Парадокс Левінталя — відомий парадокс, сформульований у 1968 році американським молекулярним біологом [en]: «проміжок часу, за який поліпептид приходить до свого скрученого стану, на багато порядків менший, ніж якби поліпептид просто перебирав всі можливі конфігурації».
Складність проблеми
Щоб вирішити цей парадокс, необхідно відповісти на питання: «Як білок вибирає свій нативний стан серед безлічі можливих?». Для ланцюга зі 100 залишків число можливих конформацій ~10100, і їх повний перебір зайняв би ~1080 років, якщо один перехід здійснювати за ~10−13 секунди. Тому складність проблеми полягає в тому, що дане питання не можна вирішити експериментально, адже доведеться чекати ~1080 років.
Причини парадоксу
Називалися такі можливі причини цього парадоксу:
- Теоретичні моделі, що використовуються для доказу твердості, не відповідають тому, що природа намагається оптимізувати.
- В ході еволюції було відібрано тільки ті білки, які легко згортаються.
- Білки можуть згортатися різними шляхами, не обов'язково дотримуючись глобально оптимального шляху.
Рішення парадоксу
Білок може згортатися не «весь раптом», а шляхом збільшення компактної глобули за рахунок послідовного прилипання до неї все нових і нових ланок білкового ланцюга. При цьому одна за одною відновлюються фінальні взаємодії (їх енергія падає приблизно пропорційно кількості ланок ланцюга), а ентропія падає також пропорційно кількості фіксованих ланок ланцюга. Падіння енергії і падіння ентропії повністю компенсують одне одного в головному (лінійному за N) члені в вільній енергії. Це виключає з оцінки часу згортання член, пропорційний 10N, і час згортання залежить від значно менших за порядком величини нелінійних членів, пов'язаних з поверхневими ентальпійними і ентропійними ефектами, пропорційними N2/3. Для білка зі 100 залишків це 101002/3 ~1021,5, що дає оцінку швидкості згортання, яка добре узгоджується з експериментальними даними.
Див. також
Ресурси Інтернету
- Парадокс Левінталя в телепередачі [ru]» (Нічний ефір), випуск № 115, ефір від 28.05.2002.
Примітки
- .ac.uk/levinthal/levinthal.html Levintha, C. (1969) How to Fold Graciously. Mossbauer Spectroscopy in Biological Systems: Proceedings of a meeting held at Allerton House, Monticello, Illinois. J. T. P. DeBrunner and E. Munck eds., University of Illinois Press Pages 22-24[недоступне посилання з липня 2019].
- Финкельштейн А. В., Птицын О. Б. Физика белка. Курс лекций с цветными и стереоскопическими иллюстрациями и задачами [1] [ 2018-09-20 у Wayback Machine.] / 4-е изд. — Москва, Книжный дом Университет, 2012. — С. 15. — 524 с.
- . Архів оригіналу за 2 жовтня 2013. Процитовано 26 січня 2019.
- Jackson S.E. Foldig & Design (1998) 3: R81-R91.
Це незавершена стаття з біохімії. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Paradoks Levintalya vidomij paradoks sformulovanij u 1968 roci amerikanskim molekulyarnim biologom en promizhok chasu za yakij polipeptid prihodit do svogo skruchenogo stanu na bagato poryadkiv menshij nizh yakbi polipeptid prosto perebirav vsi mozhlivi konfiguraciyi Skladnist problemiShob virishiti cej paradoks neobhidno vidpovisti na pitannya Yak bilok vibiraye svij nativnij stan sered bezlichi mozhlivih Dlya lancyuga zi 100 zalishkiv chislo mozhlivih konformacij 10100 i yih povnij perebir zajnyav bi 1080 rokiv yaksho odin perehid zdijsnyuvati za 10 13 sekundi Tomu skladnist problemi polyagaye v tomu sho dane pitannya ne mozhna virishiti eksperimentalno adzhe dovedetsya chekati 1080 rokiv Prichini paradoksuNazivalisya taki mozhlivi prichini cogo paradoksu Teoretichni modeli sho vikoristovuyutsya dlya dokazu tverdosti ne vidpovidayut tomu sho priroda namagayetsya optimizuvati V hodi evolyuciyi bulo vidibrano tilki ti bilki yaki legko zgortayutsya Bilki mozhut zgortatisya riznimi shlyahami ne obov yazkovo dotrimuyuchis globalno optimalnogo shlyahu Rishennya paradoksuBilok mozhe zgortatisya ne ves raptom a shlyahom zbilshennya kompaktnoyi globuli za rahunok poslidovnogo prilipannya do neyi vse novih i novih lanok bilkovogo lancyuga Pri comu odna za odnoyu vidnovlyuyutsya finalni vzayemodiyi yih energiya E displaystyle E padaye priblizno proporcijno kilkosti lanok lancyuga a entropiya S displaystyle S padaye takozh proporcijno kilkosti fiksovanih lanok lancyuga Padinnya energiyi i padinnya entropiyi povnistyu kompensuyut odne odnogo v golovnomu linijnomu za N chleni v vilnij energiyi Ce viklyuchaye z ocinki chasu zgortannya chlen proporcijnij 10N i chas zgortannya zalezhit vid znachno menshih za poryadkom velichini nelinijnih chleniv pov yazanih z poverhnevimi entalpijnimi i entropijnimi efektami proporcijnimi N2 3 Dlya bilka zi 100 zalishkiv ce 101002 3 1021 5 sho daye ocinku shvidkosti zgortannya yaka dobre uzgodzhuyetsya z eksperimentalnimi danimi Div takozhBilki Zgortannya bilkiv Folding homeResursi InternetuParadoks Levintalya v teleperedachi ru Nichnij efir vipusk 115 efir vid 28 05 2002 Primitki ac uk levinthal levinthal html Levintha C 1969 How to Fold Graciously Mossbauer Spectroscopy in Biological Systems Proceedings of a meeting held at Allerton House Monticello Illinois J T P DeBrunner and E Munck eds University of Illinois Press Pages 22 24 nedostupne posilannya z lipnya 2019 Finkelshtejn A V Pticyn O B Fizika belka Kurs lekcij s cvetnymi i stereoskopicheskimi illyustraciyami i zadachami 1 2018 09 20 u Wayback Machine 4 e izd Moskva Knizhnyj dom Universitet 2012 S 15 524 s Arhiv originalu za 2 zhovtnya 2013 Procitovano 26 sichnya 2019 Jackson S E Foldig amp Design 1998 3 R81 R91 Ce nezavershena stattya z biohimiyi Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi