S100A12 (англ. S100 calcium binding protein A12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 92 амінокислот, а молекулярна маса — 10 575.
S100A12 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | S100A12, CAAF1, CAGC, CGRP, ENRAGE, MRP-6, MRP6, p6, S100 calcium binding protein A12, EN-RAGE | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 603112 HomoloGene: 48361 GeneCards: S100A12 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 153.37 – 153.38 Mb | н/д | |||||||||||||||
PubMed search | н/д | ||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MTKLEEHLEG | IVNIFHQYSV | RKGHFDTLSK | GELKQLLTKE | LANTIKNIKD | ||||
KAVIDEIFQG | LDANQDEQVD | FQEFISLVAI | ALKAAHYHTH | KE |
Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, , фунгіцидів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь. Білок має сайт для зв'язування з іоном міді, іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Wicki R., Marenholz I., Mischke D., Schaefer B.W., Heizmann C.W. (1996). Characterization of the human S100A12 (calgranulin C, p6, CAAF1, CGRP) gene, a new member of the S100 gene cluster on chromosome 1q21. Cell Calcium. 20: 459—464. PMID 8985590 DOI:10.1016/S0143-4160(96)90087-1
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Marti T., Erttmann K.D., Gallin M.Y. (1996). Host-parasite interaction in human onchocerciasis: identification and sequence analysis of a novel human calgranulin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 221: 454—458. PMID 8619876 DOI:10.1006/bbrc.1996.0616
- Guignard F., Mauel J., Markert M. (1995). Identification and characterization of a novel human neutrophil protein related to the S100 family. Biochem. J. 309: 395—401. PMID 7626002 DOI:10.1042/bj3090395
- Filipek A., Jastrzebska B., Nowotny M., Kuznicki J. (2002). CacyBP/SIP, a calcyclin and Siah-1-interacting protein, binds EF-hand proteins of the S100 family. J. Biol. Chem. 277: 28848—28852. PMID 12042313 DOI:10.1074/jbc.M203602200
- Moroz O.V., Dodson G.G., Wilson K.S., Lukanidin E., Bronstein I.B. (2003). Multiple structural states of S100A12: A key to its functional diversity. Microsc. Res. Tech. 60: 581—592. PMID 12645006 DOI:10.1002/jemt.10300
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10489 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 8 травня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
S100A12 angl S100 calcium binding protein A12 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 92 aminokislot a molekulyarna masa 10 575 S100A12Nayavni strukturiPDBPoshuk dlya lyudej PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1E8A 1GQM 1ODB 2M9G 2WC8 2WCB 2WCE 2WCFIdentifikatoriSimvoliS100A12 CAAF1 CAGC CGRP ENRAGE MRP 6 MRP6 p6 S100 calcium binding protein A12 EN RAGEZovnishni ID OMIM 603112 HomoloGene 48361 GeneCards S100A12Ontologiya genaMolekulyarna funkciya calcium ion binding zinc ion binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding RAGE receptor binding copper ion bindingKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma membrana klitinna membrana extracellular region citoskelet klitinne yadro secretory granule lumenBiologichnij proces mast cell activation positive regulation of inflammatory response positive regulation of MAP kinase activity monocyte chemotaxis proces imunnoyi sistemi defense response to fungus neutrophil chemotaxis defense response to bacterium positive regulation of NF kappaB transcription factor activity positive regulation of I kappaB kinase NF kappaB signaling xenobiotic metabolic process vrodzhenij imunitet inflammatory response neutrophil degranulation antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide killing of cells of other organismDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6283 n dEnsembl ENSG00000163221 n dUniProt P80511 n dRefSeq mRNK NM 005621n dRefSeq bilok NP 005612n dLokus UCSC Hr 1 153 37 153 38 Mbn dPubMed search n dVikidaniDiv Red dlya lyudej Poslidovnist aminokislot1020304050 MTKLEEHLEGIVNIFHQYSVRKGHFDTLSKGELKQLLTKELANTIKNIKD KAVIDEIFQGLDANQDEQVDFQEFISLVAIALKAAHYHTHKE A Alanin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do antibiotikiv fungicidiv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak imunitet vrodzhenij imunitet zapalna vidpovid Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionom midi ionami metaliv ionom cinku ionom kalciyu Lokalizovanij u klitinnij membrani citoplazmi citoskeleti membrani Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaWicki R Marenholz I Mischke D Schaefer B W Heizmann C W 1996 Characterization of the human S100A12 calgranulin C p6 CAAF1 CGRP gene a new member of the S100 gene cluster on chromosome 1q21 Cell Calcium 20 459 464 PMID 8985590 DOI 10 1016 S0143 4160 96 90087 1 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Marti T Erttmann K D Gallin M Y 1996 Host parasite interaction in human onchocerciasis identification and sequence analysis of a novel human calgranulin Biochem Biophys Res Commun 221 454 458 PMID 8619876 DOI 10 1006 bbrc 1996 0616 Guignard F Mauel J Markert M 1995 Identification and characterization of a novel human neutrophil protein related to the S100 family Biochem J 309 395 401 PMID 7626002 DOI 10 1042 bj3090395 Filipek A Jastrzebska B Nowotny M Kuznicki J 2002 CacyBP SIP a calcyclin and Siah 1 interacting protein binds EF hand proteins of the S100 family J Biol Chem 277 28848 28852 PMID 12042313 DOI 10 1074 jbc M203602200 Moroz O V Dodson G G Wilson K S Lukanidin E Bronstein I B 2003 Multiple structural states of S100A12 A key to its functional diversity Microsc Res Tech 60 581 592 PMID 12645006 DOI 10 1002 jemt 10300PrimitkiHuman PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 10489 angl Procitovano 25 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 travnya 2016 Procitovano 25 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 1 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi