Рівня́ння Гі́лла — наближення, що дозволяє кількісно описати процеси зв'язування ліганду з макромолекулою, якщо інша молекула того самого або іншого ліганду вже зв'язана з даної макромолекулою. Це рівняння названо на честь англійського фізіолога та біохіміка Арчибальда Гілла.
Рівняння описує частку макромолекул, насичених лігандом, як функцію від концентрації ліганду; воно в основному використовується для опису ступеню кооперативності зв'язування ліганду з ферментом або рецептором. Рівняння було вперше використане Арчібальдом Гіллом для опису сігмоїдної кривої зв'язування кисню з гемоглобіном.
Рівняння Гілла:
- , де
- — частка місць (сайтів) зв'язування де ліганд може зв'язатись з макромолекулою, які вже окуповані лігандом;
- — концентрація вільного (не зв'язаного з макромолекулами, або іншим реакційним субстратом) ліганду;
- — уявна константа дисоціації, що виводиться з закону діючих мас;
- — концентрація ліганду, що призводить до окупації половини наявних сайтів зв'язування (або викликає 50%-й ефект), яка числено дорівнює мікроскопічній константі дисоціації;
- — коефіцієнт Гілла, що визначає кооперативність реакції (але інколи і інші біохімічні властивості, залежно від контексту, в якому рівняння використовується).
Для згаданого вище випадку взаємодії кисню з гемоглобіном = 2,8—3.
Інша вживана форма запису рівняння Гілла є наступною:
У випадку ліганд-рецепторної взаємодії числове значення коефіцієнту Гілла визначає кооперативність ліганд-рецепторної взаємодії наступним чином:
- — Позитивна кооперативність: при зв'язуванні однієї молекули ліганда афінність рецептора до наступної молекули підвищується (тобто, наступна молекула зв'язується з більшою імовірністю);
- — Негативна кооперативність: при зв'язуванні однієї молекули ліганда афінність рецептора до наступної молекули знижується;
- — Некооперативна реакція: афінність рецептора або субстрата до ліганда лишається незмінною незалежно від кількості молекул ліганда, вже зв'язаних з рецептором.
Рівняння Гілла в контексті кількісного опису взаємозв'язку між концентрацією реакційного субстрату (або кількістю наявних сайтів зв'язування) та часткою окупованих сайтів зв'язування є еквівалентом .
Рівняння Гілла з математичної точки зору є логістичною функцією, а в деяких випадках — її логаріфмічною формою; таким чином, при побудові графіку рівняння Гілла на логаріфмічній шкалі цей графік виглядає ідентично логістичному. Це особливо важливо при нелінійній апроксимації експериментальних даних у випадках, коли ефект ліганду є сталим для його концентрацій, які відрізняються на декілька порядків. В цьому випадку для формальної апроксимації експериментальних даних можна (а іноді навіть варто) використовувати логістичну функцію.
Примітки
- Hill, A. V. (22 січня 1910). . J. Physiol. 40 (Suppl): iv—vii. Архів оригіналу (PDF) за 1 грудня 2008. Процитовано 18 березня 2009.
Джерела
- Dorland's Illustrated Medical Dictionary
- Lehninger Principles of Biochemistry, 4th edition, David L. Nelson & Michael M. Cox
- Coval ML (December 1970). Analysis of Hill interaction coefficients and the invalidity of the Kwon and Brown equation. J. Biol. Chem. 245 (23): 6335—6. PMID 5484812. Процитовано 18 березня 2009.
- Biochemistry, Donald Voet and Judith G. Voet
- B. Mitavskiy, D. Chu, and Radu Zabet. (2009), Models of transcription factor binding: Sensitivity of activation functions to model assumptions., Journal of Theoretical Biology, 257 (3): 419—429
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Ne plutati z diferencialnim rivnyannya drugogo poryadku z periodichnoyu funkciyeyu Rivnya nnya Gi lla nablizhennya sho dozvolyaye kilkisno opisati procesi zv yazuvannya ligandu z makromolekuloyu yaksho insha molekula togo samogo abo inshogo ligandu vzhe zv yazana z danoyi makromolekuloyu Ce rivnyannya nazvano na chest anglijskogo fiziologa ta biohimika Archibalda Gilla Grafik rivnyannya Gilla v zvichajnih vgori ta napivlogarifmichnih vnizu koordinatah Po vertikali vidkladena chastka sajtiv zv yazuvannya okupovanih ligandom po gorizontali koncentraciya ligandu V oboh vipadkah KA 20 n 2 3 vidno sho velichina KA vidpovidaye koncentraciyi liganda sho viklikaye napivmaksimalnij efekt Rivnyannya opisuye chastku makromolekul nasichenih ligandom yak funkciyu vid koncentraciyi ligandu vono v osnovnomu vikoristovuyetsya dlya opisu stupenyu kooperativnosti zv yazuvannya ligandu z fermentom abo receptorom Rivnyannya bulo vpershe vikoristane Archibaldom Gillom dlya opisu sigmoyidnoyi krivoyi zv yazuvannya kisnyu z gemoglobinom Rivnyannya Gilla 8 L n K d L n L n K A n L n displaystyle theta L n over K d L n L n over K A n L n de 8 displaystyle theta chastka misc sajtiv zv yazuvannya de ligand mozhe zv yazatis z makromolekuloyu yaki vzhe okupovani ligandom L displaystyle L koncentraciya vilnogo ne zv yazanogo z makromolekulami abo inshim reakcijnim substratom ligandu K d displaystyle K d uyavna konstanta disociaciyi sho vivoditsya z zakonu diyuchih mas K A displaystyle K A koncentraciya ligandu sho prizvodit do okupaciyi polovini nayavnih sajtiv zv yazuvannya abo viklikaye 50 j efekt yaka chisleno dorivnyuye mikroskopichnij konstanti disociaciyi n displaystyle n koeficiyent Gilla sho viznachaye kooperativnist reakciyi ale inkoli i inshi biohimichni vlastivosti zalezhno vid kontekstu v yakomu rivnyannya vikoristovuyetsya Dlya zgadanogo vishe vipadku vzayemodiyi kisnyu z gemoglobinom n displaystyle n 2 8 3 Insha vzhivana forma zapisu rivnyannya Gilla ye nastupnoyu log 8 1 8 n log L log K d displaystyle log left theta over 1 theta right n log L log K d U vipadku ligand receptornoyi vzayemodiyi chislove znachennya koeficiyentu Gilla viznachaye kooperativnist ligand receptornoyi vzayemodiyi nastupnim chinom n gt 1 displaystyle n gt 1 Pozitivna kooperativnist pri zv yazuvanni odniyeyi molekuli liganda afinnist receptora do nastupnoyi molekuli pidvishuyetsya tobto nastupna molekula zv yazuyetsya z bilshoyu imovirnistyu n lt 1 displaystyle n lt 1 Negativna kooperativnist pri zv yazuvanni odniyeyi molekuli liganda afinnist receptora do nastupnoyi molekuli znizhuyetsya n 1 displaystyle n 1 Nekooperativna reakciya afinnist receptora abo substrata do liganda lishayetsya nezminnoyu nezalezhno vid kilkosti molekul liganda vzhe zv yazanih z receptorom Rivnyannya Gilla v konteksti kilkisnogo opisu vzayemozv yazku mizh koncentraciyeyu reakcijnogo substratu abo kilkistyu nayavnih sajtiv zv yazuvannya ta chastkoyu okupovanih sajtiv zv yazuvannya ye ekvivalentom Rivnyannya Gilla z matematichnoyi tochki zoru ye logistichnoyu funkciyeyu a v deyakih vipadkah yiyi logarifmichnoyu formoyu takim chinom pri pobudovi grafiku rivnyannya Gilla na logarifmichnij shkali cej grafik viglyadaye identichno logistichnomu Ce osoblivo vazhlivo pri nelinijnij aproksimaciyi eksperimentalnih danih u vipadkah koli efekt ligandu ye stalim dlya jogo koncentracij yaki vidriznyayutsya na dekilka poryadkiv V comu vipadku dlya formalnoyi aproksimaciyi eksperimentalnih danih mozhna a inodi navit varto vikoristovuvati logistichnu funkciyu PrimitkiHill A V 22 sichnya 1910 J Physiol 40 Suppl iv vii Arhiv originalu PDF za 1 grudnya 2008 Procitovano 18 bereznya 2009 DzherelaDorland s Illustrated Medical Dictionary Lehninger Principles of Biochemistry 4th edition David L Nelson amp Michael M Cox Coval ML December 1970 Analysis of Hill interaction coefficients and the invalidity of the Kwon and Brown equation J Biol Chem 245 23 6335 6 PMID 5484812 Procitovano 18 bereznya 2009 Biochemistry Donald Voet and Judith G Voet B Mitavskiy D Chu and Radu Zabet 2009 Models of transcription factor binding Sensitivity of activation functions to model assumptions Journal of Theoretical Biology 257 3 419 429