В молекулярній біології ділянка прискореної еволюції 1 англ Human accelerated region 1 HAR1 це частина геному що розміще

В молекулярній біології, ділянка прискореної еволюції 1 (англ. Human accelerated region 1, HAR1) — це частина геному, що розміщена в хромосомі 20 геному людини. Являється одним із представників ділянок прискореної еволюції генів людини. Із цієї ділянкою асоційовані два гени, що кодують довгі некодуючі РНК: HAR1A (HAR1F) та HAR1B (HAR1R). Ці гени транскрибуються в протилежних напрямках та мають по одному екзону, що перекриваються між собою та HAR1. Сам HAR1 має розмір в 118 пар основ та містить 18 нуклеотидних замін, що специфічні для людини.

HAR1A

Встановлено, що HAR1A експресується разом з риліном під час ембріонального розвитку в клітинах Кахаля-Ретціуса. Ген експресуватись з сьомого по дев'ятнадцятий тиждень вагітності в дорзальній частині кінцевого мозку плоду, що дає початок корі головного мозку. Також цей ген експресується в гіпокампі, що розвивається, мозочку та довгастому мозку.

Усі 18 нуклеотидних замін призвели до заміни слабких AT пар (мають два водневі зв'язки) на сильні GC пари (мають три водневі зв'язки), що призвело до зміни вторинної структури РНК продукту. Змінена РНК (людська) має форму листка конюшини, в порівнянні із незміненою (шимпанзе, наприклад), що має нестійку форму шпильки для волосся.

Відомо, що довгі некодуючі РНК беруть участь у регуляції транскрипції, трансляції, модифікації гістонів та їх ремоделювання. Ці функції вони здійснюють шляхом рекрутування в місце дії відповідних білків. У випадку транскрипції, РНК-полімераза може мати низьку власну специфічність до промотору й, відповідно, ініціація транскрипції є малоймовірною подією. Проте, за присутності довгої некодуючої РНК у комплексі із транскрипційними факторами, чи без них, спорідненість РНК-полімерази до промотору може зрости й, тим самим, збільшиться ймовірність початку транскрипції. Отже, зміна вторинної структури РНК, що бере участь в регуляції експресії генів, ймовірно, може призвести до зміну патерну експресії генів.

Деякі вчені пов'язують роль цього гену у виникненні шизофренії, але наразі не виявлено підтвердження даного припущення.

HAR1B

Цей ген майже не експресується в мозку під час ембріонального розвитку (експресія в 50 разів менша ніж в HAR1A). Щодо, мозку зрілої людини, то він експресується в лобовій частці, гіпокампі та в мозочку.

Примітки

Pollard, Katherine S.; Salama, Sofie R.; King, Bryan; Kern, Andrew D.; Dreszer, Tim; Katzman, Sol; Siepel, Adam; Pedersen, Jakob S.; Bejerano, Gill (13 жовт. 2006 р.). . PLOS Genetics (англ.). Т. 2, № 10. с. e168. doi:10.1371/journal.pgen.0020168. ISSN 1553-7404. Архів оригіналу за 14 травня 2020. Процитовано 19 січня 2022.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом ()
Pollard, Katherine S.; Salama, Sofie R.; Lambert, Nelle; Lambot, Marie-Alexandra; Coppens, Sandra; Pedersen, Jakob S.; Katzman, Sol; King, Bryan; Onodera, Courtney (2006-09). . Nature (англ.). Т. 443, № 7108. с. 167—172. doi:10.1038/nature05113. ISSN 1476-4687. Архів оригіналу за 6 березня 2022. Процитовано 19 січня 2022.
Beniaminov, Artemy; Westhof, Eric; Krol, Alain (1 липня 2008). . RNA (англ.). Т. 14, № 7. с. 1270—1275. doi:10.1261/rna.1054608. ISSN 1355-8382. PMC 2441984. PMID 18511501. Архів оригіналу за 2 червня 2018. Процитовано 19 січня 2022.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом ()
Tolosa, A.; Sanjuán, J.; Leal, C.; Costas, J.; Moltó, M. D.; de Frutos, R. (1 лютого 2008). Rapid evolving RNA gene HAR1A and schizophrenia. Schizophrenia Research (англ.). Т. 99, № 1. с. 370—372. doi:10.1016/j.schres.2007.10.011. ISSN 0920-9964. Процитовано 19 січня 2022.

[1] Pollard, Katherine S.; Salama, Sofie R.; King, Bryan; Kern, Andrew D.; Dreszer, Tim; Katzman, Sol; Siepel, Adam; Pedersen, Jakob S.; Bejerano, Gill (13 жовт. 2006 р.). . PLOS Genetics (англ.). Т. 2, № 10. с. e168. doi:10.1371/journal.pgen.0020168. ISSN 1553-7404. Архів оригіналу за 14 травня 2020. Процитовано 19 січня 2022.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом ()

[2] Pollard, Katherine S.; Salama, Sofie R.; Lambert, Nelle; Lambot, Marie-Alexandra; Coppens, Sandra; Pedersen, Jakob S.; Katzman, Sol; King, Bryan; Onodera, Courtney (2006-09). . Nature (англ.). Т. 443, № 7108. с. 167—172. doi:10.1038/nature05113. ISSN 1476-4687. Архів оригіналу за 6 березня 2022. Процитовано 19 січня 2022.

[3] Beniaminov, Artemy; Westhof, Eric; Krol, Alain (1 липня 2008). . RNA (англ.). Т. 14, № 7. с. 1270—1275. doi:10.1261/rna.1054608. ISSN 1355-8382. PMC 2441984. PMID 18511501. Архів оригіналу за 2 червня 2018. Процитовано 19 січня 2022.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом ()

[4] Tolosa, A.; Sanjuán, J.; Leal, C.; Costas, J.; Moltó, M. D.; de Frutos, R. (1 лютого 2008). Rapid evolving RNA gene HAR1A and schizophrenia. Schizophrenia Research (англ.). Т. 99, № 1. с. 370—372. doi:10.1016/j.schres.2007.10.011. ISSN 0920-9964. Процитовано 19 січня 2022.