Azərbaycanca
Беларускі
Dansk
Deutsch
Española
Français
Indonesia
Italiana
日本語
Қазақ
Lietuvos
Nederlands
Português
Русский
සිංහල
แบบไทย
Türkçe
Українська
中國人
United State
Afrikaans
Молекулярна механіка — метод розрахунку геометрії та енергетичних характеристик молекулярних частинок з використанням емпіричних потенціальних функцій, вид яких взято з класичної механіки і в яких враховуються вандерваальсові сили та електростатична взаємодія. Застосовується для розрахунків геометрії кон-формерів. В основі метода лежить припущення про транс-ферабельність в границях подібних молекулярних структур потенціальних функцій, а також таких геометричних параметрів як довжини зв’язків та валентні кути. Точність розрахунків залежить від параметризації силового поля. Такі методи є незастосовними у випадку сильної орбітальної взаємодії чи інших електронних ефектів.
Молекулярна механіка використовує класичну механіку для моделювання молекулярних систем. Потенціальна енергія всіх систем у рамках молекулярної механіки розраховується з використанням силових полів. Молекулярну механіку можна використовувати для вивчення як малих молекул, так і великих біологічних систем чи молекулярних агрегатів, що складаються з тисяч та, навіть, мільйонів атомів.
Методи молекулярної механіки приймають такі припущення:
- кожен атом симулюється як одна окрема частинка;
- кожній частинці присвоюється радіус (зазвичай радіус Ван дер Ваальса), поляризовність та незмінний заряд (загалом виведений з квантово-хімічних розрахунків та (або) експерименту)
- зв'язуючі взаємодії розглядаються як "пружини" із рівноважною довжиною рівною експериментальній чи розрахованій довжині хімічного зв'язку.
Можливі різні варіації цієї схеми. Так, багато моделювань використовують концепцію так званого "об'єднаного атома", тобто різні групи, такі як вуглеводневі радикали (наприклад, метил) та метиленова група розглядаються як одна частинка. Більше того, великі білкові системи зазвичай моделюються використовуючи "намистову" модель, у якій амінокислоти моделюються двома–чотирма частинками.
Див. також
Посилання
- Krishnan Namboori; Ramachandran, K. S.; Deepa Gopakumar (2008). Computational Chemistry and Molecular Modeling: Principles and Applications. Berlin: Springer. ISBN .(англ.)
- Глосарій термінів з хімії / уклад. Й. Опейда, О. Швайка ; Ін-т фізико-органічної хімії та вуглехімії ім. Л. М. Литвиненка НАН України, Донецький національний університет. — Дон. : Вебер, 2008. — 738 с. — .
 | Це незавершена стаття з хімії. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Molekulyarna mehanika metod rozrahunku geometriyi ta energetichnih harakteristik molekulyarnih chastinok z vikoristannyam empirichnih potencialnih funkcij vid yakih vzyato z klasichnoyi mehaniki i v yakih vrahovuyutsya vandervaalsovi sili ta elektrostatichna vzayemodiya Zastosovuyetsya dlya rozrahunkiv geometriyi kon formeriv V osnovi metoda lezhit pripushennya pro trans ferabelnist v granicyah podibnih molekulyarnih struktur potencialnih funkcij a takozh takih geometrichnih parametriv yak dovzhini zv yazkiv ta valentni kuti Tochnist rozrahunkiv zalezhit vid parametrizaciyi silovogo polya Taki metodi ye nezastosovnimi u vipadku silnoyi orbitalnoyi vzayemodiyi chi inshih elektronnih efektiv Silove pole vikoristovuyetsya dlya minimizaciyi energiyi roztyagu stisku zv yazku v molekuli etanu Molekulyarna mehanika vikoristovuye klasichnu mehaniku dlya modelyuvannya molekulyarnih sistem Potencialna energiya vsih sistem u ramkah molekulyarnoyi mehaniki rozrahovuyetsya z vikoristannyam silovih poliv Molekulyarnu mehaniku mozhna vikoristovuvati dlya vivchennya yak malih molekul tak i velikih biologichnih sistem chi molekulyarnih agregativ sho skladayutsya z tisyach ta navit miljoniv atomiv Metodi molekulyarnoyi mehaniki prijmayut taki pripushennya kozhen atom simulyuyetsya yak odna okrema chastinka kozhnij chastinci prisvoyuyetsya radius zazvichaj radius Van der Vaalsa polyarizovnist ta nezminnij zaryad zagalom vivedenij z kvantovo himichnih rozrahunkiv ta abo eksperimentu zv yazuyuchi vzayemodiyi rozglyadayutsya yak pruzhini iz rivnovazhnoyu dovzhinoyu rivnoyu eksperimentalnij chi rozrahovanij dovzhini himichnogo zv yazku Mozhlivi rizni variaciyi ciyeyi shemi Tak bagato modelyuvan vikoristovuyut koncepciyu tak zvanogo ob yednanogo atoma tobto rizni grupi taki yak vuglevodnevi radikali napriklad metil ta metilenova grupa rozglyadayutsya yak odna chastinka Bilshe togo veliki bilkovi sistemi zazvichaj modelyuyutsya vikoristovuyuchi namistovu model u yakij aminokisloti modelyuyutsya dvoma chotirma chastinkami Div takozhMolekulyarna mashinaPosilannyaKrishnan Namboori Ramachandran K S Deepa Gopakumar 2008 Computational Chemistry and Molecular Modeling Principles and Applications Berlin Springer ISBN 3 540 77302 9 angl Glosarij terminiv z himiyi uklad J Opejda O Shvajka In t fiziko organichnoyi himiyi ta vuglehimiyi im L M Litvinenka NAN Ukrayini Doneckij nacionalnij universitet Don Veber 2008 738 s ISBN 978 966 335 206 0 Ce nezavershena stattya z himiyi Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi