Тандемні повтори — послідовності повторюваних ділянок ДНК. Залежно від розміру, вони поділяються на три підкласи: сателіти, мінісателіти і мікросателіти. Назва «сателіти» походить від спектру оптичної щільності при розділенні ДНК у градієнті щільності розчинника, що вказує на відмінності відносного середнього вмісту різних нуклеотидів у тандемних повторах у порівнянні з рештою ДНК. Найбільша кількість повторів зустрічається у Eucalyptus grandis.
Сателіти
Розмір ділянок сателітів становить від 100 kbp до понад 1 Mpb, із повторюваною одиницею зазвичай >100 bp. У людини добре відомий приклад — альфоїдна ДНК, розташована в центромерах всіх хромосом. Довжина одного повтору становить 171 bp, а весь повторюваний регіон становить 3-5 % довжини ДНК кожної хромосоми. Інші сателіти мають коротшу довжину повтору. Більшість сателітів як людини, так і інших організмів, розташовані в центромері.
Мінісателіти
Розмір повної ділянки мінісателітів становить від 1 kb до 20 kb, із довжиною повтору зазвичай 7-100 bp. Один вид мінісателітів — «змінне число тандемних повторень» (англ. variable number of tandem repeats, VNTR). Його довжина повтору може бути від 9 до 80 пар основ, а повторювані ділянки розташовані в некодуючих регіонах геному. Число повторень для даного мінісателіту може відрізнятися між індивідуумами; ця особливість є основою методу генетичного фінґерпринтингу. Інший вид мінісателітів — теломери. У людських генеративних клітинах розмір теломер становить близько 15 kb. У старіючих соматичних клітинах, теломери можуть бути значно коротшими. У людини та інших ссавців теломери містять послідовність тандемних повторів GGGTTA.
Мікросателіти
Мікросателіти, також відомі як короткі тандемні повтори (англ. short tandem repeats, STR), тому що розмір повтору складає лише від 1 до 6 bp, а повний розмір ділянки зазвичай становить до 150 bp. Подібно до мінісателітів, число повторень для даного мікросателіту може відрізнятися між індивідуумами. Тому мікросателіти також можуть бути використані для генетичного фінґерпринтингу.
Посилання
- Загальні тексти
- Приклади
- VNTRs — інформація та анімований приклад
- Бази даних
- The Microorganisms Tandem Repeats Database
- Short Tandem Repeats Database
- Tandem Repeats Database (TRDB)
- Системи пошуку
- Tandem Repeats Finder
- Mreps
- STAR
- TRED
- Phobos — a tandem repeat search tool for perfect and imperfect repeats — the maximum pattern size depends only on computational power
- MeSH Tandem+Repeat
Це незавершена стаття з молекулярної біології. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
- . scarb.net.ua. Архів оригіналу за 19 березня 2018. Процитовано 18 березня 2018.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Tandemni povtori poslidovnosti povtoryuvanih dilyanok DNK Zalezhno vid rozmiru voni podilyayutsya na tri pidklasi sateliti minisateliti i mikrosateliti Nazva sateliti pohodit vid spektru optichnoyi shilnosti pri rozdilenni DNK u gradiyenti shilnosti rozchinnika sho vkazuye na vidminnosti vidnosnogo serednogo vmistu riznih nukleotidiv u tandemnih povtorah u porivnyanni z reshtoyu DNK Najbilsha kilkist povtoriv zustrichayetsya u Eucalyptus grandis SatelitiDokladnishe Satelitna DNK Rozmir dilyanok satelitiv stanovit vid 100 kbp do ponad 1 Mpb iz povtoryuvanoyu odiniceyu zazvichaj gt 100 bp U lyudini dobre vidomij priklad alfoyidna DNK roztashovana v centromerah vsih hromosom Dovzhina odnogo povtoru stanovit 171 bp a ves povtoryuvanij region stanovit 3 5 dovzhini DNK kozhnoyi hromosomi Inshi sateliti mayut korotshu dovzhinu povtoru Bilshist satelitiv yak lyudini tak i inshih organizmiv roztashovani v centromeri MinisatelitiDokladnishe Minisateliti Rozmir povnoyi dilyanki minisatelitiv stanovit vid 1 kb do 20 kb iz dovzhinoyu povtoru zazvichaj 7 100 bp Odin vid minisatelitiv zminne chislo tandemnih povtoren angl variable number of tandem repeats VNTR Jogo dovzhina povtoru mozhe buti vid 9 do 80 par osnov a povtoryuvani dilyanki roztashovani v nekoduyuchih regionah genomu Chislo povtoren dlya danogo minisatelitu mozhe vidriznyatisya mizh individuumami cya osoblivist ye osnovoyu metodu genetichnogo fingerprintingu Inshij vid minisatelitiv telomeri U lyudskih generativnih klitinah rozmir telomer stanovit blizko 15 kb U stariyuchih somatichnih klitinah telomeri mozhut buti znachno korotshimi U lyudini ta inshih ssavciv telomeri mistyat poslidovnist tandemnih povtoriv GGGTTA MikrosatelitiDokladnishe Mikrosateliti Mikrosateliti takozh vidomi yak korotki tandemni povtori angl short tandem repeats STR tomu sho rozmir povtoru skladaye lishe vid 1 do 6 bp a povnij rozmir dilyanki zazvichaj stanovit do 150 bp Podibno do minisatelitiv chislo povtoren dlya danogo mikrosatelitu mozhe vidriznyatisya mizh individuumami Tomu mikrosateliti takozh mozhut buti vikoristani dlya genetichnogo fingerprintingu PosilannyaZagalni teksti Prikladi VNTRs informaciya ta animovanij priklad Bazi danih The Microorganisms Tandem Repeats Database Short Tandem Repeats Database Tandem Repeats Database TRDB Sistemi poshuku Tandem Repeats Finder Mreps STAR TRED Phobos a tandem repeat search tool for perfect and imperfect repeats the maximum pattern size depends only on computational power MeSH Tandem RepeatCe nezavershena stattya z molekulyarnoyi biologiyi Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi scarb net ua Arhiv originalu za 19 bereznya 2018 Procitovano 18 bereznya 2018