(bHLH) — структурний мотив білка, який характеризує одне з найбільших сімейств факторів транскрипції.[1] [ 12 листопада 2018 у Wayback Machine.]
Фактори транскрипції bHLH часто важливі для розвитку або активності клітин. BMAL1-Clock є основним комплексом транскрипції в молекулярному циркадному годиннику. Інші гени, такі як c-Myc та HIF-1, були пов'язані з раком через їх вплив на ріст клітин та метаболізм.
Його не слід плутати з доменом helix-turn-helix.
Структура
Мотив характеризується двома α-спіралями, з'єднаними петлею. Взагалі фактори транскрипції, що включають цей домен, є димерними, кожен з яких має одну спіраль, що містить основні залишки амінокислот, які полегшують зв'язування ДНК. Загалом одна спіраль менша, і, завдяки гнучкості петлі, дозволяє димеризацію під час згортання та упаковки навпроти іншої спіралі. Більша спіраль зазвичай містить ділянки, що зв'язують ДНК. Білки bHLH, як правило, зв'язуються з консенсусною послідовністю, яка називається E-box, CANNTG. Канонічним E-поле є CACGTG (паліндромний), однак деякі фактори транскрипції bHLH, зокрема, сімейства bHLH-PAS, пов'язуються із спорідненими непаліндромними послідовностями, схожими на E-box. bHLH TF можуть гомодимеризуватись або гетеродимеризуватись з іншими TF bHLH та утворювати велику різноманітність димерів, кожен з яких має конкретні функції.
Приклади
Філогенетичний аналіз показав, що білки bHLH поділяються на 6 основних груп, позначених літерами від A до F. Приклади факторів транскрипції, що містять bHLH, включають:
Група A
- MyoD
- Myf5
- Beta2/NeuroD1
- Scl, також відомий як Tal1
- пронейральний ген bHLH, like p-CaMKII і pSer(336)NeuroD.
- Нейрогеніни
Група B
- MAX
- C-Myc, N-Myc
- TCF4 (Транскрипційний фактор 4)
Група C
Ці протеїни містять два додаткових PAS домени після bHLH домену.
- AhR
- BMAL-1-CLOCK
- HIF
- NPAS1, NPAS3, MOP5
Група D
- EMC
Група Е
- HEY1 and HEY2
Група F
Ці протеїни містять додатковий COE домен
- EBF1
Примітки
- Murre, Cornelis; Bain, Gretchen; van Dijk, Marc A.; Engel, Isaac; Furnari, Beth A.; Massari, Mark E.; Matthews, James R.; Quong, Melanie W.; Rivera, Richard R. (21 червня 1994). . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Structure and Expression. Т. 1218, № 2. с. 129—135. doi:10.1016/0167-4781(94)90001-9. ISSN 0167-4781. Архів оригіналу за 29 березня 2019. Процитовано 22 грудня 2019.
- Amoutzias, Grigoris D.; Robertson, David L.; Peer, Yves Van de; Oliver, Stephen G. (1 травня 2008). . Trends in Biochemical Sciences (English) . Т. 33, № 5. с. 220—229. doi:10.1016/j.tibs.2008.02.002. ISSN 0968-0004. PMID 18406148. Архів оригіналу за 12 жовтня 2013. Процитовано 22 грудня 2019.
- Massari, Mark Eben; Murre, Cornelis (2000-1). . Molecular and Cellular Biology. Т. 20, № 2. с. 429—440. ISSN 0270-7306. PMID 10611221. Архів оригіналу за 25 травня 2021. Процитовано 22 грудня 2019.
- . www.amazon.com. Архів оригіналу за 8 липня 2013. Процитовано 22 грудня 2019.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з текстом «archived copy» як значення параметру title () - Chaudhary, J.; Skinner, M. K. (1999-05). . Molecular Endocrinology (Baltimore, Md.). Т. 13, № 5. с. 774—786. doi:10.1210/mend.13.5.0271. ISSN 0888-8809. PMID 10319327. Архів оригіналу за 12 листопада 2018. Процитовано 22 грудня 2019.
- Amoutzias, Gregory D; Robertson, David L; Oliver, Stephen G; Bornberg-Bauer, Erich (2004-03). Convergent evolution of gene networks by single-gene duplications in higher eukaryotes. EMBO Reports. Т. 5, № 3. с. 274—279. doi:10.1038/sj.embor.7400096. ISSN 1469-221X. PMC 1299007. PMID 14968135. Процитовано 22 грудня 2019.
- Ledent, Valérie; Paquet, Odier; Vervoort, Michel (2002). Phylogenetic analysis of the human basic helix-loop-helix proteins. Genome Biology. Т. 3, № 6. с. research0030.1—research0030.18. ISSN 1465-6906. PMID 12093377. Процитовано 22 грудня 2019.
- Ledent, Valérie; Paquet, Odier; Vervoort, Michel (30 травня 2002). Phylogenetic analysis of the human basic helix-loop-helix proteins. Genome Biology. Т. 3, № 6. с. research0030.1. doi:10.1186/gb-2002-3-6-research0030. ISSN 1474-760X. PMC 116727. PMID 12093377. Процитовано 22 грудня 2019.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом () Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом ()
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
bHLH strukturnij motiv bilka yakij harakterizuye odne z najbilshih simejstv faktoriv transkripciyi 1 12 listopada 2018 u Wayback Machine Osnovnij strukturnij motiv spirali petli spirali ARNT Dva a spirali sinij z yednani korotkoyu petleyu chervonij HIF 1 Faktori transkripciyi bHLH chasto vazhlivi dlya rozvitku abo aktivnosti klitin BMAL1 Clock ye osnovnim kompleksom transkripciyi v molekulyarnomu cirkadnomu godinniku Inshi geni taki yak c Myc ta HIF 1 buli pov yazani z rakom cherez yih vpliv na rist klitin ta metabolizm Jogo ne slid plutati z domenom helix turn helix StrukturaMotiv harakterizuyetsya dvoma a spiralyami z yednanimi petleyu Vzagali faktori transkripciyi sho vklyuchayut cej domen ye dimernimi kozhen z yakih maye odnu spiral sho mistit osnovni zalishki aminokislot yaki polegshuyut zv yazuvannya DNK Zagalom odna spiral mensha i zavdyaki gnuchkosti petli dozvolyaye dimerizaciyu pid chas zgortannya ta upakovki navproti inshoyi spirali Bilsha spiral zazvichaj mistit dilyanki sho zv yazuyut DNK Bilki bHLH yak pravilo zv yazuyutsya z konsensusnoyu poslidovnistyu yaka nazivayetsya E box CANNTG Kanonichnim E pole ye CACGTG palindromnij odnak deyaki faktori transkripciyi bHLH zokrema simejstva bHLH PAS pov yazuyutsya iz sporidnenimi nepalindromnimi poslidovnostyami shozhimi na E box bHLH TF mozhut gomodimerizuvatis abo geterodimerizuvatis z inshimi TF bHLH ta utvoryuvati veliku riznomanitnist dimeriv kozhen z yakih maye konkretni funkciyi PrikladiFilogenetichnij analiz pokazav sho bilki bHLH podilyayutsya na 6 osnovnih grup poznachenih literami vid A do F Prikladi faktoriv transkripciyi sho mistyat bHLH vklyuchayut Grupa A MyoD Myf5 Beta2 NeuroD1 Scl takozh vidomij yak Tal1 pronejralnij gen bHLH like p CaMKII i pSer 336 NeuroD NejrogeniniGrupa B MAX C Myc N Myc TCF4 Transkripcijnij faktor 4 Grupa C Ci proteyini mistyat dva dodatkovih PAS domeni pislya bHLH domenu AhR BMAL 1 CLOCK HIF NPAS1 NPAS3 MOP5Grupa D EMCGrupa E HEY1 and HEY2Grupa F Ci proteyini mistyat dodatkovij COE domen EBF1PrimitkiMurre Cornelis Bain Gretchen van Dijk Marc A Engel Isaac Furnari Beth A Massari Mark E Matthews James R Quong Melanie W Rivera Richard R 21 chervnya 1994 Biochimica et Biophysica Acta BBA Gene Structure and Expression T 1218 2 s 129 135 doi 10 1016 0167 4781 94 90001 9 ISSN 0167 4781 Arhiv originalu za 29 bereznya 2019 Procitovano 22 grudnya 2019 Amoutzias Grigoris D Robertson David L Peer Yves Van de Oliver Stephen G 1 travnya 2008 Trends in Biochemical Sciences English T 33 5 s 220 229 doi 10 1016 j tibs 2008 02 002 ISSN 0968 0004 PMID 18406148 Arhiv originalu za 12 zhovtnya 2013 Procitovano 22 grudnya 2019 Massari Mark Eben Murre Cornelis 2000 1 Molecular and Cellular Biology T 20 2 s 429 440 ISSN 0270 7306 PMID 10611221 Arhiv originalu za 25 travnya 2021 Procitovano 22 grudnya 2019 www amazon com Arhiv originalu za 8 lipnya 2013 Procitovano 22 grudnya 2019 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite web title Shablon Cite web cite web a Obslugovuvannya CS1 Storinki z tekstom archived copy yak znachennya parametru title posilannya Chaudhary J Skinner M K 1999 05 Molecular Endocrinology Baltimore Md T 13 5 s 774 786 doi 10 1210 mend 13 5 0271 ISSN 0888 8809 PMID 10319327 Arhiv originalu za 12 listopada 2018 Procitovano 22 grudnya 2019 Amoutzias Gregory D Robertson David L Oliver Stephen G Bornberg Bauer Erich 2004 03 Convergent evolution of gene networks by single gene duplications in higher eukaryotes EMBO Reports T 5 3 s 274 279 doi 10 1038 sj embor 7400096 ISSN 1469 221X PMC 1299007 PMID 14968135 Procitovano 22 grudnya 2019 Ledent Valerie Paquet Odier Vervoort Michel 2002 Phylogenetic analysis of the human basic helix loop helix proteins Genome Biology T 3 6 s research0030 1 research0030 18 ISSN 1465 6906 PMID 12093377 Procitovano 22 grudnya 2019 Ledent Valerie Paquet Odier Vervoort Michel 30 travnya 2002 Phylogenetic analysis of the human basic helix loop helix proteins Genome Biology T 3 6 s research0030 1 doi 10 1186 gb 2002 3 6 research0030 ISSN 1474 760X PMC 116727 PMID 12093377 Procitovano 22 grudnya 2019 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite news title Shablon Cite news cite news a Obslugovuvannya CS1 Storinki z PMC z inshim formatom posilannya Obslugovuvannya CS1 Storinki iz nepoznachenim DOI z bezkoshtovnim dostupom posilannya