Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

Планктоміцети Planctomyces brasiliensis Біологічна класифікація Домен Бактерії Bacteria Надтип Тип Планктоміцети Plancto

Планктоміцети

Планктоміцети
Планктоміцети
image
Planctomyces brasiliensis
Біологічна класифікація
Домен: Бактерії (Bacteria)
Надтип:
Тип: Планктоміцети (Planctomycetes)
Garrity and Holt 2001
Класи
  • Fukunaga et al. 2010
  • Ward 2020
  • «Ca. Jenkins and Staley 2013
  • incertae sedis
    • «Ca. Khramenkov et al. 2013
    • «Ca. Kartal et al. 2007
    • «Ca. Kuypers et al. 2003
    • «Ca. corrig. Shiratori et al. 2019
Синоніми
* «Planctomycetaeota» Oren et al. 2015
  • «Planctomycetota» Whitman et al. 2018
Посилання
image Віківиди: Planctomycetes
image EOL: 7716
image ITIS: 956119
Fossilworks: 325165

Планктоміцети (Planctomycetes) — тип водних бактерій, знайдених в зразках солоної та прісної води, також представники групи є важливими складовими ґрунтових угрупувань, детектуються в торф'яних сфагнових болотах, мешкають також в анаеробних джерелах, багатих на сполуки сірки.

Бактерії цієї групи розмножуються брунькуванням. Вони мають унікальну для бактерій будову цитоплазми і клітинної стінки, за формою яйцеподібні і мають «стеблинку» на нерепродуктивному кінці, яка допомагає їм закріплюватися на субстраті.

Дослідження представників родини становить інтерес для вивчення еволюції і екології мікроорганізмів. Наприклад, дослідження геномів представників групи дозволяє пролити світло на походження метаногенезу і метилотрофії.

Будова клітини

Унікальною особливістю будови клітиннох стінки представників цієї групи в порівнянні з більшістю бактерій є відсутність пептидоглікану, замість якого присутні глікопротеїн, що містить багато залишків глутамінової кислоти. У мембрані виявлені  — речовини, подібні до стероїдів, які зміцнюють цитоплазматичну мембрану і раніше були виявлені лише у аеробних мікроорганізмів. Ще одною унікальною особливістю є наявність оточених мембраною внутрішніх структур у цитоплазмі: пірреллюлозому або рибоплазму, яка містить рибосоми і пов'язані білки, та вільну від рибосом парафоплазму. Крім того нуклеоїд цих бактерій оточений подвійною мембраною, утворюючи аналог клітинного ядра еукаріотів.

Геном

Порівняльний аналіз нуклеотидних послідовностій 16S рРНК показав, що ця група має високий рівень гомології з трьома іншими типами — Verrucomicrobia, Chlamydiae і Lentisphaerae, утворюючи надтип. З іншого боку, унікальною особливістю геномів планктоціцетів є те, що цілий ряд істотних шляхів не організований у вигляді оперонів, що незвичайно для бактерій. Цілий ряд знайдених генів також опинилися гомологічними знайденим в еукаріотів. Один такий приклад — послідовність одного з генів Gemmata obscurioglobis, яка, як було знайдено, має істотну гомологію до alpha-V, білка, важливого для трансмембранної передачі сигналів в еукаріотів.

Життєвий цикл

Життєвий цикл представників групи аналогічний життєвим циклам циклам кількох інших мікроорганізмів з асиметричним поділом клітини, наприклад бактерій роду Caulobacter. Він залучає чергування між нерухомими та рухомими клітинами, що плавають за допомогою джгутиків. Нерухомі клітини брунькуються, утворюючи рухомі клітини, як перепливають на деяку відстань, після чого закріплюються на місці, становлячсь нерухомими і починаючи розмноження.

Філогенія

Еволюційні зв'язки в середині групи згідно з :

 
"Planctomycetes"
 

 
 

 
 
 
 
 

 
 

 
 
 
 

 
 
 

 
 

 
 
 
 
 
 
 

 
 
 

 
 
 

 
 

 
 
 
 
 
 

 
 

 
 

 
 
 
 
 
 
 

Gemmata obscuriglobus

 
 
 

 
 

 
 
 
 
 

 
 
 

 
 

 
 

 
 
 
 
 
 
 
 

 
 


Посилання

  1. Garrity GM, ((Holt JG.)) (2001). The Road Map to the Manual. У Boone DR, Castenholz RW, Garrity GM. (ред.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Т. 1 (The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria) (вид. 2nd). New York, NY: Springer-Verlag. с. 119—166.
  2. Woebken D, Teeling H, Wecker P, Dumitriu A, Kostadinov I, Delong EF, Amann R, Glöckner FO (2007). Fosmids of novel marine Planctomycetes from the Namibian and Oregon coast upwelling systems and their cross-comparison with planctomycete genomes. ISME J. 1 (5): 419—35. PMID 18043661.
  3. Buckley DH, Huangyutitham V, Nelson TA, Rumberger A, Thies JE (2006). Diversity of Planctomycetes in soil in relation to soil history and environmental heterogeneity. Appl Environ Microbiol. 72 (7): 4522—31. PMID 16820439.
  4. Kulichevskaya I. S. ; Pankratov T. A. ; Dedysh S. N. (2006). . Microbiology. 75 (3): 329—335. Архів оригіналу за 2 січня 2009. Процитовано 18 січня 2009.
  5. Elshahed MS, Youssef NH, Luo Q, Najar FZ, Roe BA, Sisk TM, Bühring SI, Hinrichs KU, Krumholz LR (2007). Phylogenetic and metabolic diversity of Planctomycetes from anaerobic, sulfide- and sulfur-rich Zodletone Spring, Oklahoma. Appl Environ Microbiol. 73 (15): 4707—16. PMID 17545322.
  6. (PDF). Архів оригіналу (PDF) за 27 червня 2005. Процитовано 18 січня 2009. {{}}: Текст «John A. Fuerst» проігноровано ()
  7. Chistoserdova L, Jenkins C, Kalyuzhnaya MG, Marx CJ, Lapidus A, Vorholt JA, Staley JT, Lidstrom ME (2004). The enigmatic planctomycetes may hold a key to the origins of methanogenesis and methylotrophy. Mol Biol Evol. 21 (7): 1234—41. PMID 15014146.
  8. Jaap S. Sinninghe Damsté, Irene C. Rijpstra, Stefan Schouten, John A. Fuerst, Mike S. M. Jetten, and Marc Strous (2004). The occurrence of hopanoids in planctomycetes: implications for the sedimentary biomarker record. Organic Geochemistry. 35 (5): 561—566. doi:10.1016/j.orggeochem.2004.01.013.[недоступне посилання з вересня 2019]
  9. M R Lindsay, R I Webb, M Strous, M S Jetten, M K Butler, R J Forde, J A Fuerst (2001). Cell compartmentalisation in planctomycetes: novel types of structural organisation for the bacterial cell. Arch Microbiol. 175 (6): 413—29.[недоступне посилання з липня 2019]
  10. F. O. Glöckner, M. Kube, M. Bauer, H. Teeling, T. Lombardot, W. Ludwig, D. Gade, A. Beck, K. Borzym, K. Heitmann, R. Rabus, H. Schlesner, R. Amann, and R. Reinhardt (2003). Complete genome sequence of the marine planctomycete Pirellula sp. strain 1. PNAS. 100 (14): 8298—8303.
  11. Fuerst JA (2005). Intracellular compartmentation in planctomycetes. Annu Rev Microbiol. 59: 299—328. PMID 15910279.
  12. Wagner M, Horn M (2006). The Planctomycetes, Verrucomicrobia, Chlamydiae and sister phyla comprise a superphylum with biotechnological and medical relevance. Curr Opin Biotechnol. 17 (3): 241—9. PMID 16704931.
  13. Cheryl Jenkins, Vishram Kedar, and John A. Fuerst (2002). «Gene discovery within the planctomycete division of the domain Bacteria». Genome Biology 3 (6): research0031.1-0031.11
  14. (PDF). . Архів оригіналу (PDF) за 7 червня 2019. Процитовано 20 березня 2016.

Див. також

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

Planktomiceti Planctomyces brasiliensis Biologichna klasifikaciya Domen Bakteriyi Bacteria Nadtip Tip Planktomiceti Planctomycetes Garrity and Holt 2001 Klasi Fukunaga et al 2010 Ward 2020 Ca Jenkins and Staley 2013 incertae sedis Ca Khramenkov et al 2013 Ca Kartal et al 2007 Ca Kuypers et al 2003 Ca corrig Shiratori et al 2019 Sinonimi Planctomycetaeota Oren et al 2015 Planctomycetota Whitman et al 2018 Posilannya Vikividi Planctomycetes EOL 7716 ITIS 956119 Fossilworks 325165 Planktomiceti Planctomycetes tip vodnih bakterij znajdenih v zrazkah solonoyi ta prisnoyi vodi takozh predstavniki grupi ye vazhlivimi skladovimi gruntovih ugrupuvan detektuyutsya v torf yanih sfagnovih bolotah meshkayut takozh v anaerobnih dzherelah bagatih na spoluki sirki Bakteriyi ciyeyi grupi rozmnozhuyutsya brunkuvannyam Voni mayut unikalnu dlya bakterij budovu citoplazmi i klitinnoyi stinki za formoyu yajcepodibni i mayut steblinku na nereproduktivnomu kinci yaka dopomagaye yim zakriplyuvatisya na substrati Doslidzhennya predstavnikiv rodini stanovit interes dlya vivchennya evolyuciyi i ekologiyi mikroorganizmiv Napriklad doslidzhennya genomiv predstavnikiv grupi dozvolyaye proliti svitlo na pohodzhennya metanogenezu i metilotrofiyi Budova klitiniUnikalnoyu osoblivistyu budovi klitinnoh stinki predstavnikiv ciyeyi grupi v porivnyanni z bilshistyu bakterij ye vidsutnist peptidoglikanu zamist yakogo prisutni glikoproteyin sho mistit bagato zalishkiv glutaminovoyi kisloti U membrani viyavleni rechovini podibni do steroyidiv yaki zmicnyuyut citoplazmatichnu membranu i ranishe buli viyavleni lishe u aerobnih mikroorganizmiv She odnoyu unikalnoyu osoblivistyu ye nayavnist otochenih membranoyu vnutrishnih struktur u citoplazmi pirrellyulozomu abo riboplazmu yaka mistit ribosomi i pov yazani bilki ta vilnu vid ribosom parafoplazmu Krim togo nukleoyid cih bakterij otochenij podvijnoyu membranoyu utvoryuyuchi analog klitinnogo yadra eukariotiv GenomPorivnyalnij analiz nukleotidnih poslidovnostij 16S rRNK pokazav sho cya grupa maye visokij riven gomologiyi z troma inshimi tipami Verrucomicrobia Chlamydiae i Lentisphaerae utvoryuyuchi nadtip Z inshogo boku unikalnoyu osoblivistyu genomiv planktocicetiv ye te sho cilij ryad istotnih shlyahiv ne organizovanij u viglyadi operoniv sho nezvichajno dlya bakterij Cilij ryad znajdenih geniv takozh opinilisya gomologichnimi znajdenim v eukariotiv Odin takij priklad poslidovnist odnogo z geniv Gemmata obscurioglobis yaka yak bulo znajdeno maye istotnu gomologiyu do alpha V bilka vazhlivogo dlya transmembrannoyi peredachi signaliv v eukariotiv Zhittyevij ciklZhittyevij cikl predstavnikiv grupi analogichnij zhittyevim ciklam ciklam kilkoh inshih mikroorganizmiv z asimetrichnim podilom klitini napriklad bakterij rodu Caulobacter Vin zaluchaye cherguvannya mizh neruhomimi ta ruhomimi klitinami sho plavayut za dopomogoyu dzhgutikiv Neruhomi klitini brunkuyutsya utvoryuyuchi ruhomi klitini yak pereplivayut na deyaku vidstan pislya chogo zakriplyuyutsya na misci stanovlyachs neruhomimi i pochinayuchi