RTL9 (англ. Retrotransposon Gag like 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі X-хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 388 амінокислот, а молекулярна маса — 144 280.
RTL9 | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||
Символи | RTL9, MAR9, MART9, RGAG1, retrotransposon gag domain containing 1, SIRH10, retrotransposon Gag like 9 | ||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 300965 MGI: 2685231 HomoloGene: 104140 GeneCards: RTL9 | ||||||
Ортологи | |||||||
Види | Людина | Миша | |||||
Entrez |
|
| |||||
Ensembl |
|
| |||||
UniProt |
|
| |||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||
Локус (UCSC) | Хр. X: 110.36 – 110.46 Mb | Хр. X: 141.88 – 141.89 Mb | |||||
PubMed search | |||||||
Вікідані | |||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSIPLHSLRF | NNTMREENVE | PQNKQMAFCR | PMTETRADVQ | ILHSHVQLPI | ||||
VSTSASDPGG | TSTQLMTSPV | FDTMSAPLMG | VPNSGALSPP | LMPASDSGAL | ||||
SPLLMPASDS | GALSPLLMPA | LDSGTLSPLL | STSEYGVMSP | GMMTIPDFGT | ||||
MSATLMVAPD | SAEISPLAMP | APSSGVVCTP | IMSTSSSEAM | STPLMLAPDS | ||||
GELSPILMQD | MNPGVMSTQP | VPAPSSEAMS | PLQITDEDTE | AMSKVLMTAL | ||||
ASGEISSLLM | SGTDSEAISS | LIMSAVASGG | TSPQPTSTQN | SGGIPTPLMS | ||||
DLDSGIMSSL | LMSSPGSEVM | STPLLSVPDA | GEMSTLPKPA | PDAEAMSPAL | ||||
MTALPSGVMP | TQTMPAPGSG | AMSPWSTQNV | DSEMMSNPPV | RATASGVMSA | ||||
PPVRALDSGA | MSTPLMGAPA | SGNMSTLQKT | VPASGAMTTS | LMTVPSSGVM | ||||
STEQMSATAS | RVMSAQLTMA | KTSGAMPTGS | MKAVAKQYKR | ATASGKMSTP | ||||
LRRAPTSGAM | STQPVTATAS | ETMSMPQLTV | PASGSMSMLQ | MRAPVSEAMS | ||||
MPQMRTMASG | LTSAAQMKAM | TSGAMSTPLM | TAQTSGSTST | LLMRDTASGV | ||||
MSCPQMRSLA | SGALSKPLMT | PKASGTMFTE | KMTTTASEAM | PTLLMRDTVS | ||||
GALSMPQMTD | TASGGLSASL | MRDTASGAMS | TSQMTATVSG | GMSMPLMRAQ | ||||
DPGVMPASLM | RAKVSGKMLS | QPMSTQDPGG | MSMSPMKSMT | AGGMQMNSPT | ||||
SDVMSTPTVR | AWTSETMSTP | LMRTSDPGER | PSLLTRASSS | GEMSLPLMRA | ||||
PASGEIATPL | RSPAYGAMSA | PQMTATASGM | MSSMPQVKAP | ISGAMSMPLT | ||||
RSTASGGMSM | PLMRAPDSRV | TSTSQMMPTA | SGDMCTLPVR | APASGGVSSP | ||||
LVRAPASGTM | STPLRRPSAC | ETVSTELMRA | SASGHMSTAQ | TTAMVSGGMS | ||||
KPLMRAPASG | TMPMPLMSAM | ASGEMSMPLM | ETMASGATST | LQTSVANSRS | ||||
MSLSQTTYTV | SGRMATAPIR | ASASGARSTS | FMRASVSGSM | PMPLPRATAS | ||||
GCGMGMSMPQ | MTATDSRGMS | TPLMRASGPG | TMSTPQTAFG | VMSTPEIKAT | ||||
DSGEASTSHI | NITASGSKPT | SHMTATTPET | AKPPPKEVPS | FGMLTPALCY | ||||
LLEEQEAARG | SCSVEEEMEI | DEEKQMKGFL | DDSERMAFLV | SLHLGAAERW | ||||
FILQMEVGEP | LSHENKSFLR | RSQGIYDSLS | EIDILSAVLC | HPKQGQKSVR | ||||
QYATDFLLLA | RHLSWSDAIL | RTRFLEGLSE | AVTTKMGRIF | LKVAGSLKEL | ||||
IDRSLYTECQ | LAEEKDSPGN | SSQVLPTACK | RNNEEAMGNE | LSSQQQTEEH | ||||
QHVSKRCYYL | KEHGDPQEGL | HDHLGQSTGH | HQKAHTNK |
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Brandt J., Veith A.-M., Volff J.-N. (2005). A family of neofunctionalized Ty3/gypsy retrotransposon genes in mammalian genomes. Cytogenet. Genome Res. 110: 307—317. PMID 16093683 DOI:10.1159/000084963
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29245 (англ.) . Процитовано 22 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 8 листопада 2016. Процитовано 22 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
RTL9 angl Retrotransposon Gag like 9 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na dovgomu plechi X hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 388 aminokislot a molekulyarna masa 144 280 RTL9IdentifikatoriSimvoliRTL9 MAR9 MART9 RGAG1 retrotransposon gag domain containing 1 SIRH10 retrotransposon Gag like 9Zovnishni ID OMIM 300965 MGI 2685231 HomoloGene 104140 GeneCards RTL9OrtologiVidi Lyudina MishaEntrez57529 209540Ensembl ENSG00000243978 ENSMUSG00000085584UniProt Q8NET4 Q32KG4RefSeq mRNK NM 020769 NM 001385449NM 001040434RefSeq bilok NP 065820NP 001035524Lokus UCSC Hr X 110 36 110 46 MbHr X 141 88 141 89 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSIPLHSLRFNNTMREENVEPQNKQMAFCRPMTETRADVQILHSHVQLPI VSTSASDPGGTSTQLMTSPVFDTMSAPLMGVPNSGALSPPLMPASDSGAL SPLLMPASDSGALSPLLMPALDSGTLSPLLSTSEYGVMSPGMMTIPDFGT MSATLMVAPDSAEISPLAMPAPSSGVVCTPIMSTSSSEAMSTPLMLAPDS GELSPILMQDMNPGVMSTQPVPAPSSEAMSPLQITDEDTEAMSKVLMTAL ASGEISSLLMSGTDSEAISSLIMSAVASGGTSPQPTSTQNSGGIPTPLMS DLDSGIMSSLLMSSPGSEVMSTPLLSVPDAGEMSTLPKPAPDAEAMSPAL MTALPSGVMPTQTMPAPGSGAMSPWSTQNVDSEMMSNPPVRATASGVMSA PPVRALDSGAMSTPLMGAPASGNMSTLQKTVPASGAMTTSLMTVPSSGVM STEQMSATASRVMSAQLTMAKTSGAMPTGSMKAVAKQYKRATASGKMSTP LRRAPTSGAMSTQPVTATASETMSMPQLTVPASGSMSMLQMRAPVSEAMS MPQMRTMASGLTSAAQMKAMTSGAMSTPLMTAQTSGSTSTLLMRDTASGV MSCPQMRSLASGALSKPLMTPKASGTMFTEKMTTTASEAMPTLLMRDTVS GALSMPQMTDTASGGLSASLMRDTASGAMSTSQMTATVSGGMSMPLMRAQ DPGVMPASLMRAKVSGKMLSQPMSTQDPGGMSMSPMKSMTAGGMQMNSPT SDVMSTPTVRAWTSETMSTPLMRTSDPGERPSLLTRASSSGEMSLPLMRA PASGEIATPLRSPAYGAMSAPQMTATASGMMSSMPQVKAPISGAMSMPLT RSTASGGMSMPLMRAPDSRVTSTSQMMPTASGDMCTLPVRAPASGGVSSP LVRAPASGTMSTPLRRPSACETVSTELMRASASGHMSTAQTTAMVSGGMS KPLMRAPASGTMPMPLMSAMASGEMSMPLMETMASGATSTLQTSVANSRS MSLSQTTYTVSGRMATAPIRASASGARSTSFMRASVSGSMPMPLPRATAS GCGMGMSMPQMTATDSRGMSTPLMRASGPGTMSTPQTAFGVMSTPEIKAT DSGEASTSHINITASGSKPTSHMTATTPETAKPPPKEVPSFGMLTPALCY LLEEQEAARGSCSVEEEMEIDEEKQMKGFLDDSERMAFLVSLHLGAAERW FILQMEVGEPLSHENKSFLRRSQGIYDSLSEIDILSAVLCHPKQGQKSVR QYATDFLLLARHLSWSDAILRTRFLEGLSEAVTTKMGRIFLKVAGSLKEL IDRSLYTECQLAEEKDSPGNSSQVLPTACKRNNEEAMGNELSSQQQTEEH QHVSKRCYYLKEHGDPQEGLHDHLGQSTGHHQKAHTNK A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y TirozinLiteraturaNagase T Kikuno R Ishikawa K Hirosawa M Ohara O 2000 Prediction of the coding sequences of unidentified human genes XVI The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro DNA Res 7 65 73 PMID 10718198 DOI 10 1093 dnares 7 1 65 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Brandt J Veith A M Volff J N 2005 A family of neofunctionalized Ty3 gypsy retrotransposon genes in mammalian genomes Cytogenet Genome Res 110 307 317 PMID 16093683 DOI 10 1159 000084963PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 29245 angl Procitovano 22 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 listopada 2016 Procitovano 22 veresnya 2017 Div takozhHromosoma X Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi