Імунопреципітація хроматину (англ. Chromatin Immunoprecipitation, скороч. ChIP) — експериментальна техніка в молекулярній біології яку використовують для дослідження взаємодій між ДНК та білками в живих клітинах. Імунопреципітація хроматину дозволяє визначити які саме білки асоційовані з конкретними ділянками геному (наприклад, асоціація певних факторів транскрипції з певними промоторами). Важливим застосуванням методу ChIP є дослідження впливу сукупності посттрансляційних модифікацій гістонів на функціональний статус генів (див. Гістоновий код).
В основі методу імунопреципітації хроматину та його модифікацій лежить наступна послідовність операцій:
- ДНК та білки хроматину в живих клітинах або тканинах «зшиваються» (англ. crosslinking) між собою за допомогою хімічних реагентів або жорсткого ультрафіолетового опромінювання. Цю операцію пропускають в нативній імунопреципітації хроматину (англ. Native ChIP).
- Молекули ДНК випадковим чином фрагментуються до розміру приблизно 500 пар основ за допомогою фізичних (ультразвук) або біохімічних (нуклеази) методів.
- Білок який необхідно дослідити селективно імунопреципітується за допомогою відповідного антитіла. Разом із білком осаджуються фрагментами ДНК, з якими він був асоційований в клітині.
- ДНК з імунопреципітату очищується і секвенується.
Різновиди ChIP
Існує два основних різновиди імунопреципітації хроматину, які відрізняються способом фіксації та виділення ДНК-білкових комплексів. Першим є XChIP (від англ. cross-linked ChIP, тобто ChIP із хімічною «зшивкою» компонентів) під час якого використовують хімічні реагенти які ковалентно зшивають білки з відповідними ділянками ДНК. Другим є NChIP, або нативний ChIP (англ. native ChIP) під час якого виділяються комплекси які утворені тільки нековалентними взаємодіями.
XChIP
XChIP використовують для дослідження факторів транскрипції та інших протеїнів хроматину. Особливістю цього різновиду імунопреципітації хроматину є використанні хімічних реагентів таких як формальдегід або фізичних факторів таких як УФ світло для того щоб ковалентно «пришити» білки до споріднених ділянок ДНК. Після зшивки хроматин контрольовано руйнується дією ультразвуку в результаті чого утворюються фрагменти ДНК довжиною приблизно 300—1000 пар основ. Була також описана нуклеазна обробка формальдегід-зшитого хроматину.
Утворений клітинний лізат очищують центрифугуванням, після чого зшиті ДНК-білкові комплекси осаджуюють (преципітують) за допомогою білок-специфічних антитіл. Найчастіше антитіла є прикріпленими до мікрочастинок агарози, сепарози або магнітних наночастинок, для того щоб їх можна було виділити з розчину у вигляді осаду. Імунопреципітовані комплекси (тобто комплекси носій–антитіло–білок–ДНК) промивають щоб відділити неспецифічно зв'язані білки, далі білкові компоненти імунопреципітованих комплексів гідролізуються протеїназою K.
ДНК що вивільнилась внаслідок протеїназної обробки імунопреципітованих комплексів далі ампліфікується за допомогою полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР), або ж детектується за допомогою ДНК-мікрочипів, молекулярного клонування та секвенування. Найновіші методики імунопреципітації хроматину, а саме ChIP-Seq, передбачають пряме високопродуктивне секвенування імунопреципітованої ДНК.
NChIP
Нативний ChIP використовують головним чином для визначення ділянок ДНК які асоційовані з певними модифікаціями гістонів. В нативному хроматині ДНК обернена навколо октамерів гістонів, утворюючи нуклеосоми. Методика NChIP передбачає обробку нативного хроматину ДНКазою, яка руйнує вільні ділянки ДНК, але не впливає на ділянки, які були захищені нуклеосомами. В результаті такої контрольованої фрагментації геномна ДНК перетворюється на суміш фрагментів розміром від 200 пар основ (1 нуклеосома) до 1000 пар основ (5 нуклеосом).
Після цього, методика повторює кроки XChIP, при цьому в процесі імунопреципітації використовують антитіла специфічні до певних модифікацій гістонів.
Порівняння XChIP та NChIP
Основною перевагою NChIP є висока специфічність антитіл. Антитіла до модифікацій гістонів готують використовуючи високоочищені синтетичні пептиди під час імунізації. Більш того, ці антитіла преципітують гістони які перебувають у нативній конформації. На відміну від цого, під час XChIP цільові епітопи можуть бути зруйновані на стадії зшивки, що зменшує специфічність імунопреципітації. Як результат XChIP протокол є менш ефективним (дає більший фон) ніж NChIP.
Таблиця 1. Переваги та недоліки протоколів NChIP та XChIP
XChIP | NChIP | |
---|---|---|
Переваги | Підходить для факторів транскрипції та інших білків які слабо асоційовані з хроматином. Може бути застосований до багатьох типів клітин і організмів в яких важко дослідити нативний хроматин. | Краща чутливість антитіл, антитіла взаємодіють з білками в їх нативній конформації. Кращий вихід білків і ДНК |
Недоліки | Антиген може бути зруйнований під час зшивки з ДНК, що призводить до менших кількостей ДНК-білкових комплексів в преципітаті Існує можливіть хибно-позитивних результатів для білків які не взаємодіють із хроматином специфічно. | Неможливо використовувати для негістонових протеїнів Існує можливість перегрупування або деградації гістонів в нуклеосомах під час виділення |
Історія розвитку
У 1984 році Джон Т. Ліс (англ. John T. Lis) і Девід Гілмор (англ. David Gilmour) вперше використали УФ-опромінення як зшиваючий агент щоб ковалентно зв'яати ДНК та відповідні споріднені білки в живих бактеріальних клітинах. Після лізису клітин та імунопреципітації бактеріальної РНК-полімерази, ДНК в преципітаті аналізували за допомогою гібридизації з ДНК-зондами. В результаті вдалось отримати інформацію про транскрипцію певних генів. В наступному році ті ж самі автори застосували цей метод для вивчення розподілу еукаріотичної РНК-полімерази II на генах теплового шоку в геномі дрозофіли. Ці публікації поклали початок широкому використанню цього методу в дослідженнях інших білків хроматину. Метод XChIP був розроблений Олександром Варшавським (англ. Alexander Varshavsky) котрий вивчав розподіл гістонів Н4 у генах теплового шоку. Метод XChIP інтенсивно розвивався і надалі. Метод NChIP був вперше описаний в 1988 році, після чого швидко вдосконалювався.
Перші протоколи експериментів вимагали 4–5 днів робочого часу для виконання і близько 106~ 107 клітин як вихідного матеріалу. Із новими вдосконаленими методиками став можливим аналіз 100~1000 клітин протягом одного дня. Такими методиками є:
- CChIP (від англ. Carrier ChIP, тобто ChIP із додатковим носієм): Цей варіант ChIP дозволяє преципітувати хроматин з надзвичайно малої клількості (від 100) клітин. Його характерною особливістю є додавання клітин Drosophila як буферного матеріалу для того щоб зменшити втрати під час маніпуляцій. Цей метод потребує використання високоспецифічних праймерів для ампліфікації цільових генів на фоні великого надлишку генів Drosophila.
- Швидкий ChIP (англ. Fast ChIP): В цьому протоколі наступні кроки виконуються швидше ніж звичайно: (i) ультразвукова обробка пришвидшує звязування антитіл з цільовим білком, зменшуючи загальний час потрібний для імунопреципітації (ii) полімерний носій (Chelex-100) використовують для швидшого виділення ДНК. Цей протокол вимагає велику кількість вихідного матеріалу (від 106~107клітин).
- MikpoChIP (англ. MicroChIP, µChIP): метод був розроблений для аналізу малих популяцій клітин. Однієї тисячі клітин може вистачити для восьми паралельних визначень. Можливий також аналіз невеликих (1 мм3) зразків біопсій.
Обмеження
- ChIP важко адаптувати для дослідження хроматину в багатоклітинних модельних організмах.
- Метод має середню чутливість та низьке розділення в часі для вивчення швидких змін в хроматині.
- в ChIP-експерименті неможливо відрізнити різні ізоформи факторів транскрипції.
Посилання
- Collas, Philippe. (January 2010). The Current State of Chromatin Immunoprecipitation. Molecular Biotechnology. 45 (1): 87—100. doi:10.1007/s12033-009-9239-8. PMID 20077036.
- Jackson, Vaughn (November 1978). (PDF). Cell. 15 (3): 945—54. doi:10.1016/0092-8674(78)90278-7. PMID 569554. Архів оригіналу за 9 червня 2020. Процитовано 13 березня 2010.
- Gilmour DS, Lis JT (August 1985). . . 5 (8): 2009—18. PMC 366919. PMID 3018544. Архів оригіналу за 9 червня 2020. Процитовано 13 березня 2010.
- Bauer UM, Daujat S, Nielsen SJ, Nightingale K, Kouzarides T (January 2002). Methylation at arginine 17 of histone H3 is linked to gene activation. . 3 (1): 39—44. doi:10.1093/embo-reports/kvf013. PMC 1083932. PMID 11751582.
{{}}
:|access-date=
вимагає|url=
() - . Архів оригіналу за 23 вересня 2016. Процитовано 7 липня 2016.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з текстом «archived copy» як значення параметру title () - . Архів оригіналу за 22 вересня 2016. Процитовано 7 липня 2016.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з текстом «archived copy» як значення параметру title () - Varshavsky A (December 2008). . Journal of Biological Chemistry. 283 (50): 34469—89. doi:10.1074/jbc.X800009200. PMC 3259866. PMID 18708349. Архів оригіналу за 9 червня 2020. Процитовано 6 березня 2010.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом () - Solomon, Mark J; Larsen Pamela L; Varshavsky, Alexander. (June 1988). . Cell. 53 (6): 937—47. doi:10.1016/S0092-8674(88)90469-2. PMID 2454748. Архів оригіналу за 2 листопада 2017. Процитовано 6 березня 2010.
- Orlando V (March 2000). . Trends in Biochemical Sciences. 25 (3): 99—104. doi:10.1016/S0968-0004(99)01535-2. PMID 10694875. Архів оригіналу за 9 червня 2020. Процитовано 14 березня 2010.
- Hebbes, Tim R; Thorne, Alan W; Crane-Robinson C. (May 1988). A direct link between core histone acetylation and transcriptionally active chromatin. . 7 (5): 1395—402. PMC 458389. PMID 3409869. Процитовано 6 березня 2010.
- O'Neill, Laura P; Turner, Bryan M (September 2003). . Methods (San Diego, Calif.). 31 (1): 76—82. doi:10.1016/S1046-2023(03)00090-2. PMID 12893176. Архів оригіналу за 9 червня 2020. Процитовано 14 березня 2010.
- O'Neill, Laura P; VerMilyea, Matthew D; Turner, Bryan M (July 2006). Epigenetic characterization of the early embryo with a chromatin immunoprecipitation protocol applicable to small cell populations. Nature Genetics. 38 (7): 835—41. doi:10.1038/ng1820. PMID 16767102.
- Nelson, Joel D; Denisenko, Oleg; Sova, Pavel; Bomsztyk, Karol (2006). Fast chromatin immunoprecipitation assay. Nucleic Acids Research. 34 (1): e2. doi:10.1093/nar/gnj004. PMC 1325209. PMID 16397291.
{{}}
:|access-date=
вимагає|url=
() - Nelson, Joel D; Denisenko, Oleg; Bomsztyk, Karol (2006). Protocol for the fast chromatin immunoprecipitation (ChIP) method. Nature Protocols. 1 (1): 179—85. doi:10.1038/nprot.2006.27. PMID 17406230.
- Nelson J, Denisenko O, Bomsztyk K (2009). The fast chromatin immunoprecipitation method. . 567: 45—57. doi:10.1007/978-1-60327-414-2_3. PMID 19588084.
- Dahl, John Arne; Collas, Philippe (2008). A rapid micro chromatin immunoprecipitation assay (microChIP). Nature Protocols. 3 (6): 1032—45. doi:10.1038/nprot.2008.68. PMID 18536650.
- Dahl, John Arne; Collas, Philippe (2009). MicroChIP: chromatin immunoprecipitation for small cell numbers. . 567: 59—74. doi:10.1007/978-1-60327-414-2_4. PMID 19588085.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Imunoprecipitaciya hromatinu angl Chromatin Immunoprecipitation skoroch ChIP eksperimentalna tehnika v molekulyarnij biologiyi yaku vikoristovuyut dlya doslidzhennya vzayemodij mizh DNK ta bilkami v zhivih klitinah Imunoprecipitaciya hromatinu dozvolyaye viznachiti yaki same bilki asocijovani z konkretnimi dilyankami genomu napriklad asociaciya pevnih faktoriv transkripciyi z pevnimi promotorami Vazhlivim zastosuvannyam metodu ChIP ye doslidzhennya vplivu sukupnosti posttranslyacijnih modifikacij gistoniv na funkcionalnij status geniv div Gistonovij kod Imunoprecipitaciya hromatinu V osnovi metodu imunoprecipitaciyi hromatinu ta jogo modifikacij lezhit nastupna poslidovnist operacij DNK ta bilki hromatinu v zhivih klitinah abo tkaninah zshivayutsya angl crosslinking mizh soboyu za dopomogoyu himichnih reagentiv abo zhorstkogo ultrafioletovogo oprominyuvannya Cyu operaciyu propuskayut v nativnij imunoprecipitaciyi hromatinu angl Native ChIP Molekuli DNK vipadkovim chinom fragmentuyutsya do rozmiru priblizno 500 par osnov za dopomogoyu fizichnih ultrazvuk abo biohimichnih nukleazi metodiv Bilok yakij neobhidno dosliditi selektivno imunoprecipituyetsya za dopomogoyu vidpovidnogo antitila Razom iz bilkom osadzhuyutsya fragmentami DNK z yakimi vin buv asocijovanij v klitini DNK z imunoprecipitatu ochishuyetsya i sekvenuyetsya Riznovidi ChIPIsnuye dva osnovnih riznovidi imunoprecipitaciyi hromatinu yaki vidriznyayutsya sposobom fiksaciyi ta vidilennya DNK bilkovih kompleksiv Pershim ye XChIP vid angl cross linked ChIP tobto ChIP iz himichnoyu zshivkoyu komponentiv pid chas yakogo vikoristovuyut himichni reagenti yaki kovalentno zshivayut bilki z vidpovidnimi dilyankami DNK Drugim ye NChIP abo nativnij ChIP angl native ChIP pid chas yakogo vidilyayutsya kompleksi yaki utvoreni tilki nekovalentnimi vzayemodiyami XChIP XChIP vikoristovuyut dlya doslidzhennya faktoriv transkripciyi ta inshih proteyiniv hromatinu Osoblivistyu cogo riznovidu imunoprecipitaciyi hromatinu ye vikoristanni himichnih reagentiv takih yak formaldegid abo fizichnih faktoriv takih yak UF svitlo dlya togo shob kovalentno prishiti bilki do sporidnenih dilyanok DNK Pislya zshivki hromatin kontrolovano rujnuyetsya diyeyu ultrazvuku v rezultati chogo utvoryuyutsya fragmenti DNK dovzhinoyu priblizno 300 1000 par osnov Bula takozh opisana nukleazna obrobka formaldegid zshitogo hromatinu Utvorenij klitinnij lizat ochishuyut centrifuguvannyam pislya chogo zshiti DNK bilkovi kompleksi osadzhuyuyut precipituyut za dopomogoyu bilok specifichnih antitil Najchastishe antitila ye prikriplenimi do mikrochastinok agarozi separozi abo magnitnih nanochastinok dlya togo shob yih mozhna bulo vidiliti z rozchinu u viglyadi osadu Imunoprecipitovani kompleksi tobto kompleksi nosij antitilo bilok DNK promivayut shob viddiliti nespecifichno zv yazani bilki dali bilkovi komponenti imunoprecipitovanih kompleksiv gidrolizuyutsya proteyinazoyu K DNK sho vivilnilas vnaslidok proteyinaznoyi obrobki imunoprecipitovanih kompleksiv dali amplifikuyetsya za dopomogoyu polimeraznoyi lancyugovoyi reakciyi PLR abo zh detektuyetsya za dopomogoyu DNK mikrochipiv molekulyarnogo klonuvannya ta sekvenuvannya Najnovishi metodiki imunoprecipitaciyi hromatinu a same ChIP Seq peredbachayut pryame visokoproduktivne sekvenuvannya imunoprecipitovanoyi DNK NChIP Nativnij ChIP vikoristovuyut golovnim chinom dlya viznachennya dilyanok DNK yaki asocijovani z pevnimi modifikaciyami gistoniv V nativnomu hromatini DNK obernena navkolo oktameriv gistoniv utvoryuyuchi nukleosomi Metodika NChIP peredbachaye obrobku nativnogo hromatinu DNKazoyu yaka rujnuye vilni dilyanki DNK ale ne vplivaye na dilyanki yaki buli zahisheni nukleosomami V rezultati takoyi kontrolovanoyi fragmentaciyi genomna DNK peretvoryuyetsya na sumish fragmentiv rozmirom vid 200 par osnov 1 nukleosoma do 1000 par osnov 5 nukleosom Pislya cogo metodika povtoryuye kroki XChIP pri comu v procesi imunoprecipitaciyi vikoristovuyut antitila specifichni do pevnih modifikacij gistoniv Porivnyannya XChIP ta NChIP Osnovnoyu perevagoyu NChIP ye visoka specifichnist antitil Antitila do modifikacij gistoniv gotuyut vikoristovuyuchi visokoochisheni sintetichni peptidi pid chas imunizaciyi Bilsh togo ci antitila precipituyut gistoni yaki perebuvayut u nativnij konformaciyi Na vidminu vid cogo pid chas XChIP cilovi epitopi mozhut buti zrujnovani na stadiyi zshivki sho zmenshuye specifichnist imunoprecipitaciyi Yak rezultat XChIP protokol ye mensh efektivnim daye bilshij fon nizh NChIP Tablicya 1 Perevagi ta nedoliki protokoliv NChIP ta XChIP XChIP NChIPPerevagi Pidhodit dlya faktoriv transkripciyi ta inshih bilkiv yaki slabo asocijovani z hromatinom Mozhe buti zastosovanij do bagatoh tipiv klitin i organizmiv v yakih vazhko dosliditi nativnij hromatin Krasha chutlivist antitil antitila vzayemodiyut z bilkami v yih nativnij konformaciyi Krashij vihid bilkiv i DNKNedoliki Antigen mozhe buti zrujnovanij pid chas zshivki z DNK sho prizvodit do menshih kilkostej DNK bilkovih kompleksiv v precipitati Isnuye mozhlivit hibno pozitivnih rezultativ dlya bilkiv yaki ne vzayemodiyut iz hromatinom specifichno Nemozhlivo vikoristovuvati dlya negistonovih proteyiniv Isnuye mozhlivist peregrupuvannya abo degradaciyi gistoniv v nukleosomah pid chas vidilennyaIstoriya rozvitkuU 1984 roci Dzhon T Lis angl John T Lis i Devid Gilmor angl David Gilmour vpershe vikoristali UF oprominennya yak zshivayuchij agent shob kovalentno zv yaati DNK ta vidpovidni sporidneni bilki v zhivih bakterialnih klitinah Pislya lizisu klitin ta imunoprecipitaciyi bakterialnoyi RNK polimerazi DNK v precipitati analizuvali za dopomogoyu gibridizaciyi z DNK zondami V rezultati vdalos otrimati informaciyu pro transkripciyu pevnih geniv V nastupnomu roci ti zh sami avtori zastosuvali cej metod dlya vivchennya rozpodilu eukariotichnoyi RNK polimerazi II na genah teplovogo shoku v genomi drozofili Ci publikaciyi poklali pochatok shirokomu vikoristannyu cogo metodu v doslidzhennyah inshih bilkiv hromatinu Metod XChIP buv rozroblenij Oleksandrom Varshavskim angl Alexander Varshavsky kotrij vivchav rozpodil gistoniv N4 u genah teplovogo shoku Metod XChIP intensivno rozvivavsya i nadali Metod NChIP buv vpershe opisanij v 1988 roci pislya chogo shvidko vdoskonalyuvavsya Pershi protokoli eksperimentiv vimagali 4 5 dniv robochogo chasu dlya vikonannya i blizko 106 107 klitin yak vihidnogo materialu Iz novimi vdoskonalenimi metodikami stav mozhlivim analiz 100 1000 klitin protyagom odnogo dnya Takimi metodikami ye CChIP vid angl Carrier ChIP tobto ChIP iz dodatkovim nosiyem Cej variant ChIP dozvolyaye precipituvati hromatin z nadzvichajno maloyi klilkosti vid 100 klitin Jogo harakternoyu osoblivistyu ye dodavannya klitin Drosophila yak bufernogo materialu dlya togo shob zmenshiti vtrati pid chas manipulyacij Cej metod potrebuye vikoristannya visokospecifichnih prajmeriv dlya amplifikaciyi cilovih geniv na foni velikogo nadlishku geniv Drosophila Shvidkij ChIP angl Fast ChIP V comu protokoli nastupni kroki vikonuyutsya shvidshe nizh zvichajno i ultrazvukova obrobka prishvidshuye zvyazuvannya antitil z cilovim bilkom zmenshuyuchi zagalnij chas potribnij dlya imunoprecipitaciyi ii polimernij nosij Chelex 100 vikoristovuyut dlya shvidshogo vidilennya DNK Cej protokol vimagaye veliku kilkist vihidnogo materialu vid 106 107klitin MikpoChIP angl MicroChIP µChIP metod buv rozroblenij dlya analizu malih populyacij klitin Odniyeyi tisyachi klitin mozhe vistachiti dlya vosmi paralelnih viznachen Mozhlivij takozh analiz nevelikih 1 mm3 zrazkiv biopsij ObmezhennyaChIP vazhko adaptuvati dlya doslidzhennya hromatinu v bagatoklitinnih modelnih organizmah Metod maye serednyu chutlivist ta nizke rozdilennya v chasi dlya vivchennya shvidkih zmin v hromatini v ChIP eksperimenti nemozhlivo vidrizniti rizni izoformi faktoriv transkripciyi PosilannyaCollas Philippe January 2010 The Current State of Chromatin Immunoprecipitation Molecular Biotechnology 45 1 87 100 doi 10 1007 s12033 009 9239 8 PMID 20077036 Jackson Vaughn November 1978 PDF Cell 15 3 945 54 doi 10 1016 0092 8674 78 90278 7 PMID 569554 Arhiv originalu za 9 chervnya 2020 Procitovano 13 bereznya 2010 Gilmour DS Lis JT August 1985 5 8 2009 18 PMC 366919 PMID 3018544 Arhiv originalu za 9 chervnya 2020 Procitovano 13 bereznya 2010 Bauer UM Daujat S Nielsen SJ Nightingale K Kouzarides T January 2002 Methylation at arginine 17 of histone H3 is linked to gene activation 3 1 39 44 doi 10 1093 embo reports kvf013 PMC 1083932 PMID 11751582 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a access date vimagaye url dovidka Arhiv originalu za 23 veresnya 2016 Procitovano 7 lipnya 2016 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite web title Shablon Cite web cite web a Obslugovuvannya CS1 Storinki z tekstom archived copy yak znachennya parametru title posilannya Arhiv originalu za 22 veresnya 2016 Procitovano 7 lipnya 2016 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite web title Shablon Cite web cite web a Obslugovuvannya CS1 Storinki z tekstom archived copy yak znachennya parametru title posilannya Varshavsky A December 2008 Journal of Biological Chemistry 283 50 34469 89 doi 10 1074 jbc X800009200 PMC 3259866 PMID 18708349 Arhiv originalu za 9 chervnya 2020 Procitovano 6 bereznya 2010 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Obslugovuvannya CS1 Storinki iz nepoznachenim DOI z bezkoshtovnim dostupom posilannya Solomon Mark J Larsen Pamela L Varshavsky Alexander June 1988 Cell 53 6 937 47 doi 10 1016 S0092 8674 88 90469 2 PMID 2454748 Arhiv originalu za 2 listopada 2017 Procitovano 6 bereznya 2010 Orlando V March 2000 Trends in Biochemical Sciences 25 3 99 104 doi 10 1016 S0968 0004 99 01535 2 PMID 10694875 Arhiv originalu za 9 chervnya 2020 Procitovano 14 bereznya 2010 Hebbes Tim R Thorne Alan W Crane Robinson C May 1988 A direct link between core histone acetylation and transcriptionally active chromatin 7 5 1395 402 PMC 458389 PMID 3409869 Procitovano 6 bereznya 2010 O Neill Laura P Turner Bryan M September 2003 Methods San Diego Calif 31 1 76 82 doi 10 1016 S1046 2023 03 00090 2 PMID 12893176 Arhiv originalu za 9 chervnya 2020 Procitovano 14 bereznya 2010 O Neill Laura P VerMilyea Matthew D Turner Bryan M July 2006 Epigenetic characterization of the early embryo with a chromatin immunoprecipitation protocol applicable to small cell populations Nature Genetics 38 7 835 41 doi 10 1038 ng1820 PMID 16767102 Nelson Joel D Denisenko Oleg Sova Pavel Bomsztyk Karol 2006 Fast chromatin immunoprecipitation assay Nucleic Acids Research 34 1 e2 doi 10 1093 nar gnj004 PMC 1325209 PMID 16397291 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a access date vimagaye url dovidka Nelson Joel D Denisenko Oleg Bomsztyk Karol 2006 Protocol for the fast chromatin immunoprecipitation ChIP method Nature Protocols 1 1 179 85 doi 10 1038 nprot 2006 27 PMID 17406230 Nelson J Denisenko O Bomsztyk K 2009 The fast chromatin immunoprecipitation method 567 45 57 doi 10 1007 978 1 60327 414 2 3 PMID 19588084 Dahl John Arne Collas Philippe 2008 A rapid micro chromatin immunoprecipitation assay microChIP Nature Protocols 3 6 1032 45 doi 10 1038 nprot 2008 68 PMID 18536650 Dahl John Arne Collas Philippe 2009 MicroChIP chromatin immunoprecipitation for small cell numbers 567 59 74 doi 10 1007 978 1 60327 414 2 4 PMID 19588085