Порівняльна гібридизація геномів або гібридизація геномів (англ. Comparative genomic hybridization, CGH або genomic hybridization) — метод молекулярної генетики для порівняння геномів генетично близьких клітин або організмів. Метод звичайно використовується у систематиці для порівняння організмів, що належать до близьких груп та для аналізу зміни числа копій генів в ДНК пухлинних клітин. Метод заснований на гібридизації флюоресцентно або радіоактивно помічених ДНК пухлини (або одного організму) і нормальної ДНК (або іншого організму).
У систематиці
У систематиці звичайно використовуються ДНК, помічені за допомогою радіоактивного ізотопу або одного барвника. Геномна ДНК розрізається на відносно короткі частини, ДНК одного організму помічається і додається в значно меншій концентрації. Після нагрівання і охолодження одно-ланцюжкова ДНК відділяється та вимірюється кількість поміченої дволанцюгової ДНК. Це число вказує на кількість ідентичних фрагментів ДНК.
У прокаріотів якщо кількість ідентичних генів більше ~ 70 %, штами ймовірно слід віднести до одного виду, якщо більше ~ 25 % — до одного роду. Оскільки випадкові помилки методу зараз складають близько 10 %, для таксонів більш високого рангу метод не використовується.
У генетиці раку
Для порівняння числа генів між нормальними і пухлинними клітинами звичайно використовуються два барвникі, наприклад, такі пари барвників як (флюоресцеїн) (FITC) — (родамін). Використовуючи і , виявляються регіональні відмінності в співвідношенні свічення пухлини порівняно з контрольною ДНК, і використовується для ідентифікації анормальних регіонів в геномі клітин пухлини. CGH виявить тільки неврівноважені хромосомні зміни. Структурна аберація хромосом, наприклад, збалансовані взаємні переміщення та інверсії, не можуть бути виявлені.
Посилання
- Madigan, Michael and Martinko, John. Brock Biology of Microorganisms. 11th ed. Prentice Hall, 2005. . Використання методу і систематиці.
- Progenetix database: Колекція даних CGH із публікацій (> 13000 випадків, 2006).
- CGHtracker: Спроба приведення CGH публікацій з орігінальними даними. Частина проекту Progenetix.
- NCBI's Cancer Chromosomes: Cancer Chromosome, частина системи NCBI Entrez, містить кілька баз даних заснованих на даних CGH.
Це незавершена стаття з молекулярної біології. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет