У вивченні складних мереж, кажуть, що мережа має структуру спільноти, якщо вузли мережі можна легко згрупувати в такі множини (які можливо мають перетин), що кожний набір вузлів щільно пов'язаний між собою всередині. У випадку коли множини розбиття вузлів, не перетинаються, кажуть, що мережа природно ділиться на групи із щільними внутрішніми та слабкими зовнішніми зв'язками. Проте перетин спільнот також є допустимим. Більш загальне означення базується на такому принципі: пара вузлів ймовірніше має зв'язок, якщо дані вузли є членами однієї спільноти, і менш імовірно, що пара вузлів пов'язана, якщо вони не входять до однієї спільноти. Пов'язаною задачею, але трохи відмінною від даної, є [en], до якої належить певна вершина.
Властивості
У дослідженні мереж, таких, як комп'ютерні та інформаційні мережі, соціальні та біологічні мережі, виявлено велику кількість різних характеристик, включаючи з поміж інших характеристику тісного світу, безмасштабності мережі та кластеризацію. Іншою спільною характеристикою є структура спільности. У контексті мереж, структура спільности посилається на те, що виникнення груп вузлів у мережі є характерним для щільно зусереджених внутрішніх зв'язків спільноти та слабо розгалужених — зовнішніх. Така неоднорідність опису мережі говорить про те, що в мережі існує певна природна класифікація.
Спільноти часто визначаються в термінах розділення на множини вершин, тобто кожен вузол належить виключно до однієї спільноти, як на схемі. Це корисне спрощення, і більшість методів по знаходженню спільнот використовують даний підхід. У той час як, в деяких випадках, кращим представленням мережі є таким чиином, щоб вершини належали більше ніж одній спільноті. Такий випадок зустрічається, наприклад, у соціальних мережах, де кожна вершина являє собою людину, а спільноти — різні групи друзів: одна спільнота — родина, інша — співробітники, ще інша — друзі із спорт-клуба і т. д. Використання кліків для визначення спільнот, що обговорено нижче, — це лише один приклад того, як можна знайти перетинні множини.
Деякі мережі можуть не мати суттєвої структури спільноти. Багато основних мережевих моделей, наприклад, випадкові графи та модельБарабаші — Альберт не мають структури спільноти.
Актуальність
Структура спільнот — досить поширена у справжніх мережах. Соціальні мережі включають спільні групи (походження терміну, фактично), основою яких є спільні інтереси, місця, професії, і т. д.
Із ряду причин, важливим є пошук основної спільноти в структурі мережі, якщо, звісно, така існує. Спільноти дозволяють нам створювати масштабну карту мережі, оскільки окремі структури ведуть себе як мета-вузли (англ. meta-nodes) у мережі, що полегшує її вивчення.
Окремі спільноти також висвітлюють роботу системи, оскільки спільноти часто відповідають її функціональними часточками. У метаболічних мережах, таким функціональним групам відповідають цикли або шляхи, у той час як, в мережі із взаємодією з білками, спільнотам, відповідають білки із схожим функціоналом всередині біологічної клітини. Аналогічно, мережі цитат утворюють спільноту за темою дослідження. Можливість ідентифікувати ці структури всередині мережі може надати уявлення того, як мережева функція й топологія впливають один на одного. Таке розуміння може бути корисним для вдосконалення деяких алгоритмів для графів, таких як спектральна кластеризація.
Вагомою причиною того, що спільноти важливі є те, що часто дуже відмінні властивості від усереднених по мережі, мають спільноти, розглядаючи їх окремо одна від одної. Таким чином, лише виділення усереднених властивостей втрачає багато важливих і цікавих функцій у середині самої системи. Наприклад, у випадку соціальних мереж, одночасно можуть існувати дві групи: компанійські та мовчазні.
Існування спільнот також зазвичай впливає на різні процеси, такі як розповсюдження чуток або розповсюдження епідемії в мережі. Тому для правильного розуміння таких процесів важливо виявити спільноти, а також вивчати, як вони впливають на процеси поширення в різних умовах.
Нарешті, важливим застосуванням, що виявило спільноту в мережевій науці, є прогноз відсутніх зв'язків та виявлення помилкових зв'язків у мережі. Під час вимірювання, деякі зв'язки можуть не спостерігаються з ряду причин. Точно так само, деякі зв'язки можуть помилково надавати дані через помилки при вимірюванні. З обома випадками успішно справляється алгоритм виявлення спільноти, оскільки це дозволяє визначити ймовірність існування ребра між даною парою вузлів.
Алгоритми по знаходженню спільнот
Пошук спільнот у довільній мережі може бути обчислювально складним завданням. Кількість спільнот, якщо така існує, в мережі, як правило, невідома, і в спільнотах часто існує неоднорідний розмір та/або щільність. Проте, незважаючи на ці труднощі, розроблено та застосовано кілька методів пошуку спільнот із різною точністю
Метод найменшого розрізу
Одним із найдавніших алгоритмів розподілу мереж на частини є (і варіанти, такі як коефіцієнт розрізу та нормований розріз). Застосування даного методу можна побачити, наприклад, в балансуванні навантаження для паралельних обчислень, з метою мінімізації зв'язків між процесорними вузлами.
У методі мінімального розрізу мережа ділиться на заздалегідь визначену кількість частин, як правило, приблизно такого ж розміру, які вибираються таким чином, щоб мінімізувати кількість ребер між групами. Цей метод добре працює в багатьох прикладних задачах, для яких він спочатку був призначений, але менш ідеально підходить для пошуку структури спільноти в загальних мережах, оскільки він знайде спільноти незалежно від того, чи вони неявні, чи ні в структурі, а знайде лише фіксоване число їх.
Ієрархічна кластеризація
Інший спосіб пошуку структур спільноти в мережах — це ієрархічна кластеризація. У даному методі визначається міра подібності, яка кількісно визначає деякий (зазвичай топологічний) тип подібності між парами вузлів. Найбльш вживані міри це косинус подібності, коефіцієнт Джакарда та відстань Хеммінга для матриці суміжності. Тоді група подібних вузлів об'єднується відповідно до цієї міри. Існує декілька загальних схем для здійснення групування, дві найпростіші — кластеризація з одним зв'язком, у якій дві групи вважаються окремими спільнотами тоді і тільки тоді, коли всі пари вузлів у різних групах мають схожість нижче заданого порогу, і повна кластеризація зв'язків, у якій всі вузли всередині кожної групи мають подібність більшу, ніж порогові. Новий підхід у цьому напрямку полягає у застосуванні різних мір схожості або невідповідності, об'єднаних за допомогою опуклих сум, що значно покращило ефективність даної методики
Алгоритм Гірван — Ньюмана
Іншим широко вживаним алгоритмом для пошуку спільнот є алгоритм Гірвана-Ньюмана. Цей алгоритм ідентифікує ребра в мережі, що лежать між спільнотами, а потім їх видаляє, залишивши лише самі спільноти. Ідентифікація виконується за допомогою централізованості гранично-теоретичної міри, яка присвоює номер кожному ребру, якщо край лежить «між» багатьма парами вузлів.
Алгоритм Гірвана-Ньюмана повертає результати прийнятної якості і популярний, оскільки він був реалізований у ряді стандартних програмних пакетів. Але він також працює повільно, витрачаючи O(m2n) часу на мережу з n вершин і m-ребер, що робить це недоцільним для мереж з більш ніж кількома тисячами вузлів.
Максимізація модульності
Незважаючи на свої відомі недоліки, одним з найпоширеніших методів виявлення спільнот є максимізація модульності (англ. modularity maximization). Модульність — це функція вигоди, яка вимірює якість певного поділу мережі на спільноти. Метод максимізації модульності виявляє спільноти шляхом пошуку можливого поділу мережі на одну або декілька спільнот, що мають особливо високу модульність. Оскільки вичерпний пошук над усіма можливими підрозділами, як правило, неможливий, практичні алгоритми базуються на наближених методах оптимізації, таких як жадібні алгоритми, алгоритм імітації відпалу або спектральна оптимізація, з різними підходами, що пропонують різні баланси між швидкістю та точністю.. Найпопулярніший підхід до максимізації модульності — це , який ітеративно оптимізує локальні спільноти, доки не може бути вдосконалена глобальна модульність, з урахуванням збурення поточної спільноти. Нині найкращий алгоритм максимізації модульності (переможець 10-го змагання з реалізації Центру дискретної математики та теоретичної обчислювальної техніки, англ. the 10th DIMACS Implementation Challenge) — це ітеративний ансамблевий алгоритм.
Корисність оптимізації модульності є сумнівною, оскільки було показано, що оптимізація модульності часто не дозволяє виявляти кластери менші, ніж певна шкала, залежно від розміру мережі (межа точності); з іншого боку, множина значень модульності характеризується величезною виродженістю частин із високою модулярністю, близькими до абсолютного максимуму, які можуть дуже відрізнятися один від одного.
Статистичний висновок
Методи, засновані на статистичному висновуванні намагаються підібрати породжувальну модель для даних мережі. Загальна перевага цього підходу, у порівнянні з альтернативами, — це її більш принциповий характер і здатність по своїй суті розглядати питання статистичної значущості. Більшість методів у літературі базуються на основі , а також є варіанти, що включають змішане членство, корегування розмірності, й ієрархічну структурність. Обрати модель можна, використовуючи в якості головного наближення таке, що має мінімальну довжину опису (або еквівалентно, коефіцієнт Байєса) та перевіркою відношення максимальної правдоподібності. Наразі існує багато алгоритмів для ефективного виведення випадкових блокових моделей, включаючи та агломераційний Монте Карло.
На відміну від підходів, які намагаються скомпонувати мережу з об'єктивною функцією, цей клас методів ґрунтується на генеративних моделях, які не тільки служать описом великомасштабної структури мережі, але також можуть бути використані для узагальнення даних і прогнозування появи пропущених або хибних зв'язків у мережі.
Методи на основі кліки
Кліка — це підграф, у якому кожен вузол пов'язаний з кожним іншим вузлом кліки. Оскільки вузли не можуть бути більш тісно пов'язаними, ніж в описаному випадку, не дивно, що існує багато підходів до виявлення спільнот у мережах, заснованих на виявленні кліків у графі та аналізі того, як вони збігаються. Варто зауважити, що оскільки вузол може бути членом більш ніж однієї кліки, то вузол може бути членом декількох спільнот, за даним методом, останнє висвітлює структуру спільнот, що перетинаються.
Один з методів — знайти максимальні кліки, тобто знайти кліки, які не є підграфом будь-якої іншої кліки. Класичним алгоритмом їх пошуку є алгоритм Брона-Кербоша. Перетин може використовуватися для визначення спільнот кількома способами. Найпростіше розглянути лише максимальні кліки, більші за мінімальний розмір (кількість вузлів). Об'єднання цих кліків потім визначає підграф, чиї компоненти (роз'єднані частини) визначають спільноти. Такі підходи часто застосовуються у програмному забезпеченні аналізу соціальних мереж, таких як UCInet.
Альтернативний підхід до використання кліків фіксованого розміру, . Перетин може бути використаний для визначення типу -регулярного гіперграфу або структури, яка є узагальненням лінійного графу (випадку, коли ) відомою як граф кліки (англ. Clique graph). Графи клік мають вершини, які представляють кліки у початковому графі, а ребра графу кліки враховують накладання кліки у початковому графі. Застосовуючи будь-який з попередніх методів виявлення спільноти (які присвоюють кожному вузлу спільноту) до графу кліки, отримаємо, що кожній кліці буде присвоєно спільноту. Це можна використати для визначення членства спільноти в вузлах кліки. Знову ж таки, оскільки вузол може бути в декількох кліках, то він може бути членом кількох спільнот. Наприклад, метод фільтрування кліки визначає спільноти як фільтрування кластерів k-клік. Для цього він знаходить всі k-кліки в мережі, тобто всі повні підграфи. Потім він визначає, що два k-кліка — сусідні, якщо вони поділяють вузол, тобто це використовується для визначення ребер у крафі кліка. Тоді спільнота визначається як максимальна сукупність -клік у яких можна досягти -кліку із будь-якої іншої -кліки через -клік сусідніх. Тобто спільноти — це лише пов'язані компоненти в графі кліка. Оскільки вузол може одночасно належать до кількох різних кластерів -кліки, то спільноти можуть перетинатися.
Тестування методів пошуку алгоритмів спільнот
Оцінка алгоритмів, для виявлення структур спільноти, все ще залишається відкритим питанням. Очевидно, що повинна базуватися на аналізі мереж відомих структур. Типовим прикладом є тест «чотири групи», в якому мережа поділяється на чотири групи однаково великих розмірів (зазвичай по 32 вузла кожна), а ймовірність зв'язку в межах та між групами змінюється, щоб створювати більш-менш складні структури для виявлення алгоритмів. Такі тестові графи — це особливий випадок висадженої моделі l-поділу (англ. planted l-partition model) Анни Кондон та Річарда Карпа, або більш загального випадку «стохастичних блокових моделей», загального класу моделей випадкових мереж, що містить структуру спільноти. Були запропоновані інші більш гнучкі орієнтири, що дозволяють використовувати різні групи розмірів та нетривіальні розподіли ступенів, такі як тест LFR benchmark, запропонований Ланченетті, що є розширенням чотирьох груп тестів, і включає гетерогенні розподіли ступеня вузла та розміру спільноти, що робить його більш сильним тестом методів виявлення спільнот. Важливим є питання, поставлене Касимом Пастом і Фаразом Заіді в їх роботі щодо визначення алгоритмів виявлення спільнот на еталонних моделях на основі динаміки еволюції замість моделей конфігурації.
Найбільш поширені комп'ютерні тести починаються з мережі чітко визначених спільнот. Тоді ця структура деградується шляхом перекручування або видалення посилань, і для алгоритмів стає все важчим і важчим визначення початкового розподілу. Врешті, мережа досягає точки, де вона, по суті, є випадковою. Цей тип тесту можна назвати «відкритим». Продуктивність таких тестів оцінюється нормалізованою взаємною інформацією або варіацією інформації. Вони порівнюють результати, отримані алгоритмом з оригінальною структурою спільноти, оцінюючи подібність обох розділів.
Виявлення
Протягом останніх років досить неочікуваний результат був отриманий різними групами, який показує фазовий перехід у проблемі виявлення спільнот: щільність зв'язків усередині спільнот та між спільнотами стає все більш рівномірною або меншою (еквівалентно, оскільки структура спільноти стає занадто слабкою або мережа стає надто рідкою), несподівано спільноти стають невизначеними. У певному сенсі, самі спільноти все ще існують, оскільки наявність і відсутність зв'язків все ще співвідносяться з членством спільноти та їх крайніх точок; але тоді стає інформаційно -теоретично неможливим позначати вузли краще, ніж за допомогою ймовірності, або навіть відрізнити граф від створеного нульовою моделлю, такою як без структури спільноти. Цей перехід не залежить від типу алгоритму, який використовується для виявлення спільнот, тобто існує фундаментальна межа нашої здатності виявляти спільноти в мережах навіть за оптимального байєсівського висновку (тобто незалежно від наших обчислювальних ресурсів).
Розглянемо стохастичниу блокову модель, що має всього вузлів, gгрупи однакового розміру, і нехай та — ймовірності зв'язку в групах та за межами спільнот відповідно. Якщо , ця мережа матиме структуру спільноти, оскільки щільність зв'язку всередині груп буде більше, ніж щільність зв'язків між групами. Рідко, та співвідносяться як так що середній ступінь є сталою:
Тоді стає неможливим виявити спільноти якщо:
Див. також
Посилання
- M. Girvan; M. E. J. Newman (2002). Community structure in social and biological networks. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (12): 7821—7826. doi:10.1073/pnas.122653799. PMC 122977. PMID 12060727.
- S. Fortunato (2010). Community detection in graphs. Phys. Rep. 486 (3–5): 75—174. doi:10.1016/j.physrep.2009.11.002.
- F. D. Malliaros; M. Vazirgiannis (2013). Clustering and community detection in directed networks: A survey. Phys. Rep. 533 (4): 95—142. doi:10.1016/j.physrep.2013.08.002.
- M. A. Porter; J.-P. Onnela; P. J. Mucha (2009). (PDF). Notices of the American Mathematical Society. 56: 1082—1097, 1164—1166. Архів оригіналу (PDF) за 2 травня 2018. Процитовано 13 січня 2018.
- Fani, Hossein; Bagheri, Ebrahim (2017). . Encyclopedia with Semantic Computing and Robotic Intelligence. Т. 1. с. 1630001 [8]. doi:10.1142/S2425038416300019. Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 13 січня 2018.
- Hamdaqa, Mohammad; Tahvildari, Ladan; LaChapelle, Neil; Campbell, Brian (2014). . Science of Computer Programming. 95: 44—72. doi:10.1016/j.scico.2014.01.006. Архів оригіналу за 6 листопада 2018. Процитовано 13 січня 2018.
- M.E.J.Neman. Finding community structure in networks using the eigenvectors of matrices. Phys. Rev. E. 74 (3): 1—19. doi:10.1103/PhysRevE.74.036104.
- Zare, Habil; P. Shooshtari; A. Gupta; R. Brinkman (2010). . BMC Bioinformatics. 11 (1): 403. doi:10.1186/1471-2105-11-403. PMC 2923634. PMID 20667133. Архів оригіналу за 2 листопада 2015. Процитовано 13 січня 2018.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом () - Aaron Clauset; Cristopher Moore; M.E.J. Newman. Hierarchical structure and the prediction of missing links in networks. Nature. 453 (7191): 98—101. doi:10.1038/nature06830. PMID 18451861.
- M. E. J. Newman (2004). Detecting community structure in networks. Eur. Phys. J. B. 38 (2): 321—330. doi:10.1140/epjb/e2004-00124-y.
- M. E. J. Newman (2004). Fast algorithm for detecting community structure in networks. Phys. Rev. E. 69 (6): 066133. doi:10.1103/PhysRevE.69.066133.
- L. Danon; J. Duch; A. Díaz-Guilera; A. Arenas (2005). Comparing community structure identification. J. Stat. Mech. 2005 (09): P09008. doi:10.1088/1742-5468/2005/09/P09008.
- R. Guimera; L. A. N. Amaral (2004). Functional cartography of complex metabolic networks. Nature. 433 (7028): 895—900. doi:10.1038/nature03288. PMC 2175124. PMID 15729348.
- V.D. Blondel; J.-L. Guillaume; R. Lambiotte; E. Lefebvre (2008). Fast unfolding of community hierarchies in large networks. J. Stat. Mech. 2008 (10): P10008. doi:10.1088/1742-5468/2008/10/P10008.
- (PDF). 2013. Архів оригіналу (PDF) за 27 січня 2018. Процитовано 13 січня 2018.
- Michael Ovelgönne; Andreas Geyer-Schulz (2013). An ensemble learning strategy for graph clustering. Graph Partitioning and Graph Clustering. Contemporary Mathematics. American Mathematical Society. 588: 187—206. doi:10.1090/conm/588.
- S. Fortunato; M. Barthelemy (2007). Resolution limit in community detection. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 104 (1): 36—41. doi:10.1073/pnas.0605965104. PMC 1765466. PMID 17190818.
- B. H. Good; Y.-A. de Montjoye; A. Clauset (2010). The performance of modularity maximization in practical contexts. Phys. Rev. E. 81 (4): 046106. doi:10.1103/PhysRevE.81.046106.
- Holland, Paul W.; Kathryn Blackmond Laskey; Samuel Leinhardt (June 1983). . Social Networks. 5 (2): 109—137. doi:10.1016/0378-8733(83)90021-7. ISSN 0378-8733. Архів оригіналу за 7 листопада 2018. Процитовано 26 серпня 2011.
- Airoldi, Edoardo M.; David M. Blei; Stephen E. Fienberg; Eric P. Xing (June 2008). . J. Mach. Learn. Res. 9: 1981—2014. ISSN 1532-4435. Архів оригіналу за 21 листопада 2018. Процитовано 9 жовтня 2013.
- Ball, Brian; Brian Karrer; M. E. J. Newman (2011). Efficient and principled method for detecting communities in networks. Physical Review E. 84 (3): 036103. doi:10.1103/PhysRevE.84.036103. Процитовано 8 грудня 2011.
- Karrer, Brian; M. E. J. Newman (21 січня 2011). Stochastic blockmodels and community structure in networks. Physical Review E. 83 (1): 016107. doi:10.1103/PhysRevE.83.016107. Процитовано 8 листопада 2011.
- Peixoto, Tiago P. (24 березня 2014). Hierarchical Block Structures and High-Resolution Model Selection in Large Networks. Physical Review X. 4 (1): 011047. doi:10.1103/PhysRevX.4.011047. Процитовано 24 квітня 2014.
- Martin Rosvall; Carl T. Bergstrom (2007). An information-theoretic framework for resolving community structure in complex networks. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 104 (18): 7327—7331. doi:10.1073/pnas.0611034104. PMC 1855072. PMID 17452639.
- P. Peixoto, T. (2013). . Phys. Rev. Lett. 110: 148701. Bibcode:2013PhRvL.110n8701P. doi:10.1103/PhysRevLett.110.148701. Архів оригіналу за 6 травня 2020.
- P. Peixoto, T. (2017). Bayesian stochastic blockmodeling. arXiv:1705.10225.
- Yan, Xiaoran; Jacob E. Jensen; Florent Krzakala; Cristopher Moore; Cosma Rohilla Shalizi; Lenka Zdeborova; Pan Zhang; Yaojia Zhu (17 липня 2012). Model Selection for Degree-corrected Block Models. Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. 2014: P05007. arXiv:1207.3994. doi:10.1088/1742-5468/2014/05/P05007.
- Gopalan, Prem K.; David M. Blei (3 вересня 2013). . Proceedings of the National Academy of Sciences. 110 (36): 14534—14539. doi:10.1073/pnas.1221839110. ISSN 0027-8424. PMC 3767539. PMID 23950224. Архів оригіналу за 27 травня 2020. Процитовано 9 жовтня 2013.
- Decelle, Aurelien; Florent Krzakala; Cristopher Moore; Lenka Zdeborová (12 грудня 2011). Asymptotic analysis of the stochastic block model for modular networks and its algorithmic applications. Physical Review E. 84 (6): 066106. doi:10.1103/PhysRevE.84.066106. Процитовано 16 січня 2012.
- Peixoto, Tiago P. (13 січня 2014). Efficient Monte Carlo and greedy heuristic for the inference of stochastic block models. Physical Review E. 89 (1): 012804. doi:10.1103/PhysRevE.89.012804. Процитовано 21 січня 2014.
- Guimerà, Roger; Marta Sales-Pardo (29 грудня 2009). . Proceedings of the National Academy of Sciences. 106 (52): 22073—22078. doi:10.1073/pnas.0908366106. PMC 2799723. PMID 20018705. Архів оригіналу за 21 лютого 2019. Процитовано 9 листопада 2011.
- Clauset, Aaron; Cristopher Moore; M. E. J. Newman (1 травня 2008). Hierarchical structure and the prediction of missing links in networks. Nature. 453 (7191): 98—101. doi:10.1038/nature06830. ISSN 0028-0836. PMID 18451861.
- M.G. Everett; S.P. Borgatti (1998). Analyzing Clique Overlap Connections. Connections. 21: 49.
- T.S. Evans (2010). Clique Graphs and Overlapping Communities. J. Stat. Mech. 2010 (12): P12037. arXiv:1009.0638. doi:10.1088/1742-5468/2010/12/P12037.
- G. Palla; I. Derényi; I. Farkas; T. Vicsek (2005). Uncovering the overlapping community structure of complex networks in nature and society. Nature. 435 (7043): 814—818. doi:10.1038/nature03607. PMID 15944704.
- ; (2001). Algorithms for graph partitioning on the planted partition model. Random Struct. Algor. 18 (2): 116—140. doi:10.1002/1098-2418(200103)18:2<116::AID-RSA1001>3.0.CO;2-2.
- A. Lancichinetti; S. Fortunato; F. Radicchi (2008). Benchmark graphs for testing community detection algorithms. Phys. Rev. E. 78 (4): 046110. doi:10.1103/PhysRevE.78.046110.
- M. Q. Pasta; F. Zaidi (2017). Leveraging Evolution Dynamics to Generate Benchmark Complex Networks with Community Structures. arXiv:1606.01169 [cs.SI].
- Reichardt, J.; Leone, M. (2008). (Un)detectable Cluster Structure in Sparse Networks. Phys. Rev. Lett. 101 (078701): 1—4. Bibcode:2008PhRvL.101g8701R. doi:10.1103/PhysRevLett.101.078701.
- Decelle, A.; Krzakala, F.; Moore, C.; Zdeborova, L. (2011). Inference and Phase Transitions in the Detection of Modules in Sparse Networks. Phys. Rev. Lett. 107 (065701): 1—5. Bibcode:2011PhRvL.107f5701D. doi:10.1103/PhysRevLett.107.065701.
- Nadakuditi, R.R; (2012). Graph Spectra and the Detectability of Community Structure in Networks. Phys. Rev. Lett. 108 (188701): 1—5. Bibcode:2012PhRvL.108r8701N. doi:10.1103/PhysRevLett.108.188701.
Додаткові посилання
- Community detection in graphs [ 27 січня 2018 у Wayback Machine.] — an introduction
- Are there implementations of algorithms for community detection in graphs? [ 19 грудня 2016 у Wayback Machine.] — Stack Overflow
- What are the differences between community detection algorithms in igraph? [ 16 березня 2018 у Wayback Machine.] — Stack Overflow
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
U vivchenni skladnih merezh kazhut sho merezha maye strukturu spilnoti yaksho vuzli merezhi mozhna legko zgrupuvati v taki mnozhini yaki mozhlivo mayut peretin sho kozhnij nabir vuzliv shilno pov yazanij mizh soboyu vseredini U vipadku koli mnozhini rozbittya vuzliv ne peretinayutsya kazhut sho merezha prirodno dilitsya na grupi iz shilnimi vnutrishnimi ta slabkimi zovnishnimi zv yazkami Prote peretin spilnot takozh ye dopustimim Bilsh zagalne oznachennya bazuyetsya na takomu principi para vuzliv jmovirnishe maye zv yazok yaksho dani vuzli ye chlenami odniyeyi spilnoti i mensh imovirno sho para vuzliv pov yazana yaksho voni ne vhodyat do odniyeyi spilnoti Pov yazanoyu zadacheyu ale trohi vidminnoyu vid danoyi ye en do yakoyi nalezhit pevna vershina VlastivostiShema maloyi merezhi sho ilyustruye strukturu spilnoti z troma grupami vuzliv sho mayut shilni vnutrishni ta slabki zovnishni mizh grupovi zv yazki U doslidzhenni merezh takih yak komp yuterni ta informacijni merezhi socialni ta biologichni merezhi viyavleno veliku kilkist riznih harakteristik vklyuchayuchi z pomizh inshih harakteristiku tisnogo svitu bezmasshtabnosti merezhi ta klasterizaciyu Inshoyu spilnoyu harakteristikoyu ye struktura spilnosti U konteksti merezh struktura spilnosti posilayetsya na te sho viniknennya grup vuzliv u merezhi ye harakternim dlya shilno zuseredzhenih vnutrishnih zv yazkiv spilnoti ta slabo rozgaluzhenih zovnishnih Taka neodnoridnist opisu merezhi govorit pro te sho v merezhi isnuye pevna prirodna klasifikaciya Spilnoti chasto viznachayutsya v terminah rozdilennya na mnozhini vershin tobto kozhen vuzol nalezhit viklyuchno do odniyeyi spilnoti yak na shemi Ce korisne sproshennya i bilshist metodiv po znahodzhennyu spilnot vikoristovuyut danij pidhid U toj chas yak v deyakih vipadkah krashim predstavlennyam merezhi ye takim chiinom shob vershini nalezhali bilshe nizh odnij spilnoti Takij vipadok zustrichayetsya napriklad u socialnih merezhah de kozhna vershina yavlyaye soboyu lyudinu a spilnoti rizni grupi druziv odna spilnota rodina insha spivrobitniki she insha druzi iz sport kluba i t d Vikoristannya klikiv dlya viznachennya spilnot sho obgovoreno nizhche ce lishe odin priklad togo yak mozhna znajti peretinni mnozhini Deyaki merezhi mozhut ne mati suttyevoyi strukturi spilnoti Bagato osnovnih merezhevih modelej napriklad vipadkovi grafi ta modelBarabashi Albert ne mayut strukturi spilnoti AktualnistStruktura spilnot dosit poshirena u spravzhnih merezhah Socialni merezhi vklyuchayut spilni grupi pohodzhennya terminu faktichno osnovoyu yakih ye spilni interesi miscya profesiyi i t d Iz ryadu prichin vazhlivim ye poshuk osnovnoyi spilnoti v strukturi merezhi yaksho zvisno taka isnuye Spilnoti dozvolyayut nam stvoryuvati masshtabnu kartu merezhi oskilki okremi strukturi vedut sebe yak meta vuzli angl meta nodes u merezhi sho polegshuye yiyi vivchennya Okremi spilnoti takozh visvitlyuyut robotu sistemi oskilki spilnoti chasto vidpovidayut yiyi funkcionalnimi chastochkami U metabolichnih merezhah takim funkcionalnim grupam vidpovidayut cikli abo shlyahi u toj chas yak v merezhi iz vzayemodiyeyu z bilkami spilnotam vidpovidayut bilki iz shozhim funkcionalom vseredini biologichnoyi klitini Analogichno merezhi citat utvoryuyut spilnotu za temoyu doslidzhennya Mozhlivist identifikuvati ci strukturi vseredini merezhi mozhe nadati uyavlennya togo yak merezheva funkciya j topologiya vplivayut odin na odnogo Take rozuminnya mozhe buti korisnim dlya vdoskonalennya deyakih algoritmiv dlya grafiv takih yak spektralna klasterizaciya Vagomoyu prichinoyu togo sho spilnoti vazhlivi ye te sho chasto duzhe vidminni vlastivosti vid userednenih po merezhi mayut spilnoti rozglyadayuchi yih okremo odna vid odnoyi Takim chinom lishe vidilennya userednenih vlastivostej vtrachaye bagato vazhlivih i cikavih funkcij u seredini samoyi sistemi Napriklad u vipadku socialnih merezh odnochasno mozhut isnuvati dvi grupi kompanijski ta movchazni Isnuvannya spilnot takozh zazvichaj vplivaye na rizni procesi taki yak rozpovsyudzhennya chutok abo rozpovsyudzhennya epidemiyi v merezhi Tomu dlya pravilnogo rozuminnya takih procesiv vazhlivo viyaviti spilnoti a takozh vivchati yak voni vplivayut na procesi poshirennya v riznih umovah Nareshti vazhlivim zastosuvannyam sho viyavilo spilnotu v merezhevij nauci ye prognoz vidsutnih zv yazkiv ta viyavlennya pomilkovih zv yazkiv u merezhi Pid chas vimiryuvannya deyaki zv yazki mozhut ne sposterigayutsya z ryadu prichin Tochno tak samo deyaki zv yazki mozhut pomilkovo nadavati dani cherez pomilki pri vimiryuvanni Z oboma vipadkami uspishno spravlyayetsya algoritm viyavlennya spilnoti oskilki ce dozvolyaye viznachiti jmovirnist isnuvannya rebra mizh danoyu paroyu vuzliv Algoritmi po znahodzhennyu spilnotPoshuk spilnot u dovilnij merezhi mozhe buti obchislyuvalno skladnim zavdannyam Kilkist spilnot yaksho taka isnuye v merezhi yak pravilo nevidoma i v spilnotah chasto isnuye neodnoridnij rozmir ta abo shilnist Prote nezvazhayuchi na ci trudnoshi rozrobleno ta zastosovano kilka metodiv poshuku spilnot iz riznoyu tochnistyu Metod najmenshogo rozrizu Odnim iz najdavnishih algoritmiv rozpodilu merezh na chastini ye i varianti taki yak koeficiyent rozrizu ta normovanij rozriz Zastosuvannya danogo metodu mozhna pobachiti napriklad v balansuvanni navantazhennya dlya paralelnih obchislen z metoyu minimizaciyi zv yazkiv mizh procesornimi vuzlami U metodi minimalnogo rozrizu merezha dilitsya na zazdalegid viznachenu kilkist chastin yak pravilo priblizno takogo zh rozmiru yaki vibirayutsya takim chinom shob minimizuvati kilkist reber mizh grupami Cej metod dobre pracyuye v bagatoh prikladnih zadachah dlya yakih vin spochatku buv priznachenij ale mensh idealno pidhodit dlya poshuku strukturi spilnoti v zagalnih merezhah oskilki vin znajde spilnoti nezalezhno vid togo chi voni neyavni chi ni v strukturi a znajde lishe fiksovane chislo yih Iyerarhichna klasterizaciya Inshij sposib poshuku struktur spilnoti v merezhah ce iyerarhichna klasterizaciya U danomu metodi viznachayetsya mira podibnosti yaka kilkisno viznachaye deyakij zazvichaj topologichnij tip podibnosti mizh parami vuzliv Najblsh vzhivani miri ce kosinus podibnosti koeficiyent Dzhakarda ta vidstan Hemminga dlya matrici sumizhnosti Todi grupa podibnih vuzliv ob yednuyetsya vidpovidno do ciyeyi miri Isnuye dekilka zagalnih shem dlya zdijsnennya grupuvannya dvi najprostishi klasterizaciya z odnim zv yazkom u yakij dvi grupi vvazhayutsya okremimi spilnotami todi i tilki todi koli vsi pari vuzliv u riznih grupah mayut shozhist nizhche zadanogo porogu i povna klasterizaciya zv yazkiv u yakij vsi vuzli vseredini kozhnoyi grupi mayut podibnist bilshu nizh porogovi Novij pidhid u comu napryamku polyagaye u zastosuvanni riznih mir shozhosti abo nevidpovidnosti ob yednanih za dopomogoyu opuklih sum sho znachno pokrashilo efektivnist danoyi metodiki Algoritm Girvan Nyumana Inshim shiroko vzhivanim algoritmom dlya poshuku spilnot ye algoritm Girvana Nyumana Cej algoritm identifikuye rebra v merezhi sho lezhat mizh spilnotami a potim yih vidalyaye zalishivshi lishe sami spilnoti Identifikaciya vikonuyetsya za dopomogoyu centralizovanosti granichno teoretichnoyi miri yaka prisvoyuye nomer kozhnomu rebru yaksho kraj lezhit mizh bagatma parami vuzliv Algoritm Girvana Nyumana povertaye rezultati prijnyatnoyi yakosti i populyarnij oskilki vin buv realizovanij u ryadi standartnih programnih paketiv Ale vin takozh pracyuye povilno vitrachayuchi O m2n chasu na merezhu z n vershin i m reber sho robit ce nedocilnim dlya merezh z bilsh nizh kilkoma tisyachami vuzliv Maksimizaciya modulnosti Nezvazhayuchi na svoyi vidomi nedoliki odnim z najposhirenishih metodiv viyavlennya spilnot ye maksimizaciya modulnosti angl modularity maximization Modulnist ce funkciya vigodi yaka vimiryuye yakist pevnogo podilu merezhi na spilnoti Metod maksimizaciyi modulnosti viyavlyaye spilnoti shlyahom poshuku mozhlivogo podilu merezhi na odnu abo dekilka spilnot sho mayut osoblivo visoku modulnist Oskilki vicherpnij poshuk nad usima mozhlivimi pidrozdilami yak pravilo nemozhlivij praktichni algoritmi bazuyutsya na nablizhenih metodah optimizaciyi takih yak zhadibni algoritmi algoritm imitaciyi vidpalu abo spektralna optimizaciya z riznimi pidhodami sho proponuyut rizni balansi mizh shvidkistyu ta tochnistyu Najpopulyarnishij pidhid do maksimizaciyi modulnosti ce yakij iterativno optimizuye lokalni spilnoti doki ne mozhe buti vdoskonalena globalna modulnist z urahuvannyam zburennya potochnoyi spilnoti Nini najkrashij algoritm maksimizaciyi modulnosti peremozhec 10 go zmagannya z realizaciyi Centru diskretnoyi matematiki ta teoretichnoyi obchislyuvalnoyi tehniki angl the 10th DIMACS Implementation Challenge ce iterativnij ansamblevij algoritm Korisnist optimizaciyi modulnosti ye sumnivnoyu oskilki bulo pokazano sho optimizaciya modulnosti chasto ne dozvolyaye viyavlyati klasteri menshi nizh pevna shkala zalezhno vid rozmiru merezhi mezha tochnosti z inshogo boku mnozhina znachen modulnosti harakterizuyetsya velicheznoyu virodzhenistyu chastin iz visokoyu modulyarnistyu blizkimi do absolyutnogo maksimumu yaki mozhut duzhe vidriznyatisya odin vid odnogo Statistichnij visnovok Metodi zasnovani na statistichnomu visnovuvanni namagayutsya pidibrati porodzhuvalnu model dlya danih merezhi Zagalna perevaga cogo pidhodu u porivnyanni z alternativami ce yiyi bilsh principovij harakter i zdatnist po svoyij suti rozglyadati pitannya statistichnoyi znachushosti Bilshist metodiv u literaturi bazuyutsya na osnovi a takozh ye varianti sho vklyuchayut zmishane chlenstvo koreguvannya rozmirnosti j iyerarhichnu strukturnist Obrati model mozhna vikoristovuyuchi v yakosti golovnogo nablizhennya take sho maye minimalnu dovzhinu opisu abo ekvivalentno koeficiyent Bajyesa ta perevirkoyu vidnoshennya maksimalnoyi pravdopodibnosti Narazi isnuye bagato algoritmiv dlya efektivnogo vivedennya vipadkovih blokovih modelej vklyuchayuchi ta aglomeracijnij Monte Karlo Na vidminu vid pidhodiv yaki namagayutsya skomponuvati merezhu z ob yektivnoyu funkciyeyu cej klas metodiv gruntuyetsya na generativnih modelyah yaki ne tilki sluzhat opisom velikomasshtabnoyi strukturi merezhi ale takozh mozhut buti vikoristani dlya uzagalnennya danih i prognozuvannya poyavi propushenih abo hibnih zv yazkiv u merezhi Metodi na osnovi kliki Klika ce pidgraf u yakomu kozhen vuzol pov yazanij z kozhnim inshim vuzlom kliki Oskilki vuzli ne mozhut buti bilsh tisno pov yazanimi nizh v opisanomu vipadku ne divno sho isnuye bagato pidhodiv do viyavlennya spilnot u merezhah zasnovanih na viyavlenni klikiv u grafi ta analizi togo yak voni zbigayutsya Varto zauvazhiti sho oskilki vuzol mozhe buti chlenom bilsh nizh odniyeyi kliki to vuzol mozhe buti chlenom dekilkoh spilnot za danim metodom ostannye visvitlyuye strukturu spilnot sho peretinayutsya Odin z metodiv znajti maksimalni kliki tobto znajti kliki yaki ne ye pidgrafom bud yakoyi inshoyi kliki Klasichnim algoritmom yih poshuku ye algoritm Brona Kerbosha Peretin mozhe vikoristovuvatisya dlya viznachennya spilnot kilkoma sposobami Najprostishe rozglyanuti lishe maksimalni kliki bilshi za minimalnij rozmir kilkist vuzliv Ob yednannya cih klikiv potim viznachaye pidgraf chiyi komponenti roz yednani chastini viznachayut spilnoti Taki pidhodi chasto zastosovuyutsya u programnomu zabezpechenni analizu socialnih merezh takih yak UCInet Alternativnij pidhid do vikoristannya klikiv fiksovanogo rozmiru k displaystyle k Peretin mozhe buti vikoristanij dlya viznachennya tipu k displaystyle k regulyarnogo gipergrafu abo strukturi yaka ye uzagalnennyam linijnogo grafu vipadku koli k 2 displaystyle k 2 vidomoyu yak graf kliki angl Clique graph Grafi klik mayut vershini yaki predstavlyayut kliki u pochatkovomu grafi a rebra grafu kliki vrahovuyut nakladannya kliki u pochatkovomu grafi Zastosovuyuchi bud yakij z poperednih metodiv viyavlennya spilnoti yaki prisvoyuyut kozhnomu vuzlu spilnotu do grafu kliki otrimayemo sho kozhnij klici bude prisvoyeno spilnotu Ce mozhna vikoristati dlya viznachennya chlenstva spilnoti v vuzlah kliki Znovu zh taki oskilki vuzol mozhe buti v dekilkoh klikah to vin mozhe buti chlenom kilkoh spilnot Napriklad metod filtruvannya kliki viznachaye spilnoti yak filtruvannya klasteriv k klik Dlya cogo vin znahodit vsi k kliki v merezhi tobto vsi povni pidgrafi Potim vin viznachaye sho dva k klika susidni yaksho voni podilyayut k 1 displaystyle k 1 vuzol tobto ce vikoristovuyetsya dlya viznachennya reber u krafi klika Todi spilnota viznachayetsya yak maksimalna sukupnist k displaystyle k klik u yakih mozhna dosyagti k displaystyle k kliku iz bud yakoyi inshoyi k displaystyle k kliki cherez k displaystyle k klik susidnih Tobto spilnoti ce lishe pov yazani komponenti v grafi klika Oskilki vuzol mozhe odnochasno nalezhat do kilkoh riznih klasteriv k displaystyle k kliki to spilnoti mozhut peretinatisya Testuvannya metodiv poshuku algoritmiv spilnotOcinka algoritmiv dlya viyavlennya struktur spilnoti vse she zalishayetsya vidkritim pitannyam Ochevidno sho povinna bazuvatisya na analizi merezh vidomih struktur Tipovim prikladom ye test chotiri grupi v yakomu merezha podilyayetsya na chotiri grupi odnakovo velikih rozmiriv zazvichaj po 32 vuzla kozhna a jmovirnist zv yazku v mezhah ta mizh grupami zminyuyetsya shob stvoryuvati bilsh mensh skladni strukturi dlya viyavlennya algoritmiv Taki testovi grafi ce osoblivij vipadok visadzhenoyi modeli l podilu angl planted l partition model Anni Kondon ta Richarda Karpa abo bilsh zagalnogo vipadku stohastichnih blokovih modelej zagalnogo klasu modelej vipadkovih merezh sho mistit strukturu spilnoti Buli zaproponovani inshi bilsh gnuchki oriyentiri sho dozvolyayut vikoristovuvati rizni grupi rozmiriv ta netrivialni rozpodili stupeniv taki yak test LFR benchmark zaproponovanij Lanchenetti sho ye rozshirennyam chotiroh grup testiv i vklyuchaye geterogenni rozpodili stupenya vuzla ta rozmiru spilnoti sho robit jogo bilsh silnim testom metodiv viyavlennya spilnot Vazhlivim ye pitannya postavlene Kasimom Pastom i Farazom Zaidi v yih roboti shodo viznachennya algoritmiv viyavlennya spilnot na etalonnih modelyah na osnovi dinamiki evolyuciyi zamist modelej konfiguraciyi Najbilsh poshireni komp yuterni testi pochinayutsya z merezhi chitko viznachenih spilnot Todi cya struktura degraduyetsya shlyahom perekruchuvannya abo vidalennya posilan i dlya algoritmiv staye vse vazhchim i vazhchim viznachennya pochatkovogo rozpodilu Vreshti merezha dosyagaye tochki de vona po suti ye vipadkovoyu Cej tip testu mozhna nazvati vidkritim Produktivnist takih testiv ocinyuyetsya normalizovanoyu vzayemnoyu informaciyeyu abo variaciyeyu informaciyi Voni porivnyuyut rezultati otrimani algoritmom z originalnoyu strukturoyu spilnoti ocinyuyuchi podibnist oboh rozdiliv ViyavlennyaProtyagom ostannih rokiv dosit neochikuvanij rezultat buv otrimanij riznimi grupami yakij pokazuye fazovij perehid u problemi viyavlennya spilnot shilnist zv yazkiv useredini spilnot ta mizh spilnotami staye vse bilsh rivnomirnoyu abo menshoyu ekvivalentno oskilki struktura spilnoti staye zanadto slabkoyu abo merezha staye nadto ridkoyu nespodivano spilnoti stayut neviznachenimi U pevnomu sensi sami spilnoti vse she isnuyut oskilki nayavnist i vidsutnist zv yazkiv vse she spivvidnosyatsya z chlenstvom spilnoti ta yih krajnih tochok ale todi staye informacijno teoretichno nemozhlivim poznachati vuzli krashe nizh za dopomogoyu jmovirnosti abo navit vidrizniti graf vid stvorenogo nulovoyu modellyu takoyu yak bez strukturi spilnoti Cej perehid ne zalezhit vid tipu algoritmu yakij vikoristovuyetsya dlya viyavlennya spilnot tobto isnuye fundamentalna mezha nashoyi zdatnosti viyavlyati spilnoti v merezhah navit za optimalnogo bajyesivskogo visnovku tobto nezalezhno vid nashih obchislyuvalnih resursiv Rozglyanemo stohastichniu blokovu model sho maye vsogo n displaystyle n vuzliv q 2 displaystyle q 2 ggrupi odnakovogo rozmiru i nehaj p i n displaystyle p in ta p o u t displaystyle p out jmovirnosti zv yazku v grupah ta za mezhami spilnot vidpovidno Yaksho p i n gt p o u t displaystyle p in gt p out cya merezha matime strukturu spilnoti oskilki shilnist zv yazku vseredini grup bude bilshe nizh shilnist zv yazkiv mizh grupami Ridko p i n displaystyle p in ta p o u t displaystyle p out spivvidnosyatsya yak O 1 n displaystyle O 1 n tak sho serednij stupin ye staloyu p i n c i n n displaystyle p in c in n p o u t c o u t n displaystyle p out c out n Todi staye nemozhlivim viyaviti spilnoti yaksho c i n c o u t 2 c i n c o u t displaystyle c in c out sqrt 2 c in c out Div takozhSkladni merezhi Iyerarhiya Teoriya merezh Teoriya protikannyaPosilannyaM Girvan M E J Newman 2002 Community structure in social and biological networks Proc Natl Acad Sci USA 99 12 7821 7826 doi 10 1073 pnas 122653799 PMC 122977 PMID 12060727 S Fortunato 2010 Community detection in graphs Phys Rep 486 3 5 75 174 doi 10 1016 j physrep 2009 11 002 F D Malliaros M Vazirgiannis 2013 Clustering and community detection in directed networks A survey Phys Rep 533 4 95 142 doi 10 1016 j physrep 2013 08 002 M A Porter J P Onnela P J Mucha 2009 PDF Notices of the American Mathematical Society 56 1082 1097 1164 1166 Arhiv originalu PDF za 2 travnya 2018 Procitovano 13 sichnya 2018 Fani Hossein Bagheri Ebrahim 2017 Encyclopedia with Semantic Computing and Robotic Intelligence T 1 s 1630001 8 doi 10 1142 S2425038416300019 Arhiv originalu za 4 veresnya 2017 Procitovano 13 sichnya 2018 Hamdaqa Mohammad Tahvildari Ladan LaChapelle Neil Campbell Brian 2014 Science of Computer Programming 95 44 72 doi 10 1016 j scico 2014 01 006 Arhiv originalu za 6 listopada 2018 Procitovano 13 sichnya 2018 M E J Neman Finding community structure in networks using the eigenvectors of matrices Phys Rev E 74 3 1 19 doi 10 1103 PhysRevE 74 036104 Zare Habil P Shooshtari A Gupta R Brinkman 2010 BMC Bioinformatics 11 1 403 doi 10 1186 1471 2105 11 403 PMC 2923634 PMID 20667133 Arhiv originalu za 2 listopada 2015 Procitovano 13 sichnya 2018 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Obslugovuvannya CS1 Storinki iz nepoznachenim DOI z bezkoshtovnim dostupom posilannya Aaron Clauset Cristopher Moore M E J Newman Hierarchical structure and the prediction of missing links in networks Nature 453 7191 98 101 doi 10 1038 nature06830 PMID 18451861 M E J Newman 2004 Detecting community structure in networks Eur Phys J B 38 2 321 330 doi 10 1140 epjb e2004 00124 y M E J Newman 2004 Fast algorithm for detecting community structure in networks Phys Rev E 69 6 066133 doi 10 1103 PhysRevE 69 066133 L Danon J Duch A Diaz Guilera A Arenas 2005 Comparing community structure identification J Stat Mech 2005 09 P09008 doi 10 1088 1742 5468 2005 09 P09008 R Guimera L A N Amaral 2004 Functional cartography of complex metabolic networks Nature 433 7028 895 900 doi 10 1038 nature03288 PMC 2175124 PMID 15729348 V D Blondel J L Guillaume R Lambiotte E Lefebvre 2008 Fast unfolding of community hierarchies in large networks J Stat Mech 2008 10 P10008 doi 10 1088 1742 5468 2008 10 P10008 PDF 2013 Arhiv originalu PDF za 27 sichnya 2018 Procitovano 13 sichnya 2018 Michael Ovelgonne Andreas Geyer Schulz 2013 An ensemble learning strategy for graph clustering Graph Partitioning and Graph Clustering Contemporary Mathematics American Mathematical Society 588 187 206 doi 10 1090 conm 588 S Fortunato M Barthelemy 2007 Resolution limit in community detection Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 104 1 36 41 doi 10 1073 pnas 0605965104 PMC 1765466 PMID 17190818 B H Good Y A de Montjoye A Clauset 2010 The performance of modularity maximization in practical contexts Phys Rev E 81 4 046106 doi 10 1103 PhysRevE 81 046106 Holland Paul W Kathryn Blackmond Laskey Samuel Leinhardt June 1983 Social Networks 5 2 109 137 doi 10 1016 0378 8733 83 90021 7 ISSN 0378 8733 Arhiv originalu za 7 listopada 2018 Procitovano 26 serpnya 2011 Airoldi Edoardo M David M Blei Stephen E Fienberg Eric P Xing June 2008 J Mach Learn Res 9 1981 2014 ISSN 1532 4435 Arhiv originalu za 21 listopada 2018 Procitovano 9 zhovtnya 2013 Ball Brian Brian Karrer M E J Newman 2011 Efficient and principled method for detecting communities in networks Physical Review E 84 3 036103 doi 10 1103 PhysRevE 84 036103 Procitovano 8 grudnya 2011 Karrer Brian M E J Newman 21 sichnya 2011 Stochastic blockmodels and community structure in networks Physical Review E 83 1 016107 doi 10 1103 PhysRevE 83 016107 Procitovano 8 listopada 2011 Peixoto Tiago P 24 bereznya 2014 Hierarchical Block Structures and High Resolution Model Selection in Large Networks Physical Review X 4 1 011047 doi 10 1103 PhysRevX 4 011047 Procitovano 24 kvitnya 2014 Martin Rosvall Carl T Bergstrom 2007 An information theoretic framework for resolving community structure in complex networks Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 104 18 7327 7331 doi 10 1073 pnas 0611034104 PMC 1855072 PMID 17452639 P Peixoto T 2013 Phys Rev Lett 110 148701 Bibcode 2013PhRvL 110n8701P doi 10 1103 PhysRevLett 110 148701 Arhiv originalu za 6 travnya 2020 P Peixoto T 2017 Bayesian stochastic blockmodeling arXiv 1705 10225 Yan Xiaoran Jacob E Jensen Florent Krzakala Cristopher Moore Cosma Rohilla Shalizi Lenka Zdeborova Pan Zhang Yaojia Zhu 17 lipnya 2012 Model Selection for Degree corrected Block Models Journal of Statistical Mechanics Theory and Experiment 2014 P05007 arXiv 1207 3994 doi 10 1088 1742 5468 2014 05 P05007 Gopalan Prem K David M Blei 3 veresnya 2013 Proceedings of the National Academy of Sciences 110 36 14534 14539 doi 10 1073 pnas 1221839110 ISSN 0027 8424 PMC 3767539 PMID 23950224 Arhiv originalu za 27 travnya 2020 Procitovano 9 zhovtnya 2013 Decelle Aurelien Florent Krzakala Cristopher Moore Lenka Zdeborova 12 grudnya 2011 Asymptotic analysis of the stochastic block model for modular networks and its algorithmic applications Physical Review E 84 6 066106 doi 10 1103 PhysRevE 84 066106 Procitovano 16 sichnya 2012 Peixoto Tiago P 13 sichnya 2014 Efficient Monte Carlo and greedy heuristic for the inference of stochastic block models Physical Review E 89 1 012804 doi 10 1103 PhysRevE 89 012804 Procitovano 21 sichnya 2014 Guimera Roger Marta Sales Pardo 29 grudnya 2009 Proceedings of the National Academy of Sciences 106 52 22073 22078 doi 10 1073 pnas 0908366106 PMC 2799723 PMID 20018705 Arhiv originalu za 21 lyutogo 2019 Procitovano 9 listopada 2011 Clauset Aaron Cristopher Moore M E J Newman 1 travnya 2008 Hierarchical structure and the prediction of missing links in networks Nature 453 7191 98 101 doi 10 1038 nature06830 ISSN 0028 0836 PMID 18451861 M G Everett S P Borgatti 1998 Analyzing Clique Overlap Connections Connections 21 49 T S Evans 2010 Clique Graphs and Overlapping Communities J Stat Mech 2010 12 P12037 arXiv 1009 0638 doi 10 1088 1742 5468 2010 12 P12037 G Palla I Derenyi I Farkas T Vicsek 2005 Uncovering the overlapping community structure of complex networks in nature and society Nature 435 7043 814 818 doi 10 1038 nature03607 PMID 15944704 2001 Algorithms for graph partitioning on the planted partition model Random Struct Algor 18 2 116 140 doi 10 1002 1098 2418 200103 18 2 lt 116 AID RSA1001 gt 3 0 CO 2 2 A Lancichinetti S Fortunato F Radicchi 2008 Benchmark graphs for testing community detection algorithms Phys Rev E 78 4 046110 doi 10 1103 PhysRevE 78 046110 M Q Pasta F Zaidi 2017 Leveraging Evolution Dynamics to Generate Benchmark Complex Networks with Community Structures arXiv 1606 01169 cs SI Reichardt J Leone M 2008 Un detectable Cluster Structure in Sparse Networks Phys Rev Lett 101 078701 1 4 Bibcode 2008PhRvL 101g8701R doi 10 1103 PhysRevLett 101 078701 Decelle A Krzakala F Moore C Zdeborova L 2011 Inference and Phase Transitions in the Detection of Modules in Sparse Networks Phys Rev Lett 107 065701 1 5 Bibcode 2011PhRvL 107f5701D doi 10 1103 PhysRevLett 107 065701 Nadakuditi R R 2012 Graph Spectra and the Detectability of Community Structure in Networks Phys Rev Lett 108 188701 1 5 Bibcode 2012PhRvL 108r8701N doi 10 1103 PhysRevLett 108 188701 Dodatkovi posilannyaCommunity detection in graphs 27 sichnya 2018 u Wayback Machine an introduction Are there implementations of algorithms for community detection in graphs 19 grudnya 2016 u Wayback Machine Stack Overflow What are the differences between community detection algorithms in igraph 16 bereznya 2018 u Wayback Machine Stack Overflow