Стародавня ДНК — ДНК, отримана зі стародавніх зразків. Вона може також бути приблизно визначена як ДНК, отримана з біологічних зразків, що не були попередньо збережені для пізнішого аналізу ДНК. Прикладами є ДНК, отримана з археологічних та історичних скелетних матеріалів, муміфікованих тканин, архівних колекцій незаморожених медичних зразків, збережених залишків рослин, льоду та багаторічної мерзлоти, планктону голоцену у морських та озерних відкладах, і тому подібне. Якість стародавньої ДНК низька. Це обмежує результати, яких можна досягти аналізом. Більш того, через деградацію молекул ДНК, — процес, що приблизно корелює з такими чинниками як час, температура та наявність доступної води, — існують верхні ліміти, після яких виживання ДНК малоймовірне. Аллентофт et al. (2012) спробували вирахувати цей ліміт, вивчаючи розкладання мітохондріальної та ядерної ДНК в кістках моа. ДНК деградує за експоненційним законом. Відповідно до моделі дослідників, мітохондріальна ДНК деградує до середньої довжини у 1 пару основ через 6 830 000 років при температурі −5 °C. Кінетика розкладання була виміряна за допомогою експериментів з прискореного старіння, ще більш наочно показуючи сильний вплив температури збереження і вологості на деградацію ДНК. Ядерна ДНК деградує вдвічі швидше, ніж мітохондріальна. Таким чином, ранні дослідження, які повідомляли про знаходження більш стародавньої ДНК, наприклад з залишків динозаврів крейдового періоду, напевно були отримані через забруднення зразків.
Примітки
- Bioinformatics and Functional Genomics By Jonathan Pevsner ,
- Allentoft ME; Collins M; Harker D; Haile J; Oskam CL; Hale ML; Campos PF; Samaniego JA; Gilbert MTP; Willerslev E; Zhang G; Scofield RP; Holdaway RN; Bunce M (2012). The half-life of DNA in bone: measuring decay kinetics in 158 dated fossils. Proceedings of the Royal Society B. 279 (1748): 4724—33. doi:10.1098/rspb.2012.1745.
- Grass, R. N.; Heckel, R.; Puddu, M.; Paunescu, D.; Stark, W. J. (2015). Robust Chemical Preservation of Digital Information on DNA in Silica with Error-Correcting Codes. Angewandte Chemie International Edition. 54 (8): 2552—2555. doi:10.1002/anie.201411378.
Це незавершена стаття з біології. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Це незавершена стаття з археології. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Starodavnya DNK DNK otrimana zi starodavnih zrazkiv Vona mozhe takozh buti priblizno viznachena yak DNK otrimana z biologichnih zrazkiv sho ne buli poperedno zberezheni dlya piznishogo analizu DNK Prikladami ye DNK otrimana z arheologichnih ta istorichnih skeletnih materialiv mumifikovanih tkanin arhivnih kolekcij nezamorozhenih medichnih zrazkiv zberezhenih zalishkiv roslin lodu ta bagatorichnoyi merzloti planktonu golocenu u morskih ta ozernih vidkladah i tomu podibne Yakist starodavnoyi DNK nizka Ce obmezhuye rezultati yakih mozhna dosyagti analizom Bilsh togo cherez degradaciyu molekul DNK proces sho priblizno korelyuye z takimi chinnikami yak chas temperatura ta nayavnist dostupnoyi vodi isnuyut verhni limiti pislya yakih vizhivannya DNK malojmovirne Allentoft et al 2012 sprobuvali virahuvati cej limit vivchayuchi rozkladannya mitohondrialnoyi ta yadernoyi DNK v kistkah moa DNK degraduye za eksponencijnim zakonom Vidpovidno do modeli doslidnikiv mitohondrialna DNK degraduye do serednoyi dovzhini u 1 paru osnov cherez 6 830 000 rokiv pri temperaturi 5 C Kinetika rozkladannya bula vimiryana za dopomogoyu eksperimentiv z priskorenogo starinnya she bilsh naochno pokazuyuchi silnij vpliv temperaturi zberezhennya i vologosti na degradaciyu DNK Yaderna DNK degraduye vdvichi shvidshe nizh mitohondrialna Takim chinom ranni doslidzhennya yaki povidomlyali pro znahodzhennya bilsh starodavnoyi DNK napriklad z zalishkiv dinozavriv krejdovogo periodu napevno buli otrimani cherez zabrudnennya zrazkiv DNK z perehresnimi zv yazkami otrimana z pechinki vikom 4000 rokiv sho nalezhala yegipetskomu zhrecyu Nekht Ankhu PrimitkiBioinformatics and Functional Genomics By Jonathan Pevsner ISBN 978 0 470 08585 1 ISBN 0 470 08585 1 Allentoft ME Collins M Harker D Haile J Oskam CL Hale ML Campos PF Samaniego JA Gilbert MTP Willerslev E Zhang G Scofield RP Holdaway RN Bunce M 2012 The half life of DNA in bone measuring decay kinetics in 158 dated fossils Proceedings of the Royal Society B 279 1748 4724 33 doi 10 1098 rspb 2012 1745 Grass R N Heckel R Puddu M Paunescu D Stark W J 2015 Robust Chemical Preservation of Digital Information on DNA in Silica with Error Correcting Codes Angewandte Chemie International Edition 54 8 2552 2555 doi 10 1002 anie 201411378 Ce nezavershena stattya z biologiyi Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Ce nezavershena stattya z arheologiyi Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi