International Code of Phylogenetic Nomenclature (Міжнародний кодекс філогенетичної номенклатури), скорочено відомий як PhyloCode — офіційний набір правил, що регулюють філогенетичну номенклатуру. Його поточна версія спеціально розроблена для регулювання іменування клад, залишаючи управління назвами видів до номенклатурних кодексів на основі рангів (ICN, , ICNP, ICZN, ICVCN).
PhyloCode | |
Назва | англ. International Code of Phylogenetic Nomenclature |
---|---|
Автор | d і d |
Повний твір доступний на | phylonames.org/code/ |
PhyloCode пов'язаний з (ISPN).
PhyloCode регулює філогенетичну номенклатуру, надаючи правила для прийняття рішення про те, які асоціації імен і визначень вважаються встановленими, які з них вважатимуться омонімами або синонімами і які з набору синонімів або омонімів будуть вважається прийнятим (зазвичай той, хто зареєстрований першим; див. нижче). PhyloCode регулює лише найменування клад, а не парафілетичних або поліфілетичних груп, і дозволяє використовувати лише зразки, види та апоморфії як специфікатори.
Філогенетична номенклатура
На відміну від номенклатурних кодів на основі рангів (ICN, ICZN, ICNB), PhyloCode не вимагає використання рангів, хоча він необов'язково дозволяє їх використання. Рангові коди визначають таксони за допомогою рангу (наприклад, роду, родини тощо) і, у багатьох випадках, типового зразка або типового підтаксону. Точний вміст таксона, окрім типу, не визначається кодами на основі рангів.
Навпаки, за філогенетичною номенклатурою вміст таксонів розмежовується за допомогою визначення, яке базується на філогенезі (тобто походження) і використовує специфікатори (наприклад, види, зразки, апоморфії) для позначення фактичних організмів. Формула визначення вказує на предка. Отже, визначений таксон — це предок і всі його нащадки. Таким чином, зміст філогенетично визначеного таксону спирається на філогенетичну гіпотезу.
Нижче наведено приклади типів філогенетичних визначень (великі літери позначають специфікатори):
- На основі вузла: «клада, що походить від останнього спільного предка A і B» або «найменш включена клада, що містить A і B»
- На основі гілок: «клада, що складається з A та всіх організмів або видів, які мають більш недавнього спільного предка з A, ніж з Z», або «найбільш комплексна клада, що містить A, але не Z».
- На основі апоморфії : «клада, що походить від першого організму або виду, який мав апоморфію M, успадковану A».
Можливі й інші типи визначення, беручи до уваги не лише філогенетичні зв'язки й апоморфії організмів, але й те, чи існують споріднені організми.
У наступній таблиці наведено приклади філогенетичних визначень клад, які також мають ранги в традиційній номенклатурі.
Назва | Ранг | Тип | Можливе філогенетичне визначення |
---|---|---|---|
Tyrannosauridae | Родина | Тиранозавр. Осборн 1905 рік | Найменш включна клада, що містить Tyrannosaurus rex Osborn 1905, Gorgosaurus libratus Lambe 1914 і Albertosaurus sarcophagus Osborn 1905 |
Ссавці | Клас | N/A | Клада, що походить від останнього спільного предка людини, Homo sapiens Linnaeus 1758, і качкодзьобів, Ornithorhynchus anatinus Shaw 1799 |
Гризуни | Ряд | N/A | Найбільш інклюзивна клада, що містить Mus musculus Linnaeus 1758, але Sylvilagus floridanus Allen 1890 |
Неорніти (Сучасні птахи) | Підклас | N/A | Клада, що походить від останнього спільного предка існуючих членів найбільшої клади, яка містить домашнього горобця Passer domesticus Linnaeus 1758, але не динозавра Stegosaurus armatus Marsh 1887 |
Тетраподи | Надклас | N/A | Клада, що походить від найдавнішого предка, від якого Homo sapiens Linnaeus 1758 успадкував кінцівки з пальцями рук або ніг |
Історія
PhyloCode виник на семінарі в Гарвардському університеті в серпні 1998 року, де приймалися рішення щодо його масштабів і змісту. Багато учасників семінару разом із кількома іншими людьми, які згодом приєдналися до проєкту, служили консультативною групою. У квітні 2000 року чернетку було оприлюднено в Інтернеті, і наукове співтовариство запросило коментарі.
