacteria New York New York Springer ISBN 978 0 387 24145 6 Salter S Cox M Turek E Calus S Cookson W Moffatt M Turner P Parkhill J Loman N Walker A 2014 Reagent contamination can critically impact sequence based microbiome analyses BMC Biology 12 1 doi 10 1186 s12915 014 0087 z a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Obslugovuvannya CS1 Storinki iz nepoznachenim DOI z bezkoshtovnim dostupom posilannya Bowler Jacinta 16 bereznya 2021 ScienceAlert Arhiv originalu za 16 bereznya 2021 Procitovano 16 bereznya 2021 Rogers Adam 5 kvitnya 2021 Wired Arhiv originalu za 24 travnya 2021 Procitovano 5 chervnya 2021 One species found on a HEPA filter in the station s life support system was a garden variety literally Methylobacterium rhodesianum But three samples from a surface near the materials research rack a wall near the cupola of windows and the astronauts dining table were something new O Connor M Wopat A Hanson RS 1977 Genetic transformation in Methylobacterium organophilum J Gen Microbiol 98 1 265 72 doi 10 1099 00221287 98 1 265 PMID 401866 Euzeby JP Parte AC List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature LPSN Arhiv originalu za 22 travnya 2021 Procitovano 22 travnya 2021 Bijlani S Singh NK Eedara VVR Podile AR Mason CE Wang CCC Venkateswaran K 2021 Methylobacterium ajmalii sp nov Isolated From the International Space Station Front Microbiol 12 639396 doi 10 3389 fmicb 2021 639396 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Obslugovuvannya CS1 Storinki iz nepoznachenim DOI z bezkoshtovnim dostupom posilannya DzherelaTrocenko Yu A Doronina N V Torgonskaya M L Aerobnye metilobakterii Pushino ONTI PNC RAN 2010 325 s