Частина інформації в цій статті застаріла. (2 лютого 2015) |
Ця стаття потребує додаткових для поліпшення її . (2 лютого 2015) |
Дилема Голдейна — невідповідність реальної швидкості видоутворення і очікуваної відповідно до популяційно-генетичної моделі. Ця проблема була описана Джоном Голдейном в 1957 р. у статті «Ціна природного відбору» в науковому виданні «Journal of Genetics», а пізніше інтерпретована його послідовниками. Креаціоністи вважають дилему Голдейна невирішеною і апелюють до неї, вважаючи її одним з доказів помилковості теорії біологічної еволюції.
Завдання та висновки роботи Голдейна
Голдейн розраховував математичне співвідношення між інтенсивністю відбору, швидкістю заміщення одних алелів в популяції іншими, більш пристосованими, і ціни (в частці особин, які загинули через генетично знижену пристосованість), яку популяція платить за це заміщення. За його розрахунками і допущеннями, час, необхідний для видоутворення, виявився порівнюваним або більшим відносно реально спостережуваного (тобто — по палеонтологічних даних). Розрахунки Голдейна являють собою першу широко відому спробу оцінити темпи еволюції з точки зору генетики популяцій. Розрахунки, зроблені пізніше для оцінки швидкості еволюції (з точки зору популяційної генетики), враховують або ґрунтуються на моделі Голдейна. За цими пізнішими моделями, видоутворення може займати набагато менше часу. Сам Голдейн не хотів робити гучних висновків зі своїх розрахунків і чекав подальшого розвитку подібного роду моделей. Його робота завершувалася словами: «На закінчення, я хочу сказати, що цілком усвідомлюю — мої висновки, можливо, потребують критичного перегляду. Але я переконаний, що математичні розрахунки подібного роду будуть відігравати вирішальну роль у всіх еволюційних міркуваннях».
Математична модель Голдейна і вирішення проблеми швидкості еволюції
Модель Голдейна
Нехай у популяції в початковий момент часу є 2 алелі гену, що нас цікавить: A і a. Алель a переважає, алель A — присутній у невеликій кількості. На популяцію починає діяти відбір проти алелю a. Тоді, щоб компенсувати спад чисельності особин, що відмітаються відбором, особини, які виживають у популяції, повинні мати надлишкову плодючість. За умови, що інтенсивність відбору проти особин, несучих алель a, дорівнює одиниці, заміщення одного алелю в популяції іншим займе всього лише одне покоління, але при вкрай малій частоті алелю A, спад чисельності популяції може бути критичним.
У разі якщо інтенсивність відбору набагато менша одиниці, сумарне число загиблих через знижену пристосованість особин виявляється несподівано великим і становить у загальному випадку, кілька десятків вихідних чисельностей популяції.
На перший погляд, можна очікувати, що число особин, які загинули через знижену пристосованість не може перевищувати чисельність популяції, але це не зовсім так.
Розглянемо наступну спрощену модель (ця модель відсутня у роботі Голдейна, але може допомогти в розумінні моделі).
Нехай є популяція гаплоїдних організмів, чисельністю 10 000 особин. 10% з них несе більш пристосований алель A, 90% — алель a. Проти алелю a діє відбір з інтенсивністю 0,1. Тоді у 1-му поколінні після відбору в популяції буде присутня 1000 особин з аллелем A і 8100 особин з алелем a (11% і 89% відповідно). Так як популяція прагне зберегти свою вихідну чисельність, то в наступному поколінні (до відбору) чисельність особин складе 10 000 особин з пропорційним (до кінця 10-го покоління) розподілом по генотипових класах 1100 A і 8900 a.
Таким чином, у даній моделі при інтенсивності відбору 0,1 проти алелю a зміна частот алелів за 1-е покоління склала всього 1%, а число особин, загиблих через знижену пристосованість, склало 9%. Очевидно, що повна заміна алельного складу в ряді поколінь потребує числа генетично зумовлених смертей більшого, ніж чисельність популяції.
Голдейн врахував варіанти відбору для гаплоїдних і диплоїдних організмів, розглянув варіанти при інбридинзі і для генів, розташованих у статевих хромосомах.
У загальному випадку, число особин, загиблих через знижену пристосованість, визначається величиною
D = — ln p0
где p0 — вихідна частота сприятливого алелю.
D — міра, яка вказує на те, у скільки разів генетично зумовлена смертність в популяції вище її реальної чисельності.
За формулою, число генетично зумовлених смертей не залежить від інтенсивності відбору, але пов'язане з вихідною частотою сприятливого алелю.
Час, необхідний на заміщення одного алелю іншим, тим не менш, з відбором пов'язаний:
T = D/s
де T — час, виражений у поколіннях, s — інтенсивність відбору.
У наступних роботах, що розглядають існування малопристосованих особин в популяціях як прояв генетичного вантажу, , пов'язаний з рушійним добором отримав назву перехідного, або вантажу заміщення, L i.
Li = D.
Протиріччя між темпами еволюції і розрахованими швидкостями замін алелів у популяціях
Якщо добір сприяє одиничному мутанту, то вихідна частота позитивно відбираємого алелю мала. Голдейн прийняв як вихідну частоту алелю 10−5 . У цьому випадку, вантаж заміщення по одному алелю великий і складає в середньому 30, що еквівалентно великому числу генетично зумовлених смертей. При залученні у відбір більш ніж одного гена, ціна заміщення (за умови рівних коефіцієнтів відбору по розглянутих генах) пропорційно зростає і може призвести до загрозливого зменшення чисельності популяції.
У Алтухова Ю. П. наводиться оцінка, що відповідно до моделі Голдейна, одночасно не може йти рушійний відбір більш ніж по 12 генам, інакше зниження чисельності виду може загрожувати самому існуванню цього виду
Голдейн вважав, що для видоутворення необхідна заміна алелей по 1000 локусах, що при селективній перевазі по кожному з локусів в 0,1 потрібно буде 300000 поколінь. Розрахунки віку багатьох видів суперечать такій оцінці.
Спроби вирішення проблеми
За оцінками Ю. П. Алтухова, ефективна чисельність популяції несподівано мала, і становить у середньому кілька сотень особин. Припустимо, що видоутворення пов'язане не з усім вихідним видом, а з окремими крайовими популяціями. Якщо рушійний відбір зачіпає алелі в популяціях з такою невеликою ефективною чисельністю, то вихідна частота сприятливого алелю спочатку буде мати значення не порядку 10−5 — 10−6, а в інтервалі 10−3−10−2. Для малих значень ефективної чисельності популяцій, зміна алельного складу має супроводжуватися меншим генетичним вантажем, завдяки ефектам генетичного дрейфу.
Оцінка в необхідності заміни алельного складу по 1000 генах може бути завищена. Якщо відбір йде по регуляторних генах, то зміни в кожному з таких генів можуть мати різноманітні плейотропні ефекти. Тобто — для одержання істотних відмінностей і формування репродуктивної ізоляції між вихідним видом і дочірньою групою достатні зміни по відносно малому числу генів.
Заміщення алельного складу в популяції може відбуватися без ризику зменшення чисельності цієї популяції, якщо алель-замісник є сприятливим навіть у разі не зниженої пристосованості особин, що несуть нормальний алель.
При такому глобальному процесі, як видоутворення, слід враховувати вплив виду на середовище його перебування. У загальному випадку у міру розростання та еволюційної адаптації виду середовище, в якому він мешкає, змінюється несприятливим для нього чином — знижується й еволюціонує в напрямку зниження доступності (утворення колючок і отруйних речовин у рослин, збільшення швидкості, спритності і засобів активної самооборони у тварин і т. і.) кормова база, виснажуються інші ресурси, розростаються і еволюціонують популяції хижаків і паразитів, зростає конкуренція між особинами цього виду і т. і. Тобто на ранніх етапах видоутворення, коли алелі, що заміщаються, мають малу поширеність (або взагалі відсутні), ризик вимирання популяції все ж невеликий, оскільки умови середовища існування сприятливі (багато доступної їжі, мало хижаків і паразитів), а конкуренція між особинами невелика.
Інтенсивність відбору при цьому буде високою за рахунок високих пристосованості та плодючості носіїв заміщаючих алелів, а не за рахунок низької пристосованості носіїв нормального алелю. У процесі поширення заміщаючих алелів пристосованість і плодючість їх носіїв через зростаючу конкуренцію і зміни середовища проживання будуть поступово знижуватися до нормального рівня.
Випадки заміни менш пристосованих алелів більш пристосованими в умовах зниженого тиску відбору розглядалися Голдейном як можливі, але малоймовірні (у зв'язку з тим, що в загальному випадку, на популяції діє істотний відбір).
Процеси, пов'язані з видоутворенням, мабуть, занадто складні, для того, щоб їх можна було точно описати виходячи з популяційно-генетичних моделей, так як, відповідно до СТЕ, видоутворення — тривалий процес, а реальні природні співтовариства, взаємодії біотичних і абіотичних факторів середовища точно описати і врахувати в популяційно-генетичній моделі видоутворення важко.
Див. також
Література
- Алтухов Ю. П. Генетические процессы в популяциях. М.: ИКЦ «Академкнига», 2003. — 431 с.
- Кимура М. Молекулярная эволюция: теория нейтральности. — М.: Мир, 1985. — 394 с.
Ресурси Інтернету
- Haldane J.B.S. The Cost of Natural Selection [ 30 січня 2016 у Wayback Machine.]. — J. Genet. — 1957. — Vol. 55. — P. 511–524.
- Сучасні уявлення і збірка посилань з приводу ділеми Голдейна [ 3 лютого 2015 у Wayback Machine.] (англ.)
Виноски
- «To conclude, I am quite aware that my conclusions will probably need drastic revision. But I am convinced that quantitative arguments of the kind here put forward should play a part in all future discussions of evolution.» Haldane J.B.S. The cost of natural selection // J. Genet. — 1957. — Vol. 55. — Р. 511–524
- Алтухов Ю. П. Генетические процессы в популяциях. М.: ИКЦ «Академкнига», 2003. — 431 с.
- Robert Williams. Haldane's Dilemma. Архів оригіналу за 23 березня 2012. Процитовано 3 листопада 2008.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Chastina informaciyi v cij statti zastarila Vi mozhete dopomogti onovivshi yiyi Mozhlivo storinka obgovorennya mistit zauvazhennya shodo potribnih zmin 2 lyutogo 2015 Cya stattya potrebuye dodatkovih posilan na dzherela dlya polipshennya yiyi perevirnosti Bud laska dopomozhit udoskonaliti cyu stattyu dodavshi posilannya na nadijni avtoritetni dzherela Zvernitsya na storinku obgovorennya za poyasnennyami ta dopomozhit vipraviti nedoliki Material bez dzherel mozhe buti piddano sumnivu ta vilucheno 2 lyutogo 2015 Dilema Goldejna nevidpovidnist realnoyi shvidkosti vidoutvorennya i ochikuvanoyi vidpovidno do populyacijno genetichnoyi modeli Cya problema bula opisana Dzhonom Goldejnom v 1957 r u statti Cina prirodnogo vidboru v naukovomu vidanni Journal of Genetics a piznishe interpretovana jogo poslidovnikami Kreacionisti vvazhayut dilemu Goldejna nevirishenoyu i apelyuyut do neyi vvazhayuchi yiyi odnim z dokaziv pomilkovosti teoriyi biologichnoyi evolyuciyi Zavdannya ta visnovki roboti GoldejnaGoldejn rozrahovuvav matematichne spivvidnoshennya mizh intensivnistyu vidboru shvidkistyu zamishennya odnih aleliv v populyaciyi inshimi bilsh pristosovanimi i cini v chastci osobin yaki zaginuli cherez genetichno znizhenu pristosovanist yaku populyaciya platit za ce zamishennya Za jogo rozrahunkami i dopushennyami chas neobhidnij dlya vidoutvorennya viyavivsya porivnyuvanim abo bilshim vidnosno realno sposterezhuvanogo tobto po paleontologichnih danih Rozrahunki Goldejna yavlyayut soboyu pershu shiroko vidomu sprobu ociniti tempi evolyuciyi z tochki zoru genetiki populyacij Rozrahunki zrobleni piznishe dlya ocinki shvidkosti evolyuciyi z tochki zoru populyacijnoyi genetiki vrahovuyut abo gruntuyutsya na modeli Goldejna Za cimi piznishimi modelyami vidoutvorennya mozhe zajmati nabagato menshe chasu Sam Goldejn ne hotiv robiti guchnih visnovkiv zi svoyih rozrahunkiv i chekav podalshogo rozvitku podibnogo rodu modelej Jogo robota zavershuvalasya slovami Na zakinchennya ya hochu skazati sho cilkom usvidomlyuyu moyi visnovki mozhlivo potrebuyut kritichnogo pereglyadu Ale ya perekonanij sho matematichni rozrahunki podibnogo rodu budut vidigravati virishalnu rol u vsih evolyucijnih mirkuvannyah Matematichna model Goldejna i virishennya problemi shvidkosti evolyuciyiModel Goldejna Nehaj u populyaciyi v pochatkovij moment chasu ye 2 aleli genu sho nas cikavit A i a Alel a perevazhaye alel A prisutnij u nevelikij kilkosti Na populyaciyu pochinaye diyati vidbir proti alelyu a Todi shob kompensuvati spad chiselnosti osobin sho vidmitayutsya vidborom osobini yaki vizhivayut u populyaciyi povinni mati nadlishkovu plodyuchist Za umovi sho intensivnist vidboru proti osobin nesuchih alel a dorivnyuye odinici zamishennya odnogo alelyu v populyaciyi inshim zajme vsogo lishe odne pokolinnya ale pri vkraj malij chastoti alelyu A spad chiselnosti populyaciyi mozhe buti kritichnim U razi yaksho intensivnist vidboru nabagato mensha odinici sumarne chislo zagiblih cherez znizhenu pristosovanist osobin viyavlyayetsya nespodivano velikim i stanovit u zagalnomu vipadku kilka desyatkiv vihidnih chiselnostej populyaciyi Na pershij poglyad mozhna ochikuvati sho chislo osobin yaki zaginuli cherez znizhenu pristosovanist ne mozhe perevishuvati chiselnist populyaciyi ale ce ne zovsim tak Rozglyanemo nastupnu sproshenu model cya model vidsutnya u roboti Goldejna ale mozhe dopomogti v rozuminni modeli Nehaj ye populyaciya gaployidnih organizmiv chiselnistyu 10 000 osobin 10 z nih nese bilsh pristosovanij alel A 90 alel a Proti alelyu a diye vidbir z intensivnistyu 0 1 Todi u 1 mu pokolinni pislya vidboru v populyaciyi bude prisutnya 1000 osobin z allelem A i 8100 osobin z alelem a 11 i 89 vidpovidno Tak yak populyaciya pragne zberegti svoyu vihidnu chiselnist to v nastupnomu pokolinni do vidboru chiselnist osobin sklade 10 000 osobin z proporcijnim do kincya 10 go pokolinnya rozpodilom po genotipovih klasah 1100 A i 8900 a Takim chinom u danij modeli pri intensivnosti vidboru 0 1 proti alelyu a zmina chastot aleliv za 1 e pokolinnya sklala vsogo 1 a chislo osobin zagiblih cherez znizhenu pristosovanist sklalo 9 Ochevidno sho povna zamina alelnogo skladu v ryadi pokolin potrebuye chisla genetichno zumovlenih smertej bilshogo nizh chiselnist populyaciyi Goldejn vrahuvav varianti vidboru dlya gaployidnih i diployidnih organizmiv rozglyanuv varianti pri inbridinzi i dlya geniv roztashovanih u statevih hromosomah U zagalnomu vipadku chislo osobin zagiblih cherez znizhenu pristosovanist viznachayetsya velichinoyu D ln p0 gde p0 vihidna chastota spriyatlivogo alelyu D mira yaka vkazuye na te u skilki raziv genetichno zumovlena smertnist v populyaciyi vishe yiyi realnoyi chiselnosti Za formuloyu chislo genetichno zumovlenih smertej ne zalezhit vid intensivnosti vidboru ale pov yazane z vihidnoyu chastotoyu spriyatlivogo alelyu Chas neobhidnij na zamishennya odnogo alelyu inshim tim ne mensh z vidborom pov yazanij T D s de T chas virazhenij u pokolinnyah s intensivnist vidboru U nastupnih robotah sho rozglyadayut isnuvannya malopristosovanih osobin v populyaciyah yak proyav genetichnogo vantazhu pov yazanij z rushijnim doborom otrimav nazvu perehidnogo abo vantazhu zamishennya L i Li D Protirichchya mizh tempami evolyuciyi i rozrahovanimi shvidkostyami zamin aleliv u populyaciyah Yaksho dobir spriyaye odinichnomu mutantu to vihidna chastota pozitivno vidbirayemogo alelyu mala Goldejn prijnyav yak vihidnu chastotu alelyu 10 5 U comu vipadku vantazh zamishennya po odnomu alelyu velikij i skladaye v serednomu 30 sho ekvivalentno velikomu chislu genetichno zumovlenih smertej Pri zaluchenni u vidbir bilsh nizh odnogo gena cina zamishennya za umovi rivnih koeficiyentiv vidboru po rozglyanutih genah proporcijno zrostaye i mozhe prizvesti do zagrozlivogo zmenshennya chiselnosti populyaciyi U Altuhova Yu P navoditsya ocinka sho vidpovidno do modeli Goldejna odnochasno ne mozhe jti rushijnij vidbir bilsh nizh po 12 genam inakshe znizhennya chiselnosti vidu mozhe zagrozhuvati samomu isnuvannyu cogo vidu Goldejn vvazhav sho dlya vidoutvorennya neobhidna zamina alelej po 1000 lokusah sho pri selektivnij perevazi po kozhnomu z lokusiv v 0 1 potribno bude 300000 pokolin Rozrahunki viku bagatoh vidiv superechat takij ocinci Sprobi virishennya problemi Za ocinkami Yu P Altuhova efektivna chiselnist populyaciyi nespodivano mala i stanovit u serednomu kilka soten osobin Pripustimo sho vidoutvorennya pov yazane ne z usim vihidnim vidom a z okremimi krajovimi populyaciyami Yaksho rushijnij vidbir zachipaye aleli v populyaciyah z takoyu nevelikoyu efektivnoyu chiselnistyu to vihidna chastota spriyatlivogo alelyu spochatku bude mati znachennya ne poryadku 10 5 10 6 a v intervali 10 3 10 2 Dlya malih znachen efektivnoyi chiselnosti populyacij zmina alelnogo skladu maye suprovodzhuvatisya menshim genetichnim vantazhem zavdyaki efektam genetichnogo drejfu Ocinka v neobhidnosti zamini alelnogo skladu po 1000 genah mozhe buti zavishena Yaksho vidbir jde po regulyatornih genah to zmini v kozhnomu z takih geniv mozhut mati riznomanitni plejotropni efekti Tobto dlya oderzhannya istotnih vidminnostej i formuvannya reproduktivnoyi izolyaciyi mizh vihidnim vidom i dochirnoyu grupoyu dostatni zmini po vidnosno malomu chislu geniv Zamishennya alelnogo skladu v populyaciyi mozhe vidbuvatisya bez riziku zmenshennya chiselnosti ciyeyi populyaciyi yaksho alel zamisnik ye spriyatlivim navit u razi ne znizhenoyi pristosovanosti osobin sho nesut normalnij alel Pri takomu globalnomu procesi yak vidoutvorennya slid vrahovuvati vpliv vidu na seredovishe jogo perebuvannya U zagalnomu vipadku u miru rozrostannya ta evolyucijnoyi adaptaciyi vidu seredovishe v yakomu vin meshkaye zminyuyetsya nespriyatlivim dlya nogo chinom znizhuyetsya j evolyucionuye v napryamku znizhennya dostupnosti utvorennya kolyuchok i otrujnih rechovin u roslin zbilshennya shvidkosti spritnosti i zasobiv aktivnoyi samooboroni u tvarin i t i kormova baza visnazhuyutsya inshi resursi rozrostayutsya i evolyucionuyut populyaciyi hizhakiv i parazitiv zrostaye konkurenciya mizh osobinami cogo vidu i t i Tobto na rannih etapah vidoutvorennya koli aleli sho zamishayutsya mayut malu poshirenist abo vzagali vidsutni rizik vimirannya populyaciyi vse zh nevelikij oskilki umovi seredovisha isnuvannya spriyatlivi bagato dostupnoyi yizhi malo hizhakiv i parazitiv a konkurenciya mizh osobinami nevelika Intensivnist vidboru pri comu bude visokoyu za rahunok visokih pristosovanosti ta plodyuchosti nosiyiv zamishayuchih aleliv a ne za rahunok nizkoyi pristosovanosti nosiyiv normalnogo alelyu U procesi poshirennya zamishayuchih aleliv pristosovanist i plodyuchist yih nosiyiv cherez zrostayuchu konkurenciyu i zmini seredovisha prozhivannya budut postupovo znizhuvatisya do normalnogo rivnya Vipadki zamini mensh pristosovanih aleliv bilsh pristosovanimi v umovah znizhenogo tisku vidboru rozglyadalisya Goldejnom yak mozhlivi ale malojmovirni u zv yazku z tim sho v zagalnomu vipadku na populyaciyi diye istotnij vidbir Procesi pov yazani z vidoutvorennyam mabut zanadto skladni dlya togo shob yih mozhna bulo tochno opisati vihodyachi z populyacijno genetichnih modelej tak yak vidpovidno do STE vidoutvorennya trivalij proces a realni prirodni spivtovaristva vzayemodiyi biotichnih i abiotichnih faktoriv seredovisha tochno opisati i vrahuvati v populyacijno genetichnij modeli vidoutvorennya vazhko Div takozhKoshmar Dzhenkina Hrapovik MelleraLiteraturaAltuhov Yu P Geneticheskie processy v populyaciyah M IKC Akademkniga 2003 431 s Kimura M Molekulyarnaya evolyuciya teoriya nejtralnosti M Mir 1985 394 s Resursi InternetuHaldane J B S The Cost of Natural Selection 30 sichnya 2016 u Wayback Machine J Genet 1957 Vol 55 P 511 524 Suchasni uyavlennya i zbirka posilan z privodu dilemi Goldejna 3 lyutogo 2015 u Wayback Machine angl Vinoski To conclude I am quite aware that my conclusions will probably need drastic revision But I am convinced that quantitative arguments of the kind here put forward should play a part in all future discussions of evolution Haldane J B S The cost of natural selection J Genet 1957 Vol 55 R 511 524 Altuhov Yu P Geneticheskie processy v populyaciyah M IKC Akademkniga 2003 431 s Robert Williams Haldane s Dilemma Arhiv originalu za 23 bereznya 2012 Procitovano 3 listopada 2008