PPR-білки (англ. Pentatricopeptide repeat), білки з пентатрикопептидним повтором — родина білків, які мають у своїй структурі мотив з 35 амінокислотних залишків. Гени цієї родини наявні у всіх гілках евкаріотів, але найбільш поширені в рослин, де виконують різноманітні функції, включно з редагуванням РНК у мітохондріях та хлоропластах. Також виявляються в окремих прокаріотів, але, скоріш за все, набуті шляхом горизонтального перенесення генів.
Білки з пентатрикопептидним повтором | |
---|---|
Ідентифікатори | |
Символ | PPR |
Інша інформація |
Структура
Кількість 35-амінокислотних мотивів коливається від 2 до 26. Схожість з послідовністю 34-амінокислотного мотиву свідчить про їхнє розходження на ранній стадії еволюції евкаріот.
Низка білків цієї родини формує гомодимери для взаємодії з молекулами РНК.
Класифікація
PPR-білки поділяють на два класи:
- P-клас, молекули якого містять класичний 35-амінокислотний домен та зазвичай не мають інших додаткових доменів;
- PLS-клас, молекули якого мають різні домени: класичний P (35 амінокислот), короткий S (31 амінокислота), довгий L (35-36 амінокислот), а також задіяні в редагуванні РНК
PLS
PLS-клас поділяється на підкласи білків з DYW-доменом (який складається з залишків аспартату (D), тирозину (Y) та триптофану (W)) та білків з E-доменом (від англ. extension).
У рослин
У рослин значна частина PPR-білків має DYW-домен та/або E-домен.
У людини
У людини відомо 7-8 білків цієї родини, зокрема:
Примітки
- Sun, Tao; Bentolila, Stephane; Hanson, Maureen R. (2016). The Unexpected Diversity of Plant Organelle RNA Editosomes. Trends in Plant Science. 21 (11): 962—973. doi:10.1016/j.tplants.2016.07.005. ISSN 1360-1385.
- Manna, Sam (2015). An overview of pentatricopeptide repeat proteins and their applications. Biochimie. 113: 93—99. doi:10.1016/j.biochi.2015.04.004. ISSN 0300-9084.
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Ця стаття недостатньо чи зовсім не , або категорії, до яких вона належить, не існують. (січень 2024) |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
PPR bilki angl Pentatricopeptide repeat bilki z pentatrikopeptidnim povtorom rodina bilkiv yaki mayut u svoyij strukturi motiv z 35 aminokislotnih zalishkiv Geni ciyeyi rodini nayavni u vsih gilkah evkariotiv ale najbilsh poshireni v roslin de vikonuyut riznomanitni funkciyi vklyuchno z redaguvannyam RNK u mitohondriyah ta hloroplastah Takozh viyavlyayutsya v okremih prokariotiv ale skorish za vse nabuti shlyahom gorizontalnogo perenesennya geniv Bilki z pentatrikopeptidnim povtoromIdentifikatoriSimvolPPRInsha informaciyaStrukturaKilkist 35 aminokislotnih motiviv kolivayetsya vid 2 do 26 Shozhist z poslidovnistyu 34 aminokislotnogo motivu svidchit pro yihnye rozhodzhennya na rannij stadiyi evolyuciyi evkariot Nizka bilkiv ciyeyi rodini formuye gomodimeri dlya vzayemodiyi z molekulami RNK KlasifikaciyaPPR bilki podilyayut na dva klasi P klas molekuli yakogo mistyat klasichnij 35 aminokislotnij domen ta zazvichaj ne mayut inshih dodatkovih domeniv PLS klas molekuli yakogo mayut rizni domeni klasichnij P 35 aminokislot korotkij S 31 aminokislota dovgij L 35 36 aminokislot a takozh zadiyani v redaguvanni RNK PLS PLS klas podilyayetsya na pidklasi bilkiv z DYW domenom yakij skladayetsya z zalishkiv aspartatu D tirozinu Y ta triptofanu W ta bilkiv z E domenom vid angl extension U roslinU roslin znachna chastina PPR bilkiv maye DYW domen ta abo E domen U lyudiniU lyudini vidomo 7 8 bilkiv ciyeyi rodini zokrema POLRMT KIAA0391 PTCD1 PTCD2 LRPPRCPrimitkiSun Tao Bentolila Stephane Hanson Maureen R 2016 The Unexpected Diversity of Plant Organelle RNA Editosomes Trends in Plant Science 21 11 962 973 doi 10 1016 j tplants 2016 07 005 ISSN 1360 1385 Manna Sam 2015 An overview of pentatricopeptide repeat proteins and their applications Biochimie 113 93 99 doi 10 1016 j biochi 2015 04 004 ISSN 0300 9084 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Cya stattya nedostatno chi zovsim ne kategorizovana abo kategoriyi do yakih vona nalezhit ne isnuyut Bud laska dopomozhit dodati nalezhni kategoriyi abi cyu stattyu mozhna bulo kategorizuvati iz sumizhnimi storinkami sichen 2024