У липні 2002 року в Єльському університеті відбувся другий семінар, на якому були внесені деякі зміни в правила та рекомендації PhyloCode. Час від часу також вносилися інші зміни.
У Першій міжнародній зустрічі з філогенетичної номенклатури, яка проходила з 6 по 9 липня 2004 року в Парижі, Франція, взяли участь близько 70 систематичних та еволюційних біологів з 11 країн. Це була перша відкрита багатоденна конференція, яка повністю зосереджувалася на філогенетичній номенклатурі, і вона стала місцем для урочистого відкриття нової асоціації, (ISPN). Члени ISPN обирають (CPN), який взяв на себе роль консультативної групи, яка спостерігала за попередніми етапами розробки PhyloCode.
З 28 червня по 2 липня 2006 року в Єльському університеті (Нью-Гейвен, Коннектикут, США) відбулася Друга міжнародна філогенетична номенклатурна зустріч.
З 21 по 22 липня 2008 року в Університеті Далгаузі (Галіфакс, Нова Шотландія, Канада) проходила Третя Міжнародна філогенетична номенклатурна зустріч.
PhyloCode набув чинності з публікацією супровідного тому «Phylonyms» у 2020 році.
Примітки
- International Society for Phylogenetic Nomenclature (website). Phylonames.org. Процитовано 7 липня 2010.
- International Code of Phylogenetic Nomenclature, Version 4b - Chapter II. Publication. Ohiou.edu. Процитовано 7 липня 2010.
- International Code of Phylogenetic Nomenclature, Version 4b - Article 13: Homonymy. ohiou.edu. Процитовано 7 липня 2010.
- International Code of Phylogenetic Nomenclature Version 4b, Article 14: Synonymy. Ohiou.edu. Процитовано 7 липня 2010.
- International Code of Phylogenetic Nomenclature, Version 4b - Rule 1.1. Ohiou.edu. Процитовано 7 липня 2010.
- International Code of Phylogenetic Nomenclature, Version 4b - Article 11. Specifiers and Qualifying Clauses. Ohiou.edu. Процитовано 7 липня 2010.
- International Code of Phylogenetic Nomenclature, Version 4b - Article 3. Hierarchy and Rank. Ohiou.edu. Процитовано 7 липня 2010.
- Although note that the PhyloCode does not permit a taxon's name to change when its rank changes, while the rank-based codes require this for at least some names.
- International Code of Phylogenetic Nomenclature, Version 4b - Article 9. General Requirements for Establishment of Clade Names. Ohiou.edu. Процитовано 7 липня 2010.
- Laurin, M.; P. D. Cantino (2004). First international phylogenetic nomenclature meeting: a report. Zool. Scr. 33 (5): 475—479. doi:10.1111/j.0300-3256.2004.00176.x.
- Laurin, M.; P. D. Cantino (2007). Second meeting of the International Society for Phylogenetic Nomenclature: a report. Zool. Scr. 36: 109—117. doi:10.1111/j.1463-6409.2006.00268.x.
- Laurin, M.; Bryant, H.N. (May 2009). Third meeting of the International Society for Phylogenetic Nomenclature: a report. Zoologica Scripta. 38 (3): 333—337. doi:10.1111/j.1463-6409.2008.00379.x.
- de Queiroz. K., Cantino. P. D., Gauthier. J. A. eds. (2020). Phylonyms: A Companion to the PhyloCode. CRC Press Boca Raton, FL
Посилання
- The PhyloCode (current draft)
- International Society for Phylogenetic Nomenclature
- RegNum, the official repository of phylogenetic clade names generated according to the rules of the PhyloCode
- Christine Soares, What's in a Name?, Scientific American, (November 2004).
- What if we decide to rename every living thing on Earth?, Discovery Magazine, (04.28.2005)
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
International Code of Phylogenetic Nomenclature Mizhnarodnij kodeks filogenetichnoyi nomenklaturi skorocheno vidomij yak PhyloCode oficijnij nabir pravil sho regulyuyut filogenetichnu nomenklaturu Jogo potochna versiya specialno rozroblena dlya regulyuvannya imenuvannya klad zalishayuchi upravlinnya nazvami vidiv do nomenklaturnih kodeksiv na osnovi rangiv ICN ICNP ICZN ICVCN PhyloCodeNazvaangl International Code of Phylogenetic NomenclatureAvtord i dPovnij tvir dostupnij naphylonames org code PhyloCode pov yazanij z ISPN PhyloCode regulyuye filogenetichnu nomenklaturu nadayuchi pravila dlya prijnyattya rishennya pro te yaki asociaciyi imen i viznachen vvazhayutsya vstanovlenimi yaki z nih vvazhatimutsya omonimami abo sinonimami i yaki z naboru sinonimiv abo omonimiv budut vvazhayetsya prijnyatim zazvichaj toj hto zareyestrovanij pershim div nizhche PhyloCode regulyuye lishe najmenuvannya klad a ne parafiletichnih abo polifiletichnih grup i dozvolyaye vikoristovuvati lishe zrazki vidi ta apomorfiyi yak specifikatori Filogenetichna nomenklaturaNa vidminu vid nomenklaturnih kodiv na osnovi rangiv ICN ICZN ICNB PhyloCode ne vimagaye vikoristannya rangiv hocha vin neobov yazkovo dozvolyaye yih vikoristannya Rangovi kodi viznachayut taksoni za dopomogoyu rangu napriklad rodu rodini tosho i u bagatoh vipadkah tipovogo zrazka abo tipovogo pidtaksonu Tochnij vmist taksona okrim tipu ne viznachayetsya kodami na osnovi rangiv Navpaki za filogenetichnoyu nomenklaturoyu vmist taksoniv rozmezhovuyetsya za dopomogoyu viznachennya yake bazuyetsya na filogenezi tobto pohodzhennya i vikoristovuye specifikatori napriklad vidi zrazki apomorfiyi dlya poznachennya faktichnih organizmiv Formula viznachennya vkazuye na predka Otzhe viznachenij takson ce predok i vsi jogo nashadki Takim chinom zmist filogenetichno viznachenogo taksonu spirayetsya na filogenetichnu gipotezu Nizhche navedeno prikladi tipiv filogenetichnih viznachen veliki literi poznachayut specifikatori Na osnovi vuzla klada sho pohodit vid ostannogo spilnogo predka A i B abo najmensh vklyuchena klada sho mistit A i B Na osnovi gilok klada sho skladayetsya z A ta vsih organizmiv abo vidiv yaki mayut bilsh nedavnogo spilnogo predka z A nizh z Z abo najbilsh kompleksna klada sho mistit A ale ne Z Na osnovi apomorfiyi klada sho pohodit vid pershogo organizmu abo vidu yakij mav apomorfiyu M uspadkovanu A Mozhlivi j inshi tipi viznachennya beruchi do uvagi ne lishe filogenetichni zv yazki j apomorfiyi organizmiv ale j te chi isnuyut sporidneni organizmi U nastupnij tablici navedeno prikladi filogenetichnih viznachen klad yaki takozh mayut rangi v tradicijnij nomenklaturi Nazva Rang Tip Mozhlive filogenetichne viznachennyaTyrannosauridae Rodina Tiranozavr Osborn 1905 rik Najmensh vklyuchna klada sho mistit Tyrannosaurus rex Osborn 1905 Gorgosaurus libratus Lambe 1914 i Albertosaurus sarcophagus Osborn 1905Ssavci Klas N A Klada sho pohodit vid ostannogo spilnogo predka lyudini Homo sapiens Linnaeus 1758 i kachkodzobiv Ornithorhynchus anatinus Shaw 1799Grizuni Ryad N A Najbilsh inklyuzivna klada sho mistit Mus musculus Linnaeus 1758 ale Sylvilagus floridanus Allen 1890Neorniti Suchasni ptahi Pidklas N A Klada sho pohodit vid ostannogo spilnogo predka isnuyuchih chleniv najbilshoyi kladi yaka mistit domashnogo gorobcya Passer domesticus Linnaeus 1758 ale ne dinozavra Stegosaurus armatus Marsh 1887Tetrapodi Nadklas N A Klada sho pohodit vid najdavnishogo predka vid yakogo Homo sapiens Linnaeus 1758 uspadkuvav kincivki z palcyami ruk abo nigIstoriyaPhyloCode vinik na seminari v Garvardskomu universiteti v serpni 1998 roku de prijmalisya rishennya shodo jogo masshtabiv i zmistu Bagato uchasnikiv seminaru razom iz kilkoma inshimi lyudmi yaki zgodom priyednalisya do proyektu sluzhili konsultativnoyu grupoyu U kvitni 2000 roku chernetku bulo oprilyudneno v Interneti i naukove spivtovaristvo zaprosilo komentari U lipni 2002 roku v Yelskomu universiteti vidbuvsya drugij seminar na yakomu buli vneseni deyaki zmini v pravila ta rekomendaciyi PhyloCode Chas vid chasu takozh vnosilisya inshi zmini U Pershij mizhnarodnij zustrichi z filogenetichnoyi nomenklaturi yaka prohodila z 6 po 9 lipnya 2004 roku v Parizhi Franciya vzyali uchast blizko 70 sistematichnih ta evolyucijnih biologiv z 11 krayin Ce bula persha vidkrita bagatodenna konferenciya yaka povnistyu zoseredzhuvalasya na filogenetichnij nomenklaturi i vona stala miscem dlya urochistogo vidkrittya novoyi asociaciyi ISPN Chleni ISPN obirayut CPN yakij vzyav na sebe rol konsultativnoyi grupi yaka sposterigala za poperednimi etapami rozrobki PhyloCode Z 28 chervnya po 2 lipnya 2006 roku v Yelskomu universiteti Nyu Gejven Konnektikut SShA vidbulasya Druga mizhnarodna filogenetichna nomenklaturna zustrich Z 21 po 22 lipnya 2008 roku v Universiteti Dalgauzi Galifaks Nova Shotlandiya Kanada prohodila Tretya Mizhnarodna filogenetichna nomenklaturna zustrich PhyloCode nabuv chinnosti z publikaciyeyu suprovidnogo tomu Phylonyms u 2020 roci PrimitkiInternational Society for Phylogenetic Nomenclature website Phylonames org Procitovano 7 lipnya 2010 International Code of Phylogenetic Nomenclature Version 4b Chapter II Publication Ohiou edu Procitovano 7 lipnya 2010 International Code of Phylogenetic Nomenclature Version 4b Article 13 Homonymy ohiou edu Procitovano 7 lipnya 2010 International Code of Phylogenetic Nomenclature Version 4b Article 14 Synonymy Ohiou edu Procitovano 7 lipnya 2010 International Code of Phylogenetic Nomenclature Version 4b Rule 1 1 Ohiou edu Procitovano 7 lipnya 2010 International Code of Phylogenetic Nomenclature Version 4b Article 11 Specifiers and Qualifying Clauses Ohiou edu Procitovano 7 lipnya 2010 International Code of Phylogenetic Nomenclature Version 4b Article 3 Hierarchy and Rank Ohiou edu Procitovano 7 lipnya 2010 Although note that the PhyloCode does not permit a taxon s name to change when its rank changes while the rank based codes require this for at least some names International Code of Phylogenetic Nomenclature Version 4b Article 9 General Requirements for Establishment of Clade Names Ohiou edu Procitovano 7 lipnya 2010 Laurin M P D Cantino 2004 First international phylogenetic nomenclature meeting a report Zool Scr 33 5 475 479 doi 10 1111 j 0300 3256 2004 00176 x Laurin M P D Cantino 2007 Second meeting of the International Society for Phylogenetic Nomenclature a report Zool Scr 36 109 117 doi 10 1111 j 1463 6409 2006 00268 x Laurin M Bryant H N May 2009 Third meeting of the International Society for Phylogenetic Nomenclature a report Zoologica Scripta 38 3 333 337 doi 10 1111 j 1463 6409 2008 00379 x de Queiroz K Cantino P D Gauthier J A eds 2020 Phylonyms A Companion to the PhyloCode CRC Press Boca Raton FLPosilannyaThe PhyloCode current draft International Society for Phylogenetic Nomenclature RegNum the official repository of phylogenetic clade names generated according to the rules of the PhyloCode Christine Soares What s in a Name Scientific American November 2004 What if we decide to rename every living thing on Earth Discovery Magazine 04 28 2005