Ця стаття є сирим з іншої мови. Можливо, вона створена за допомогою машинного перекладу або перекладачем, який недостатньо володіє обома мовами. (січень 2019) |
Гістонові ацетилтрансферази(Histone acetyltransferases (HATs)) — ферменти, що ацетилюють лізинові залишки на гістонах. ДНК обмотана навколо гістонів, тому, перенесення ацетильних груп на гістони може вимикати чи вмикати певні гени. Ацетилювання гістонів переважно підвищує експресію гену. Такий механізм зміни експресії генів є епігенетичним.
GCN5 histone acetyltransferase domain homo24-mer, Human | |
Ідентифікатори | |
---|---|
Код КФ | 2.3.1.48 |
Номер CAS | 9054-51-7 |
Бази ферментів | |
IntEnz | IntEnz view |
BRENDA | BRENDA entry |
ExPASy | NiceZyme view |
MetaCyc | metabolic pathway |
KEGG | KEGG entry |
PRIAM | profile |
PDB structures | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum |
Gene Ontology | AmiGO • EGO |
Пошук | |
PMC | статті |
PubMed | статті |
NCBI | NCBI proteins |
CAS | 9054-51-7 |
Ацетилювання гістонів пов'язане з активацією транскрипції і асоційоване з еухроматином. На еухроматині, що є менш компактним за гетерохроматин, може відбуватись транскрипція за рахунок меншої щільності. Спершу вважали, що ацетилювання гістонів нівелює їх позитивний заряд, таким чином, зменшуючи спорідненість до ДНК. Але сучасні дослідження показують, що ацетилювання створює сайти для білок-білкових взаємодій. Гістонові ацетилтрансферази можуть ацетилювати не тільки гістони, а ще, наприклад, деякі ядерні рецептори та інші транскрипційні фактори.
Родини ГАТ
Гістонові ацетилтрансферази(ГАТ) традиційно поділяють на два класи на основі субклітинної локалізації. ГАТ А-типу розташовані в ядрі і залучені в регуляцію генної експресії шляхом ацетилювання нуклеосомних гістонів в хроматині. Вони містять бромодомен, який допомагає їм зв'язуватись з гістонами. Gcn5, p300/CBP і TAFII250 - приклади ГАТ А-типу. ГАТ В-типу розташовані в цитоплазмі та відповідальні за ацетилювання щойносинтезованих гістонів до їх асоціації в нуклеосоми.
Gcn5-споріднені N-ацетилтрансферази (GNATs)
ГАТи можна згрупувати в декілька різних родин, спираючись на гомологію послідовностей, структурні особливості та функції. Gcn5-споріднені N-ацетилтрансферази характеризуються наявністю бромодомену, вони ацетилюють лізини на гістонах Н2В, Н3 та Н4. Всі білки цієї родини мають чотири консервативні мотиви(A-D) в каталітичному домені. Крім каталітичного, ферменти цієї родини мають ще N-кінцевий домен, Ada2 домен та C-кінцевий бромодомен.
MYST
Родина MYST названа по першим буквам чотирьох її членів: MOZ, Ybf2 (Sas3), Sas2 і Tip60. Для ферментів даної родини характерна наявність цинкових пальців та хромодомену, вони ацетилюють гістони Н2А, Н3 та Н4. MOZ(monocytic leukemia zinc finger protein) виявляє онкогенні властивості у людей.
Інші
Крім попередніх родин гістонових ацетилтрансфераз, є кілька інших ферментів, що знайдені у вищих еукаріотів. До них належать p300/CBP, коактиватор ядерних рецепторів (e.g., ACTR/SRC-1), TAFII250, TFIIIC, Rtt109, та CLOCK. p300/CBP має кілька регіонів з цинковими пальцями та бромодомен і кількома висококонсервативними доменами схожий на GNATs, функціонує, як активатор транскрипції.
Коактиватори ядерних рецепторів
Три важливих коактиватори ядерних рецепторів - SRC-1, ACTR та TIF-2. SRC-1 (steroid receptor coactivator-1) може взаємодіяти з p300/CBP та PCAF, ацетилтрансферазний домен розташований в С-кінцевому регіоні.
Таблиця підумовує різницю між ферментами, експресію в різних організмах та структурні особливості.
Родина | Організм | Асоційовані комплекси | Субстратна специфічність | Структурні особливості |
---|---|---|---|---|
GNAT | ||||
Gcn5 | S. cerevisiae | SAGA, SLIK (SALSA), ADA, HAT-A2 | H2B, H3, (H4) | Bromodomain |
GCN5 | D. melanogaster | SAGA, ATAC | H3, H4 | Bromodomain |
GCN5 | H. sapiens | STAGA, TFTC | H3, (H4, H2B) | Bromodomain |
PCAF | H. sapiens | PCAF | H3, H4 | Bromodomain |
Hat1 | S. cerevisiae - H. sapiens | HAT-B, NuB4, HAT-A3 | H4, (H2A) | |
Elp3 | S. cerevisiae | Elongator | H3, H4, (H2A, H2B) | |
Hpa2 | S. cerevisiae | HAT-B | H3, H4 | |
Hpa3 | S. cerevisiae | H3, H4 | ||
ATF-2 | S. cerevisiae - H. sapiens | H2B, H4 | ||
Nut1 | S. cerevisiae | Mediator | H3, H4 | |
MYST | ||||
Esa1 | S. cerevisiae | NuA4, piccolo NuA4 | H2A, H4, (H2B, H3) | Chromodomain |
Sas2 | S. cerevisiae | SAS, NuA4 | H4, (H2A, H3) | |
Sas3 (Ybf2) | S. cerevisiae | NuA3 | H3, (H4, H2A) | |
Tip60 | H. sapiens | Tip60, NuA4 | H2A, H4, (H3) | Chromodomain |
MOF | D. melanogaster | MSL | H4, (H2A, H3) | Chromodomain |
MOZ | H. sapiens | MSL | H3, H4 | |
MORF | H. sapiens | MSL | H3, H4 | |
HBO1 | H. sapiens | ORC | H3, H4 | |
p300/CBP | ||||
p300 | H. sapiens | H2A, H2B, H3, H4 | Bromodomain | |
CBP | H. sapiens | H2A, H2B, H3, H4 | Bromodomain | |
SRC (nuclear receptor coactivators) | ||||
SRC-1 | H. sapiens | ACTR/SRC-1 | H3, H4 | |
ACTR (RAC3, AIB1, TRAM-1) | H. sapiens | ACTR/SRC-1 | H3, H4 | |
TIF-2 (GRIP1) | H. sapiens | H3, H4 | ||
SRC-3 | H. sapiens | |||
Other | ||||
TAFII250 (TAF1) | S. cerevisiae - H. sapiens | TFIID | H3, H4, (H2A) | Bromodomain |
TFIIIC (p220, p110, p90) | H. sapiens | TFIIIC | H2A, H3, H4 | |
Rtt109 | S. cerevisiae | Histone chaperones | H3 | |
CLOCK | H. sapiens | H3, H4 |
Загальна структура
В загальному, ГАТи характеризуються структурно консервативним коровим регіоном, який утворюють 3 бета-складки, після яких розташована довга альфа-спіраль, повернута одним боком до бета-регіону. Основна область, яка відповідає мотивам A, B і D білків GNAT, фланкується на протилежних сторонах N- і C-кінцевими α / β сегментами, які є структурно унікальними для даної родини ГАТ. Центральне ядро і бічні сегменти разом утворюють щілину над першим, де субстрати гістонів можуть зв'язуватися перед каталізом. У той час як домен центрального ядра (мотив A в GNATs) бере участь в зв'язуванні ацетил-CoA і каталізі, N- і C-кінцеві сегменти допомагають у зв'язуванні субстратів гістонів. Унікальні особливості, пов'язані з послідовністю та / або структурою N- і С-кінцевих областей для різних HAT-сімей, можуть допомогти пояснити деякі спостережувані відмінності серед HATs в специфічності субстрату гістонів. Припускається, що зв'язування CoA розширює паз для зв'язування гістонів в центральному ядрі шляхом переміщення C-кінцевого сегмента Gcn5 назовні. Крім того, оскільки контакти між CoA і білком сприяють утворенню сприятливих контактів гістонового білка, ймовірно, що зв'язування CoA передує зв'язуванню гістонів in vivo.
Гени деяких ГАТ
- KAT2A - кодує GCN5. Розташований на довгому плечі 17-ї хромосоми, складається з 8 286 нуклеотидів. Продукт - GCN5 складається з 837 амінокислот і має молекулярну масу в 93,9 кДа
- KAT2B - кодує PCAF. Розташований на короткому плечі 3-ї хромосоми, складається з 114 382 нуклеотидів. Продукт - PCAF складається з 832 амінокислот і має молекулярну масу в 93 кДа
- HAT1 - кодує HAT1. Розташований на довгому плечі 2-ї хромосоми, складається з 61 262 нуклеотидів. Продукт - HAT1 складається з 419 амінокислот і має молекулярну масу в 49,5 кДа
- KAT6A - кодує MOZ. Розташований на короткому плечі 8-ї хромосоми, складається з 122 512 нуклеотидів. Продукт - MOZ складається з 2004 амінокислот і має молекулярну масу в 225 кДа
- NCOA1 - кодує SRC-1. Розташований на короткому плечі 2-ї хромосоми, складається з 278 789 нуклеотидів. Продукт - SRC-1 складається з 1441 амінокислот і має молекулярну масу в 156,8 кДа
Біологічна роль
Ремоделювання хроматину
Гістонові ацетилтрансферази виконують багато біологічних функцій всередині клітини. Хроматин є комбінацією білків і ДНК, що знаходяться в ядрі, і він зазнає багатьох структурних змін, оскільки відбуваються різні клітинні події, такі як реплікація ДНК, репарація ДНК і транскрипція. Хроматин в клітині можна знайти в двох станах: конденсованому і неконденсованому. Останній, відомий як еухроматин, є транскрипційно активним, тоді як перший, відомий як гетерохроматин, є транскрипційно неактивним. Гістони являють собою білкову частину хроматину. Існує п'ять різних гістонових білків: H1, H2A, H2B, H3 і H4. Гістонові ядра утворюються, коли по два кожного підтипу гістонів, за винятком H1, утворюють четвертинний комплекс. Цей октамерний комплекс, разом з 147 парами основ ДНК, згорнутою навколо нього, утворює нуклеосому. Гістон H1 скріплює комплекс нуклеосом, і він є останнім білком, який зв'язується з комплексом..
Гістони, як правило, є позитивно зарядженими білками з N-кінцевими хвостами, які виходять з кору. Фосфодіефірний остов ДНК є негативним, що дозволяє проводити сильні іонні взаємодії між білками гістонів і ДНК. Ацетилтрансферази гістонів переносять ацетильну групу до специфічних залишків лізину на гістонах, що нейтралізує їх позитивний заряд і таким чином зменшує сильні взаємодії між гістонами і ДНК. Вважається також, що ацетилювання викликає збурення взаємодій між окремими нуклеосомами і діє як сайти взаємодії для інших пов'язаних з ДНК білків.
Можуть бути різні рівні ацетилювання гістонів, а також інші типи модифікацій, що дозволяють клітині контролювати рівень упаковки хроматину під час різних клітинних подій, таких як реплікація, транскрипція, рекомбінація та репарація. Ацетилювання не є єдиною регуляторною посттрансляційної модифікацією гістонів, що визначає структуру хроматину; також існують процеси метилювання, фосфорилювання, ADP-рибозилювання та убіквітинування. Ці комбінації різних ковалентних модифікацій на N-кінцевих хвостах гістонів називаються гістоновим кодом, і вважається, що цей код може бути спадковим і збережений в наступній генерації клітин.
Гістонові білки H3 і H4 є головними мішенями ГАТ, але H2A і H2B також ацетильовані in vivo. Лізини 9, 14, 18 і 23 Н3 і лізинів 5, 8, 12 і 16 Н4 є орієнтованими на ацетилювання. Лізини 5, 12, 15 і 20 ацетилюються на Н2В, тоді як тільки лізини 5 і 9 виявляються ацетильованими на гістоні Н2А.
Експресія генів
Гістонові модифікації модулюють упаковку хроматину. Рівень упаковки ДНК важливий для транскрипції генів, оскільки доступ до промотору є важливим для того, щоб відбулася транскрипція. Нейтралізація заряджених залишків лізину ГАТ дозволяє модифікувати хроматин таким чином, щоб цей РНК-полімераза мала доступ до транскрибованого гена. Однак ацетилювання не завжди пов'язане з посиленою транскрипционной активністю. Наприклад, ацетилювання H4K12 пов'язано з конденсованим і транскрипційно неактивним хроматином. Крім того, деякі модифікації гістонів пов'язані як з підвищеною, так і з репресованою активністю, залежно від умов.
ГАТи діють як транскрипційні коактиватори або генні інгібітори і найчастіше зустрічаються у великих комплексах. Ці комплекси включають SAGA (Spt / Ada / Gcn5L ацетилтрансфераза), PCAF, ADA (транскрипційний адаптер), TFIID (фактор транскрипції II D), TFTC (TAF комплекс без TBF) і NuA3 / NuA4 (нуклеосомні ацетилтрансферази Н3 і H4). Ці комплекси модулюють специфічність ГАТ шляхом приведення ГАТ до своїх цільових генів, де вони потім можуть ацетилювати нуклеосомні гістони. Деякі ГАТ-транскрипційні ко-активатори містять бромодомени - 110-амінокислотний модуль, який розпізнає ацетильовані залишки лізину і функціонально пов'язаний з коактиваторами в регуляції транскрипції.
Див. також
Література
- Marmorstein R (August 2001). "Structure of histone acetyltransferases". Journal of Molecular Biology. 311 (3): 433–44. doi:10.1006/jmbi.2001.4859. PMID 11492997.
- Berger S.L. The complex language of chromatin regulation during transcription. Nature. 2007; 447: 407-412
- https://doi.org/10.1016/j.bbagrm.2011.07.006
- https://doi.org/10.1016/j.prp.2017.06.013
- Su J, Wang F, Cai Y, Jin J. The Functional Analysis of Histone Acetyltransferase MOF in Tumorigenesis. Int J Mol Sci. 2016;17(1):99. Published 2016 Jan 14. doi:10.3390/ijms17010099
- Lee KK, Workman JL (April 2007). "Histone acetyltransferase complexes: one size doesn't fit all". Nature Reviews. Molecular Cell Biology. 8 (4): 284–95. doi:10.1038/nrm2145. PMID 17380162.
Посилання
- https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=KAT6A&keywords=moz [ 10 січня 2019 у Wayback Machine.]
- https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=NCOA1&keywords=src-1 [ 10 січня 2019 у Wayback Machine.]
- https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=KAT2B&keywords=pcaf [ 10 січня 2019 у Wayback Machine.]
- https://www.genecards.org/Search/Keyword?queryString=pcaf [ 10 січня 2019 у Wayback Machine.]
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Cya stattya ye sirim perekladom z inshoyi movi Mozhlivo vona stvorena za dopomogoyu mashinnogo perekladu abo perekladachem yakij nedostatno volodiye oboma movami Bud laska dopomozhit polipshiti pereklad sichen 2019 U Vikipediyi ye statti pro inshi znachennya cogo termina Gistonovi acetiltransferazi Histone acetyltransferases HATs fermenti sho acetilyuyut lizinovi zalishki na gistonah DNK obmotana navkolo gistoniv tomu perenesennya acetilnih grup na gistoni mozhe vimikati chi vmikati pevni geni Acetilyuvannya gistoniv perevazhno pidvishuye ekspresiyu genu Takij mehanizm zmini ekspresiyi geniv ye epigenetichnim Histone acetyltransferaseGCN5 histone acetyltransferase domain homo24 mer HumanIdentifikatoriKod KF2 3 1 48Nomer CAS9054 51 7Bazi fermentivIntEnzIntEnz viewBRENDABRENDA entryExPASyNiceZyme viewMetaCycmetabolic pathwayKEGGKEGG entryPRIAMprofilePDB structuresRCSB PDB PDBe PDBj PDBsumGene OntologyAmiGO EGOPoshukPMCstattiPubMedstattiNCBINCBI proteinsCAS9054 51 7 Acetilyuvannya gistoniv pov yazane z aktivaciyeyu transkripciyi i asocijovane z euhromatinom Na euhromatini sho ye mensh kompaktnim za geterohromatin mozhe vidbuvatis transkripciya za rahunok menshoyi shilnosti Spershu vvazhali sho acetilyuvannya gistoniv nivelyuye yih pozitivnij zaryad takim chinom zmenshuyuchi sporidnenist do DNK Ale suchasni doslidzhennya pokazuyut sho acetilyuvannya stvoryuye sajti dlya bilok bilkovih vzayemodij Gistonovi acetiltransferazi mozhut acetilyuvati ne tilki gistoni a she napriklad deyaki yaderni receptori ta inshi transkripcijni faktori Rodini GATGistonovi acetiltransferazi GAT tradicijno podilyayut na dva klasi na osnovi subklitinnoyi lokalizaciyi GAT A tipu roztashovani v yadri i zalucheni v regulyaciyu gennoyi ekspresiyi shlyahom acetilyuvannya nukleosomnih gistoniv v hromatini Voni mistyat bromodomen yakij dopomagaye yim zv yazuvatis z gistonami Gcn5 p300 CBP i TAFII250 prikladi GAT A tipu GAT V tipu roztashovani v citoplazmi ta vidpovidalni za acetilyuvannya shojnosintezovanih gistoniv do yih asociaciyi v nukleosomi Gcn5 sporidneni N acetiltransferazi GNATs GATi mozhna zgrupuvati v dekilka riznih rodin spirayuchis na gomologiyu poslidovnostej strukturni osoblivosti ta funkciyi Gcn5 sporidneni N acetiltransferazi harakterizuyutsya nayavnistyu bromodomenu voni acetilyuyut lizini na gistonah N2V N3 ta N4 Vsi bilki ciyeyi rodini mayut chotiri konservativni motivi A D v katalitichnomu domeni Krim katalitichnogo fermenti ciyeyi rodini mayut she N kincevij domen Ada2 domen ta C kincevij bromodomen MYST Rodina MYST nazvana po pershim bukvam chotiroh yiyi chleniv MOZ Ybf2 Sas3 Sas2 i Tip60 Dlya fermentiv danoyi rodini harakterna nayavnist cinkovih palciv ta hromodomenu voni acetilyuyut gistoni N2A N3 ta N4 MOZ monocytic leukemia zinc finger protein viyavlyaye onkogenni vlastivosti u lyudej Inshi Krim poperednih rodin gistonovih acetiltransferaz ye kilka inshih fermentiv sho znajdeni u vishih eukariotiv Do nih nalezhat p300 CBP koaktivator yadernih receptoriv e g ACTR SRC 1 TAFII250 TFIIIC Rtt109 ta CLOCK p300 CBP maye kilka regioniv z cinkovimi palcyami ta bromodomen i kilkoma visokokonservativnimi domenami shozhij na GNATs funkcionuye yak aktivator transkripciyi Koaktivatori yadernih receptoriv Tri vazhlivih koaktivatori yadernih receptoriv SRC 1 ACTR ta TIF 2 SRC 1 steroid receptor coactivator 1 mozhe vzayemodiyati z p300 CBP ta PCAF acetiltransferaznij domen roztashovanij v S kincevomu regioni Tablicya pidumovuye riznicyu mizh fermentami ekspresiyu v riznih organizmah ta strukturni osoblivosti Rodina Organizm Asocijovani kompleksi Substratna specifichnist Strukturni osoblivosti GNAT Gcn5 S cerevisiae SAGA SLIK SALSA ADA HAT A2 H2B H3 H4 Bromodomain GCN5 D melanogaster SAGA ATAC H3 H4 Bromodomain GCN5 H sapiens STAGA TFTC H3 H4 H2B Bromodomain PCAF H sapiens PCAF H3 H4 Bromodomain Hat1 S cerevisiae H sapiens HAT B NuB4 HAT A3 H4 H2A Elp3 S cerevisiae Elongator H3 H4 H2A H2B Hpa2 S cerevisiae HAT B H3 H4 Hpa3 S cerevisiae H3 H4 ATF 2 S cerevisiae H sapiens H2B H4 Nut1 S cerevisiae Mediator H3 H4 MYST Esa1 S cerevisiae NuA4 piccolo NuA4 H2A H4 H2B H3 Chromodomain Sas2 S cerevisiae SAS NuA4 H4 H2A H3 Sas3 Ybf2 S cerevisiae NuA3 H3 H4 H2A Tip60 H sapiens Tip60 NuA4 H2A H4 H3 Chromodomain MOF D melanogaster MSL H4 H2A H3 Chromodomain MOZ H sapiens MSL H3 H4 MORF H sapiens MSL H3 H4 HBO1 H sapiens ORC H3 H4 p300 CBP p300 H sapiens H2A H2B H3 H4 Bromodomain CBP H sapiens H2A H2B H3 H4 Bromodomain SRC nuclear receptor coactivators SRC 1 H sapiens ACTR SRC 1 H3 H4 ACTR RAC3 AIB1 TRAM 1 H sapiens ACTR SRC 1 H3 H4 TIF 2 GRIP1 H sapiens H3 H4 SRC 3 H sapiens Other TAFII250 TAF1 S cerevisiae H sapiens TFIID H3 H4 H2A Bromodomain TFIIIC p220 p110 p90 H sapiens TFIIIC H2A H3 H4 Rtt109 S cerevisiae Histone chaperones H3 CLOCK H sapiens H3 H4Zagalna strukturaKristalichna struktura GCN5 z KoA i N3 gistonom Centralnij kor zelenij bichni N ta C terminalni segmenti sini KoA oranzhevij i gistonovij bilok chervonij V zagalnomu GATi harakterizuyutsya strukturno konservativnim korovim regionom yakij utvoryuyut 3 beta skladki pislya yakih roztashovana dovga alfa spiral povernuta odnim bokom do beta regionu Osnovna oblast yaka vidpovidaye motivam A B i D bilkiv GNAT flankuyetsya na protilezhnih storonah N i C kincevimi a b segmentami yaki ye strukturno unikalnimi dlya danoyi rodini GAT Centralne yadro i bichni segmenti razom utvoryuyut shilinu nad pershim de substrati gistoniv mozhut zv yazuvatisya pered katalizom U toj chas yak domen centralnogo yadra motiv A v GNATs bere uchast v zv yazuvanni acetil CoA i katalizi N i C kincevi segmenti dopomagayut u zv yazuvanni substrativ gistoniv Unikalni osoblivosti pov yazani z poslidovnistyu ta abo strukturoyu N i S kincevih oblastej dlya riznih HAT simej mozhut dopomogti poyasniti deyaki sposterezhuvani vidminnosti sered HATs v specifichnosti substratu gistoniv Pripuskayetsya sho zv yazuvannya CoA rozshiryuye paz dlya zv yazuvannya gistoniv v centralnomu yadri shlyahom peremishennya C kincevogo segmenta Gcn5 nazovni Krim togo oskilki kontakti mizh CoA i bilkom spriyayut utvorennyu spriyatlivih kontaktiv gistonovogo bilka jmovirno sho zv yazuvannya CoA pereduye zv yazuvannyu gistoniv in vivo Geni deyakih GATKAT2A koduye GCN5 Roztashovanij na dovgomu plechi 17 yi hromosomi skladayetsya z 8 286 nukleotidiv Produkt GCN5 skladayetsya z 837 aminokislot i maye molekulyarnu masu v 93 9 kDa KAT2B koduye PCAF Roztashovanij na korotkomu plechi 3 yi hromosomi skladayetsya z 114 382 nukleotidiv Produkt PCAF skladayetsya z 832 aminokislot i maye molekulyarnu masu v 93 kDa HAT1 koduye HAT1 Roztashovanij na dovgomu plechi 2 yi hromosomi skladayetsya z 61 262 nukleotidiv Produkt HAT1 skladayetsya z 419 aminokislot i maye molekulyarnu masu v 49 5 kDa KAT6A koduye MOZ Roztashovanij na korotkomu plechi 8 yi hromosomi skladayetsya z 122 512 nukleotidiv Produkt MOZ skladayetsya z 2004 aminokislot i maye molekulyarnu masu v 225 kDa NCOA1 koduye SRC 1 Roztashovanij na korotkomu plechi 2 yi hromosomi skladayetsya z 278 789 nukleotidiv Produkt SRC 1 skladayetsya z 1441 aminokislot i maye molekulyarnu masu v 156 8 kDaBiologichna rolRemodelyuvannya hromatinu Gistonovi acetiltransferazi vikonuyut bagato biologichnih funkcij vseredini klitini Hromatin ye kombinaciyeyu bilkiv i DNK sho znahodyatsya v yadri i vin zaznaye bagatoh strukturnih zmin oskilki vidbuvayutsya rizni klitinni podiyi taki yak replikaciya DNK reparaciya DNK i transkripciya Hromatin v klitini mozhna znajti v dvoh stanah kondensovanomu i nekondensovanomu Ostannij vidomij yak euhromatin ye transkripcijno aktivnim todi yak pershij vidomij yak geterohromatin ye transkripcijno neaktivnim Gistoni yavlyayut soboyu bilkovu chastinu hromatinu Isnuye p yat riznih gistonovih bilkiv H1 H2A H2B H3 i H4 Gistonovi yadra utvoryuyutsya koli po dva kozhnogo pidtipu gistoniv za vinyatkom H1 utvoryuyut chetvertinnij kompleks Cej oktamernij kompleks razom z 147 parami osnov DNK zgornutoyu navkolo nogo utvoryuye nukleosomu Giston H1 skriplyuye kompleks nukleosom i vin ye ostannim bilkom yakij zv yazuyetsya z kompleksom Gistoni yak pravilo ye pozitivno zaryadzhenimi bilkami z N kincevimi hvostami yaki vihodyat z koru Fosfodiefirnij ostov DNK ye negativnim sho dozvolyaye provoditi silni ionni vzayemodiyi mizh bilkami gistoniv i DNK Acetiltransferazi gistoniv perenosyat acetilnu grupu do specifichnih zalishkiv lizinu na gistonah sho nejtralizuye yih pozitivnij zaryad i takim chinom zmenshuye silni vzayemodiyi mizh gistonami i DNK Vvazhayetsya takozh sho acetilyuvannya viklikaye zburennya vzayemodij mizh okremimi nukleosomami i diye yak sajti vzayemodiyi dlya inshih pov yazanih z DNK bilkiv Mozhut buti rizni rivni acetilyuvannya gistoniv a takozh inshi tipi modifikacij sho dozvolyayut klitini kontrolyuvati riven upakovki hromatinu pid chas riznih klitinnih podij takih yak replikaciya transkripciya rekombinaciya ta reparaciya Acetilyuvannya ne ye yedinoyu regulyatornoyu posttranslyacijnoyi modifikaciyeyu gistoniv sho viznachaye strukturu hromatinu takozh isnuyut procesi metilyuvannya fosforilyuvannya ADP ribozilyuvannya ta ubikvitinuvannya Ci kombinaciyi riznih kovalentnih modifikacij na N kincevih hvostah gistoniv nazivayutsya gistonovim kodom i vvazhayetsya sho cej kod mozhe buti spadkovim i zberezhenij v nastupnij generaciyi klitin Gistonovi bilki H3 i H4 ye golovnimi mishenyami GAT ale H2A i H2B takozh acetilovani in vivo Lizini 9 14 18 i 23 N3 i liziniv 5 8 12 i 16 N4 ye oriyentovanimi na acetilyuvannya Lizini 5 12 15 i 20 acetilyuyutsya na N2V todi yak tilki lizini 5 i 9 viyavlyayutsya acetilovanimi na gistoni N2A Ekspresiya geniv Shematichna rol GAT v transkripciyi Gistonovi modifikaciyi modulyuyut upakovku hromatinu Riven upakovki DNK vazhlivij dlya transkripciyi geniv oskilki dostup do promotoru ye vazhlivim dlya togo shob vidbulasya transkripciya Nejtralizaciya zaryadzhenih zalishkiv lizinu GAT dozvolyaye modifikuvati hromatin takim chinom shob cej RNK polimeraza mala dostup do transkribovanogo gena Odnak acetilyuvannya ne zavzhdi pov yazane z posilenoyu transkripcionnoj aktivnistyu Napriklad acetilyuvannya H4K12 pov yazano z kondensovanim i transkripcijno neaktivnim hromatinom Krim togo deyaki modifikaciyi gistoniv pov yazani yak z pidvishenoyu tak i z represovanoyu aktivnistyu zalezhno vid umov GATi diyut yak transkripcijni koaktivatori abo genni ingibitori i najchastishe zustrichayutsya u velikih kompleksah Ci kompleksi vklyuchayut SAGA Spt Ada Gcn5L acetiltransferaza PCAF ADA transkripcijnij adapter TFIID faktor transkripciyi II D TFTC TAF kompleks bez TBF i NuA3 NuA4 nukleosomni acetiltransferazi N3 i H4 Ci kompleksi modulyuyut specifichnist GAT shlyahom privedennya GAT do svoyih cilovih geniv de voni potim mozhut acetilyuvati nukleosomni gistoni Deyaki GAT transkripcijni ko aktivatori mistyat bromodomeni 110 aminokislotnij modul yakij rozpiznaye acetilovani zalishki lizinu i funkcionalno pov yazanij z koaktivatorami v regulyaciyi transkripciyi Div takozhhromatin gistoni DNK gen transferazaLiteraturaMarmorstein R August 2001 Structure of histone acetyltransferases Journal of Molecular Biology 311 3 433 44 doi 10 1006 jmbi 2001 4859 PMID 11492997 Berger S L The complex language of chromatin regulation during transcription Nature 2007 447 407 412 https doi org 10 1016 j bbagrm 2011 07 006 https doi org 10 1016 j prp 2017 06 013 Su J Wang F Cai Y Jin J The Functional Analysis of Histone Acetyltransferase MOF in Tumorigenesis Int J Mol Sci 2016 17 1 99 Published 2016 Jan 14 doi 10 3390 ijms17010099 Lee KK Workman JL April 2007 Histone acetyltransferase complexes one size doesn t fit all Nature Reviews Molecular Cell Biology 8 4 284 95 doi 10 1038 nrm2145 PMID 17380162 Posilannyahttps www genecards org cgi bin carddisp pl gene KAT6A amp keywords moz 10 sichnya 2019 u Wayback Machine https www genecards org cgi bin carddisp pl gene NCOA1 amp keywords src 1 10 sichnya 2019 u Wayback Machine https www genecards org cgi bin carddisp pl gene KAT2B amp keywords pcaf 10 sichnya 2019 u Wayback Machine https www genecards org Search Keyword queryString pcaf 10 sichnya 2019 u Wayback Machine Zhou Dao Xiu Wei Wei Shen Yuan 1 zhovtnya 2015 Histone Acetylation Enzymes Coordinate Metabolism and Gene Expression Trends in Plant Science English T 20 10 s 614 621 doi 10 1016 j tplants 2015 07 005 ISSN 1360 1385 PMID 26440431 Procitovano 10 sichnya 2019