Acidobacteria

Acidobacteria
Біологічна класифікація
Домен: Бактерії Надтип: Fibrobacteres/Acidobacteria Тип: Acidobacteria
Класи/ряди/родини/роди
(інші мови) (інші мови) (інші мови) (інші мови) (інші мови) (інші мови) (інші мови) (інші мови) (інші мови) (інші мови) (інші мови) некласифіковані Acidobacteria
Посилання
Вікісховище: Acidobacteria EOL: 7916 ITIS: 956098 NCBI: 57723 Fossilworks: 325146

Acidobacteria — недавно визначений тип бактерій. Як вказує назва, відомі види типу ацидофільні. Попри те, що тип вивчений дуже мало, він — важлива складова частина багатьох екосистем, особливо, ґрунтів. Часто, більш ніж 30 % або навіть 50 % послідовностей мікроорганізмів у зразках ґрунту, згідно з аналізом їх 16S рРНК, належали до цього типу . Вони домінували в молекулярних аналізах вологих ґрунтів Вісконсіна, безводих ґрунтів Аризони і в ризосфері масляних культурних рослин Окремі послідовності представників Acidobacteria також були виявлені в прісноводих середовищах , мікробних матах гарячих джерел , густій грязі стічних вод , біореакторах очищення стічних вод та інших середовищах.

Хоча тепер тип Acidobacteria містить тільки три описані види: (інші мови), (інші мови) і (інші мови), та декілька недавно ідентифікованих ізолятів , більшість Acidobacteria ще не була культивирована і відома тільки за своїми послідовностями 16S рРНК. Фізіологічні дані про цю групу дуже обмежені. Окрім деяких фенотипичних рис трьох описаних видів, цей тип поки що тільки відомий одним геном і його відповідною послідовністю в суспільних базах даних (ендо-1-4-бета-ксиланаза бактерії A. capsulatum). Засновуючись на філогенетичному аналізі 16S рРНК, Acidobacteria може бути розділеними на шість головних груп , які відрізняються до 22 % своїми генами 16S рРНК. Розповсюдженість і велика кількість цих мікроорганізмів піднімає питання їх екологічної ролі і метаболічних процесів, в яких вони беруть участь, особливо в ґрунтових середовищах. Засновуючись на різноманітності їх філогенезу і екологічному розповсюдженні, очікується, що Acidobacteria метаболічно і генетично являють собою дуже різноманітну групу, порівнянну з такими групами, як Протеобактерії або грам-позитивні бактерії .

Посилання

1. Achim Quaiser, Torsten Ochsenreiter, Christa Lanz, Stephan C. Schuster, Alexander H. Treusch, Jürgen Eck and Christa Schleper (2003). Acidobacteria form a coherent but highly diverse group within the bacterial domain: evidence from environmental genomics. Molecular Microbiology. 50(2): 563.
2. Kuske, C.R., Barns, S.M., and Busch, J.D. (1997). Diverse uncultivated bacterial groups from soils of the arid southwestern United States that are present in many geographic regions. Appl Environ Microbiol. 63: 3614—3621.
3. Dunbar, J., Takala, S., Barns, S.M., Davis, J.A., and Kuske, C.R. (1999). Levels of bacterial community diversity in four arid soils compared by cultivation and 16S rRNA gene cloning. Appl Environ Microbiol. 65: 1662—1669.
4. Barns, S.M., Takala, S.L., and Kuske, C.R. (1999). Wide distribution and diversity of members of the bacterial kingdom Acidobacterium in the environment. Appl Environ Microbiol. 65: 1731—1737.
5. Layton, A.C., Karanth, P.N., Lajoie, C.A., Meyers, A.J., Gregory, I.R., Stapleton, R.D. та ін. (2000). Quantification of Hyphomicrobium populations in activated sludge from an industrial wastewater treatment system as determined by 16S rRNA analysis. Appl Environ Microbiol. 66: 1167—1174. {{}}: Явне використання «та ін.» у: |author= ()
6. LaPara, T.M., Nakatsu, C.H., Pantea, L., and Alleman, J.E. (2000). Phylogenetic analysis of bacterial communities in mesophilic and thermophilic bioreactors treating pharmaceutical wastewater. Appl Environ Microbiol. 66: 3951—3959.
7. Janssen, P.H., Yates, P.S., Grinton, B.E., Taylor, P.M., and Sait, M (2002). Improved culturability of soil bacteria and isolation in pure culture of novel members of the divisions Acidobacteria, Actinobacteria, Proteobacteria, and Verrucomicrobia. Appl Environ Microbiol. 68: 2391—2396.