PADI6 англ Peptidyl arginine deiminase 6 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на 1 й хромосомі 4

PADI6 (англ. Peptidyl arginine deiminase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 694 амінокислот, а молекулярна маса — 77 727.

PADI6

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4DAT, 4DAU

Ідентифікатори

Символи

PADI6, hPADVI, peptidyl arginine deiminase 6, PREMBL2

Зовнішні ІД

OMIM: 610363 MGI: 2655198 HomoloGene: 17695 GeneCards: PADI6

Пов'язані генетичні захворювання

genetic female infertility

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • hydrolase activity • protein-arginine deiminase activity
Клітинна компонента	• intermediate filament cytoskeleton • клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес	• cytoskeleton organization • cytoplasm organization • regulation of translation by machinery localization
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


353238


242726

Ensembl


ENSG00000276747 ENSG00000280949


ENSMUSG00000040935

UniProt


Q6TGC4


Q8K3V4

RefSeq (мРНК)


NM_207421


NM_153106

RefSeq (білок)


NP_997304


NP_694746

Локус (UCSC)

Хр. 1: 17.37 – 17.4 Mb

Хр. 4: 140.45 – 140.47 Mb

PubMed search

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVSVEGRAMS	FQSIIHLSLD	SPVHAVCVLG	TEICLDLSGC	APQKCQCFTI
HGSGRVLIDV	ANTVISEKED	ATIWWPLSDP	TYATVKMTSP	SPSVDADKVS
VTYYGPNEDA	PVGTAVLYLT	GIEVSLEVDI	YRNGQVEMSS	DKQAKKKWIW
GPSGWGAILL	VNCNPADVGQ	QLEDKKTKKV	IFSEEITNLS	QMTLNVQGPS
CILKKYRLVL	HTSKEESKKA	RVYWPQKDNS	STFELVLGPD	QHAYTLALLG
NHLKETFYVE	AIAFPSAEFS	GLISYSVSLV	EESQDPSIPE	TVLYKDTVVF
RVAPCVFIPC	TQVPLEVYLC	RELQLQGFVD	TVTKLSEKSN	SQVASVYEDP
NRLGRWLQDE	MAFCYTQAPH	KTTSLILDTP	QAADLDEFPM	KYSLSPGIGY
MIQDTEDHKV	ASMDSIGNLM	VSPPVKVQGK	EYPLGRVLIG	SSFYPSAEGR
AMSKTLRDFL	YAQQVQAPVE	LYSDWLMTGH	VDEFMCFIPT	DDKNEGKKGF
LLLLASPSAC	YKLFREKQKE	GYGDALLFDE	LRADQLLSNG	REAKTIDQLL
ADESLKKQNE	YVEKCIHLNR	DILKTELGLV	EQDIIEIPQL	FCLEKLTNIP
SDQQPKRSFA	RPYFPDLLRM	IVMGKNLGIP	KPFGPQIKGT	CCLEEKICCL
LEPLGFKCTF	INDFDCYLTE	VGDICACANI	RRVPFAFKWW	KMVP

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Rose R., Rose M., Ottmann C. (2012). Identification and structural characterization of two 14-3-3 binding sites in the human peptidylarginine deiminase type VI. J. Struct. Biol. 180: 65—72. PMID 22634725 DOI:10.1016/j.jsb.2012.05.010

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з PADI6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20449 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url ()
UniProt, Q6TGC4 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PADI6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20449 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url ()

[UniProt-5] UniProt, Q6TGC4 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.