rozmnozhennya FilogeniyaEvolyucijni zv yazki v seredini grupi zgidno z Planctomycetes Gemmata obscuriglobus PosilannyaGarrity GM Holt JG 2001 The Road Map to the Manual U Boone DR Castenholz RW Garrity GM red Bergey s Manual of Systematic Bacteriology T 1 The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria vid 2nd New York NY Springer Verlag s 119 166 Woebken D Teeling H Wecker P Dumitriu A Kostadinov I Delong EF Amann R Glockner FO 2007 Fosmids of novel marine Planctomycetes from the Namibian and Oregon coast upwelling systems and their cross comparison with planctomycete genomes ISME J 1 5 419 35 PMID 18043661 Buckley DH Huangyutitham V Nelson TA Rumberger A Thies JE 2006 Diversity of Planctomycetes in soil in relation to soil history and environmental heterogeneity Appl Environ Microbiol 72 7 4522 31 PMID 16820439 Kulichevskaya I S Pankratov T A Dedysh S N 2006 Microbiology 75 3 329 335 Arhiv originalu za 2 sichnya 2009 Procitovano 18 sichnya 2009 Elshahed MS Youssef NH Luo Q Najar FZ Roe BA Sisk TM Buhring SI Hinrichs KU Krumholz LR 2007 Phylogenetic and metabolic diversity of Planctomycetes from anaerobic sulfide and sulfur rich Zodletone Spring Oklahoma Appl Environ Microbiol 73 15 4707 16 PMID 17545322 PDF Arhiv originalu PDF za 27 chervnya 2005 Procitovano 18 sichnya 2009 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite web title Shablon Cite web cite web a Tekst John A Fuerst proignorovano dovidka Chistoserdova L Jenkins C Kalyuzhnaya MG Marx CJ Lapidus A Vorholt JA Staley JT Lidstrom ME 2004 The enigmatic planctomycetes may hold a key to the origins of methanogenesis and methylotrophy Mol Biol Evol 21 7 1234 41 PMID 15014146 Jaap S Sinninghe Damste Irene C Rijpstra Stefan Schouten John A Fuerst Mike S M Jetten and Marc Strous 2004 The occurrence of hopanoids in planctomycetes implications for the sedimentary biomarker record Organic Geochemistry 35 5 561 566 doi 10 1016 j orggeochem 2004 01 013 nedostupne posilannya z veresnya 2019 M R Lindsay R I Webb M Strous M S Jetten M K Butler R J Forde J A Fuerst 2001 Cell compartmentalisation in planctomycetes novel types of structural organisation for the bacterial cell Arch Microbiol 175 6 413 29 nedostupne posilannya z lipnya 2019 F O Glockner M Kube M Bauer H Teeling T Lombardot W Ludwig D Gade A Beck K Borzym K Heitmann R Rabus H Schlesner R Amann and R Reinhardt 2003 Complete genome sequence of the marine planctomycete Pirellula sp strain 1 PNAS 100 14 8298 8303 Fuerst JA 2005 Intracellular compartmentation in planctomycetes Annu Rev Microbiol 59 299 328 PMID 15910279 Wagner M Horn M 2006 The Planctomycetes Verrucomicrobia Chlamydiae and sister phyla comprise a superphylum with biotechnological and medical relevance Curr Opin Biotechnol 17 3 241 9 PMID 16704931 Cheryl Jenkins Vishram Kedar and John A Fuerst 2002 Gene discovery within the planctomycete division of the domain Bacteria Genome Biology 3 6 research0031 1 0031 11 PDF Arhiv originalu PDF za 7 chervnya 2019 Procitovano 20 bereznya 2016 Div takozhPoznachennya sho vikoristovuyutsya v najmenuvannyah taksoniv

Дата публікації:
Топ