Ізопропіл-β-D-1-тіогалактопіранозид (ІПТГ, IPTG) — хімічна сполука, широко вживана у молекулярній біології. Ця сполука є молекулярним міміком алолактози, метаболіту лактози, який запускає транскрипцію з лактозного оперону. Через це IPTG застосовується для контрольованої індукції експресії з генів, що знаходяться під контролем lac оператору.
Ізопропіл-β-D-1-тіогалактопіранозид | |
---|---|
Ідентифікатори | |
Абревіатури | ІПТГ, IPTG |
Номер CAS | 367-93-1 |
PubChem | 656894 |
Номер EINECS | 206-703-0 |
DrugBank | DB01862 |
Назва MeSH | D02.886.740.600.500, D09.408.320.820.500 і D09.408.903.600.500 |
ChEBI | 61448 |
SMILES | CC(C)S[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O1)CO)O)O)O |
InChI | InChI=1S/C9H18O5S/c1-4(2)15-9-8(13)7(12)6(11)5(3-10)14-9/h4-13H,3H2,1-2H3/t5-,6+,7+,8-,9+/m1/s1 |
Номер Бельштейна | 4631 |
Властивості | |
Молекулярна формула | C9H18O5S |
Молярна маса | 238,3 г/моль |
Якщо не зазначено інше, дані наведено для речовин у стандартному стані (за 25 °C, 100 кПа) | |
Примітки картки |
На відміну від алолактози, IPTG не гідролізує під впливом β-галактозидази, того його концентрація в середовищі не змінюється після активації лактозного оператору і залишається сталою. Для індукції, стерильний 1 M розчин IPTG додається до середовища з 1:1000 розведенням під час логарифмічної фази росту бактеріальної культури.
Механізм дії
Так само як і алолактоза, IPTG зв*язується з lac репресором та спричиняє його дисоціацію з лактозного оператора за алостеричним механізмом. Таким чином IPTG робить можливою транскрипцію генів лактозного оперону, таких як ген бета-галактозидази, гідролітичного ензиму який каталізує гідроліз β-галактозидів до мономерних цукрів. На відміну від алолактози, IPTG є S-глікозидом, які є хімічно стійкими в біологічному середовищі; таким чином IPTG не може гідролізуватись після активації лактозного оператора і концентрація активатора залишається сталою.
Поглинання IPTG кишечною паличкою E. coli може відбуватись незалежно від лактозної пермеази. При низьких концентраціях, IPTG проникає до клітини за участю пермеази, але за високих концентрацій (які зазвичай використовуються для індукції), IPTG проникає у клітини іншими шляхами.
Лабораторне застосування
IPTG це ефективний індуктор експресії білків з lac-залежних промоторів в бактеріальній культурі при концентраціях від 100 μM до 1.0 mM. Концентрація залежить від потрібної сили індукції, а також від типу клітин і плазмід що використовуються. Якщо використовується мутант lacIq, який перепродукує lac-репресор, можуть бути потрібні вищі концентрації IPTG.
В синьо-білому скринінгу IPTG застосовується разом з X-gal. дозволяє ідентифікувати колонії що несуть рекомбінантну плазміду на фоні тих що експресують нерекомбінантну версію плазміди.
Див. також
Посилання
- Hansen LH, Knudsen S, Sørensen SJ (June 1998). «The effect of the lacY gene on the induction of IPTG inducible promoters, studied in Escherichia coli and Pseudomonas fluorescens». Curr. Microbiol. 36 (6): 341–7. doi:10.1007/s002849900320. PMID 9608745.
- Marbach A, Bettenbrock K. (2012). «lac operon induction in Escherichia coli: Systematic comparison of IPTG and TMG induction and influence of the transacetylase LacA». Journal of Biotechnology 157 (1): 82–8. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.10.009. PMID 22079752.
- BL21(DE3) Competent Cells, BL21 (DE3)pLysS Competent Cells, and BL21 Competent Cells Instruction Manual (Revision #066004e ed.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Izopropil b D 1 tiogalaktopiranozid IPTG IPTG himichna spoluka shiroko vzhivana u molekulyarnij biologiyi Cya spoluka ye molekulyarnim mimikom alolaktozi metabolitu laktozi yakij zapuskaye transkripciyu z laktoznogo operonu Cherez ce IPTG zastosovuyetsya dlya kontrolovanoyi indukciyi ekspresiyi z geniv sho znahodyatsya pid kontrolem lac operatoru Izopropil b D 1 tiogalaktopiranozid Identifikatori Abreviaturi IPTG IPTGNomer CAS 367 93 1PubChem 656894Nomer EINECS 206 703 0DrugBank DB01862Nazva MeSH D02 886 740 600 500 D09 408 320 820 500 i D09 408 903 600 500ChEBI 61448SMILES CC C S C H 1 C H C H C H C H O1 CO O O OInChI InChI 1S C9H18O5S c1 4 2 15 9 8 13 7 12 6 11 5 3 10 14 9 h4 13H 3H2 1 2H3 t5 6 7 8 9 m1 s1Nomer Belshtejna 4631 Vlastivosti Molekulyarna formula C9H18O5S Molyarna masa 238 3 g mol Yaksho ne zaznacheno inshe dani navedeno dlya rechovin u standartnomu stani za 25 C 100 kPa Instrukciya z vikoristannya shablonu Primitki kartki Na vidminu vid alolaktozi IPTG ne gidrolizuye pid vplivom b galaktozidazi togo jogo koncentraciya v seredovishi ne zminyuyetsya pislya aktivaciyi laktoznogo operatoru i zalishayetsya staloyu Dlya indukciyi sterilnij 1 M rozchin IPTG dodayetsya do seredovisha z 1 1000 rozvedennyam pid chas logarifmichnoyi fazi rostu bakterialnoyi kulturi Mehanizm diyiTak samo yak i alolaktoza IPTG zv yazuyetsya z lac represorom ta sprichinyaye jogo disociaciyu z laktoznogo operatora za alosterichnim mehanizmom Takim chinom IPTG robit mozhlivoyu transkripciyu geniv laktoznogo operonu takih yak gen beta galaktozidazi gidrolitichnogo enzimu yakij katalizuye gidroliz b galaktozidiv do monomernih cukriv Na vidminu vid alolaktozi IPTG ye S glikozidom yaki ye himichno stijkimi v biologichnomu seredovishi takim chinom IPTG ne mozhe gidrolizuvatis pislya aktivaciyi laktoznogo operatora i koncentraciya aktivatora zalishayetsya staloyu Poglinannya IPTG kishechnoyu palichkoyu E coli mozhe vidbuvatis nezalezhno vid laktoznoyi permeazi Pri nizkih koncentraciyah IPTG pronikaye do klitini za uchastyu permeazi ale za visokih koncentracij yaki zazvichaj vikoristovuyutsya dlya indukciyi IPTG pronikaye u klitini inshimi shlyahami Laboratorne zastosuvannyaIPTG ce efektivnij induktor ekspresiyi bilkiv z lac zalezhnih promotoriv v bakterialnij kulturi pri koncentraciyah vid 100 mM do 1 0 mM Koncentraciya zalezhit vid potribnoyi sili indukciyi a takozh vid tipu klitin i plazmid sho vikoristovuyutsya Yaksho vikoristovuyetsya mutant lacIq yakij pereprodukuye lac represor mozhut buti potribni vishi koncentraciyi IPTG V sino bilomu skriningu IPTG zastosovuyetsya razom z X gal dozvolyaye identifikuvati koloniyi sho nesut rekombinantnu plazmidu na foni tih sho ekspresuyut nerekombinantnu versiyu plazmidi Div takozhX galPosilannyaHansen LH Knudsen S Sorensen SJ June 1998 The effect of the lacY gene on the induction of IPTG inducible promoters studied in Escherichia coli and Pseudomonas fluorescens Curr Microbiol 36 6 341 7 doi 10 1007 s002849900320 PMID 9608745 Marbach A Bettenbrock K 2012 lac operon induction in Escherichia coli Systematic comparison of IPTG and TMG induction and influence of the transacetylase LacA Journal of Biotechnology 157 1 82 8 doi 10 1016 j jbiotec 2011 10 009 PMID 22079752 BL21 DE3 Competent Cells BL21 DE3 pLysS Competent Cells and BL21 Competent Cells Instruction Manual Revision 066004e ed