Молекуля́рна дина́міка — комп'ютерне моделювання руху атомів і молекул у газах, рідинах та твердих тілах.
Молекулярна динаміка поділяється на класичну й квантову. В класичній молекулярній динаміці взаємодія між атомами задається модельними потенціалами. В рамках квантової молекулярної динаміки для знаходження сил взаємодії атомів і молекул розв'язується рівняння Шредінгера для електронів.
Можливості молекулярної динаміки обмежені рівнем обчислювальної техніки. В класичній молекулярній динаміці можна розглянути еволюцію систем сотень тисяч частинок до часів порядку кількох наносекунд. Такий проміжок часу дозволяє прослідкувати за встановленням у системі термодинамічної рівноваги, але недостатній, наприклад, для розгляду процесів дифузії в твердому тілі.
Молекулярна динаміка передбачає кількісне вивчення руху молекулярних систем по поверхнях потенціальної енергії, де на відміну від кінематики, яка вивчає тільки властивості руху, враховується природа діючих сил. Чисельний розрахунок руху атомів у молекулі, або індивідуальних атомів чи молекул у твердому тілі, рідині чи газі здійснюється згідно з законами руху Ньютона. Сили, що діють на атоми, розраховуються з використанням силових полів молекулярної механіки. Результатом розрахунку за методом молекулярної динаміки є траєкторія. Синонім — динаміка реакцій.
У жовтні 2017 з'явився фреймворк [en], перша платформа з відкритим кодом для перекладу проблем хімії та матеріалознавства в квантові схеми. OpenFermion - це бібліотека для моделювання систем взаємодіючих електронів (ферміонів), що породжують властивості речовини. До OpenFermion розробникам квантових алгоритмів потрібно було вивчити значну кількість хімії та написати велику кількість коду, щоб зламати інші коди, щоб скласти навіть найосновніші квантові симуляції.
Див також
- [en]
- [en]
- [en]
- Мартін Карплус
- Клаус Шультен
Література
- Stevens Jan A.; Grünewald Fabian; van Tilburg P. A. Marco та ін. (2023). Molecular dynamics simulation of an entire cell. Frontiers in Chemistry 11. doi:10.3389/fchem.2023.1106495.
- Глосарій термінів з хімії // Й.Опейда, О.Швайка. Ін-т фізико-органічної хімії та вуглехімії ім. Л.М.Литвиненка НАН України, Донецький національний університет — Донецьк: «Вебер», 2008. — 758 с. —
Це незавершена стаття з фізики. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Це незавершена стаття з хімії. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Molekulya rna dina mika komp yuterne modelyuvannya ruhu atomiv i molekul u gazah ridinah ta tverdih tilah Example of a molecular dynamics simulation in a simple system deposition of a single atom on a Cu Each circle illustrates the position of a single atom note that the actual atomic interactions used in current simulations are more complex than those of 2 dimensional hard spheres Molekulyarna dinamika podilyayetsya na klasichnu j kvantovu V klasichnij molekulyarnij dinamici vzayemodiya mizh atomami zadayetsya modelnimi potencialami V ramkah kvantovoyi molekulyarnoyi dinamiki dlya znahodzhennya sil vzayemodiyi atomiv i molekul rozv yazuyetsya rivnyannya Shredingera dlya elektroniv Mozhlivosti molekulyarnoyi dinamiki obmezheni rivnem obchislyuvalnoyi tehniki V klasichnij molekulyarnij dinamici mozhna rozglyanuti evolyuciyu sistem soten tisyach chastinok do chasiv poryadku kilkoh nanosekund Takij promizhok chasu dozvolyaye proslidkuvati za vstanovlennyam u sistemi termodinamichnoyi rivnovagi ale nedostatnij napriklad dlya rozglyadu procesiv difuziyi v tverdomu tili Molekulyarna dinamika peredbachaye kilkisne vivchennya ruhu molekulyarnih sistem po poverhnyah potencialnoyi energiyi de na vidminu vid kinematiki yaka vivchaye tilki vlastivosti ruhu vrahovuyetsya priroda diyuchih sil Chiselnij rozrahunok ruhu atomiv u molekuli abo individualnih atomiv chi molekul u tverdomu tili ridini chi gazi zdijsnyuyetsya zgidno z zakonami ruhu Nyutona Sili sho diyut na atomi rozrahovuyutsya z vikoristannyam silovih poliv molekulyarnoyi mehaniki Rezultatom rozrahunku za metodom molekulyarnoyi dinamiki ye trayektoriya Sinonim dinamika reakcij U zhovtni 2017 z yavivsya frejmvork en persha platforma z vidkritim kodom dlya perekladu problem himiyi ta materialoznavstva v kvantovi shemi OpenFermion ce biblioteka dlya modelyuvannya sistem vzayemodiyuchih elektroniv fermioniv sho porodzhuyut vlastivosti rechovini Do OpenFermion rozrobnikam kvantovih algoritmiv potribno bulo vivchiti znachnu kilkist himiyi ta napisati veliku kilkist kodu shob zlamati inshi kodi shob sklasti navit najosnovnishi kvantovi simulyaciyi Div takozh en en en Martin Karplus Klaus ShultenLiteraturaStevens Jan A Grunewald Fabian van Tilburg P A Marco ta in 2023 Molecular dynamics simulation of an entire cell Frontiers in Chemistry 11 doi 10 3389 fchem 2023 1106495 Glosarij terminiv z himiyi J Opejda O Shvajka In t fiziko organichnoyi himiyi ta vuglehimiyi im L M Litvinenka NAN Ukrayini Doneckij nacionalnij universitet Doneck Veber 2008 758 s ISBN 978 966 335 206 0 Ce nezavershena stattya z fiziki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Ce nezavershena stattya z himiyi Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi