Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

APOBEC3G англ Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G білок який кодується однойменним геном розташова

APOBEC3G

APOBEC3G

APOBEC3G (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 384 амінокислот, а молекулярна маса — 46 408. Цей білок належить до родини цитидиндезаміназ, його ген у приматів та людини знаходиться у кластері генів APOBEC3.

APOBEC3G
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи APOBEC3G, A3G, ARCD, ARP-9, ARP9, CEM-15, CEM15, MDS019, bK150C2.7, dJ494G10.1, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G
Зовнішні ІД OMIM: 607113 MGI: 1933111 HomoloGene: 128348 GeneCards: APOBEC3G
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
60489
80287
Ensembl
ENSG00000239713
ENSMUSG00000009585
UniProt
Q9HC16
Q99J72
RefSeq (мРНК)
NM_021822
NM_001160415
NM_030255
NM_001347041
RefSeq (білок)
NP_068594
NP_001336365
NP_001336366
NP_001336367
NP_001153887
NP_001333970
NP_084531
Локус (UCSC) н/д Хр. 15: 79.78 – 79.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MKPHFRNTVERMYRDTFSYNFYNRPILSRRNTVWLCYEVKTKGPSRPPLD
AKIFRGQVYSELKYHPEMRFFHWFSKWRKLHRDQEYEVTWYISWSPCTKC
TRDMATFLAEDPKVTLTIFVARLYYFWDPDYQEALRSLCQKRDGPRATMK
IMNYDEFQHCWSKFVYSQRELFEPWNNLPKYYILLHIMLGEILRHSMDPP
TFTFNFNNEPWVRGRHETYLCYEVERMHNDTWVLLNQRRGFLCNQAPHKH
GFLEGRHAELCFLDVIPFWKLDLDQDYRVTCFTSWSPCFSCAQEMAKFIS
KNKHVSLCIFTARIYDDQGRCQEGLRTLAEAGAKISIMTYSEFKHCWDTF
VDHQGCPFQPWDGLDEHSQDLSGRLRAILQNQEN

Задіяний у таких біологічних процесах як вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, антивірусний захист. Відповідає за дезамінування цидитиинів ДНК ретровірусів, вірусу гепатиту B, .

Білок має сайт для зв'язування з іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

APOBEC3G присутній у багатьох тканинах і клітинах, зокрема в T-лімфоцитах. Цей білок уперше було відкрито завдяки його взаємодії із білком [en] вірусу імунодефіциту людини.

У 2016 році було виявлено, що чимало генетичних відмінностей між послідовністю ДНК людини та людиноподібних мавп визначається локусами, подібними до тих, що редагує APOBEC3G.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Sheehy A.M., Gaddis N.C., Choi J.D., Malim M.H. (2002). Isolation of a human gene that inhibits HIV-1 infection and is suppressed by the viral Vif protein. Nature. 418: 646—650. PMID 12167863 DOI:10.1038/nature00939
  • Stopak K., de Noronha C., Yonemoto W., Greene W.C. (2003). HIV-1 Vif blocks the antiviral activity of APOBEC3G by impairing both its translation and intracellular stability. Mol. Cell. 12: 591—601. PMID 14527406 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00353-8
  • Marin M., Rose K.M., Kozak S.L., Kabat D. (2003). HIV-1 Vif protein binds the editing enzyme APOBEC3G and induces its degradation. Nat. Med. 9: 1398—1403. PMID 14528301 DOI:10.1038/nm946
  • Sheehy A.M., Gaddis N.C., Malim M.H. (2003). The antiretroviral enzyme APOBEC3G is degraded by the proteasome in response to HIV-1 Vif. Nat. Med. 9: 1404—1407. PMID 14528300 DOI:10.1038/nm945
  • Wedekind J.E., Dance G.S.C., Sowden M.P., Smith H.C. (2003). Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business. Trends Genet. 19: 207—216. PMID 12683974 DOI:10.1016/S0168-9525(03)00054-4

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17357 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 2 листопада 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
  5. Silvestro G. Conticello (2008). The AID/APOBEC family of nucleic acid mutators. [en]. 9 (6): 229. doi:10.1186/gb-2008-9-6-229. PMID 18598372.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом ()(англ.)
  6. Arnaud Moris, Shannon Murray & Sylvain Cardinaud (2014). AID and APOBECs span the gap between innate and adaptive immunity. . 5: 534. doi:10.3389/fmicb.2014.00534. PMID 25352838.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом ()(англ.)
  7. Pinto, Yishay; Gabay, Orshay; Arbiza, Leonardo; Sams, Aaron J.; Keinan, Alon; Levanon, Erez Y. (2016). Clustered mutations in hominid genome evolution are consistent with APOBEC3G enzymatic activity. Genome Research. 26 (5): 579—587. doi:10.1101/gr.199240.115. ISSN 1088-9051.(англ.)

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

APOBEC3G angl Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 22 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 384 aminokislot a molekulyarna masa 46 408 Cej bilok nalezhit do rodini citidindezaminaz jogo gen u primativ ta lyudini znahoditsya u klasteri geniv APOBEC3 APOBEC3GNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2JYW 2KBO 2KEM 3E1U 3IQS 3IR2 3V4J 3V4K 4ROV 4ROWIdentifikatoriSimvoliAPOBEC3G A3G ARCD ARP 9 ARP9 CEM 15 CEM15 MDS019 bK150C2 7 dJ494G10 1 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3GZovnishni ID OMIM 607113 MGI 1933111 HomoloGene 128348 GeneCards APOBEC3GOntologiya genaMolekulyarna funkciya protein homodimerization activity cytidine deaminase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding katalitichna aktivnist hydrolase activity hydrolase activity acting on carbon nitrogen but not peptide bonds in cyclic amidines zv yazuvannya z ionom metalu deoxycytidine deaminase activity RNA binding zinc ion binding dCTP deaminase activity identical protein bindingKlitinna komponenta klitinne yadro apolipoprotein B mRNA editing enzyme complex gialoplazma citoplazma P body RibonukleoproteyiniBiologichnij proces cytidine deamination negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate negative regulation of transposition base conversion or substitution editing proces imunnoyi sistemi DNA cytosine deamination positive regulation of defense response to virus by host negative regulation of viral genome replication negative regulation of viral process defense response to virus vrodzhenij imunitet GO 0022415 viral process cytidine to uridine editing DNA demethylationDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez60489 80287Ensembl ENSG00000239713 ENSMUSG00000009585UniProt Q9HC16 Q99J72RefSeq mRNK NM 021822NM 001160415 NM 030255 NM 001347041RefSeq bilok NP 068594 NP 001336365 NP 001336366 NP 001336367NP 001153887 NP 001333970 NP 084531Lokus UCSC n dHr 15 79 78 79 8 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MKPHFRNTVERMYRDTFSYNFYNRPILSRRNTVWLCYEVKTKGPSRPPLD AKIFRGQVYSELKYHPEMRFFHWFSKWRKLHRDQEYEVTWYISWSPCTKC TRDMATFLAEDPKVTLTIFVARLYYFWDPDYQEALRSLCQKRDGPRATMK IMNYDEFQHCWSKFVYSQRELFEPWNNLPKYYILLHIMLGEILRHSMDPP TFTFNFNNEPWVRGRHETYLCYEVERMHNDTWVLLNQRRGFLCNQAPHKH GFLEGRHAELCFLDVIPFWKLDLDQDYRVTCFTSWSPCFSCAQEMAKFIS KNKHVSLCIFTARIYDDQGRCQEGLRTLAEAGAKISIMTYSEFKHCWDTF VDHQGCPFQPWDGLDEHSQDLSGRLRAILQNQEN A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak vrodzhenij imunitet vzayemodiya hazyayin virus antivirusnij zahist Vidpovidaye za dezaminuvannya ciditiiniv DNK retrovirusiv virusu gepatitu B Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionom cinku Lokalizovanij u citoplazmi yadri APOBEC3G prisutnij u bagatoh tkaninah i klitinah zokrema v T limfocitah Cej bilok upershe bulo vidkrito zavdyaki jogo vzayemodiyi iz bilkom en virusu imunodeficitu lyudini U 2016 roci bulo viyavleno sho chimalo genetichnih vidminnostej mizh poslidovnistyu DNK lyudini ta lyudinopodibnih mavp viznachayetsya lokusami podibnimi do tih sho redaguye APOBEC3G LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Sheehy A M Gaddis N C Choi J D Malim M H 2002 Isolation of a human gene that inhibits HIV 1 infection and is suppressed by the viral Vif protein Nature 418 646 650 PMID 12167863 DOI 10 1038 nature00939 Stopak K de Noronha C Yonemoto W Greene W C 2003 HIV 1 Vif blocks the antiviral activity of APOBEC3G by impairing both its translation and intracellular stability Mol Cell 12 591 601 PMID 14527406 DOI 10 1016 S1097 2765 03 00353 8 Marin M Rose K M Kozak S L Kabat D 2003 HIV 1 Vif protein binds the editing enzyme APOBEC3G and induces its degradation Nat Med 9 1398 1403 PMID 14528301 DOI 10 1038 nm946 Sheehy A M Gaddis N C Malim M H 2003 The antiretroviral enzyme APOBEC3G is degraded by the proteasome in response to HIV 1 Vif Nat Med 9 1404 1407 PMID 14528300 DOI 10 1038 nm945 Wedekind J E Dance G S C Sowden M P Smith H C 2003 Messenger RNA editing in mammals new members of the APOBEC family seeking roles in the family business Trends Genet 19 207 216 PMID 12683974 DOI 10 1016 S0168 9525 03 00054 4PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 17357 angl Procitovano 22 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 2 listopada 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 Silvestro G Conticello 2008 The AID APOBEC family of nucleic acid mutators en 9 6 229 doi 10 1186 gb 2008 9 6 229 PMID 18598372 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Obslugovuvannya CS1 Storinki iz nepoznachenim DOI z bezkoshtovnim dostupom posilannya angl Arnaud Moris Shannon Murray amp Sylvain Cardinaud 2014 AID and APOBECs span the gap between innate and adaptive immunity 5 534 doi 10 3389 fmicb 2014 00534 PMID 25352838 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Obslugovuvannya CS1 Storinki iz nepoznachenim DOI z bezkoshtovnim dostupom posilannya angl Pinto Yishay Gabay Orshay Arbiza Leonardo Sams Aaron J Keinan Alon Levanon Erez Y 2016 Clustered mutations in hominid genome evolution are consistent with APOBEC3G enzymatic activity Genome Research 26 5 579 587 doi 10 1101 gr 199240 115 ISSN 1088 9051 angl Div takozhHromosoma 22 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