Частковий куб

У теорії графів частковий куб — це підграф гіперкуба, що зберігає відстані (в термінах графів) — відстань між будь-якими двома вершинами підграфу така ж, як у початковому графі. Еквівалентно, частковий куб — це граф, вершини якого можна позначити бітовими рядками однакової довжини, так що відстань між двома вершинами в графі дорівнює відстані Геммінга між цими двома позначками. Така розмітка називається розміткою Геммінга і вона представляє ізометричне вкладення часткового куба в гіперкуб.

Історія

В. Фірсов першим досліджував ізометричні вкладення графів у гіперкуби. Графи, що дозволяють такі вкладення, описані Д. Джоковичем і П. Вінклером, пізніше отримали назву «часткові куби». Окремо ці ж структури в термінології сімейств множин, а не розмітки гіперкубів, досліджували, серед інших, В. Кузьмін і С. Овчинніков, а також Фалмагне і Дойнон.

Приклади

Приклад часткового куба з розміткою Геммінга у вершинах. Граф є також .

Будь-яке дерево є частковим кубом. Припустимо, що дерево T має m ребер і номери цих ребер (в довільному порядку) від 0 до m − 1. Виберемо довільну кореневу вершину r для дерева, і надамо кожній вершині v позначку (бітовий рядок) довжиною m біт, у якій стоїть 1 у позиції i, якщо ребро i лежить на шляху з r до v в дереві T. Наприклад, сама вершина r матиме позначку з нулів, а всі сусідні їй вершини будуть мати 1 в одній позиції, і т. д. Тоді відстань Геммінга між будь-якими двома позначками дорівнюватиме відстані між відповідними вершинами дерева, так що така розмітка показує, що дерево T є частковим кубом.

Будь-який граф гіперкуба є сам частковим кубом, який можна розмітити різними бітовими рядками з довжиною, що дорівнює розмірності гіперкуба.

Складніші приклади:

• Розглянемо граф, вершини якого складаються з усіх можливих бітових рядків довжиною 2n + 1, які мають або n, або n + 1 ненульових біт. Дві вершини цього графу суміжні, якщо їх мітки відрізняються на єдиний біт. Така розмітка визначає вкладення цього графу в гіперкуб (граф усіх бітових рядків заданої довжини з тією ж умовою суміжності). Отриманий граф є двочастинним кнезеровим графом. Граф, отриманий таким способом з n = 2, має 20 вершин і 30 ребер і називається графом Дезарга.
• Всі є частковими кубами^[8]. Дерева і гіперкуби є окремими випадками медіанних графів. Оскільки до медіанних графів належать рамкові графи, ^[en] і куби Фібоначчі, а також покривні графи скінченних дистрибутивних ґраток, всі вони є частковими кубами.
• Графи, двоїсті конфігураціям прямих на евклідовій площині, є частковими кубами. У загальнішому вигляді, для будь-якої ^[en] у евклідовому просторі будь-якої розмірності граф, що має вершину для кожної комірки конфігурації і ребро для будь-яких двох суміжних комірок, є частковим кубом^[9].
• Частковий куб, у якому кожна вершина має рівно три сусіди, відомий як кубічний частковий куб. Хоча деякі нескінченні сімейства кубічних часткових кубів відомі, разом з іншими спорадичними прикладами, єдиний відомий кубічний частковий куб, який не є планарним, — це граф Дезарга.
• Граф, що лежить в основі будь-якого антиматроїда, що має вершину для кожної множини в антиматроїді і ребро для будь-яких двох множин, що відрізняються єдиним елементом, завжди є частковим кубом.
• Прямий добуток будь-якої скінченної множини часткових кубів є іншим частковим кубом^[11].

Співвідношення Джоковича — Вінклера

Багато теорем про часткові куби спираються прямо або побічно на деяке бінарне відношення, визначене на ребрах графу. Це відношення, вперше описане Джоковичем, позначається ${\displaystyle \Theta }$. Вінклер дав еквівалентне визначення співвідношення в термінах відстані. Два ребра ${\displaystyle e=\{x,y\}}$ і ${\displaystyle f=\{u,v\}}$ перебувають у відношенні ${\displaystyle \Theta }$ (записується ${\displaystyle e{\mathrel {\Theta }}f}$), якщо ${\displaystyle d(x,u)+d(y,v)\not =d(x,v)+d(y,u)}$. Це відношення є рефлексивним і симетричним, але, в загальному випадку, не транзитивним.

Вінклер показав, що зв'язний граф є частковим кубом тоді і тільки тоді, коли він є двочастковим і відношення ${\displaystyle \Theta }$ транзитивне. У цьому випадку відношення утворює відношення еквівалентності і кожен клас еквівалентності відокремлює два зв'язних підграфи графу один від одного. Розмітку Геммінга можна отримати призначенням одного біта в кожній позначці для кожного класу еквівалентності співвідношення Джоковича — Вінклера. В одному з двох зв'язних підграфів, розділених співвідношенням еквівалентності ребер, позначки мають 0 у відповідній позиції, а в іншому зв'язному підграфі всі позначки в тій самій позиції мають 1.

Розпізнавання

Часткові куби можна розпізнати і побудувати для них розмітку Геммінга за час ${\displaystyle O(n^{2})}$, де ${\displaystyle n}$ — число вершин графу. Якщо задано частковий куб, можна безпосередньо побудувати класи еквівалентності відношення Джоковича — Вінклера використовуючи пошук у ширину від кожної вершини за загальний час ${\displaystyle O(nm)}$. Алгоритм розпізнавання з часом роботи ${\displaystyle O(n^{2})}$ прискорює пошук, використовуючи для здійснення множинних пошуків у ширину за один прохід графу паралелізм бітового рівня, потім використовується окремий алгоритм для перевірки, що отримано правильну розмітку часткового куба.

Розмірність

Ізометрична розмірність часткового куба — це мінімальна розмірність гіперкуба, в який можна вкласти граф ізометрично і вона дорівнює числу класів еквівалентності відношення Джоковича — Вінклера. Наприклад, ізометрична розмірність дерева з ${\displaystyle n}$ вершинами дорівнює числу його ребер, ${\displaystyle n-1}$. Вкладення часткового куба в гіперкуб такої розмірності єдине з точністю до симетрій гіперкуба^[15][16].

Будь-який гіперкуб, а тому і будь-який частковий куб, можна вкласти ізометрично в цілочисельну ґратку і розмірність ґратки для часткового куба — це мінімальна розмірність цілочисельної ґратки, в яку можна вкласти частковий куб. Розмірність ґратки може виявитися істотно меншою від ізометричної розмірності. Наприклад, для дерева вона дорівнює половині числа листків у дереві (з округленням до найближчого цілого). Розмірність ґратки для будь-якого графу і вкладення в ґратку мінімальної розмірності можна знайти за поліноміальний час алгоритмом, заснованим на пошуку найбільшого парування в допоміжному графі.

Визначаються й інші типи розмірностей часткового куба, засновані на специфічніших структурах.

Застосування до теорії хімічних графів

Ізометричні вкладення графів у гіперкуб мають важливе застосування в хімічній теорії графів. Бензоїдний граф — це граф, що складається з вершин і ребер, які лежать на циклі і всередині циклу в шестикутній ґратці. Такі графи є молекулярними графами бензоїдних вуглеводнів, великого класу органічних молекул. Кожен такий граф є частковим кубом. Розмітку Геммінга такого графу можна використати для обчислення індексу Вінера відповідної молекули, який можна використовувати для передбачення деяких хімічних властивостей. Інша молекулярна структура, утворена вуглецем, структура алмазу, також відповідає частковим кубам.

Примітки

1. Ovchinnikov, 2011, с. 127, Definition 5.1.
2. Фирсов, 1965.
3. Djoković, 1973.
4. Winkler, 1984.
5. Кузьмин, Овчинников, 1975.
6. Falmagne, Doignon, 1997.
7. Ovchinnikov, 2011, с. 174.
8. Ovchinnikov, 2011, с. 163–165, Section 5.11, "Median Graphs".
9. Ovchinnikov, 2011, с. 207–235, Chapter 7, "Hyperplane Arrangements".
10. Eppstein, 2006.
11. Ovchinnikov, 2011, с. 144–145, Section 5.7, "Cartesian Products of Partial Cubes".
12. Winkler, 1984, с. Theorem 4.
13. Ovchinnikov, 2011, с. 29, 139, Definition 2.13, Theorem 5.19.
14. Eppstein, 2008.
15. Ovchinnikov, 2011, с. 142–144, Section 5.6, "Isometric Dimension".
16. Ovchinnikov, 2011, с. 157–162, Section 5.10, "Uniqueness of Isometric Embeddings".
17. Hadlock, Hoffman, 1978; Eppstein, 2005; Ovchinnikov, 2011, Chapter 6, «Lattice Embeddings», стр. 183—205.
18. Eppstein, 2009.
19. Cabello, Eppstein, Klavžar, 2011.
20. Klavžar, Gutman, Mohar, 1995, Propositions 2.1 and 3.1; Imrich, Klavžar, 2000, стр. 60; Ovchinnikov, 2011, Section 5.12, «Average Length and the Wiener Index», стр. 165—168.

Література

• S. Cabello, D. Eppstein, S. Klavžar. The Fibonacci dimension of a graph // Electronic Journal of Combinatorics. — 2011. — Т. 18, вип. 1 (16 червня). — arXiv:0903.2507.
• D. Ž. Djoković. Distance-preserving subgraphs of hypercubes // . — 1973. — Т. 14, вип. 3 (16 червня). — С. 263–267. — DOI:10.1016/0095-8956(73)90010-5.
• David Eppstein. The lattice dimension of a graph // European Journal of Combinatorics. — 2005. — Т. 26, вип. 6 (16 червня). — С. 585–592. — arXiv:cs.DS/0402028. — DOI:10.1016/j.ejc.2004.05.001.
• David Eppstein. Cubic partial cubes from simplicial arrangements // Electronic Journal of Combinatorics. — 2006. — Т. 13, вип. 1 (16 червня). — arXiv:math.CO/0510263. з джерела 14 лютого 2012. Процитовано 28 червня 2021.
• David Eppstein. Proc. 19th ACM-SIAM Symposium on Discrete Algorithms. — 2008. — С. 1258–1266.
• David Eppstein. Proc. 16th International Symposium on Graph Drawing, Heraklion, Crete, 2008. — Springer-Verlag, 2009. — Т. 5417. — С. 384–389. — (Lecture Notes in Computer Science) — DOI:10.1007/978-3-642-00219-9_37.
• J.-C. Falmagne, J.-P. Doignon. Stochastic evolution of rationality // Theory and Decision. — 1997. — Т. 43 (16 червня). — С. 107–138. — DOI:10.1023/A:1004981430688.
• Фирсов В. В. Об изометрическом вложении графа в булевский куб // Кибернетика. — 1965. — Вип. 6 (16 червня). — С. 95-96.
• F. Hadlock, F. Hoffman. Manhattan trees // Utilitas Mathematica. — 1978. — Т. 13 (16 червня). — С. 55–67. Як процитовано в (Ovchinnikov, 2011).
• Wilfried Imrich, Sandi Klavžar. Product Graphs: Structure and Recognition. — New York : John Wiley & Sons, 2000. — (Wiley-Interscience Series in Discrete Mathematics and Optimization) — .
• Sandi Klavžar, Ivan Gutman, Bojan Mohar. Labeling of benzenoid systems which reflects the vertex-distance relations // Journal of Chemical Information and Computer Sciences. — 1995. — Т. 35, вип. 3 (16 червня). — С. 590–593. — DOI:10.1021/ci00025a030. з джерела 3 липня 2021. Процитовано 28 червня 2021.
• В. Б. Кузьмин, С. В. Овчинников. Геометрия пространств предпочтений. I // Автоматика и телемеханика. — 1975. — Вип. 12 (16 червня). — С. 140-145.
• Sergei Ovchinnikov. Graphs and Cubes. — Springer, 2011. — (Universitext). См. главу 5, «Partial Cubes», стр. 127—181.
• Peter M. Winkler. Isometric embedding in products of complete graphs // Discrete Applied Mathematics. — 1984. — Т. 7, вип. 2 (16 червня). — С. 221–225. — DOI:10.1016/0166-218X(84)90069-6.