Обчи́слювальна хі́мія (англ. computational chemistry, часто називається також комп'ютерною хімією, але остання є ширшим поняттям та охоплює ще інші дисципліни) — розділ хімії, що використовує принципи інформатики для розв'язку хімічних задач. Обчислювальна хімія використовує результати теоретичної хімії, що включенні в комп'ютерні програми, для розрахунків хімічної структури, хімічних та фізичних властивостей речовин та їх сумішей у різних агрегатних станах. Зазвичай результати обчислювальної хімії доповнюють інформацію отриману хімічними та фізичними експериментами, хоча часто вона використовується для передбачення властивостей та хімічних явищ, що ще не спостерігалися експериментально. Обчислювальна хімія широко використовується для розробки нових ліків та матеріалів.
Методи
Одна молекулярна формула може відображати величезну кількість різних ізомерів. Ситуація ускладнюється також існуванням великої кількості конформерів. Кожна така структура (стабільна) має локальний мінімум на енергетичній поверхні (так званій поверхні потенційної енергії (ППЕ)), тобто поверхні залежності сумарної енергії (тобто електронної енергії плюс енергії відштовхування між ядрами) від координат всіх ядер цієї структури. Стаціонарною точкою є така геометрія, при якій всі похідні енергії щодо всіх можливих зміщень ядра рівні нулеві. Локальним енергетичним мінімум є така стаціонарна точка, у якій всі такі зміщення призводять до зростання енергії. Локальний мінімум, що лежить найнижче на ППЕ серед усіх інших, називається глобальним мінімум та належить до найстійкішої конфігурації ядер, а отже до найстійкішого ізомеру. Якщо лише одна зміна по координаті призводить до зменшення загальної енергії в обох напрямках, то така стаціонарна точка називається перехідним станом, а координата — [en]. Процес виявлення стаціонарної точки (точок) називається оптимізацією геометрії.
В останні 10 років успішно розвивається метод комп'ютерного моделювання кристалічних структур USPEX. Метод дозволяє передбачати кристалічну структуру при довільних P-T умовах, виходячи із знання тільки хімічного складу речовини. Сліпе тестування складних немолекулярних неорганічних структур показало переваги еволюційного методу USPEX в більшості тестів в порівнянні з методами випадкової вибірки і симуляції відпалу. Код USPEX базується на ефективному еволюційному алгоритмі, розробленому групою професора А. Оганова. Крім того, в коді реалізовано альтернативні методи (випадковий пошук, [en], покращений алгоритм оптимізації рою часток) і методи пошуку механізмів перетворення кристалічних структур. Цим методом було теоретично передбачено цілий ряд нових матеріалів.
Джерела
Вікісховище має мультимедійні дані за темою: Обчислювальна хімія |
- Тим Кларк. Компьютерная химия. Практическое руководство по расчетам структуры и энергии молекулы. — М. : Мир, 1990. — 385 стр.(рос.)
- Christopher J. Cramer Essentials of Computational Chemistry, John Wiley & Sons (2002)(англ.)
Примітки
- . Архів оригіналу за 7 березня 2018. Процитовано 6 березня 2018.
- . Архів оригіналу за 18 березня 2018. Процитовано 26 лютого 2018.
- . Архів оригіналу за 26 лютого 2018. Процитовано 26 лютого 2018.
Література
- Глосарій термінів з хімії // Й. Опейда, О. Швайка. Ін-т фізико-органічної хімії та вуглехімії ім. Л. М. Литвиненка НАН України, Донецький національний університет. — Донецьк: Вебер, 2008. — 758 с. —
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Obchi slyuvalna hi miya angl computational chemistry chasto nazivayetsya takozh komp yuternoyu himiyeyu ale ostannya ye shirshim ponyattyam ta ohoplyuye she inshi disciplini rozdil himiyi sho vikoristovuye principi informatiki dlya rozv yazku himichnih zadach Obchislyuvalna himiya vikoristovuye rezultati teoretichnoyi himiyi sho vklyuchenni v komp yuterni programi dlya rozrahunkiv himichnoyi strukturi himichnih ta fizichnih vlastivostej rechovin ta yih sumishej u riznih agregatnih stanah Zazvichaj rezultati obchislyuvalnoyi himiyi dopovnyuyut informaciyu otrimanu himichnimi ta fizichnimi eksperimentami hocha chasto vona vikoristovuyetsya dlya peredbachennya vlastivostej ta himichnih yavish sho she ne sposterigalisya eksperimentalno Obchislyuvalna himiya shiroko vikoristovuyetsya dlya rozrobki novih likiv ta materialiv Komp yuterna himiya mozhe dopomogti peredbachiti taki znachennya yak energiya aktivaciyi vid katalizu Prisutnist katalizatora vidkrivaye inshij shlyah reakciyi pokazanij chervonim iz menshoyu energiyeyu aktivaciyi Kincevij rezultat i zagalna termodinamika odnakovi MetodiOdna molekulyarna formula mozhe vidobrazhati velicheznu kilkist riznih izomeriv Situaciya uskladnyuyetsya takozh isnuvannyam velikoyi kilkosti konformeriv Kozhna taka struktura stabilna maye lokalnij minimum na energetichnij poverhni tak zvanij poverhni potencijnoyi energiyi PPE tobto poverhni zalezhnosti sumarnoyi energiyi tobto elektronnoyi energiyi plyus energiyi vidshtovhuvannya mizh yadrami vid koordinat vsih yader ciyeyi strukturi Stacionarnoyu tochkoyu ye taka geometriya pri yakij vsi pohidni energiyi shodo vsih mozhlivih zmishen yadra rivni nulevi Lokalnim energetichnim minimum ye taka stacionarna tochka u yakij vsi taki zmishennya prizvodyat do zrostannya energiyi Lokalnij minimum sho lezhit najnizhche na PPE sered usih inshih nazivayetsya globalnim minimum ta nalezhit do najstijkishoyi konfiguraciyi yader a otzhe do najstijkishogo izomeru Yaksho lishe odna zmina po koordinati prizvodit do zmenshennya zagalnoyi energiyi v oboh napryamkah to taka stacionarna tochka nazivayetsya perehidnim stanom a koordinata en Proces viyavlennya stacionarnoyi tochki tochok nazivayetsya optimizaciyeyu geometriyi V ostanni 10 rokiv uspishno rozvivayetsya metod komp yuternogo modelyuvannya kristalichnih struktur USPEX Metod dozvolyaye peredbachati kristalichnu strukturu pri dovilnih P T umovah vihodyachi iz znannya tilki himichnogo skladu rechovini Slipe testuvannya skladnih nemolekulyarnih neorganichnih struktur pokazalo perevagi evolyucijnogo metodu USPEX v bilshosti testiv v porivnyanni z metodami vipadkovoyi vibirki i simulyaciyi vidpalu Kod USPEX bazuyetsya na efektivnomu evolyucijnomu algoritmi rozroblenomu grupoyu profesora A Oganova Krim togo v kodi realizovano alternativni metodi vipadkovij poshuk en pokrashenij algoritm optimizaciyi royu chastok i metodi poshuku mehanizmiv peretvorennya kristalichnih struktur Cim metodom bulo teoretichno peredbacheno cilij ryad novih materialiv DzherelaVikishovishe maye multimedijni dani za temoyu Obchislyuvalna himiya Tim Klark Kompyuternaya himiya Prakticheskoe rukovodstvo po raschetam struktury i energii molekuly M Mir 1990 385 str ros Christopher J Cramer Essentials of Computational Chemistry John Wiley amp Sons 2002 angl Primitki Arhiv originalu za 7 bereznya 2018 Procitovano 6 bereznya 2018 Arhiv originalu za 18 bereznya 2018 Procitovano 26 lyutogo 2018 Arhiv originalu za 26 lyutogo 2018 Procitovano 26 lyutogo 2018 LiteraturaGlosarij terminiv z himiyi J Opejda O Shvajka In t fiziko organichnoyi himiyi ta vuglehimiyi im L M Litvinenka NAN Ukrayini Doneckij nacionalnij universitet Doneck Veber 2008 758 s ISBN 978 966 335 206 0