SET (англ. SET nuclear proto-oncogene) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 290 амінокислот, а молекулярна маса — 33 489.
SET | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SET, 2PP2A, I2PP2A, IGAAD, IPP2A2, PHAPII, TAF-I, TAF-IBETA, SET nuclear proto-oncogene, MRD58 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600960 MGI: 1860267 HomoloGene: 55707 GeneCards: SET | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
розумова відсталість | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 9: 128.68 – 128.7 Mb | Хр. 2: 29.95 – 29.96 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAPKRQSPLP | PQKKKPRPPP | ALGPEETSAS | AGLPKKGEKE | QQEAIEHIDE | ||||
VQNEIDRLNE | QASEEILKVE | QKYNKLRQPF | FQKRSELIAK | IPNFWVTTFV | ||||
NHPQVSALLG | EEDEEALHYL | TRVEVTEFED | IKSGYRIDFY | FDENPYFENK | ||||
VLSKEFHLNE | SGDPSSKSTE | IKWKSGKDLT | KRSSQTQNKA | SRKRQHEEPE | ||||
SFFTWFTDHS | DAGADELGEV | IKDDIWPNPL | QYYLVPDMDD | EEGEGEEDDD | ||||
DDEEEEGLED | IDEEGDEDEG | EEDEDDDEGE | EGEEDEGEDD |
Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
- Li M., Makkinje A., Damuni Z. (1996). The myeloid leukemia-associated protein SET is a potent inhibitor of protein phosphatase 2A. J. Biol. Chem. 271: 11059—11062. PMID 8626647 DOI:10.1074/jbc.271.19.11059
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Fan Z., Beresford P.J., Zhang D., Lieberman J. (2002). HMG2 interacts with the nucleosome assembly protein SET and is a target of the cytotoxic T-lymphocyte protease granzyme A. Mol. Cell. Biol. 22: 2810—2820. PMID 11909973 DOI:10.1128/MCB.22.8.2810-2820.2002
- Fan Z., Beresford P.J., Oh D.Y., Zhang D., Lieberman J. (2003). Tumor suppressor NM23-H1 is a granzyme A-activated DNase during CTL-mediated apoptosis, and the nucleosome assembly protein SET is its inhibitor. Cell. 112: 659—672. PMID 12628186 DOI:10.1016/S0092-8674(03)00150-8
- Adachi Y., Pavlaki G.N., Copeland T.D. (1994). Identification and characterization of SET, a nuclear phosphoprotein encoded by the translocation break point in acute undifferentiated leukemia. J. Biol. Chem. 269: 2258—2262. PMID 8294483
- Fan Z., Beresford P.J., Oh D.Y., Zhang D., Lieberman J. (2003). Cell. 115: 241—241.
{{}}
: Пропущений або порожній|title=
()
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з SET переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10760 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 9 квітня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SET angl SET nuclear proto oncogene bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 9 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 290 aminokislot a molekulyarna masa 33 489 SETNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2E50IdentifikatoriSimvoliSET 2PP2A I2PP2A IGAAD IPP2A2 PHAPII TAF I TAF IBETA SET nuclear proto oncogene MRD58Zovnishni ID OMIM 600960 MGI 1860267 HomoloGene 55707 GeneCards SETPov yazani genetichni zahvoryuvannyarozumova vidstalist Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding GO 0031493 histone binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding protein phosphatase inhibitor activity protein phosphatase regulator activityKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma nukleoplazma endoplazmatichnij retikulum perinuclear region of cytoplasm klitinne yadro lipid droplet GO 0009327 protein containing complexBiologichnij proces GO 1904089 negative regulation of neuron apoptotic process nucleosome assembly regulation of mRNA stability replikaciya DNK nucleosome disassembly nucleocytoplasmic transport GO 0022415 viral process GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated negative regulation of histone acetylation GO 0048553 negative regulation of catalytic activity GO 0048552 regulation of catalytic activity negative regulation of phosphoprotein phosphatase activity regulation of phosphoprotein phosphatase activityDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6418 56086Ensembl ENSG00000119335 ENSMUSG00000054766UniProt Q01105 Q9EQU5RefSeq mRNK NM 001122821 NM 001248000 NM 001248001 NM 003011 NM 001374326NM 001204875 NM 023871RefSeq bilok NP 001116293 NP 001234929 NP 001234930 NP 003002 NP 001361255NP 001191804 NP 076360Lokus UCSC Hr 9 128 68 128 7 MbHr 2 29 95 29 96 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAPKRQSPLPPQKKKPRPPPALGPEETSASAGLPKKGEKEQQEAIEHIDE VQNEIDRLNEQASEEILKVEQKYNKLRQPFFQKRSELIAKIPNFWVTTFV NHPQVSALLGEEDEEALHYLTRVEVTEFEDIKSGYRIDFYFDENPYFENK VLSKEFHLNESGDPSSKSTEIKWKSGKDLTKRSSQTQNKASRKRQHEEPE SFFTWFTDHSDAGADELGEVIKDDIWPNPLQYYLVPDMDDEEGEGEEDDD DDEEEEGLEDIDEEGDEDEGEEDEDDDEGEEGEEDEGEDD A Alanin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do shaperoniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak vzayemodiya hazyayin virus Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri endoplazmatichnomu retikulumi LiteraturaLi M Makkinje A Damuni Z 1996 The myeloid leukemia associated protein SET is a potent inhibitor of protein phosphatase 2A J Biol Chem 271 11059 11062 PMID 8626647 DOI 10 1074 jbc 271 19 11059 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Fan Z Beresford P J Zhang D Lieberman J 2002 HMG2 interacts with the nucleosome assembly protein SET and is a target of the cytotoxic T lymphocyte protease granzyme A Mol Cell Biol 22 2810 2820 PMID 11909973 DOI 10 1128 MCB 22 8 2810 2820 2002 Fan Z Beresford P J Oh D Y Zhang D Lieberman J 2003 Tumor suppressor NM23 H1 is a granzyme A activated DNase during CTL mediated apoptosis and the nucleosome assembly protein SET is its inhibitor Cell 112 659 672 PMID 12628186 DOI 10 1016 S0092 8674 03 00150 8 Adachi Y Pavlaki G N Copeland T D 1994 Identification and characterization of SET a nuclear phosphoprotein encoded by the translocation break point in acute undifferentiated leukemia J Biol Chem 269 2258 2262 PMID 8294483 Fan Z Beresford P J Oh D Y Zhang D Lieberman J 2003 Cell 115 241 241 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Propushenij abo porozhnij title dovidka PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z SET pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 10760 angl Procitovano 6 lyutogo 2017 angl Arhiv originalu za 9 kvitnya 2017 Procitovano 6 lyutogo 2017 Div takozhHromosoma 9 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi