Протеоміка (англ. proteomics, протеомікс) — наука про протеом, що вивчає протеїни (білки) в цілому та їх структуру і функції зокрема. Протеїни є однією з важливих складових живих організмів, оскільки вони є головними складовими фізіологічних шляхів метаболізму клітини.
Історія
Термін протеоміка (англ. proteomics) був вперше застосований в 1997 по анології з геномікою (англ. genomics), наукою, що вивчає гени. Слово протеом (англ. proteome) походить від «протеїн» та «геном», та було запропоновано генетиком Marc Wilkins в 1994 році, під час його роботи над протеїнами та геномом, яку він виконував як PhD-студент (докторант). Інтегративне й комплексне дослідження всіх омік називається мультиоміка.
Загальна характеристика
Після геноміки і транскриптомікі, протеоміка — наступний крок у вивченні біологічних систем. Основне завдання протеоміки полягає в ідентифікації нових білків і їх кількісному аналізі. Протеом — це сукупність всіх протеїнів та їх модифікацій, що складають протеїновий набір, утворений в результаті діяльності певної біологічної системи. Протеом біологічних систем варіює в часі та під впливом різноманітних факторів, наприклад, стресу, впливу якого може зазнавати як окремі клітини так і весь організм. Протеоміка — це міждисциплінарна наука, що виникла як результат науково-дослідного пошуку в рамках Проекту Геному Людини (англ. Human Genome Project). Крім того, протеоміка — це галузь наукових досліджень протеому, що стрімко розвивається, та важливий компонент функціональної геноміки.
Незважаючи на те, що протеоміка часто асоціюється з маштабним експериментальним аналізом протеїнів, ця галузь також застосовується для очищення протеїнів та мас-спектрометрії.
Див. також
Додаткова література
Книги
- Srivastava Sanjeeva (2023). From Proteins to Proteomics. Boca Raton: CRC Press. ISBN .
- Ali Shafat; Majid Sabhiya; Rehman Muneeb U. (2023). Proteomics: A Promising Approach for Cancer Research. Elsevier. ISBN .
- Donev Rossen; Karabencheva-Christova Tatyana (2021). Proteomics and systems biology. Advances in protein chemistry and structural biology (1st edition). Academic Press. ISBN .
- Comai Lucio; Katz Jonathan E.; Mallick Parag (2017). Proteomics: methods and protocols. Methods in molecular biology. New York, NY: Humana Press. ISBN .
Журнали
- Molecular and Cellular Proteomics (Elsevier)
- Proteomics (Wiley-Blackwell)
- Journal of Proteome Research (American Chemical Society)
- Proteome Science (BioMed Central)
- Proteomes (MDPI)
- Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics (Elsevier)
- Journal of Proteomics (Elsevier)
- Expert Review of Proteomics ()
- Genomics, Proteomics and Bioinformatics
- Cancer Genomics and Proteomics
- Proteomics - Clinical Applications (Wiley-Blackwell)
- Clinical Proteomics (BioMed Central, )
Статті
- Cui Miao; Cheng Chao; Zhang Lanjing (2022-11). High-throughput proteomics: a methodological mini-review. Laboratory Investigation (англ.) 102 (11). doi:10.1038/s41374-022-00830-7.
- Dupree Emmalyn J.; Jayathirtha Madhuri; Yorkey Hannah; Mihasan та ін. (2020-09). A Critical Review of Bottom-Up Proteomics: The Good, the Bad, and the Future of This Field. Proteomes (англ.) 8 (3). doi:10.3390/proteomes8030014.
- Specht Harrison; Slavov Nikolai (3 серпня 2018). Transformative Opportunities for Single-Cell Proteomics. Journal of Proteome Research (англ.) 17 (8). doi:10.1021/acs.jproteome.8b00257.
Примітки
- Anderson NL, Anderson NG (1998). Proteome and proteomics: new technologies, new concepts, and new words. Electrophoresis. 19 (11): 1853—61. doi:10.1002/elps.1150191103. PMID 9740045.
- Blackstock WP, Weir MP (1999). Proteomics: quantitative and physical mapping of cellular proteins. Trends Biotechnol. 17 (3): 121—7. doi:10.1016/S0167-7799(98)01245-1. PMID 10189717.
- P. James (1997). Protein identification in the post-genome era: the rapid rise of proteomics. Quarterly reviews of biophysics. 30 (4): 279—331. doi:10.1017/S0033583597003399. PMID 9634650.
- Marc R. Wilkins, Christian Pasquali, Ron D. Appel, Keli Ou, Olivier Golaz, Jean-Charles Sanchez, Jun X. Yan, Andrew. A. Gooley, Graham Hughes, Ian Humphery-Smith, Keith L. Williams & Denis F. Hochstrasser (1996). From Proteins to Proteomes: Large Scale Protein Identification by Two-Dimensional Electrophoresis and Arnino Acid Analysis. Nature Biotechnology. 14 (1): 61—65. doi:10.1038/nbt0196-61. PMID 9636313.
- . Архів оригіналу за 12 лютого 2009. Процитовано 23 грудня 2012.
Це незавершена стаття з хімії. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Proteomika angl proteomics proteomiks nauka pro proteom sho vivchaye proteyini bilki v cilomu ta yih strukturu i funkciyi zokrema Proteyini ye odniyeyu z vazhlivih skladovih zhivih organizmiv oskilki voni ye golovnimi skladovimi fiziologichnih shlyahiv metabolizmu klitini Proteom identifikovanij pri zastosuvannya gelevogo elektroforezu v 2D geliIstoriyaTermin proteomika angl proteomics buv vpershe zastosovanij v 1997 po anologiyi z genomikoyu angl genomics naukoyu sho vivchaye geni Slovo proteom angl proteome pohodit vid proteyin ta genom ta bulo zaproponovano genetikom Marc Wilkins v 1994 roci pid chas jogo roboti nad proteyinami ta genomom yaku vin vikonuvav yak PhD student doktorant Integrativne j kompleksne doslidzhennya vsih omik nazivayetsya multiomika Zagalna harakteristikaPislya genomiki i transkriptomiki proteomika nastupnij krok u vivchenni biologichnih sistem Osnovne zavdannya proteomiki polyagaye v identifikaciyi novih bilkiv i yih kilkisnomu analizi Proteom ce sukupnist vsih proteyiniv ta yih modifikacij sho skladayut proteyinovij nabir utvorenij v rezultati diyalnosti pevnoyi biologichnoyi sistemi Proteom biologichnih sistem variyuye v chasi ta pid vplivom riznomanitnih faktoriv napriklad stresu vplivu yakogo mozhe zaznavati yak okremi klitini tak i ves organizm Proteomika ce mizhdisciplinarna nauka sho vinikla yak rezultat naukovo doslidnogo poshuku v ramkah Proektu Genomu Lyudini angl Human Genome Project Krim togo proteomika ce galuz naukovih doslidzhen proteomu sho strimko rozvivayetsya ta vazhlivij komponent funkcionalnoyi genomiki Nezvazhayuchi na te sho proteomika chasto asociyuyetsya z mashtabnim eksperimentalnim analizom proteyiniv cya galuz takozh zastosovuyetsya dlya ochishennya proteyiniv ta mas spektrometriyi Div takozhMultiomika OmikiDodatkova literaturaKnigi Srivastava Sanjeeva 2023 From Proteins to Proteomics Boca Raton CRC Press ISBN 978 1 003 09864 5 Ali Shafat Majid Sabhiya Rehman Muneeb U 2023 Proteomics A Promising Approach for Cancer Research Elsevier ISBN 978 0 323 95072 5 Donev Rossen Karabencheva Christova Tatyana 2021 Proteomics and systems biology Advances in protein chemistry and structural biology 1st edition Academic Press ISBN 978 0 323 85319 4 Comai Lucio Katz Jonathan E Mallick Parag 2017 Proteomics methods and protocols Methods in molecular biology New York NY Humana Press ISBN 978 1 4939 6745 2 Zhurnali Molecular and Cellular Proteomics Elsevier Proteomics Wiley Blackwell Journal of Proteome Research American Chemical Society Proteome Science BioMed Central Proteomes MDPI Biochimica et Biophysica Acta Proteins and Proteomics Elsevier Journal of Proteomics Elsevier Expert Review of Proteomics Taylor amp Francis Genomics Proteomics and Bioinformatics Cancer Genomics and Proteomics Proteomics Clinical Applications Wiley Blackwell Clinical Proteomics BioMed Central Springer Statti Cui Miao Cheng Chao Zhang Lanjing 2022 11 High throughput proteomics a methodological mini review Laboratory Investigation angl 102 11 doi 10 1038 s41374 022 00830 7 Dupree Emmalyn J Jayathirtha Madhuri Yorkey Hannah Mihasan ta in 2020 09 A Critical Review of Bottom Up Proteomics The Good the Bad and the Future of This Field Proteomes angl 8 3 doi 10 3390 proteomes8030014 Specht Harrison Slavov Nikolai 3 serpnya 2018 Transformative Opportunities for Single Cell Proteomics Journal of Proteome Research angl 17 8 doi 10 1021 acs jproteome 8b00257 PrimitkiAnderson NL Anderson NG 1998 Proteome and proteomics new technologies new concepts and new words Electrophoresis 19 11 1853 61 doi 10 1002 elps 1150191103 PMID 9740045 Blackstock WP Weir MP 1999 Proteomics quantitative and physical mapping of cellular proteins Trends Biotechnol 17 3 121 7 doi 10 1016 S0167 7799 98 01245 1 PMID 10189717 P James 1997 Protein identification in the post genome era the rapid rise of proteomics Quarterly reviews of biophysics 30 4 279 331 doi 10 1017 S0033583597003399 PMID 9634650 Marc R Wilkins Christian Pasquali Ron D Appel Keli Ou Olivier Golaz Jean Charles Sanchez Jun X Yan Andrew A Gooley Graham Hughes Ian Humphery Smith Keith L Williams amp Denis F Hochstrasser 1996 From Proteins to Proteomes Large Scale Protein Identification by Two Dimensional Electrophoresis and Arnino Acid Analysis Nature Biotechnology 14 1 61 65 doi 10 1038 nbt0196 61 PMID 9636313 Arhiv originalu za 12 lyutogo 2009 Procitovano 23 grudnya 2012 Ce nezavershena stattya z himiyi Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi