Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

Транскриптом сукупність продуктів транскрипції клітини організму чи їх груп тобто молекул РНК Часто під поняттям транскр

Транскриптом

Транскриптом — сукупність продуктів транскрипції клітини, організму чи їх груп, тобто молекул РНК. Часто під поняттям транскриптом мають на увазі лише сукупність матричних РНК, в інших випадках до них додають короткі та довгі некодуючі РНК.

Клітини постійно мають транскриптом, оскільки без РНК більшість функцій клітини неможлива. Фактично, транскрипція підтримує транскриптом, а не створює його наново.

Термін «транскриптом» уперше був використаний у другій половині 1990-х років для позначення сукупності мРНК дріжджів та окремих органів людини, як наприклад мозку.

Розмір транскриптому оцінюється по-різному. Так ранні оцінки розміру транскриптому людини давали транскрипцію приблизно 5 % всієї ДНК. Подібні результати показав аналіз транскриптому миші 2002 року, де було виявлено трохи більше 60 тисяч різних РНК. Натомість пізніші проєкти ENCODE та FANTOM прийшли до висновків, що транскрибується значно більша частина ДНК — до 80 % усього геному. Хоча висновки ENCODE і піддавалися сумнівам, загалом дослідники прийняли ідею, що до транскриптому входять РНК, синтезовані на матриці більшості наявних ДНК.

Примітки

  1. transcriptome definition. Nature Scitable(англ.)
  2. Brown TA. Genomes. 2nd edition. Oxford: Wiley-Liss; 2002. Chapter 3, Transcriptomes and Proteomes(англ.)
  3. Lowe, R., Shirley, N., Bleackley, M., Dolan, S., & Shafee, T. (2017). Transcriptomics technologies. PLoS computational biology, 13(5), e1005457. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005457
  4. Adams, J. (2008) Transcriptome: connecting the genome to gene function. Nature Education 1(1):195(англ.)
  5. de Hoon, M., Shin, J. W., & Carninci, P. (2015). Paradigm shifts in genomics through the FANTOM projects. Mammalian genome: official journal of the International Mammalian Genome Society, 26(9-10), 391—402. https://doi.org/10.1007/s00335-015-9593-8
  6. Pertea M. (2012). The human transcriptome: an unfinished story. Genes, 3(3), 344–360. https://doi.org/10.3390/genes3030344
  7. Park, E. G., Ha, H., Lee, D. H., Kim, W. R., Lee, Y. J., Bae, W. H., & Kim, H. S. (2022). Genomic Analyses of Non-Coding RNAs Overlapping Transposable Elements and Its Implication to Human Diseases. International journal of molecular sciences, 23(16), 8950. https://doi.org/10.3390/ijms23168950
  8. Guttinger, Stephan and John Dupré, «Genomics and Postgenomics», The Stanford Encyclopedia of Philosophy (Winter 2016 Edition), Edward N. Zalta (ed.)(англ.)

Література

  • Venket Raghavan, Louis Kraft, Fantin Mesny, Linda Rigerte, A simple guide to de novo transcriptome assembly and annotation, Briefings in Bioinformatics, Volume 23, Issue 2, March 2022, bbab563, https://doi.org/10.1093/bib/bbab563

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

Дата публікації:
Transkriptom sukupnist produktiv transkripciyi klitini organizmu chi yih grup tobto molekul RNK Chasto pid ponyattyam transkriptom mayut na uvazi lishe sukupnist matrichnih RNK v inshih vipadkah do nih dodayut korotki ta dovgi nekoduyuchi RNK Klitini postijno mayut transkriptom oskilki bez RNK bilshist funkcij klitini nemozhliva Faktichno transkripciya pidtrimuye transkriptom a ne stvoryuye jogo nanovo Termin transkriptom upershe buv vikoristanij u drugij polovini 1990 h rokiv dlya poznachennya sukupnosti mRNK drizhdzhiv ta okremih organiv lyudini yak napriklad mozku Rozmir transkriptomu ocinyuyetsya po riznomu Tak ranni ocinki rozmiru transkriptomu lyudini davali transkripciyu priblizno 5 vsiyeyi DNK Podibni rezultati pokazav analiz transkriptomu mishi 2002 roku de bulo viyavleno trohi bilshe 60 tisyach riznih RNK Natomist piznishi proyekti ENCODE ta FANTOM prijshli do visnovkiv sho transkribuyetsya znachno bilsha chastina DNK do 80 usogo genomu Hocha visnovki ENCODE i piddavalisya sumnivam zagalom doslidniki prijnyali ideyu sho do transkriptomu vhodyat RNK sintezovani na matrici bilshosti nayavnih DNK Primitkitranscriptome definition Nature Scitable angl Brown TA Genomes 2nd edition Oxford Wiley Liss 2002 Chapter 3 Transcriptomes and Proteomes angl Lowe R Shirley N Bleackley M Dolan S amp Shafee T 2017 Transcriptomics technologies PLoS computational biology 13 5 e1005457 https doi org 10 1371 journal pcbi 1005457 Adams J 2008 Transcriptome connecting the genome to gene function Nature Education 1 1 195 angl de Hoon M Shin J W amp Carninci P 2015 Paradigm shifts in genomics through the FANTOM projects Mammalian genome official journal of the International Mammalian Genome Society 26 9 10 391 402 https doi org 10 1007 s00335 015 9593 8 Pertea M 2012 The human transcriptome an unfinished story Genes 3 3 344 360 https doi org 10 3390 genes3030344 Park E G Ha H Lee D H Kim W R Lee Y J Bae W H amp Kim H S 2022 Genomic Analyses of Non Coding RNAs Overlapping Transposable Elements and Its Implication to Human Diseases International journal of molecular sciences 23 16 8950 https doi org 10 3390 ijms23168950 Guttinger Stephan and John Dupre Genomics and Postgenomics The Stanford Encyclopedia of Philosophy Winter 2016 Edition Edward N Zalta ed angl LiteraturaVenket Raghavan Louis Kraft Fantin Mesny Linda Rigerte A simple guide to de novo transcriptome assembly and annotation Briefings in Bioinformatics Volume 23 Issue 2 March 2022 bbab563 https doi org 10 1093 bib bbab563
Топ