Однонуклеотидний поліморфізм (англ. Single nucleotide polymorphism, SNP) — гетерогенність первинної структури ДНК, що виявляється в однонуклеотидних (точкових) відмінностях алелей і трапляється відносно часто у популяції (за порогове значення частоти зазвичай приймають 1%). Наприклад, дві послідовності ДНК різних людей — AAGCCTA і AAGCTTA — відрізняються на один нуклеотид. У такому разі говорять про існування двох алелей: C і T.
SNP використовуються як молекулярно-генетичні маркери (разом з ПДРФ (RFLP) і ПДАФ (AFLP)).
Вивчення SNP широко використовується в молекулярній систематиці — побудові біологічної систематики на основі дивергенції гомологічних ділянок ДНК у філогенезі. У даній області найчастіше використовуються спейсери генів рибосомної РНК. З огляду на те, що мутації в даних спейсерах не позначаються на структурі кінцевих продуктів гену (теоретично вони не впливають на життєздатність), в першому наближенні зазвичай постулюється пряма залежність між ступенем поліморфізму і відстанню філогенезу між організмами.
Напрямки застосування
Різноманітністю послідовностей ДНК у людей, можливо, пояснюється характер проходження різних захворювань, реакції у відповідь на патогени, прийом ліків, вакцин і т. ін. Величезне значення SNPs в біомедичних дослідженнях полягає в тому, що їх використовують для порівняння ділянок геному між досліджуваними групами (наприклад, одна група — люди з певним захворюванням, а друга — без нього).
Валері Ху у своєму дослідженні класифікувала аутичних дітей за підгрупами на основі їхніх [en], і в результаті виявила однонуклеотидні поліморфізми, які, за її словами, можуть дозволити діагностувати аутизм з точністю понад 98 %.
Примітки
- Nachman, Michael W. (2001). Single nucleotide polymorphisms and recombination rate in humans. Trends in genetics. 17 (9): 481—485. doi:10.1016/S0168-9525(01)02409-X. PMID 11525814.
- SNP. Scitable. Nature Publishing Group.
- Carlson et al. (2008). «SNPs — A Shortcut to Personalized Medicine». Genetic Engineering & Biotechnology News
- Hamel, Brant (2011-12). . . Архів оригіналу за 5 березня 2016. Процитовано 29 жовтня 2013.
- Hu, V. W.; Addington, A.; Hyman, A. Novel Autism Subtype-Dependent Genetic Variants Are Revealed by Quantitative Trait and Subphenotype Association Analyses of Published GWAS Data / Kashanchi, Fatah // PLOS One : journal. — 2011. — Vol. 6, no. 4 (7 July). — P. e19067. — DOI: . — PMID 21556359 .
Посилання
Це незавершена стаття з молекулярної біології. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Це незавершена стаття з генетики. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Odnonukleotidnij polimorfizm angl Single nucleotide polymorphism SNP geterogennist pervinnoyi strukturi DNK sho viyavlyayetsya v odnonukleotidnih tochkovih vidminnostyah alelej i traplyayetsya vidnosno chasto u populyaciyi za porogove znachennya chastoti zazvichaj prijmayut 1 Napriklad dvi poslidovnosti DNK riznih lyudej AAGCCTA i AAGCTTA vidriznyayutsya na odin nukleotid U takomu razi govoryat pro isnuvannya dvoh alelej C i T U Vikipediyi ye statti pro inshi znachennya cogo termina Polimorfizm SNP vikoristovuyutsya yak molekulyarno genetichni markeri razom z PDRF RFLP i PDAF AFLP Vivchennya SNP shiroko vikoristovuyetsya v molekulyarnij sistematici pobudovi biologichnoyi sistematiki na osnovi divergenciyi gomologichnih dilyanok DNK u filogenezi U danij oblasti najchastishe vikoristovuyutsya spejseri geniv ribosomnoyi RNK Z oglyadu na te sho mutaciyi v danih spejserah ne poznachayutsya na strukturi kincevih produktiv genu teoretichno voni ne vplivayut na zhittyezdatnist v pershomu nablizhenni zazvichaj postulyuyetsya pryama zalezhnist mizh stupenem polimorfizmu i vidstannyu filogenezu mizh organizmami Napryamki zastosuvannyaRiznomanitnistyu poslidovnostej DNK u lyudej mozhlivo poyasnyuyetsya harakter prohodzhennya riznih zahvoryuvan reakciyi u vidpovid na patogeni prijom likiv vakcin i t in Velichezne znachennya SNPs v biomedichnih doslidzhennyah polyagaye v tomu sho yih vikoristovuyut dlya porivnyannya dilyanok genomu mizh doslidzhuvanimi grupami napriklad odna grupa lyudi z pevnim zahvoryuvannyam a druga bez nogo Valeri Hu u svoyemu doslidzhenni klasifikuvala autichnih ditej za pidgrupami na osnovi yihnih en i v rezultati viyavila odnonukleotidni polimorfizmi yaki za yiyi slovami mozhut dozvoliti diagnostuvati autizm z tochnistyu ponad 98 PrimitkiNachman Michael W 2001 Single nucleotide polymorphisms and recombination rate in humans Trends in genetics 17 9 481 485 doi 10 1016 S0168 9525 01 02409 X PMID 11525814 SNP Scitable Nature Publishing Group Carlson et al 2008 SNPs A Shortcut to Personalized Medicine Genetic Engineering amp Biotechnology News Hamel Brant 2011 12 Arhiv originalu za 5 bereznya 2016 Procitovano 29 zhovtnya 2013 Hu V W Addington A Hyman A Novel Autism Subtype Dependent Genetic Variants Are Revealed by Quantitative Trait and Subphenotype Association Analyses of Published GWAS Data Kashanchi Fatah PLOS One journal 2011 Vol 6 no 4 7 July P e19067 DOI 10 1371 journal pone 0019067 PMID 21556359 PosilannyaCe nezavershena stattya z molekulyarnoyi biologiyi Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Ce nezavershena stattya z genetiki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi